MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_020450	CCT	2	6	2114441	2114446	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459286169
41002	NC_020450	GCAA	2	8	2114516	2114523	50 %	0 %	25 %	25 %	459286169
41003	NC_020450	A	6	6	2114528	2114533	100 %	0 %	0 %	0 %	459286169
41004	NC_020450	TCT	2	6	2114660	2114665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286170
41005	NC_020450	AAT	2	6	2114737	2114742	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286170
41006	NC_020450	AAT	2	6	2115019	2115024	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286170
41007	NC_020450	CTT	2	6	2115059	2115064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286170
41008	NC_020450	AGA	2	6	2115109	2115114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286170
41009	NC_020450	CCA	2	6	2115161	2115166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286170
41010	NC_020450	TAA	2	6	2115177	2115182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286170
41011	NC_020450	AAC	2	6	2115238	2115243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286170
41012	NC_020450	CAAG	2	8	2115287	2115294	50 %	0 %	25 %	25 %	459286170
41013	NC_020450	AAG	2	6	2115324	2115329	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286170
41014	NC_020450	CTA	2	6	2115366	2115371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286170
41015	NC_020450	AAC	2	6	2115379	2115384	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286170
41016	NC_020450	ATG	2	6	2115450	2115455	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286170
41017	NC_020450	AGA	2	6	2115456	2115461	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459286170
41018	NC_020450	CTG	2	6	2115474	2115479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286170
41019	NC_020450	ATTT	2	8	2115486	2115493	25 %	75 %	0 %	0 %	459286170
41020	NC_020450	T	6	6	2115498	2115503	0 %	100 %	0 %	0 %	459286170
41021	NC_020450	TTTG	2	8	2115575	2115582	0 %	75 %	25 %	0 %	459286171
41022	NC_020450	TTC	2	6	2115599	2115604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286171
41023	NC_020450	GTT	2	6	2115607	2115612	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286171
41024	NC_020450	ATGG	2	8	2115624	2115631	25 %	25 %	50 %	0 %	459286171
41025	NC_020450	AGCA	2	8	2115704	2115711	50 %	0 %	25 %	25 %	459286171
41026	NC_020450	TGG	2	6	2115752	2115757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459286171
41027	NC_020450	CAAG	2	8	2115778	2115785	50 %	0 %	25 %	25 %	459286171
41028	NC_020450	TCT	2	6	2115807	2115812	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286171
41029	NC_020450	TCT	2	6	2115840	2115845	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286171
41030	NC_020450	CCA	2	6	2115879	2115884	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286171
41031	NC_020450	T	6	6	2115929	2115934	0 %	100 %	0 %	0 %	459286171
41032	NC_020450	CAG	2	6	2115961	2115966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286171
41033	NC_020450	TTTC	2	8	2115982	2115989	0 %	75 %	0 %	25 %	459286171
41034	NC_020450	GTAAA	2	10	2115994	2116003	60 %	20 %	20 %	0 %	459286171
41035	NC_020450	GAT	2	6	2116006	2116011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286171
41036	NC_020450	TTC	3	9	2116028	2116036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286171
41037	NC_020450	CAAT	2	8	2116059	2116066	50 %	25 %	0 %	25 %	459286171
41038	NC_020450	ATCA	2	8	2116094	2116101	50 %	25 %	0 %	25 %	459286171
41039	NC_020450	TTG	2	6	2116106	2116111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286171
41040	NC_020450	GTCA	2	8	2116193	2116200	25 %	25 %	25 %	25 %	459286171
41041	NC_020450	CCA	2	6	2116254	2116259	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286171
41042	NC_020450	CAAG	2	8	2116287	2116294	50 %	0 %	25 %	25 %	459286171
41043	NC_020450	TTTG	2	8	2116309	2116316	0 %	75 %	25 %	0 %	459286171
41044	NC_020450	CAG	2	6	2116360	2116365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286171
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41046	NC_020450	AAC	2	6	2116388	2116393	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286171
41047	NC_020450	CTT	2	6	2116399	2116404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286171
41048	NC_020450	CAT	3	9	2116504	2116512	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286171
41049	NC_020450	TCT	3	9	2116602	2116610	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286171
41050	NC_020450	ATG	2	6	2116618	2116623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286171
41051	NC_020450	TG	3	6	2116638	2116643	0 %	50 %	50 %	0 %	459286171
41052	NC_020450	CAC	2	6	2116660	2116665	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286171
41053	NC_020450	TCA	2	6	2116674	2116679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286171
41054	NC_020450	ATA	2	6	2116700	2116705	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286171
41055	NC_020450	CAG	2	6	2116717	2116722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286171
41056	NC_020450	TTA	2	6	2116779	2116784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286171
41057	NC_020450	ATTT	2	8	2116828	2116835	25 %	75 %	0 %	0 %	459286171
41058	NC_020450	TCCA	2	8	2116868	2116875	25 %	25 %	0 %	50 %	459286171
41059	NC_020450	GTC	2	6	2116896	2116901	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286171
41060	NC_020450	GAC	2	6	2116936	2116941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286171
41061	NC_020450	ATC	2	6	2116973	2116978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286171
41062	NC_020450	CAT	2	6	2116990	2116995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286171
41063	NC_020450	GTT	2	6	2117013	2117018	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459286171
41064	NC_020450	TTCAAT	2	12	2117051	2117062	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	459286171
41065	NC_020450	ACC	2	6	2117063	2117068	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286171
41066	NC_020450	CTTG	2	8	2117087	2117094	0 %	50 %	25 %	25 %	459286171
41067	NC_020450	CAA	2	6	2117101	2117106	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459286171
41068	NC_020450	GCT	2	6	2117151	2117156	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286171
41069	NC_020450	GCT	2	6	2117172	2117177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286171
41070	NC_020450	CCA	2	6	2117241	2117246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459286171
41071	NC_020450	TAACCG	2	12	2117275	2117286	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	459286171
41072	NC_020450	TTC	2	6	2117300	2117305	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286171
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41074	NC_020450	GTTTT	2	10	2117408	2117417	0 %	80 %	20 %	0 %	459286172
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41079	NC_020450	ACTG	2	8	2117681	2117688	25 %	25 %	25 %	25 %	459286172
41080	NC_020450	CAT	2	6	2117695	2117700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286172
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41084	NC_020450	TTTGA	2	10	2117897	2117906	20 %	60 %	20 %	0 %	459286173
41085	NC_020450	TCT	2	6	2117922	2117927	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286173
41086	NC_020450	TAA	2	6	2117935	2117940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286173
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41088	NC_020450	TTC	2	6	2118104	2118109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286173
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41090	NC_020450	ATC	2	6	2118141	2118146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286173
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41096	NC_020450	CAAG	2	8	2118352	2118359	50 %	0 %	25 %	25 %	459286173
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41100	NC_020450	GAC	3	9	2118487	2118495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286173
41101	NC_020450	TCT	2	6	2118501	2118506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286173
41102	NC_020450	AATC	2	8	2118535	2118542	50 %	25 %	0 %	25 %	459286173
41103	NC_020450	GT	3	6	2118631	2118636	0 %	50 %	50 %	0 %	459286173
41104	NC_020450	AAT	2	6	2118647	2118652	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286173
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41106	NC_020450	TGA	2	6	2118702	2118707	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286173
41107	NC_020450	TAC	2	6	2118782	2118787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459286173
41108	NC_020450	TCC	2	6	2118866	2118871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459286173
41109	NC_020450	TTC	2	6	2119010	2119015	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286173
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41111	NC_020450	CTG	2	6	2119054	2119059	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459286173
41112	NC_020450	T	7	7	2119084	2119090	0 %	100 %	0 %	0 %	459286173
41113	NC_020450	TTC	2	6	2119403	2119408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459286174
41114	NC_020450	TGA	2	6	2119599	2119604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286174
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41116	NC_020450	ACG	2	6	2119688	2119693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459286174
41117	NC_020450	AATT	2	8	2119700	2119707	50 %	50 %	0 %	0 %	459286174
41118	NC_020450	TTCT	2	8	2119718	2119725	0 %	75 %	0 %	25 %	459286174
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41232	NC_020450	TGTC	2	8	2125983	2125990	0 %	50 %	25 %	25 %	459286180
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41234	NC_020450	ATA	2	6	2126002	2126007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459286180
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41350	NC_020450	TCAA	2	8	2131579	2131586	50 %	25 %	0 %	25 %	459286187
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41352	NC_020450	TGGATG	2	12	2131620	2131631	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	459286187
41353	NC_020450	TAT	3	9	2131661	2131669	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459286187
41354	NC_020450	ATG	2	6	2131731	2131736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459286187
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41467	NC_020450	T	6	6	2137541	2137546	0 %	100 %	0 %	0 %	459286191
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