MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_020450	TTC	2	6	1336266	1336271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285447
26003	NC_020450	CAGT	2	8	1336304	1336311	25 %	25 %	25 %	25 %	459285447
26004	NC_020450	CCA	2	6	1336312	1336317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459285447
26005	NC_020450	T	6	6	1336513	1336518	0 %	100 %	0 %	0 %	459285448
26006	NC_020450	GCA	3	9	1336538	1336546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285448
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26008	NC_020450	TTG	2	6	1336564	1336569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285448
26009	NC_020450	CAT	2	6	1336606	1336611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285448
26010	NC_020450	GGGT	2	8	1336636	1336643	0 %	25 %	75 %	0 %	459285448
26011	NC_020450	T	7	7	1336657	1336663	0 %	100 %	0 %	0 %	459285448
26012	NC_020450	A	6	6	1336694	1336699	100 %	0 %	0 %	0 %	459285448
26013	NC_020450	AAT	2	6	1336936	1336941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285449
26014	NC_020450	CGA	2	6	1336959	1336964	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285449
26015	NC_020450	TCT	2	6	1336983	1336988	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285449
26016	NC_020450	CTT	2	6	1337007	1337012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285449
26017	NC_020450	TAA	2	6	1337072	1337077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285449
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26019	NC_020450	CTTT	2	8	1337106	1337113	0 %	75 %	0 %	25 %	459285449
26020	NC_020450	ATT	2	6	1337126	1337131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285449
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26023	NC_020450	CAT	2	6	1337212	1337217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285449
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26042	NC_020450	TTA	2	6	1338293	1338298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285450
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26053	NC_020450	CTG	2	6	1338776	1338781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285450
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26117	NC_020450	ATA	2	6	1342353	1342358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285451
26118	NC_020450	GTT	2	6	1342359	1342364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285451
26119	NC_020450	ATC	2	6	1342424	1342429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285451
26120	NC_020450	TTC	2	6	1342469	1342474	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285451
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26122	NC_020450	GGACT	2	10	1342513	1342522	20 %	20 %	40 %	20 %	459285451
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26137	NC_020450	ATA	2	6	1343646	1343651	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285451
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26154	NC_020450	TGC	2	6	1344679	1344684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285452
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26220	NC_020450	AAAT	2	8	1348847	1348854	75 %	25 %	0 %	0 %	459285455
26221	NC_020450	ACT	2	6	1348856	1348861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285455
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26226	NC_020450	TGC	3	9	1349023	1349031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285455
26227	NC_020450	CAA	2	6	1349052	1349057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285455
26228	NC_020450	ATT	2	6	1349105	1349110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285455
26229	NC_020450	TAAC	2	8	1349112	1349119	50 %	25 %	0 %	25 %	459285455
26230	NC_020450	ATG	2	6	1349128	1349133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285455
26231	NC_020450	GCT	2	6	1349210	1349215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285455
26232	NC_020450	TAA	2	6	1349260	1349265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285455
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26471	NC_020450	T	6	6	1362485	1362490	0 %	100 %	0 %	0 %	459285466
26472	NC_020450	TTA	2	6	1362517	1362522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285467
26473	NC_020450	AATA	2	8	1362609	1362616	75 %	25 %	0 %	0 %	459285467
26474	NC_020450	TGA	2	6	1362670	1362675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285467
26475	NC_020450	TGG	2	6	1362689	1362694	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	459285467
26476	NC_020450	AAT	2	6	1362709	1362714	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285467
26477	NC_020450	GCT	2	6	1362778	1362783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285467
26478	NC_020450	AAT	2	6	1362812	1362817	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285467
26479	NC_020450	ACT	2	6	1362833	1362838	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285467
26480	NC_020450	AAG	2	6	1362862	1362867	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459285467
26481	NC_020450	TTCT	2	8	1362901	1362908	0 %	75 %	0 %	25 %	459285467
26482	NC_020450	TTCGC	2	10	1362909	1362918	0 %	40 %	20 %	40 %	459285467
26483	NC_020450	ATT	2	6	1362976	1362981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285467
26484	NC_020450	CTC	2	6	1363015	1363020	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459285467
26485	NC_020450	ATC	2	6	1363120	1363125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285467
26486	NC_020450	A	6	6	1363140	1363145	100 %	0 %	0 %	0 %	459285467
26487	NC_020450	CTA	2	6	1363242	1363247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285467
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26490	NC_020450	CAC	2	6	1363453	1363458	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459285467
26491	NC_020450	CTGA	2	8	1363542	1363549	25 %	25 %	25 %	25 %	459285467
26492	NC_020450	CAA	3	9	1363671	1363679	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285467
26493	NC_020450	CAT	2	6	1363786	1363791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285467
26494	NC_020450	CAAA	2	8	1363812	1363819	75 %	0 %	0 %	25 %	459285467
26495	NC_020450	AGA	2	6	1364489	1364494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459285468
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26497	NC_020450	GTT	2	6	1364533	1364538	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285468
26498	NC_020450	TGAC	2	8	1364551	1364558	25 %	25 %	25 %	25 %	459285468
26499	NC_020450	TTG	2	6	1364727	1364732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285468
26500	NC_020450	CCT	2	6	1364962	1364967	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459285468

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