MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. lactis IO-1 DNA

Total Repeats: 46689

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_020450	TCAT	2	8	1249737	1249744	25 %	50 %	0 %	25 %	459285372
24502	NC_020450	ATT	2	6	1249757	1249762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285372
24503	NC_020450	TTA	2	6	1249854	1249859	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285372
24504	NC_020450	AT	3	6	1249887	1249892	50 %	50 %	0 %	0 %	459285372
24505	NC_020450	TAT	2	6	1249936	1249941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285372
24506	NC_020450	AAG	2	6	1250014	1250019	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459285372
24507	NC_020450	ATA	3	9	1250034	1250042	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285372
24508	NC_020450	CGC	2	6	1250045	1250050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	459285372
24509	NC_020450	ACTAA	2	10	1250112	1250121	60 %	20 %	0 %	20 %	459285372
24510	NC_020450	GAC	2	6	1250128	1250133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285372
24511	NC_020450	GTT	2	6	1250167	1250172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285372
24512	NC_020450	GAC	2	6	1250179	1250184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285372
24513	NC_020450	T	7	7	1250204	1250210	0 %	100 %	0 %	0 %	459285372
24514	NC_020450	GAG	2	6	1250260	1250265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	459285372
24515	NC_020450	AAC	2	6	1250267	1250272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285372
24516	NC_020450	TAGA	2	8	1250290	1250297	50 %	25 %	25 %	0 %	459285372
24517	NC_020450	CTT	2	6	1250344	1250349	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285372
24518	NC_020450	TTCATT	2	12	1250357	1250368	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	459285372
24519	NC_020450	T	6	6	1250388	1250393	0 %	100 %	0 %	0 %	459285372
24520	NC_020450	T	6	6	1250426	1250431	0 %	100 %	0 %	0 %	459285372
24521	NC_020450	TTCTTT	2	12	1250451	1250462	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	459285372
24522	NC_020450	TGT	3	9	1250544	1250552	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285372
24523	NC_020450	AGT	2	6	1250573	1250578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285372
24524	NC_020450	CTT	2	6	1250625	1250630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285372
24525	NC_020450	ACA	2	6	1250631	1250636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285372
24526	NC_020450	TTC	2	6	1250649	1250654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285372
24527	NC_020450	CAT	2	6	1250683	1250688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285372
24528	NC_020450	CTT	2	6	1250694	1250699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285372
24529	NC_020450	CTTT	2	8	1250773	1250780	0 %	75 %	0 %	25 %	459285373
24530	NC_020450	CCT	3	9	1250830	1250838	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459285373
24531	NC_020450	TGA	2	6	1250844	1250849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285373
24532	NC_020450	T	7	7	1250859	1250865	0 %	100 %	0 %	0 %	459285373
24533	NC_020450	TGAT	2	8	1250899	1250906	25 %	50 %	25 %	0 %	459285373
24534	NC_020450	AAG	2	6	1250929	1250934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	459285373
24535	NC_020450	CCTT	2	8	1250968	1250975	0 %	50 %	0 %	50 %	459285373
24536	NC_020450	CAT	2	6	1251023	1251028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285373
24537	NC_020450	TCA	3	9	1251076	1251084	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285373
24538	NC_020450	AATTTC	2	12	1251090	1251101	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	459285373
24539	NC_020450	TGT	2	6	1251117	1251122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285373
24540	NC_020450	T	6	6	1251210	1251215	0 %	100 %	0 %	0 %	459285373
24541	NC_020450	AAAT	2	8	1251227	1251234	75 %	25 %	0 %	0 %	459285373
24542	NC_020450	TGTT	2	8	1251251	1251258	0 %	75 %	25 %	0 %	459285373
24543	NC_020450	TTCAGG	2	12	1251324	1251335	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	459285373
24544	NC_020450	TGT	2	6	1251411	1251416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285373
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24546	NC_020450	CCA	2	6	1251442	1251447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	459285373
24547	NC_020450	T	6	6	1251486	1251491	0 %	100 %	0 %	0 %	459285373
24548	NC_020450	CTT	2	6	1251599	1251604	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285373
24549	NC_020450	CAT	3	9	1251662	1251670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285373
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24551	NC_020450	GTT	2	6	1251712	1251717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285373
24552	NC_020450	CCTGAA	2	12	1251724	1251735	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	459285373
24553	NC_020450	T	6	6	1251760	1251765	0 %	100 %	0 %	0 %	459285373
24554	NC_020450	TAA	2	6	1251807	1251812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285373
24555	NC_020450	TCC	2	6	1251831	1251836	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	459285373
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24557	NC_020450	TGC	2	6	1251984	1251989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285373
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24559	NC_020450	AAT	2	6	1252170	1252175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	459285373
24560	NC_020450	AT	3	6	1252184	1252189	50 %	50 %	0 %	0 %	459285373
24561	NC_020450	TTC	2	6	1252206	1252211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285373
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24565	NC_020450	TTC	2	6	1252749	1252754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285373
24566	NC_020450	T	6	6	1252800	1252805	0 %	100 %	0 %	0 %	459285373
24567	NC_020450	TCT	3	9	1252855	1252863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285373
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24571	NC_020450	T	8	8	1253119	1253126	0 %	100 %	0 %	0 %	459285373
24572	NC_020450	A	6	6	1253249	1253254	100 %	0 %	0 %	0 %	459285374
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24588	NC_020450	GA	3	6	1253937	1253942	50 %	0 %	50 %	0 %	459285375
24589	NC_020450	T	6	6	1253945	1253950	0 %	100 %	0 %	0 %	459285375
24590	NC_020450	TGC	2	6	1253955	1253960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285375
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24602	NC_020450	TTA	2	6	1254878	1254883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	459285376
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24605	NC_020450	AATG	2	8	1255056	1255063	50 %	25 %	25 %	0 %	459285376
24606	NC_020450	CTT	2	6	1255115	1255120	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	459285376
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24609	NC_020450	T	6	6	1255176	1255181	0 %	100 %	0 %	0 %	459285376
24610	NC_020450	TTTC	2	8	1255247	1255254	0 %	75 %	0 %	25 %	459285376
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24615	NC_020450	TTAA	2	8	1255525	1255532	50 %	50 %	0 %	0 %	459285376
24616	NC_020450	TAG	2	6	1255535	1255540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285376
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24732	NC_020450	T	6	6	1261943	1261948	0 %	100 %	0 %	0 %	459285380
24733	NC_020450	TTTCT	2	10	1261995	1262004	0 %	80 %	0 %	20 %	459285380
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24735	NC_020450	TAC	2	6	1262321	1262326	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285381
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24737	NC_020450	TGT	2	6	1262417	1262422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	459285381
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24848	NC_020450	CTAT	2	8	1269882	1269889	25 %	50 %	0 %	25 %	459285389
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24850	NC_020450	T	8	8	1269982	1269989	0 %	100 %	0 %	0 %	459285389
24851	NC_020450	AT	3	6	1270001	1270006	50 %	50 %	0 %	0 %	459285389
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24972	NC_020450	CAA	2	6	1277888	1277893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	459285400
24973	NC_020450	ATG	2	6	1278429	1278434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285401
24974	NC_020450	TCG	2	6	1278583	1278588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285401
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24976	NC_020450	ATC	2	6	1278642	1278647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	459285401
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24979	NC_020450	GCA	2	6	1278779	1278784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	459285401
24980	NC_020450	A	7	7	1278784	1278790	100 %	0 %	0 %	0 %	459285401
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24983	NC_020450	GTA	2	6	1278981	1278986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	459285401
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24990	NC_020450	GCAT	2	8	1279845	1279852	25 %	25 %	25 %	25 %	459285402
24991	NC_020450	AG	3	6	1279884	1279889	50 %	0 %	50 %	0 %	459285402
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25000	NC_020450	CTG	2	6	1280242	1280247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	459285402

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