MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 52289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42003	NC_020229	C	6	6	2546864	2546869	0 %	0 %	0 %	100 %	448822040
42004	NC_020229	T	6	6	2546920	2546925	0 %	100 %	0 %	0 %	448822040
42005	NC_020229	GCCG	2	8	2547050	2547057	0 %	0 %	50 %	50 %	448822041
42006	NC_020229	ACGTC	2	10	2547107	2547116	20 %	20 %	20 %	40 %	448822041
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42009	NC_020229	GCTTG	2	10	2547282	2547291	0 %	40 %	40 %	20 %	448822041
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42013	NC_020229	ATT	2	6	2547525	2547530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822041
42014	NC_020229	ATGGC	2	10	2547544	2547553	20 %	20 %	40 %	20 %	448822041
42015	NC_020229	AGA	2	6	2547560	2547565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822041
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42017	NC_020229	TGA	2	6	2547665	2547670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822041
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42101	NC_020229	ATT	2	6	2552397	2552402	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822048
42102	NC_020229	TTGA	2	8	2552409	2552416	25 %	50 %	25 %	0 %	448822048
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42105	NC_020229	ACCA	2	8	2552932	2552939	50 %	0 %	0 %	50 %	448822049
42106	NC_020229	ATC	2	6	2553000	2553005	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822049
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42108	NC_020229	CGA	2	6	2553200	2553205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822049
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42113	NC_020229	GCG	2	6	2553342	2553347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448822049
42114	NC_020229	CCAG	2	8	2553350	2553357	25 %	0 %	25 %	50 %	448822049
42115	NC_020229	CAC	2	6	2553386	2553391	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822049
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42117	NC_020229	TCT	2	6	2553500	2553505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822049
42118	NC_020229	CAAC	2	8	2553533	2553540	50 %	0 %	0 %	50 %	448822049
42119	NC_020229	T	7	7	2553620	2553626	0 %	100 %	0 %	0 %	448822049
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42128	NC_020229	AC	3	6	2554023	2554028	50 %	0 %	0 %	50 %	448822050
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42180	NC_020229	TA	3	6	2557623	2557628	50 %	50 %	0 %	0 %	448822054
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42214	NC_020229	ATG	2	6	2560242	2560247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822056
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42218	NC_020229	CG	3	6	2560511	2560516	0 %	0 %	50 %	50 %	448822056
42219	NC_020229	GAT	2	6	2560521	2560526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822056
42220	NC_020229	ACT	2	6	2560586	2560591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822056
42221	NC_020229	ATT	2	6	2560695	2560700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822057
42222	NC_020229	AAG	2	6	2560718	2560723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822057
42223	NC_020229	CAG	2	6	2560728	2560733	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822057
42224	NC_020229	CTT	2	6	2560734	2560739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822057
42225	NC_020229	GGCT	2	8	2560801	2560808	0 %	25 %	50 %	25 %	448822057
42226	NC_020229	GTC	2	6	2560890	2560895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822057
42227	NC_020229	TTG	2	6	2560939	2560944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822057
42228	NC_020229	AGCTT	2	10	2560973	2560982	20 %	40 %	20 %	20 %	448822057
42229	NC_020229	ATA	2	6	2561084	2561089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822057
42230	NC_020229	GCC	2	6	2561104	2561109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822057
42231	NC_020229	TTA	2	6	2561135	2561140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822057
42232	NC_020229	CAA	2	6	2561205	2561210	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822057
42233	NC_020229	CAT	2	6	2561250	2561255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822057
42234	NC_020229	CG	3	6	2561302	2561307	0 %	0 %	50 %	50 %	448822057
42235	NC_020229	GAT	2	6	2561368	2561373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822057
42236	NC_020229	GTC	2	6	2561441	2561446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822057
42237	NC_020229	CAC	3	9	2561449	2561457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822057
42238	NC_020229	AAAT	2	8	2561464	2561471	75 %	25 %	0 %	0 %	448822057
42239	NC_020229	TTG	2	6	2561472	2561477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822057
42240	NC_020229	ACT	2	6	2561644	2561649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822058
42241	NC_020229	CTTCG	2	10	2561831	2561840	0 %	40 %	20 %	40 %	448822058
42242	NC_020229	TAA	2	6	2561860	2561865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822058
42243	NC_020229	CCG	2	6	2561887	2561892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822058
42244	NC_020229	TCG	2	6	2561940	2561945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822058
42245	NC_020229	AGTTGC	2	12	2561951	2561962	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	448822058
42246	NC_020229	TTG	2	6	2562042	2562047	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822059
42247	NC_020229	GCTT	2	8	2562059	2562066	0 %	50 %	25 %	25 %	448822059
42248	NC_020229	GCT	2	6	2562074	2562079	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822059
42249	NC_020229	GT	3	6	2562169	2562174	0 %	50 %	50 %	0 %	448822059
42250	NC_020229	CCA	2	6	2562299	2562304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822059
42251	NC_020229	CCT	2	6	2562375	2562380	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	448822059
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42253	NC_020229	GTC	2	6	2562458	2562463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822059
42254	NC_020229	CAT	2	6	2562528	2562533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822059
42255	NC_020229	ACG	2	6	2562566	2562571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822059
42256	NC_020229	TAT	2	6	2562621	2562626	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822059
42257	NC_020229	TGC	2	6	2562748	2562753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822059
42258	NC_020229	AAG	2	6	2562821	2562826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448822059
42259	NC_020229	TCA	2	6	2562848	2562853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822059
42260	NC_020229	AAT	2	6	2562859	2562864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822059
42261	NC_020229	CAC	2	6	2562870	2562875	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822059
42262	NC_020229	GCC	2	6	2562905	2562910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822059
42263	NC_020229	CG	3	6	2562996	2563001	0 %	0 %	50 %	50 %	448822059
42264	NC_020229	TCT	2	6	2563083	2563088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822059
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42266	NC_020229	AAT	2	6	2563613	2563618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822060
42267	NC_020229	CGC	2	6	2563731	2563736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822060
42268	NC_020229	CGA	2	6	2563824	2563829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822060
42269	NC_020229	CAA	2	6	2564201	2564206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822061
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42271	NC_020229	TAAAC	2	10	2564323	2564332	60 %	20 %	0 %	20 %	448822061
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42274	NC_020229	CTG	2	6	2564442	2564447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822061
42275	NC_020229	TGA	3	9	2564475	2564483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822061
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42278	NC_020229	TAC	2	6	2564570	2564575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822061
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42282	NC_020229	T	6	6	2564706	2564711	0 %	100 %	0 %	0 %	448822061
42283	NC_020229	GACT	2	8	2564755	2564762	25 %	25 %	25 %	25 %	448822061
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42285	NC_020229	AACT	2	8	2564828	2564835	50 %	25 %	0 %	25 %	448822061
42286	NC_020229	T	7	7	2564840	2564846	0 %	100 %	0 %	0 %	448822061
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42288	NC_020229	TGA	2	6	2565354	2565359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822062
42289	NC_020229	CAT	2	6	2565448	2565453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822062
42290	NC_020229	AT	3	6	2565502	2565507	50 %	50 %	0 %	0 %	448822062
42291	NC_020229	TTG	2	6	2565678	2565683	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822062
42292	NC_020229	TCA	2	6	2565699	2565704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822062
42293	NC_020229	TCG	2	6	2565705	2565710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822062
42294	NC_020229	CAG	2	6	2565768	2565773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822062
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42301	NC_020229	GCC	2	6	2566576	2566581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822064
42302	NC_020229	TAA	2	6	2566622	2566627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822064
42303	NC_020229	GCCA	2	8	2566723	2566730	25 %	0 %	25 %	50 %	448822064
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42307	NC_020229	T	6	6	2567146	2567151	0 %	100 %	0 %	0 %	448822065
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42310	NC_020229	CAA	2	6	2567247	2567252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822065
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42320	NC_020229	GTC	2	6	2567930	2567935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822066
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42328	NC_020229	TAG	2	6	2568170	2568175	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822066
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42330	NC_020229	TAA	2	6	2568869	2568874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822067
42331	NC_020229	GC	3	6	2568911	2568916	0 %	0 %	50 %	50 %	448822067
42332	NC_020229	GTC	2	6	2568941	2568946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822067
42333	NC_020229	TGTT	2	8	2568972	2568979	0 %	75 %	25 %	0 %	448822067
42334	NC_020229	CGT	2	6	2568991	2568996	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822067
42335	NC_020229	GTA	2	6	2569099	2569104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822067
42336	NC_020229	CCGG	2	8	2569148	2569155	0 %	0 %	50 %	50 %	448822067
42337	NC_020229	GTT	2	6	2569172	2569177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822067
42338	NC_020229	CAC	2	6	2569245	2569250	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822067
42339	NC_020229	GTAAC	2	10	2569288	2569297	40 %	20 %	20 %	20 %	448822067
42340	NC_020229	GTC	2	6	2569313	2569318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822067
42341	NC_020229	TCA	2	6	2569469	2569474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822067
42342	NC_020229	TTGC	2	8	2569607	2569614	0 %	50 %	25 %	25 %	448822067
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42344	NC_020229	GTT	3	9	2569697	2569705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822067
42345	NC_020229	ATC	2	6	2569712	2569717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822067
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42347	NC_020229	TTA	2	6	2569925	2569930	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822067
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42349	NC_020229	ATG	2	6	2569997	2570002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448822067
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42454	NC_020229	CGCAA	2	10	2575995	2576004	40 %	0 %	20 %	40 %	448822073
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42460	NC_020229	CAG	2	6	2576515	2576520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448822074
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42462	NC_020229	TTA	2	6	2576640	2576645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448822074
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42464	NC_020229	CAGC	2	8	2576752	2576759	25 %	0 %	25 %	50 %	448822074
42465	NC_020229	CAA	2	6	2576783	2576788	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822074
42466	NC_020229	GCC	2	6	2576857	2576862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448822074
42467	NC_020229	ACC	2	6	2576867	2576872	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822074
42468	NC_020229	TTG	2	6	2576941	2576946	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448822074
42469	NC_020229	CAC	2	6	2576967	2576972	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822074
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42486	NC_020229	CAA	2	6	2578062	2578067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448822076
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42490	NC_020229	CAT	2	6	2578187	2578192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822076
42491	NC_020229	CTT	2	6	2578254	2578259	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448822076
42492	NC_020229	CTG	2	6	2578284	2578289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448822076
42493	NC_020229	TAA	2	6	2578307	2578312	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448822076
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42495	NC_020229	ACAG	2	8	2578335	2578342	50 %	0 %	25 %	25 %	448822076
42496	NC_020229	T	7	7	2578349	2578355	0 %	100 %	0 %	0 %	448822076
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