MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 52289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
41001	NC_020229	TTGAAC	2	12	2480199	2480210	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	448821976
41002	NC_020229	GCA	2	6	2480220	2480225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821976
41003	NC_020229	GAA	2	6	2480255	2480260	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821976
41004	NC_020229	TCA	2	6	2480265	2480270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821976
41005	NC_020229	AAT	2	6	2480305	2480310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821976
41006	NC_020229	CAAC	2	8	2480402	2480409	50 %	0 %	0 %	50 %	448821976
41007	NC_020229	GACCA	2	10	2480411	2480420	40 %	0 %	20 %	40 %	448821976
41008	NC_020229	TAA	2	6	2480447	2480452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821976
41009	NC_020229	ACA	2	6	2480666	2480671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821977
41010	NC_020229	ATTG	2	8	2480911	2480918	25 %	50 %	25 %	0 %	448821977
41011	NC_020229	A	8	8	2480989	2480996	100 %	0 %	0 %	0 %	448821977
41012	NC_020229	GGT	2	6	2481109	2481114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821978
41013	NC_020229	TCAA	2	8	2481168	2481175	50 %	25 %	0 %	25 %	448821978
41014	NC_020229	CTT	2	6	2481327	2481332	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821978
41015	NC_020229	GAA	2	6	2481342	2481347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821978
41016	NC_020229	GCTC	2	8	2481378	2481385	0 %	25 %	25 %	50 %	448821978
41017	NC_020229	CTTA	2	8	2481426	2481433	25 %	50 %	0 %	25 %	448821978
41018	NC_020229	AGT	2	6	2481434	2481439	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821978
41019	NC_020229	AGATT	2	10	2481654	2481663	40 %	40 %	20 %	0 %	448821979
41020	NC_020229	CTT	2	6	2481696	2481701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821979
41021	NC_020229	AAG	2	6	2481743	2481748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821979
41022	NC_020229	CAAG	2	8	2481765	2481772	50 %	0 %	25 %	25 %	448821979
41023	NC_020229	CGC	2	6	2481832	2481837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821979
41024	NC_020229	TTGA	2	8	2481949	2481956	25 %	50 %	25 %	0 %	448821979
41025	NC_020229	AAT	2	6	2481957	2481962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821979
41026	NC_020229	CAA	2	6	2482111	2482116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821979
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41028	NC_020229	TTG	2	6	2482330	2482335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821979
41029	NC_020229	CTT	2	6	2482371	2482376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821979
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41031	NC_020229	GA	3	6	2482479	2482484	50 %	0 %	50 %	0 %	448821979
41032	NC_020229	AAT	2	6	2482515	2482520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821979
41033	NC_020229	CCAA	2	8	2482524	2482531	50 %	0 %	0 %	50 %	448821979
41034	NC_020229	TCG	2	6	2482557	2482562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821979
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41037	NC_020229	GAT	2	6	2482612	2482617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821979
41038	NC_020229	ACC	2	6	2482630	2482635	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821979
41039	NC_020229	TGA	2	6	2482647	2482652	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821979
41040	NC_020229	ATT	2	6	2482726	2482731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821979
41041	NC_020229	GTT	2	6	2482809	2482814	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821979
41042	NC_020229	TGT	2	6	2483118	2483123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821979
41043	NC_020229	CTT	2	6	2483308	2483313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821980
41044	NC_020229	CG	3	6	2483369	2483374	0 %	0 %	50 %	50 %	448821980
41045	NC_020229	GCG	2	6	2483387	2483392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821980
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41047	NC_020229	CAT	2	6	2483505	2483510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821980
41048	NC_020229	CGT	2	6	2483535	2483540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821980
41049	NC_020229	TCGGCC	2	12	2483597	2483608	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	448821980
41050	NC_020229	ACT	2	6	2483609	2483614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821980
41051	NC_020229	AAT	2	6	2483634	2483639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821980
41052	NC_020229	GTC	2	6	2483692	2483697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821980
41053	NC_020229	TCA	2	6	2483717	2483722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821980
41054	NC_020229	ATTA	2	8	2483731	2483738	50 %	50 %	0 %	0 %	448821980
41055	NC_020229	CGT	2	6	2483757	2483762	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821980
41056	NC_020229	TGA	2	6	2484868	2484873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821981
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41058	NC_020229	ATT	2	6	2484895	2484900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821981
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41061	NC_020229	TGA	2	6	2485156	2485161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821981
41062	NC_020229	GCCGG	2	10	2485202	2485211	0 %	0 %	60 %	40 %	448821981
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41065	NC_020229	A	6	6	2485299	2485304	100 %	0 %	0 %	0 %	448821981
41066	NC_020229	GAC	2	6	2485528	2485533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821982
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41068	NC_020229	GTC	2	6	2485561	2485566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821982
41069	NC_020229	AATACT	2	12	2485706	2485717	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	448821982
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41071	NC_020229	CAT	2	6	2486018	2486023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821983
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41074	NC_020229	TAA	2	6	2486162	2486167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821983
41075	NC_020229	TCG	2	6	2486182	2486187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821983
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41081	NC_020229	CGT	2	6	2486621	2486626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821983
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41084	NC_020229	TTTGC	2	10	2486677	2486686	0 %	60 %	20 %	20 %	448821983
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41086	NC_020229	TGC	2	6	2486711	2486716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821983
41087	NC_020229	CACC	2	8	2486743	2486750	25 %	0 %	0 %	75 %	448821983
41088	NC_020229	TAA	2	6	2486829	2486834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821983
41089	NC_020229	GTTG	2	8	2486875	2486882	0 %	50 %	50 %	0 %	448821983
41090	NC_020229	AATA	2	8	2486904	2486911	75 %	25 %	0 %	0 %	448821983
41091	NC_020229	TAA	2	6	2486999	2487004	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821983
41092	NC_020229	ATGA	2	8	2487027	2487034	50 %	25 %	25 %	0 %	448821983
41093	NC_020229	ACG	2	6	2487067	2487072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821983
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41095	NC_020229	T	7	7	2487107	2487113	0 %	100 %	0 %	0 %	448821983
41096	NC_020229	CAT	2	6	2487167	2487172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821983
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41098	NC_020229	TGGC	2	8	2487222	2487229	0 %	25 %	50 %	25 %	448821983
41099	NC_020229	GTG	2	6	2487290	2487295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821983
41100	NC_020229	CCG	2	6	2487424	2487429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821983
41101	NC_020229	AGC	2	6	2487449	2487454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821983
41102	NC_020229	TCG	2	6	2487628	2487633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821983
41103	NC_020229	TGAC	2	8	2487712	2487719	25 %	25 %	25 %	25 %	448821983
41104	NC_020229	ACC	2	6	2487776	2487781	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821983
41105	NC_020229	TCCCAA	2	12	2487826	2487837	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	448821983
41106	NC_020229	GCT	2	6	2487846	2487851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821983
41107	NC_020229	TGAC	2	8	2487881	2487888	25 %	25 %	25 %	25 %	448821983
41108	NC_020229	CAT	2	6	2488145	2488150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821984
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41110	NC_020229	TGCC	2	8	2488366	2488373	0 %	25 %	25 %	50 %	448821984
41111	NC_020229	CAT	2	6	2488384	2488389	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821984
41112	NC_020229	ACATGC	2	12	2488510	2488521	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	448821984
41113	NC_020229	GCC	2	6	2488557	2488562	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821984
41114	NC_020229	CTTG	2	8	2488579	2488586	0 %	50 %	25 %	25 %	448821984
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41116	NC_020229	ATC	2	6	2488689	2488694	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821984
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41465	NC_020229	GTGC	2	8	2512553	2512560	0 %	25 %	50 %	25 %	448822008
41466	NC_020229	AATAC	2	10	2512566	2512575	60 %	20 %	0 %	20 %	448822008
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41468	NC_020229	CAC	2	6	2512625	2512630	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448822008
41469	NC_020229	CCAT	2	8	2512663	2512670	25 %	25 %	0 %	50 %	448822008
41470	NC_020229	CAT	2	6	2512995	2513000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448822009
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41491	NC_020229	TGG	2	6	2513763	2513768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448822009
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