MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 52289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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35502	NC_020229	T	6	6	2147464	2147469	0 %	100 %	0 %	0 %	448821635
35503	NC_020229	CG	3	6	2147584	2147589	0 %	0 %	50 %	50 %	448821635
35504	NC_020229	GCT	2	6	2147604	2147609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821635
35505	NC_020229	TTC	2	6	2147680	2147685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821635
35506	NC_020229	AGAA	2	8	2147948	2147955	75 %	0 %	25 %	0 %	448821636
35507	NC_020229	TAT	2	6	2148004	2148009	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821636
35508	NC_020229	GTGA	2	8	2148077	2148084	25 %	25 %	50 %	0 %	448821636
35509	NC_020229	CATCC	2	10	2148098	2148107	20 %	20 %	0 %	60 %	448821636
35510	NC_020229	ACC	2	6	2148239	2148244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821636
35511	NC_020229	ACT	2	6	2148251	2148256	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821636
35512	NC_020229	CCAAC	2	10	2148280	2148289	40 %	0 %	0 %	60 %	448821636
35513	NC_020229	AAT	2	6	2148297	2148302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821636
35514	NC_020229	GCTT	2	8	2148309	2148316	0 %	50 %	25 %	25 %	448821636
35515	NC_020229	CGC	2	6	2148320	2148325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821636
35516	NC_020229	CAT	2	6	2148328	2148333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821636
35517	NC_020229	T	6	6	2148424	2148429	0 %	100 %	0 %	0 %	448821636
35518	NC_020229	AAG	2	6	2148531	2148536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821636
35519	NC_020229	CAC	2	6	2148547	2148552	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821636
35520	NC_020229	CAC	2	6	2148566	2148571	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821636
35521	NC_020229	AGT	2	6	2148692	2148697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821637
35522	NC_020229	ATA	2	6	2148742	2148747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821637
35523	NC_020229	C	6	6	2148764	2148769	0 %	0 %	0 %	100 %	448821637
35524	NC_020229	GAAC	2	8	2148781	2148788	50 %	0 %	25 %	25 %	448821637
35525	NC_020229	AATT	2	8	2148804	2148811	50 %	50 %	0 %	0 %	448821637
35526	NC_020229	AAT	2	6	2148822	2148827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821637
35527	NC_020229	TAA	2	6	2148857	2148862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821637
35528	NC_020229	TTC	2	6	2148889	2148894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821637
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35530	NC_020229	AT	3	6	2149000	2149005	50 %	50 %	0 %	0 %	448821637
35531	NC_020229	AAT	2	6	2149041	2149046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821637
35532	NC_020229	CAT	2	6	2149113	2149118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821637
35533	NC_020229	ACC	2	6	2149157	2149162	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821637
35534	NC_020229	GAT	2	6	2149221	2149226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821637
35535	NC_020229	GAA	2	6	2149233	2149238	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821637
35536	NC_020229	ATCAG	2	10	2149585	2149594	40 %	20 %	20 %	20 %	448821637
35537	NC_020229	TGAA	2	8	2149688	2149695	50 %	25 %	25 %	0 %	448821637
35538	NC_020229	TGA	2	6	2149730	2149735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821637
35539	NC_020229	ATA	2	6	2149755	2149760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821637
35540	NC_020229	CCG	2	6	2149785	2149790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821637
35541	NC_020229	GGGTT	2	10	2149796	2149805	0 %	40 %	60 %	0 %	448821637
35542	NC_020229	CATC	2	8	2149928	2149935	25 %	25 %	0 %	50 %	448821637
35543	NC_020229	TCTTAC	2	12	2149943	2149954	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	448821637
35544	NC_020229	GAC	2	6	2150082	2150087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821637
35545	NC_020229	AAT	2	6	2150106	2150111	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821637
35546	NC_020229	ACC	2	6	2150120	2150125	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821637
35547	NC_020229	T	7	7	2150132	2150138	0 %	100 %	0 %	0 %	448821637
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35553	NC_020229	ATT	2	6	2150783	2150788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821639
35554	NC_020229	TAAC	2	8	2150830	2150837	50 %	25 %	0 %	25 %	448821639
35555	NC_020229	TTA	2	6	2150844	2150849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821639
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35559	NC_020229	AGTT	2	8	2151523	2151530	25 %	50 %	25 %	0 %	448821640
35560	NC_020229	CTT	2	6	2151578	2151583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821641
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35562	NC_020229	TGTT	2	8	2151655	2151662	0 %	75 %	25 %	0 %	448821641
35563	NC_020229	TC	3	6	2151806	2151811	0 %	50 %	0 %	50 %	448821641
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35568	NC_020229	TAA	2	6	2152342	2152347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821642
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35578	NC_020229	TTG	2	6	2152910	2152915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821642
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35588	NC_020229	AATT	2	8	2153831	2153838	50 %	50 %	0 %	0 %	448821643
35589	NC_020229	GTC	2	6	2153852	2153857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821643
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35600	NC_020229	TTG	3	9	2154176	2154184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821643
35601	NC_020229	TCT	2	6	2154225	2154230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821643
35602	NC_020229	CAT	2	6	2154301	2154306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821643
35603	NC_020229	TTC	2	6	2154359	2154364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821643
35604	NC_020229	GT	3	6	2154367	2154372	0 %	50 %	50 %	0 %	448821643
35605	NC_020229	CTT	2	6	2154463	2154468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821643
35606	NC_020229	TCG	2	6	2154525	2154530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821643
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35608	NC_020229	AGT	2	6	2154598	2154603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821643
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35610	NC_020229	TGGT	2	8	2154683	2154690	0 %	50 %	50 %	0 %	448821643
35611	NC_020229	CTTC	2	8	2154691	2154698	0 %	50 %	0 %	50 %	448821643
35612	NC_020229	CTT	2	6	2154925	2154930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821643
35613	NC_020229	CTT	2	6	2154976	2154981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821643
35614	NC_020229	TTGA	2	8	2154992	2154999	25 %	50 %	25 %	0 %	448821643
35615	NC_020229	CCTTAC	2	12	2155015	2155026	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	448821643
35616	NC_020229	CTT	2	6	2155132	2155137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821643
35617	NC_020229	TCA	2	6	2155367	2155372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821644
35618	NC_020229	ACA	2	6	2155382	2155387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821644
35619	NC_020229	ACC	2	6	2155405	2155410	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821644
35620	NC_020229	ACGTT	2	10	2155473	2155482	20 %	40 %	20 %	20 %	448821644
35621	NC_020229	GTG	2	6	2155541	2155546	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821644
35622	NC_020229	GAA	2	6	2155576	2155581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821644
35623	NC_020229	CTT	3	9	2155599	2155607	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821644
35624	NC_020229	CTT	2	6	2155636	2155641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821644
35625	NC_020229	AAC	2	6	2155684	2155689	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821644
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35627	NC_020229	TCG	2	6	2155826	2155831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821644
35628	NC_020229	CGAT	2	8	2155850	2155857	25 %	25 %	25 %	25 %	448821644
35629	NC_020229	TCA	2	6	2155958	2155963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821644
35630	NC_020229	ACA	2	6	2155964	2155969	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821644
35631	NC_020229	TCGTCA	2	12	2156117	2156128	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	448821644
35632	NC_020229	AAG	2	6	2156147	2156152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448821644
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35634	NC_020229	CACGTT	2	12	2156373	2156384	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	448821644
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35638	NC_020229	TCA	2	6	2156812	2156817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821645
35639	NC_020229	T	6	6	2156818	2156823	0 %	100 %	0 %	0 %	448821645
35640	NC_020229	TCA	2	6	2156832	2156837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821645
35641	NC_020229	GATC	2	8	2156878	2156885	25 %	25 %	25 %	25 %	448821645
35642	NC_020229	TAA	2	6	2156902	2156907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821645
35643	NC_020229	CTCGT	2	10	2157027	2157036	0 %	40 %	20 %	40 %	448821645
35644	NC_020229	TCT	2	6	2157079	2157084	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821645
35645	NC_020229	TA	3	6	2157139	2157144	50 %	50 %	0 %	0 %	448821645
35646	NC_020229	CTA	2	6	2157181	2157186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821645
35647	NC_020229	GCT	2	6	2157234	2157239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821645
35648	NC_020229	TTG	2	6	2157298	2157303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821645
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35650	NC_020229	GCT	2	6	2157513	2157518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821645
35651	NC_020229	TTG	2	6	2157527	2157532	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821645
35652	NC_020229	CAAC	2	8	2157538	2157545	50 %	0 %	0 %	50 %	448821645
35653	NC_020229	GCC	2	6	2157612	2157617	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821645
35654	NC_020229	CGG	2	6	2157649	2157654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821645
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35659	NC_020229	ATAA	2	8	2157861	2157868	75 %	25 %	0 %	0 %	448821646
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35672	NC_020229	TTA	2	6	2158532	2158537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821646
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35719	NC_020229	C	6	6	2161174	2161179	0 %	0 %	0 %	100 %	448821648
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35727	NC_020229	ACG	2	6	2161893	2161898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821649
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35729	NC_020229	TGAA	2	8	2161929	2161936	50 %	25 %	25 %	0 %	448821649
35730	NC_020229	CTT	2	6	2161941	2161946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821649
35731	NC_020229	TAA	2	6	2162048	2162053	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821649
35732	NC_020229	TCT	2	6	2162060	2162065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821649
35733	NC_020229	ACAA	2	8	2162348	2162355	75 %	0 %	0 %	25 %	448821650
35734	NC_020229	CTG	2	6	2162400	2162405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821650
35735	NC_020229	A	6	6	2162408	2162413	100 %	0 %	0 %	0 %	448821650
35736	NC_020229	GCT	2	6	2162420	2162425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821650
35737	NC_020229	CTG	2	6	2162430	2162435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821650
35738	NC_020229	CGA	2	6	2162449	2162454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821650
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35740	NC_020229	GCT	2	6	2162489	2162494	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821650
35741	NC_020229	CAA	2	6	2162515	2162520	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821650
35742	NC_020229	ATAA	2	8	2162799	2162806	75 %	25 %	0 %	0 %	448821651
35743	NC_020229	CGC	2	6	2162876	2162881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821651
35744	NC_020229	GCTA	2	8	2162957	2162964	25 %	25 %	25 %	25 %	448821651
35745	NC_020229	CAA	2	6	2163011	2163016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821651
35746	NC_020229	TAA	2	6	2163029	2163034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821651
35747	NC_020229	CCA	2	6	2163070	2163075	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821651
35748	NC_020229	ATC	2	6	2163216	2163221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821651
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35750	NC_020229	GCGTT	2	10	2163338	2163347	0 %	40 %	40 %	20 %	448821651
35751	NC_020229	CGT	2	6	2163377	2163382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821651
35752	NC_020229	T	7	7	2163389	2163395	0 %	100 %	0 %	0 %	448821651
35753	NC_020229	GTT	2	6	2163472	2163477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821651
35754	NC_020229	TCT	2	6	2163520	2163525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821651
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35756	NC_020229	A	6	6	2163581	2163586	100 %	0 %	0 %	0 %	448821651
35757	NC_020229	CAT	2	6	2163601	2163606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821651
35758	NC_020229	CGT	2	6	2163626	2163631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821651
35759	NC_020229	TTC	2	6	2163665	2163670	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821651
35760	NC_020229	TGC	2	6	2163681	2163686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821651
35761	NC_020229	TGT	2	6	2163783	2163788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821651
35762	NC_020229	CCTT	2	8	2163805	2163812	0 %	50 %	0 %	50 %	448821651
35763	NC_020229	GAT	2	6	2163839	2163844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821652
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35766	NC_020229	TTA	2	6	2163914	2163919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448821652
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35768	NC_020229	ATG	2	6	2164029	2164034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821652
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35770	NC_020229	AGC	2	6	2164273	2164278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821652
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35774	NC_020229	TG	3	6	2164381	2164386	0 %	50 %	50 %	0 %	448821653
35775	NC_020229	AGTG	2	8	2164405	2164412	25 %	25 %	50 %	0 %	448821653
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35778	NC_020229	C	6	6	2164511	2164516	0 %	0 %	0 %	100 %	448821653
35779	NC_020229	AGACTA	2	12	2164620	2164631	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	448821653
35780	NC_020229	CGC	2	6	2164671	2164676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	448821653
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35794	NC_020229	TAA	2	6	2165309	2165314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821653
35795	NC_020229	GTC	2	6	2165379	2165384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821653
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35832	NC_020229	CTG	2	6	2166920	2166925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821655
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35834	NC_020229	GTCG	2	8	2167059	2167066	0 %	25 %	50 %	25 %	448821655
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35836	NC_020229	CGG	2	6	2167192	2167197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821655
35837	NC_020229	GCT	2	6	2167204	2167209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821655
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35841	NC_020229	GT	3	6	2167421	2167426	0 %	50 %	50 %	0 %	448821656
35842	NC_020229	AAT	2	6	2167432	2167437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448821656
35843	NC_020229	AAC	2	6	2167466	2167471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821656
35844	NC_020229	TAGT	2	8	2167518	2167525	25 %	50 %	25 %	0 %	448821656
35845	NC_020229	TTC	2	6	2167535	2167540	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448821656
35846	NC_020229	TGGT	2	8	2167558	2167565	0 %	50 %	50 %	0 %	448821656
35847	NC_020229	AGC	2	6	2167607	2167612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448821656
35848	NC_020229	ACC	2	6	2167631	2167636	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821656
35849	NC_020229	TCCG	2	8	2167687	2167694	0 %	25 %	25 %	50 %	448821656
35850	NC_020229	GTC	3	9	2167797	2167805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821656
35851	NC_020229	GTG	2	6	2167844	2167849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821656
35852	NC_020229	CTTG	2	8	2167875	2167882	0 %	50 %	25 %	25 %	448821656
35853	NC_020229	TGG	2	6	2167977	2167982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821656
35854	NC_020229	GCG	2	6	2168248	2168253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821656
35855	NC_020229	TGA	2	6	2168298	2168303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821656
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35858	NC_020229	AAC	2	6	2168439	2168444	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821656
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35961	NC_020229	CAA	2	6	2174954	2174959	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448821662
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35964	NC_020229	AGG	2	6	2175245	2175250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	448821663
35965	NC_020229	ATC	2	6	2175266	2175271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821663
35966	NC_020229	AGT	2	6	2175332	2175337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448821663
35967	NC_020229	ACC	2	6	2175342	2175347	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448821663
35968	NC_020229	TAAA	3	12	2175391	2175402	75 %	25 %	0 %	0 %	448821663
35969	NC_020229	T	6	6	2175404	2175409	0 %	100 %	0 %	0 %	448821663
35970	NC_020229	GAAA	2	8	2175453	2175460	75 %	0 %	25 %	0 %	448821663
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35975	NC_020229	TTGA	2	8	2175575	2175582	25 %	50 %	25 %	0 %	448821663
35976	NC_020229	T	6	6	2175591	2175596	0 %	100 %	0 %	0 %	448821663
35977	NC_020229	TGG	2	6	2175603	2175608	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448821663
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35983	NC_020229	CGG	3	9	2175939	2175947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821663
35984	NC_020229	CGG	2	6	2175961	2175966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448821663
35985	NC_020229	TCA	2	6	2175981	2175986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448821663
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35990	NC_020229	A	6	6	2176162	2176167	100 %	0 %	0 %	0 %	448821663
35991	NC_020229	A	6	6	2176183	2176188	100 %	0 %	0 %	0 %	448821663
35992	NC_020229	TGT	2	6	2176248	2176253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448821663
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35994	NC_020229	CG	3	6	2176461	2176466	0 %	0 %	50 %	50 %	448821663
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35996	NC_020229	CGT	2	6	2176516	2176521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448821663
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