MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus plantarum ZJ316

Total Repeats: 52289

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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5002	NC_020229	AGT	2	6	296349	296354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819793
5003	NC_020229	GATTG	2	10	296414	296423	20 %	40 %	40 %	0 %	448819793
5004	NC_020229	ACG	2	6	296469	296474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819793
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5007	NC_020229	CTT	2	6	296969	296974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819794
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5009	NC_020229	AGC	2	6	297294	297299	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819794
5010	NC_020229	ACC	3	9	297345	297353	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	448819794
5011	NC_020229	C	6	6	297459	297464	0 %	0 %	0 %	100 %	448819794
5012	NC_020229	GCA	2	6	297490	297495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819794
5013	NC_020229	TGT	2	6	297601	297606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819794
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5017	NC_020229	ATT	2	6	297768	297773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819794
5018	NC_020229	TG	3	6	297796	297801	0 %	50 %	50 %	0 %	448819794
5019	NC_020229	TCT	2	6	297829	297834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819794
5020	NC_020229	TCA	2	6	297853	297858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819794
5021	NC_020229	TAC	2	6	297872	297877	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819794
5022	NC_020229	T	6	6	297880	297885	0 %	100 %	0 %	0 %	448819794
5023	NC_020229	TCT	2	6	297928	297933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819794
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5025	NC_020229	GTG	2	6	298049	298054	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819794
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5030	NC_020229	TCGC	2	8	298155	298162	0 %	25 %	25 %	50 %	448819794
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5033	NC_020229	AGT	2	6	298279	298284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819794
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5036	NC_020229	ATA	2	6	298533	298538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819794
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5100	NC_020229	TTC	2	6	302475	302480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819797
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5105	NC_020229	T	6	6	303012	303017	0 %	100 %	0 %	0 %	448819798
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5110	NC_020229	GATCA	2	10	303364	303373	40 %	20 %	20 %	20 %	448819798
5111	NC_020229	TGAT	2	8	303383	303390	25 %	50 %	25 %	0 %	448819798
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5122	NC_020229	CAT	2	6	304582	304587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819799
5123	NC_020229	ATGA	2	8	304692	304699	50 %	25 %	25 %	0 %	448819800
5124	NC_020229	GGT	2	6	304784	304789	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819800
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5127	NC_020229	ATG	2	6	304881	304886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819800
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5243	NC_020229	GCT	2	6	312263	312268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819806
5244	NC_020229	CAA	2	6	312272	312277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819806
5245	NC_020229	CGA	2	6	312285	312290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819806
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5253	NC_020229	CGT	2	6	312770	312775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819807
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5255	NC_020229	TGA	2	6	312994	312999	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819807
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5274	NC_020229	GTT	2	6	313972	313977	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819807
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5332	NC_020229	T	6	6	317534	317539	0 %	100 %	0 %	0 %	448819812
5333	NC_020229	ATT	2	6	317709	317714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819812
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5347	NC_020229	AGC	2	6	318411	318416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819812
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5350	NC_020229	TTG	2	6	318658	318663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819812
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5352	NC_020229	TGG	2	6	318858	318863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819812
5353	NC_020229	GC	3	6	318885	318890	0 %	0 %	50 %	50 %	448819812
5354	NC_020229	TGA	2	6	318905	318910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819812
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5356	NC_020229	GTT	2	6	318936	318941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819812
5357	NC_020229	ACGG	2	8	319060	319067	25 %	0 %	50 %	25 %	448819812
5358	NC_020229	GACT	2	8	319068	319075	25 %	25 %	25 %	25 %	448819812
5359	NC_020229	GAC	2	6	319077	319082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819812
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5361	NC_020229	TGT	2	6	319209	319214	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819812
5362	NC_020229	CAG	2	6	319238	319243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819812
5363	NC_020229	GAT	2	6	319403	319408	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819813
5364	NC_020229	CCAG	2	8	319460	319467	25 %	0 %	25 %	50 %	448819813
5365	NC_020229	TGA	2	6	319520	319525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819813
5366	NC_020229	CA	3	6	319549	319554	50 %	0 %	0 %	50 %	448819813
5367	NC_020229	CAAG	2	8	319574	319581	50 %	0 %	25 %	25 %	448819813
5368	NC_020229	G	6	6	319613	319618	0 %	0 %	100 %	0 %	448819813
5369	NC_020229	TGG	2	6	319632	319637	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819813
5370	NC_020229	GAT	2	6	319650	319655	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819813
5371	NC_020229	CAG	2	6	319670	319675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819813
5372	NC_020229	TTAC	2	8	319801	319808	25 %	50 %	0 %	25 %	448819814
5373	NC_020229	ATT	2	6	319988	319993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819814
5374	NC_020229	TGG	2	6	320033	320038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819814
5375	NC_020229	GAT	2	6	320076	320081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819814
5376	NC_020229	GAA	2	6	320088	320093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819815
5377	NC_020229	TACA	2	8	320341	320348	50 %	25 %	0 %	25 %	448819815
5378	NC_020229	TCA	2	6	320433	320438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819815
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5380	NC_020229	ATT	2	6	320470	320475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819815
5381	NC_020229	GCT	2	6	320500	320505	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819815
5382	NC_020229	T	6	6	320556	320561	0 %	100 %	0 %	0 %	448819815
5383	NC_020229	CACC	2	8	320702	320709	25 %	0 %	0 %	75 %	448819815
5384	NC_020229	TCT	2	6	320824	320829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	448819815
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5386	NC_020229	TGA	2	6	320871	320876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819815
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5388	NC_020229	ATT	3	9	320911	320919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	448819815
5389	NC_020229	CGA	2	6	320953	320958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819815
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5392	NC_020229	CGG	2	6	321311	321316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	448819816
5393	NC_020229	ATC	3	9	321444	321452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819816
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5397	NC_020229	CAAT	2	8	321691	321698	50 %	25 %	0 %	25 %	448819817
5398	NC_020229	CG	3	6	321710	321715	0 %	0 %	50 %	50 %	448819817
5399	NC_020229	T	6	6	321845	321850	0 %	100 %	0 %	0 %	448819817
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5452	NC_020229	AAAT	2	8	325377	325384	75 %	25 %	0 %	0 %	448819820
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5459	NC_020229	AGTG	2	8	326731	326738	25 %	25 %	50 %	0 %	448819823
5460	NC_020229	AAG	2	6	326754	326759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	448819823
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5467	NC_020229	TACG	2	8	327011	327018	25 %	25 %	25 %	25 %	448819824
5468	NC_020229	GCTA	2	8	327069	327076	25 %	25 %	25 %	25 %	448819824
5469	NC_020229	TTAT	2	8	327077	327084	25 %	75 %	0 %	0 %	448819824
5470	NC_020229	GAT	2	6	327174	327179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819824
5471	NC_020229	CAG	2	6	327218	327223	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	448819824
5472	NC_020229	TGC	2	6	327246	327251	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	448819824
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5475	NC_020229	GAT	2	6	327472	327477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819824
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5480	NC_020229	ATCA	2	8	328010	328017	50 %	25 %	0 %	25 %	448819825
5481	NC_020229	TTGA	2	8	328018	328025	25 %	50 %	25 %	0 %	448819825
5482	NC_020229	GCTG	2	8	328269	328276	0 %	25 %	50 %	25 %	448819825
5483	NC_020229	T	6	6	328360	328365	0 %	100 %	0 %	0 %	448819825
5484	NC_020229	AGGTG	2	10	328432	328441	20 %	20 %	60 %	0 %	448819825
5485	NC_020229	TTG	2	6	328460	328465	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819825
5486	NC_020229	AGAT	2	8	328476	328483	50 %	25 %	25 %	0 %	448819825
5487	NC_020229	T	7	7	328525	328531	0 %	100 %	0 %	0 %	448819825
5488	NC_020229	ATG	2	6	328542	328547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819825
5489	NC_020229	TCAA	2	8	328754	328761	50 %	25 %	0 %	25 %	448819826
5490	NC_020229	TAA	2	6	328763	328768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819826
5491	NC_020229	AAT	2	6	328791	328796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	448819826
5492	NC_020229	TCA	2	6	328860	328865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	448819826
5493	NC_020229	CATT	2	8	328915	328922	25 %	50 %	0 %	25 %	448819826
5494	NC_020229	ATG	2	6	328933	328938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	448819826
5495	NC_020229	CAA	2	6	329046	329051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	448819826
5496	NC_020229	GTT	2	6	329079	329084	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819826
5497	NC_020229	AACT	2	8	329095	329102	50 %	25 %	0 %	25 %	448819826
5498	NC_020229	TTG	2	6	329110	329115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	448819826
5499	NC_020229	TGG	2	6	329126	329131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	448819826
5500	NC_020229	TTAA	2	8	329152	329159	50 %	50 %	0 %	0 %	448819826

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