MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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3502	NC_020127	AAG	2	6	172633	172638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555399
3503	NC_020127	TTG	2	6	172710	172715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555399
3504	NC_020127	TTG	2	6	172759	172764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555399
3505	NC_020127	AAG	2	6	172766	172771	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555399
3506	NC_020127	AGGA	2	8	172787	172794	50 %	0 %	50 %	0 %	442555399
3507	NC_020127	CTT	2	6	172833	172838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555399
3508	NC_020127	TTCT	2	8	172841	172848	0 %	75 %	0 %	25 %	442555399
3509	NC_020127	AAC	2	6	172876	172881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555399
3510	NC_020127	CAT	2	6	172897	172902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555399
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3512	NC_020127	CCA	2	6	172976	172981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555399
3513	NC_020127	T	6	6	172994	172999	0 %	100 %	0 %	0 %	442555399
3514	NC_020127	TGC	2	6	173017	173022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555399
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3516	NC_020127	TTG	2	6	173064	173069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555399
3517	NC_020127	TGT	2	6	173132	173137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555399
3518	NC_020127	ATAA	2	8	173152	173159	75 %	25 %	0 %	0 %	442555399
3519	NC_020127	ATT	2	6	173245	173250	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555399
3520	NC_020127	GCA	2	6	173276	173281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555399
3521	NC_020127	AT	3	6	173331	173336	50 %	50 %	0 %	0 %	442555399
3522	NC_020127	ATA	2	6	173355	173360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555399
3523	NC_020127	TGA	2	6	173398	173403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555399
3524	NC_020127	ATT	2	6	173407	173412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555399
3525	NC_020127	GTT	2	6	173431	173436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555399
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3527	NC_020127	TA	3	6	173487	173492	50 %	50 %	0 %	0 %	442555399
3528	NC_020127	AAT	3	9	173497	173505	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555399
3529	NC_020127	TAT	2	6	173715	173720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555400
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3532	NC_020127	ATT	2	6	173751	173756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555400
3533	NC_020127	TTA	2	6	173757	173762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555400
3534	NC_020127	TTC	2	6	173811	173816	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555400
3535	NC_020127	ATG	2	6	173849	173854	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555400
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3538	NC_020127	TG	3	6	173975	173980	0 %	50 %	50 %	0 %	442555400
3539	NC_020127	ACA	2	6	173995	174000	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555400
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3542	NC_020127	CATG	2	8	174139	174146	25 %	25 %	25 %	25 %	442555400
3543	NC_020127	TAT	2	6	174197	174202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555400
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3552	NC_020127	CTG	2	6	174497	174502	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555400
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3554	NC_020127	ATT	2	6	174525	174530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555400
3555	NC_020127	ATGG	2	8	174598	174605	25 %	25 %	50 %	0 %	442555400
3556	NC_020127	TA	7	14	178256	178269	50 %	50 %	0 %	0 %	442555401
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3558	NC_020127	A	6	6	178322	178327	100 %	0 %	0 %	0 %	442555401
3559	NC_020127	T	7	7	178328	178334	0 %	100 %	0 %	0 %	442555401
3560	NC_020127	CAA	3	9	178354	178362	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555401
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3563	NC_020127	TTA	2	6	178400	178405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555401
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3589	NC_020127	TGC	2	6	179362	179367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555402
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3591	NC_020127	TAC	2	6	179407	179412	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555402
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3594	NC_020127	ATGA	2	8	179567	179574	50 %	25 %	25 %	0 %	442555402
3595	NC_020127	TGA	2	6	179581	179586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555402
3596	NC_020127	AAT	2	6	179587	179592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555402
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3598	NC_020127	A	6	6	179604	179609	100 %	0 %	0 %	0 %	442555402
3599	NC_020127	ATA	2	6	179616	179621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555402
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3601	NC_020127	AGAT	2	8	180077	180084	50 %	25 %	25 %	0 %	442555403
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3605	NC_020127	CATA	2	8	180212	180219	50 %	25 %	0 %	25 %	442555403
3606	NC_020127	ATGT	2	8	180224	180231	25 %	50 %	25 %	0 %	442555403
3607	NC_020127	T	7	7	180249	180255	0 %	100 %	0 %	0 %	442555403
3608	NC_020127	TTA	2	6	180262	180267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555403
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3611	NC_020127	TA	3	6	180411	180416	50 %	50 %	0 %	0 %	442555403
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3614	NC_020127	ATC	2	6	180754	180759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555404
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3616	NC_020127	TTG	2	6	180808	180813	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555404
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3619	NC_020127	T	7	7	180857	180863	0 %	100 %	0 %	0 %	442555404
3620	NC_020127	GAG	2	6	180867	180872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555404
3621	NC_020127	TTTC	2	8	180882	180889	0 %	75 %	0 %	25 %	442555404
3622	NC_020127	T	6	6	180945	180950	0 %	100 %	0 %	0 %	442555404
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3993	NC_020127	CAT	2	6	197198	197203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555417
3994	NC_020127	TCC	2	6	197229	197234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555417
3995	NC_020127	CAA	2	6	197258	197263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555417
3996	NC_020127	ACA	2	6	197293	197298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555417
3997	NC_020127	GAT	2	6	197369	197374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555417
3998	NC_020127	ATT	2	6	197398	197403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555418
3999	NC_020127	AATT	2	8	197422	197429	50 %	50 %	0 %	0 %	442555418
4000	NC_020127	T	8	8	197451	197458	0 %	100 %	0 %	0 %	442555418

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