MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_020127	AG	3	6	149429	149434	50 %	0 %	50 %	0 %	442555377
3002	NC_020127	AGATGT	2	12	149473	149484	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555377
3003	NC_020127	TCA	2	6	149516	149521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555377
3004	NC_020127	ACT	2	6	149569	149574	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555377
3005	NC_020127	ATG	2	6	149604	149609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555377
3006	NC_020127	TGTAC	2	10	149639	149648	20 %	40 %	20 %	20 %	442555377
3007	NC_020127	TGA	2	6	149656	149661	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555377
3008	NC_020127	ATG	2	6	149663	149668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555377
3009	NC_020127	ACA	2	6	149734	149739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555377
3010	NC_020127	AT	3	6	149765	149770	50 %	50 %	0 %	0 %	442555377
3011	NC_020127	ATA	2	6	149796	149801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555377
3012	NC_020127	AGT	2	6	149819	149824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555377
3013	NC_020127	GTTAAA	2	12	149831	149842	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	442555377
3014	NC_020127	TTA	2	6	149886	149891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555377
3015	NC_020127	AGGA	2	8	149904	149911	50 %	0 %	50 %	0 %	442555377
3016	NC_020127	T	6	6	150034	150039	0 %	100 %	0 %	0 %	442555378
3017	NC_020127	TGA	2	6	150051	150056	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555378
3018	NC_020127	TTC	2	6	150059	150064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555378
3019	NC_020127	GAA	2	6	150088	150093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555378
3020	NC_020127	GTTT	2	8	150117	150124	0 %	75 %	25 %	0 %	442555378
3021	NC_020127	TAT	2	6	150134	150139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555378
3022	NC_020127	A	6	6	150175	150180	100 %	0 %	0 %	0 %	442555378
3023	NC_020127	A	8	8	150248	150255	100 %	0 %	0 %	0 %	442555378
3024	NC_020127	TAAC	2	8	150273	150280	50 %	25 %	0 %	25 %	442555378
3025	NC_020127	T	6	6	150357	150362	0 %	100 %	0 %	0 %	442555378
3026	NC_020127	TCC	2	6	150443	150448	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555378
3027	NC_020127	TCT	2	6	150462	150467	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555378
3028	NC_020127	GAGT	2	8	150546	150553	25 %	25 %	50 %	0 %	442555379
3029	NC_020127	T	7	7	150571	150577	0 %	100 %	0 %	0 %	442555379
3030	NC_020127	TAC	2	6	150626	150631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555379
3031	NC_020127	TCA	2	6	150694	150699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555379
3032	NC_020127	CAC	2	6	150755	150760	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555379
3033	NC_020127	AT	3	6	150772	150777	50 %	50 %	0 %	0 %	442555379
3034	NC_020127	CTT	3	9	150782	150790	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555379
3035	NC_020127	GAA	2	6	150836	150841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555379
3036	NC_020127	CTT	2	6	150851	150856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555379
3037	NC_020127	TAA	2	6	150964	150969	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555380
3038	NC_020127	AT	3	6	151017	151022	50 %	50 %	0 %	0 %	442555380
3039	NC_020127	TAA	2	6	151072	151077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555380
3040	NC_020127	TTG	2	6	151091	151096	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555380
3041	NC_020127	AGG	2	6	151111	151116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555380
3042	NC_020127	AAC	2	6	151136	151141	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555380
3043	NC_020127	GTT	2	6	151149	151154	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555380
3044	NC_020127	TTC	2	6	151181	151186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555380
3045	NC_020127	TTG	2	6	151205	151210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555380
3046	NC_020127	TCC	2	6	151247	151252	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555380
3047	NC_020127	TTA	2	6	151264	151269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555380
3048	NC_020127	T	7	7	151288	151294	0 %	100 %	0 %	0 %	442555380
3049	NC_020127	TCA	2	6	151309	151314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555380
3050	NC_020127	CTG	2	6	151324	151329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555380
3051	NC_020127	TA	3	6	151363	151368	50 %	50 %	0 %	0 %	442555380
3052	NC_020127	TGA	2	6	151407	151412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555380
3053	NC_020127	T	6	6	151452	151457	0 %	100 %	0 %	0 %	442555380
3054	NC_020127	CGA	2	6	151524	151529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555380
3055	NC_020127	T	6	6	152235	152240	0 %	100 %	0 %	0 %	442555381
3056	NC_020127	T	6	6	152296	152301	0 %	100 %	0 %	0 %	442555381
3057	NC_020127	TGC	2	6	152368	152373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555381
3058	NC_020127	GTT	2	6	152419	152424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555381
3059	NC_020127	T	6	6	152437	152442	0 %	100 %	0 %	0 %	442555381
3060	NC_020127	ATT	2	6	152508	152513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555381
3061	NC_020127	TTAT	2	8	152590	152597	25 %	75 %	0 %	0 %	442555381
3062	NC_020127	GT	3	6	152628	152633	0 %	50 %	50 %	0 %	442555381
3063	NC_020127	GGA	2	6	152678	152683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555381
3064	NC_020127	CTTAC	2	10	152717	152726	20 %	40 %	0 %	40 %	442555381
3065	NC_020127	TAG	2	6	152728	152733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555381
3066	NC_020127	TGC	2	6	152755	152760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555381
3067	NC_020127	ACAT	2	8	152776	152783	50 %	25 %	0 %	25 %	442555381
3068	NC_020127	GGT	2	6	152801	152806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555381
3069	NC_020127	TGT	2	6	152846	152851	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555381
3070	NC_020127	ATT	2	6	152927	152932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555381
3071	NC_020127	TAT	3	9	152935	152943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555381
3072	NC_020127	TTG	2	6	153130	153135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555382
3073	NC_020127	TAA	2	6	153148	153153	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555382
3074	NC_020127	TACT	2	8	153199	153206	25 %	50 %	0 %	25 %	442555382
3075	NC_020127	CCT	2	6	153270	153275	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555382
3076	NC_020127	ATT	2	6	153284	153289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555382
3077	NC_020127	CTG	2	6	153355	153360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555382
3078	NC_020127	ATT	2	6	153392	153397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555382
3079	NC_020127	TAGTA	2	10	153422	153431	40 %	40 %	20 %	0 %	442555382
3080	NC_020127	T	6	6	153537	153542	0 %	100 %	0 %	0 %	442555382
3081	NC_020127	TTC	2	6	153557	153562	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555382
3082	NC_020127	TTC	2	6	153620	153625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555382
3083	NC_020127	CAT	2	6	153649	153654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555382
3084	NC_020127	ATA	2	6	153655	153660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555382
3085	NC_020127	CTTTTT	2	12	153673	153684	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	442555382
3086	NC_020127	ATT	2	6	154228	154233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555383
3087	NC_020127	GA	3	6	154251	154256	50 %	0 %	50 %	0 %	442555383
3088	NC_020127	GATAT	2	10	154269	154278	40 %	40 %	20 %	0 %	442555383
3089	NC_020127	A	6	6	154302	154307	100 %	0 %	0 %	0 %	442555383
3090	NC_020127	ATC	2	6	154309	154314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555383
3091	NC_020127	AGA	2	6	154343	154348	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555383
3092	NC_020127	GAT	2	6	154389	154394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555383
3093	NC_020127	A	6	6	154396	154401	100 %	0 %	0 %	0 %	442555383
3094	NC_020127	CGG	2	6	154490	154495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	442555383
3095	NC_020127	T	6	6	154527	154532	0 %	100 %	0 %	0 %	442555383
3096	NC_020127	TGG	2	6	154544	154549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555383
3097	NC_020127	G	6	6	154548	154553	0 %	0 %	100 %	0 %	442555383
3098	NC_020127	AGT	2	6	154566	154571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555383
3099	NC_020127	TCT	2	6	154587	154592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555383
3100	NC_020127	ATTTCT	2	12	154626	154637	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442555383
3101	NC_020127	TGG	2	6	154655	154660	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555383
3102	NC_020127	GGA	2	6	154782	154787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555383
3103	NC_020127	ATA	3	9	154849	154857	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555383
3104	NC_020127	AAT	2	6	154874	154879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555383
3105	NC_020127	CTG	2	6	154951	154956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555383
3106	NC_020127	AGT	2	6	154962	154967	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555383
3107	NC_020127	GTG	2	6	155017	155022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555383
3108	NC_020127	TTA	2	6	155032	155037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555383
3109	NC_020127	CTA	2	6	155053	155058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555383
3110	NC_020127	AGCT	2	8	155092	155099	25 %	25 %	25 %	25 %	442555383
3111	NC_020127	A	6	6	155154	155159	100 %	0 %	0 %	0 %	442555384
3112	NC_020127	GCT	2	6	155170	155175	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555384
3113	NC_020127	AAC	2	6	155216	155221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555384
3114	NC_020127	GGCT	2	8	155253	155260	0 %	25 %	50 %	25 %	442555384
3115	NC_020127	GTAC	2	8	155268	155275	25 %	25 %	25 %	25 %	442555384
3116	NC_020127	CAA	2	6	155298	155303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555384
3117	NC_020127	TAT	3	9	155375	155383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555384
3118	NC_020127	TCT	2	6	155387	155392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555384
3119	NC_020127	A	6	6	155413	155418	100 %	0 %	0 %	0 %	442555384
3120	NC_020127	TCA	2	6	155433	155438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555384
3121	NC_020127	TTA	2	6	155441	155446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555384
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3123	NC_020127	CA	3	6	155555	155560	50 %	0 %	0 %	50 %	442555385
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3367	NC_020127	TCT	3	9	165798	165806	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555393
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3493	NC_020127	AT	3	6	172367	172372	50 %	50 %	0 %	0 %	442555399
3494	NC_020127	AAAT	2	8	172413	172420	75 %	25 %	0 %	0 %	442555399
3495	NC_020127	TTG	2	6	172441	172446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555399
3496	NC_020127	AATC	2	8	172458	172465	50 %	25 %	0 %	25 %	442555399
3497	NC_020127	AT	3	6	172490	172495	50 %	50 %	0 %	0 %	442555399
3498	NC_020127	TTC	2	6	172534	172539	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555399
3499	NC_020127	ATT	2	6	172570	172575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555399
3500	NC_020127	T	7	7	172574	172580	0 %	100 %	0 %	0 %	442555399

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