MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_020127	ATG	2	6	1428457	1428462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556456
30503	NC_020127	TAA	2	6	1428470	1428475	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556456
30504	NC_020127	AGA	2	6	1428488	1428493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556456
30505	NC_020127	AGG	2	6	1428505	1428510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556456
30506	NC_020127	GAA	2	6	1428513	1428518	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556456
30507	NC_020127	ACT	2	6	1428525	1428530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556456
30508	NC_020127	GAT	2	6	1428594	1428599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556456
30509	NC_020127	TAAAGA	2	12	1428608	1428619	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	442556456
30510	NC_020127	AGAA	2	8	1428649	1428656	75 %	0 %	25 %	0 %	442556456
30511	NC_020127	A	6	6	1428669	1428674	100 %	0 %	0 %	0 %	442556456
30512	NC_020127	A	6	6	1428707	1428712	100 %	0 %	0 %	0 %	442556456
30513	NC_020127	TCA	2	6	1428732	1428737	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556456
30514	NC_020127	GAT	2	6	1428747	1428752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556456
30515	NC_020127	ATG	2	6	1428777	1428782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556456
30516	NC_020127	TTA	2	6	1428783	1428788	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556456
30517	NC_020127	GAT	2	6	1428807	1428812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556456
30518	NC_020127	CAA	2	6	1428834	1428839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556456
30519	NC_020127	AGT	2	6	1428903	1428908	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556456
30520	NC_020127	AAT	2	6	1428909	1428914	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556456
30521	NC_020127	AAG	2	6	1428968	1428973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556456
30522	NC_020127	AAG	2	6	1428979	1428984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556456
30523	NC_020127	T	6	6	1429001	1429006	0 %	100 %	0 %	0 %	442556456
30524	NC_020127	CAG	2	6	1429018	1429023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556456
30525	NC_020127	GTT	2	6	1429074	1429079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556456
30526	NC_020127	CAG	2	6	1429116	1429121	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556456
30527	NC_020127	CAA	3	9	1429162	1429170	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556456
30528	NC_020127	AAT	3	9	1429174	1429182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556456
30529	NC_020127	ATT	2	6	1429252	1429257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556457
30530	NC_020127	TTC	2	6	1429371	1429376	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556457
30531	NC_020127	TCAT	2	8	1429407	1429414	25 %	50 %	0 %	25 %	442556457
30532	NC_020127	CCT	2	6	1429454	1429459	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556457
30533	NC_020127	TAT	2	6	1429497	1429502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556457
30534	NC_020127	T	6	6	1429552	1429557	0 %	100 %	0 %	0 %	442556457
30535	NC_020127	ATG	2	6	1429574	1429579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556457
30536	NC_020127	TCC	2	6	1429615	1429620	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556457
30537	NC_020127	T	6	6	1429696	1429701	0 %	100 %	0 %	0 %	442556457
30538	NC_020127	AGAAAA	2	12	1429711	1429722	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	442556457
30539	NC_020127	ACA	2	6	1429834	1429839	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556457
30540	NC_020127	GAT	2	6	1429859	1429864	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556457
30541	NC_020127	AGA	3	9	1429896	1429904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556457
30542	NC_020127	AGG	2	6	1429948	1429953	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556457
30543	NC_020127	CAA	2	6	1429959	1429964	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556457
30544	NC_020127	ATG	2	6	1429977	1429982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556457
30545	NC_020127	AGA	2	6	1429993	1429998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556457
30546	NC_020127	TGG	2	6	1430008	1430013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556457
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30548	NC_020127	TCTGG	2	10	1430126	1430135	0 %	40 %	40 %	20 %	442556457
30549	NC_020127	TTGAAC	2	12	1430151	1430162	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442556457
30550	NC_020127	TAAA	2	8	1430336	1430343	75 %	25 %	0 %	0 %	442556457
30551	NC_020127	GAA	2	6	1430430	1430435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556458
30552	NC_020127	AAT	2	6	1430436	1430441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556458
30553	NC_020127	CAA	4	12	1430479	1430490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556458
30554	NC_020127	A	6	6	1430511	1430516	100 %	0 %	0 %	0 %	442556458
30555	NC_020127	CTG	2	6	1430536	1430541	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556458
30556	NC_020127	AT	3	6	1430567	1430572	50 %	50 %	0 %	0 %	442556458
30557	NC_020127	CTG	2	6	1430578	1430583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556458
30558	NC_020127	T	6	6	1430641	1430646	0 %	100 %	0 %	0 %	442556458
30559	NC_020127	GA	3	6	1430656	1430661	50 %	0 %	50 %	0 %	442556458
30560	NC_020127	AT	3	6	1430709	1430714	50 %	50 %	0 %	0 %	442556458
30561	NC_020127	AAG	2	6	1430725	1430730	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556458
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30567	NC_020127	CTG	2	6	1431104	1431109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556459
30568	NC_020127	TA	3	6	1431116	1431121	50 %	50 %	0 %	0 %	442556459
30569	NC_020127	T	6	6	1431160	1431165	0 %	100 %	0 %	0 %	442556459
30570	NC_020127	TAA	2	6	1431189	1431194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556459
30571	NC_020127	TAAT	2	8	1431208	1431215	50 %	50 %	0 %	0 %	442556459
30572	NC_020127	ATT	2	6	1431289	1431294	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556460
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30574	NC_020127	T	7	7	1431319	1431325	0 %	100 %	0 %	0 %	442556460
30575	NC_020127	ACA	2	6	1431329	1431334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556460
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30583	NC_020127	G	6	6	1431573	1431578	0 %	0 %	100 %	0 %	442556460
30584	NC_020127	CTTC	2	8	1431587	1431594	0 %	50 %	0 %	50 %	442556460
30585	NC_020127	GAAA	2	8	1431601	1431608	75 %	0 %	25 %	0 %	442556460
30586	NC_020127	AGCT	2	8	1431846	1431853	25 %	25 %	25 %	25 %	442556460
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30589	NC_020127	A	7	7	1431934	1431940	100 %	0 %	0 %	0 %	442556460
30590	NC_020127	AACT	2	8	1432132	1432139	50 %	25 %	0 %	25 %	442556461
30591	NC_020127	GAT	2	6	1432157	1432162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556461
30592	NC_020127	AT	3	6	1432218	1432223	50 %	50 %	0 %	0 %	442556461
30593	NC_020127	ATG	2	6	1432247	1432252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556461
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30600	NC_020127	AGAT	2	8	1432537	1432544	50 %	25 %	25 %	0 %	442556461
30601	NC_020127	TTAC	2	8	1432571	1432578	25 %	50 %	0 %	25 %	442556461
30602	NC_020127	ATA	3	9	1432613	1432621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556461
30603	NC_020127	AAT	2	6	1432732	1432737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556462
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30605	NC_020127	GAG	2	6	1432779	1432784	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556462
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30607	NC_020127	CAT	2	6	1432869	1432874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556462
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30972	NC_020127	CT	4	8	1448277	1448284	0 %	50 %	0 %	50 %	442556472
30973	NC_020127	GTT	2	6	1448295	1448300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556472
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