MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_020127	ATTGCT	2	12	1398676	1398687	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442556436
30002	NC_020127	AGG	2	6	1398696	1398701	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556436
30003	NC_020127	ACA	3	9	1398712	1398720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556436
30004	NC_020127	TTG	2	6	1398731	1398736	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556436
30005	NC_020127	A	6	6	1398750	1398755	100 %	0 %	0 %	0 %	442556436
30006	NC_020127	A	6	6	1398757	1398762	100 %	0 %	0 %	0 %	442556436
30007	NC_020127	TTGATC	2	12	1398773	1398784	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442556436
30008	NC_020127	AG	3	6	1398905	1398910	50 %	0 %	50 %	0 %	442556436
30009	NC_020127	TGT	2	6	1398927	1398932	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556436
30010	NC_020127	AAAAG	2	10	1398982	1398991	80 %	0 %	20 %	0 %	442556436
30011	NC_020127	ATT	2	6	1399017	1399022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556436
30012	NC_020127	TAT	3	9	1399041	1399049	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556436
30013	NC_020127	TCC	2	6	1399056	1399061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556436
30014	NC_020127	TAG	2	6	1399091	1399096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556436
30015	NC_020127	TTA	2	6	1399105	1399110	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556436
30016	NC_020127	T	6	6	1399131	1399136	0 %	100 %	0 %	0 %	442556436
30017	NC_020127	ATA	2	6	1399177	1399182	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556436
30018	NC_020127	ACA	2	6	1399194	1399199	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556436
30019	NC_020127	CAA	2	6	1399223	1399228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556436
30020	NC_020127	AT	3	6	1399259	1399264	50 %	50 %	0 %	0 %	442556436
30021	NC_020127	AAG	2	6	1399334	1399339	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556436
30022	NC_020127	CAG	2	6	1399346	1399351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556436
30023	NC_020127	ATG	2	6	1399370	1399375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556436
30024	NC_020127	AGA	2	6	1399413	1399418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556436
30025	NC_020127	AGT	2	6	1399419	1399424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556436
30026	NC_020127	CTT	2	6	1399467	1399472	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556437
30027	NC_020127	AT	3	6	1399517	1399522	50 %	50 %	0 %	0 %	442556437
30028	NC_020127	GAA	2	6	1399596	1399601	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556437
30029	NC_020127	TAG	2	6	1399684	1399689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556437
30030	NC_020127	GTA	2	6	1399731	1399736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556437
30031	NC_020127	AGG	2	6	1399738	1399743	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556437
30032	NC_020127	CTT	2	6	1399777	1399782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556437
30033	NC_020127	GTT	2	6	1399788	1399793	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556437
30034	NC_020127	TTA	2	6	1399801	1399806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556437
30035	NC_020127	AT	3	6	1399817	1399822	50 %	50 %	0 %	0 %	442556437
30036	NC_020127	T	6	6	1399868	1399873	0 %	100 %	0 %	0 %	442556437
30037	NC_020127	ATA	2	6	1399939	1399944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556437
30038	NC_020127	TCA	2	6	1399946	1399951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556437
30039	NC_020127	ATT	2	6	1399997	1400002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556437
30040	NC_020127	ATT	2	6	1400022	1400027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556437
30041	NC_020127	TTTA	2	8	1400030	1400037	25 %	75 %	0 %	0 %	442556437
30042	NC_020127	TAT	2	6	1400062	1400067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556437
30043	NC_020127	TAT	2	6	1400078	1400083	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556437
30044	NC_020127	AGG	2	6	1400110	1400115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556437
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30046	NC_020127	GGAT	3	12	1400297	1400308	25 %	25 %	50 %	0 %	442556438
30047	NC_020127	TA	3	6	1400342	1400347	50 %	50 %	0 %	0 %	442556438
30048	NC_020127	ATT	3	9	1400359	1400367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556438
30049	NC_020127	AGAA	2	8	1400378	1400385	75 %	0 %	25 %	0 %	442556438
30050	NC_020127	A	7	7	1400397	1400403	100 %	0 %	0 %	0 %	442556438
30051	NC_020127	TA	3	6	1400426	1400431	50 %	50 %	0 %	0 %	442556438
30052	NC_020127	TTA	2	6	1400479	1400484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556438
30053	NC_020127	TAAA	2	8	1400725	1400732	75 %	25 %	0 %	0 %	442556439
30054	NC_020127	ATCA	2	8	1400733	1400740	50 %	25 %	0 %	25 %	442556439
30055	NC_020127	TGA	2	6	1400768	1400773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556439
30056	NC_020127	TTA	2	6	1400794	1400799	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556439
30057	NC_020127	CAAC	2	8	1400964	1400971	50 %	0 %	0 %	50 %	442556439
30058	NC_020127	AG	3	6	1400981	1400986	50 %	0 %	50 %	0 %	442556439
30059	NC_020127	CAGC	2	8	1401039	1401046	25 %	0 %	25 %	50 %	442556439
30060	NC_020127	GAT	2	6	1401065	1401070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556439
30061	NC_020127	A	9	9	1401127	1401135	100 %	0 %	0 %	0 %	442556439
30062	NC_020127	TGA	2	6	1401233	1401238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556439
30063	NC_020127	AAT	2	6	1401311	1401316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556439
30064	NC_020127	TAT	2	6	1401362	1401367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556439
30065	NC_020127	TGAAT	2	10	1401377	1401386	40 %	40 %	20 %	0 %	442556439
30066	NC_020127	CTCA	2	8	1401390	1401397	25 %	25 %	0 %	50 %	442556439
30067	NC_020127	TTG	2	6	1401411	1401416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556439
30068	NC_020127	ATAG	2	8	1401489	1401496	50 %	25 %	25 %	0 %	442556439
30069	NC_020127	TAG	2	6	1401499	1401504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556439
30070	NC_020127	AG	3	6	1401512	1401517	50 %	0 %	50 %	0 %	442556439
30071	NC_020127	TTGT	2	8	1401559	1401566	0 %	75 %	25 %	0 %	442556439
30072	NC_020127	CTG	2	6	1401574	1401579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556439
30073	NC_020127	TGGAG	2	10	1401665	1401674	20 %	20 %	60 %	0 %	442556439
30074	NC_020127	TCA	2	6	1401714	1401719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556439
30075	NC_020127	TTC	2	6	1401728	1401733	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556439
30076	NC_020127	CAG	2	6	1401774	1401779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556439
30077	NC_020127	TGC	2	6	1401794	1401799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556439
30078	NC_020127	AG	4	8	1401829	1401836	50 %	0 %	50 %	0 %	442556439
30079	NC_020127	TGC	2	6	1401878	1401883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556439
30080	NC_020127	CAG	2	6	1401928	1401933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556439
30081	NC_020127	TTG	2	6	1401937	1401942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556439
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30083	NC_020127	TTG	2	6	1402009	1402014	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556439
30084	NC_020127	TCT	2	6	1402062	1402067	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556439
30085	NC_020127	AAG	2	6	1402084	1402089	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556439
30086	NC_020127	TAC	2	6	1402112	1402117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556439
30087	NC_020127	TGT	2	6	1402139	1402144	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556439
30088	NC_020127	CAG	2	6	1402147	1402152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556439
30089	NC_020127	A	6	6	1402268	1402273	100 %	0 %	0 %	0 %	442556439
30090	NC_020127	CCT	2	6	1402281	1402286	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556439
30091	NC_020127	ATG	2	6	1402324	1402329	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556439
30092	NC_020127	TCA	2	6	1402350	1402355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556439
30093	NC_020127	TTA	3	9	1402411	1402419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556439
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30095	NC_020127	TGT	2	6	1402478	1402483	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556439
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30098	NC_020127	T	6	6	1402588	1402593	0 %	100 %	0 %	0 %	442556439
30099	NC_020127	AAG	2	6	1402639	1402644	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556439
30100	NC_020127	GAA	2	6	1402665	1402670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556439
30101	NC_020127	CTA	2	6	1402786	1402791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556439
30102	NC_020127	GAT	2	6	1402851	1402856	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556439
30103	NC_020127	A	6	6	1402899	1402904	100 %	0 %	0 %	0 %	442556439
30104	NC_020127	GAA	2	6	1402920	1402925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556439
30105	NC_020127	GAT	2	6	1402938	1402943	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556439
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30111	NC_020127	CTTT	2	8	1403109	1403116	0 %	75 %	0 %	25 %	442556439
30112	NC_020127	AAG	2	6	1403314	1403319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556439
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30117	NC_020127	TGG	2	6	1403480	1403485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556439
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30351	NC_020127	AG	3	6	1421462	1421467	50 %	0 %	50 %	0 %	442556449
30352	NC_020127	AAC	2	6	1421498	1421503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556449
30353	NC_020127	AGA	2	6	1421510	1421515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556449
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30450	NC_020127	TTC	2	6	1426644	1426649	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556453
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30452	NC_020127	AGT	2	6	1426722	1426727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556453
30453	NC_020127	CAA	2	6	1426762	1426767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556453
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30456	NC_020127	A	7	7	1426885	1426891	100 %	0 %	0 %	0 %	442556454
30457	NC_020127	TGCT	2	8	1426906	1426913	0 %	50 %	25 %	25 %	442556454
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30460	NC_020127	TTG	2	6	1427008	1427013	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556454
30461	NC_020127	GTC	2	6	1427065	1427070	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556454
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30465	NC_020127	AAC	2	6	1427296	1427301	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556454
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