MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_020127	CAGA	2	8	101256	101263	50 %	0 %	25 %	25 %	442555336
2003	NC_020127	AT	3	6	101276	101281	50 %	50 %	0 %	0 %	442555336
2004	NC_020127	CTG	2	6	101395	101400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555336
2005	NC_020127	AGA	2	6	101432	101437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555336
2006	NC_020127	TTA	2	6	101463	101468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555336
2007	NC_020127	TAC	3	9	101550	101558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555337
2008	NC_020127	ATTAT	2	10	101562	101571	40 %	60 %	0 %	0 %	442555337
2009	NC_020127	TAT	2	6	101595	101600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555337
2010	NC_020127	CATT	2	8	101607	101614	25 %	50 %	0 %	25 %	442555337
2011	NC_020127	CTA	2	6	101649	101654	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555337
2012	NC_020127	TTA	2	6	101655	101660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555337
2013	NC_020127	T	7	7	101665	101671	0 %	100 %	0 %	0 %	442555337
2014	NC_020127	TTG	2	6	101703	101708	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555337
2015	NC_020127	CTAT	2	8	101719	101726	25 %	50 %	0 %	25 %	442555337
2016	NC_020127	AGA	2	6	101734	101739	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555337
2017	NC_020127	AAT	2	6	101765	101770	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555337
2018	NC_020127	T	8	8	101927	101934	0 %	100 %	0 %	0 %	442555337
2019	NC_020127	CAC	2	6	101937	101942	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555337
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2021	NC_020127	T	6	6	102021	102026	0 %	100 %	0 %	0 %	442555337
2022	NC_020127	TTG	3	9	102033	102041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555337
2023	NC_020127	T	6	6	102062	102067	0 %	100 %	0 %	0 %	442555337
2024	NC_020127	T	6	6	102072	102077	0 %	100 %	0 %	0 %	442555337
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2045	NC_020127	TGC	2	6	102711	102716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555338
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2051	NC_020127	TGA	2	6	102939	102944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555338
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2054	NC_020127	TATGTT	2	12	102988	102999	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	442555338
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2057	NC_020127	TCT	2	6	103096	103101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555338
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2110	NC_020127	AGAA	2	8	104816	104823	75 %	0 %	25 %	0 %	442555339
2111	NC_020127	GAAC	2	8	104847	104854	50 %	0 %	25 %	25 %	442555339
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2114	NC_020127	TAT	2	6	105274	105279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555340
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2117	NC_020127	TAA	3	9	105396	105404	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555340
2118	NC_020127	GAAA	2	8	105451	105458	75 %	0 %	25 %	0 %	442555340
2119	NC_020127	A	6	6	105456	105461	100 %	0 %	0 %	0 %	442555340
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2122	NC_020127	CT	3	6	105610	105615	0 %	50 %	0 %	50 %	442555340
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2373	NC_020127	T	6	6	120220	120225	0 %	100 %	0 %	0 %	442555352
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2381	NC_020127	TGTA	2	8	120514	120521	25 %	50 %	25 %	0 %	442555353
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2484	NC_020127	A	6	6	125778	125783	100 %	0 %	0 %	0 %	442555357
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2486	NC_020127	AACAG	2	10	125870	125879	60 %	0 %	20 %	20 %	442555357
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2492	NC_020127	TGT	2	6	126105	126110	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555358
2493	NC_020127	ATTTGC	2	12	126132	126143	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442555358
2494	NC_020127	CTA	3	9	126218	126226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555358
2495	NC_020127	GTA	2	6	126400	126405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555358
2496	NC_020127	GTT	2	6	126440	126445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555358
2497	NC_020127	A	6	6	126533	126538	100 %	0 %	0 %	0 %	442555358
2498	NC_020127	AAT	2	6	126651	126656	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555358
2499	NC_020127	AAC	2	6	126668	126673	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555358
2500	NC_020127	CAA	2	6	126683	126688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555358

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