MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24002	NC_020127	ACA	2	6	1124222	1124227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556187
24003	NC_020127	CAA	2	6	1124283	1124288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556187
24004	NC_020127	CTT	2	6	1124346	1124351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556187
24005	NC_020127	TA	3	6	1124391	1124396	50 %	50 %	0 %	0 %	442556187
24006	NC_020127	GTT	2	6	1124421	1124426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556187
24007	NC_020127	ATATTG	2	12	1124448	1124459	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	442556187
24008	NC_020127	TAG	2	6	1124472	1124477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556187
24009	NC_020127	ATT	2	6	1124489	1124494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556187
24010	NC_020127	GAT	2	6	1124501	1124506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556187
24011	NC_020127	TGA	2	6	1124507	1124512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556187
24012	NC_020127	TCA	2	6	1124519	1124524	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556187
24013	NC_020127	CTT	2	6	1124643	1124648	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556187
24014	NC_020127	CTT	2	6	1124652	1124657	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556187
24015	NC_020127	TCTTTC	2	12	1124692	1124703	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556187
24016	NC_020127	TTC	2	6	1124802	1124807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556187
24017	NC_020127	CCA	2	6	1124858	1124863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556187
24018	NC_020127	CATAA	2	10	1124976	1124985	60 %	20 %	0 %	20 %	442556187
24019	NC_020127	TTC	2	6	1125052	1125057	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556187
24020	NC_020127	T	6	6	1125061	1125066	0 %	100 %	0 %	0 %	442556187
24021	NC_020127	AAC	2	6	1125067	1125072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556187
24022	NC_020127	GAT	2	6	1125103	1125108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556187
24023	NC_020127	GAT	2	6	1125123	1125128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556187
24024	NC_020127	GATAG	2	10	1125130	1125139	40 %	20 %	40 %	0 %	442556187
24025	NC_020127	AGA	2	6	1125140	1125145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556187
24026	NC_020127	TTTG	2	8	1125174	1125181	0 %	75 %	25 %	0 %	442556187
24027	NC_020127	CCA	2	6	1125188	1125193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556187
24028	NC_020127	ACA	2	6	1125263	1125268	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556187
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24030	NC_020127	AAT	2	6	1125409	1125414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556187
24031	NC_020127	CAT	2	6	1125499	1125504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556187
24032	NC_020127	TTCT	2	8	1125537	1125544	0 %	75 %	0 %	25 %	442556187
24033	NC_020127	AAC	2	6	1125559	1125564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556187
24034	NC_020127	GAA	2	6	1125593	1125598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556187
24035	NC_020127	CAA	2	6	1125627	1125632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556187
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24039	NC_020127	AAT	2	6	1125739	1125744	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556187
24040	NC_020127	CAA	2	6	1125861	1125866	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556187
24041	NC_020127	T	8	8	1125878	1125885	0 %	100 %	0 %	0 %	442556187
24042	NC_020127	CTG	2	6	1125954	1125959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556187
24043	NC_020127	TAT	2	6	1125963	1125968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556187
24044	NC_020127	AT	4	8	1125967	1125974	50 %	50 %	0 %	0 %	442556187
24045	NC_020127	TTA	2	6	1126022	1126027	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556187
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24049	NC_020127	TCA	2	6	1126185	1126190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556187
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24052	NC_020127	CAA	2	6	1126314	1126319	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556187
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24059	NC_020127	TAG	2	6	1126461	1126466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556187
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24061	NC_020127	T	6	6	1126479	1126484	0 %	100 %	0 %	0 %	442556187
24062	NC_020127	TAAA	2	8	1126496	1126503	75 %	25 %	0 %	0 %	442556187
24063	NC_020127	T	7	7	1126527	1126533	0 %	100 %	0 %	0 %	442556187
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24067	NC_020127	AG	3	6	1126657	1126662	50 %	0 %	50 %	0 %	442556187
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24077	NC_020127	T	6	6	1127000	1127005	0 %	100 %	0 %	0 %	442556187
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24084	NC_020127	GCCATA	2	12	1127246	1127257	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	442556187
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24086	NC_020127	AT	3	6	1127301	1127306	50 %	50 %	0 %	0 %	442556187
24087	NC_020127	TAAT	2	8	1127507	1127514	50 %	50 %	0 %	0 %	442556187
24088	NC_020127	T	6	6	1127524	1127529	0 %	100 %	0 %	0 %	442556187
24089	NC_020127	TAC	2	6	1127628	1127633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556187
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24103	NC_020127	ATC	3	9	1128308	1128316	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556188
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24107	NC_020127	A	6	6	1128536	1128541	100 %	0 %	0 %	0 %	442556188
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24118	NC_020127	ACG	2	6	1129046	1129051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556188
24119	NC_020127	T	6	6	1129113	1129118	0 %	100 %	0 %	0 %	442556188
24120	NC_020127	TTC	2	6	1129160	1129165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556188
24121	NC_020127	TCT	2	6	1129215	1129220	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556188
24122	NC_020127	ATA	2	6	1129245	1129250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556188
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24125	NC_020127	TTC	2	6	1129310	1129315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556188
24126	NC_020127	TTC	2	6	1129352	1129357	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556188
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24145	NC_020127	AG	3	6	1130264	1130269	50 %	0 %	50 %	0 %	442556188
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24223	NC_020127	TGTTT	2	10	1133579	1133588	0 %	80 %	20 %	0 %	442556190
24224	NC_020127	T	6	6	1133586	1133591	0 %	100 %	0 %	0 %	442556190
24225	NC_020127	ATC	2	6	1133637	1133642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556190
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24227	NC_020127	GCT	2	6	1133715	1133720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556190
24228	NC_020127	ATC	2	6	1133747	1133752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556190
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24230	NC_020127	ATC	2	6	1133834	1133839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556190
24231	NC_020127	TGT	2	6	1133847	1133852	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556190
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24233	NC_020127	TGT	2	6	1133929	1133934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556190
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24470	NC_020127	TAA	2	6	1146638	1146643	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556200
24471	NC_020127	GAA	2	6	1146662	1146667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556200
24472	NC_020127	AAG	2	6	1146733	1146738	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556200
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24474	NC_020127	AG	3	6	1146787	1146792	50 %	0 %	50 %	0 %	442556200
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24477	NC_020127	GAA	2	6	1146831	1146836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556200
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