MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_020127	TTC	2	6	918891	918896	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556014
19503	NC_020127	GTA	2	6	918939	918944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556014
19504	NC_020127	TTA	2	6	919002	919007	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556014
19505	NC_020127	TAT	2	6	919021	919026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556014
19506	NC_020127	TAC	2	6	919201	919206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556015
19507	NC_020127	GTAAA	2	10	919212	919221	60 %	20 %	20 %	0 %	442556015
19508	NC_020127	TA	3	6	919230	919235	50 %	50 %	0 %	0 %	442556015
19509	NC_020127	TTC	2	6	919245	919250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556015
19510	NC_020127	ATG	2	6	919302	919307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556015
19511	NC_020127	AAT	2	6	919382	919387	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556015
19512	NC_020127	TTCTAT	2	12	919438	919449	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	442556015
19513	NC_020127	AT	3	6	919448	919453	50 %	50 %	0 %	0 %	442556015
19514	NC_020127	A	7	7	919456	919462	100 %	0 %	0 %	0 %	442556015
19515	NC_020127	TGG	3	9	919486	919494	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556015
19516	NC_020127	TGC	3	9	919504	919512	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556015
19517	NC_020127	A	7	7	919530	919536	100 %	0 %	0 %	0 %	442556015
19518	NC_020127	ACT	2	6	919564	919569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556015
19519	NC_020127	TGC	2	6	919576	919581	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556015
19520	NC_020127	T	6	6	919604	919609	0 %	100 %	0 %	0 %	442556015
19521	NC_020127	GA	3	6	919644	919649	50 %	0 %	50 %	0 %	442556015
19522	NC_020127	AGA	2	6	919654	919659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442556015
19523	NC_020127	TC	3	6	919662	919667	0 %	50 %	0 %	50 %	442556015
19524	NC_020127	TAT	2	6	919702	919707	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556015
19525	NC_020127	GAT	2	6	919754	919759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556015
19526	NC_020127	TAA	2	6	919762	919767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556015
19527	NC_020127	A	6	6	919766	919771	100 %	0 %	0 %	0 %	442556015
19528	NC_020127	CCT	2	6	919782	919787	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442556015
19529	NC_020127	A	7	7	919810	919816	100 %	0 %	0 %	0 %	442556015
19530	NC_020127	ACT	2	6	919857	919862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556015
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19532	NC_020127	GCT	2	6	919955	919960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556015
19533	NC_020127	ATC	2	6	919978	919983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556015
19534	NC_020127	AT	3	6	919985	919990	50 %	50 %	0 %	0 %	442556015
19535	NC_020127	A	8	8	920042	920049	100 %	0 %	0 %	0 %	442556015
19536	NC_020127	TCAG	2	8	920061	920068	25 %	25 %	25 %	25 %	442556015
19537	NC_020127	TATG	2	8	920224	920231	25 %	50 %	25 %	0 %	442556016
19538	NC_020127	AAC	2	6	920288	920293	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556016
19539	NC_020127	TAG	2	6	920362	920367	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556016
19540	NC_020127	GTG	3	9	920373	920381	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442556016
19541	NC_020127	CAG	2	6	920484	920489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442556016
19542	NC_020127	TAT	2	6	920498	920503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556016
19543	NC_020127	TAG	2	6	920559	920564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556016
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19545	NC_020127	ATT	2	6	920677	920682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556016
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19547	NC_020127	TTG	3	9	920712	920720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442556016
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19552	NC_020127	GAT	2	6	920876	920881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442556016
19553	NC_020127	ATT	2	6	920882	920887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556016
19554	NC_020127	CTG	2	6	920907	920912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556016
19555	NC_020127	CTT	2	6	920924	920929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556016
19556	NC_020127	CA	3	6	920962	920967	50 %	0 %	0 %	50 %	442556016
19557	NC_020127	TTA	2	6	921101	921106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442556016
19558	NC_020127	ATA	2	6	921129	921134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556016
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19560	NC_020127	TAC	2	6	921380	921385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442556017
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19563	NC_020127	A	6	6	921467	921472	100 %	0 %	0 %	0 %	442556017
19564	NC_020127	TAA	2	6	921509	921514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556017
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19569	NC_020127	TAA	2	6	921754	921759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556017
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19596	NC_020127	ATTT	2	8	922945	922952	25 %	75 %	0 %	0 %	442556019
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19599	NC_020127	ACTG	2	8	923109	923116	25 %	25 %	25 %	25 %	442556019
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19984	NC_020127	ACA	2	6	939440	939445	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556033
19985	NC_020127	AAT	2	6	939507	939512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556033
19986	NC_020127	AT	3	6	939535	939540	50 %	50 %	0 %	0 %	442556033
19987	NC_020127	AGG	2	6	939582	939587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442556033
19988	NC_020127	AAGG	2	8	939608	939615	50 %	0 %	50 %	0 %	442556033
19989	NC_020127	TAA	2	6	939659	939664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442556033
19990	NC_020127	A	6	6	939694	939699	100 %	0 %	0 %	0 %	442556033
19991	NC_020127	A	7	7	939751	939757	100 %	0 %	0 %	0 %	442556033
19992	NC_020127	ACC	2	6	939759	939764	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442556033
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19996	NC_020127	AACT	2	8	940064	940071	50 %	25 %	0 %	25 %	442556034
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19998	NC_020127	CTTTTC	2	12	940138	940149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442556034
19999	NC_020127	CTG	2	6	940150	940155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442556034
20000	NC_020127	ACA	2	6	940191	940196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442556034

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