MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_020127	GA	3	6	656076	656081	50 %	0 %	50 %	0 %	442555809
14002	NC_020127	AAG	2	6	656145	656150	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555809
14003	NC_020127	TAG	2	6	656166	656171	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555809
14004	NC_020127	ATT	2	6	656252	656257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555809
14005	NC_020127	TGG	2	6	656260	656265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555809
14006	NC_020127	GTG	2	6	656268	656273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555809
14007	NC_020127	AAG	2	6	656358	656363	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555809
14008	NC_020127	TAG	2	6	656415	656420	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555809
14009	NC_020127	TGGC	2	8	656439	656446	0 %	25 %	50 %	25 %	442555809
14010	NC_020127	CTT	2	6	656447	656452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555809
14011	NC_020127	GTT	3	9	656597	656605	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555809
14012	NC_020127	TGG	2	6	656611	656616	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555809
14013	NC_020127	CCT	2	6	656622	656627	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555809
14014	NC_020127	AGA	2	6	656641	656646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555809
14015	NC_020127	GAA	2	6	656744	656749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555809
14016	NC_020127	GCT	2	6	656750	656755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555809
14017	NC_020127	TCC	2	6	657059	657064	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555810
14018	NC_020127	CTG	2	6	657067	657072	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555810
14019	NC_020127	TAG	2	6	657109	657114	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555810
14020	NC_020127	TGTGG	2	10	657156	657165	0 %	40 %	60 %	0 %	442555810
14021	NC_020127	TAT	2	6	657200	657205	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555810
14022	NC_020127	AT	3	6	657204	657209	50 %	50 %	0 %	0 %	442555810
14023	NC_020127	ATC	2	6	657229	657234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555810
14024	NC_020127	CAA	2	6	657253	657258	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555810
14025	NC_020127	TTA	2	6	657262	657267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555810
14026	NC_020127	ATT	2	6	657299	657304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555810
14027	NC_020127	TAT	2	6	657305	657310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555810
14028	NC_020127	AATA	2	8	657377	657384	75 %	25 %	0 %	0 %	442555810
14029	NC_020127	CAT	2	6	657390	657395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555810
14030	NC_020127	AGCT	2	8	657508	657515	25 %	25 %	25 %	25 %	442555810
14031	NC_020127	TC	3	6	657527	657532	0 %	50 %	0 %	50 %	442555810
14032	NC_020127	AGC	2	6	657593	657598	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555810
14033	NC_020127	A	6	6	657697	657702	100 %	0 %	0 %	0 %	442555810
14034	NC_020127	ATG	2	6	657715	657720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555810
14035	NC_020127	CTG	2	6	657736	657741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555810
14036	NC_020127	AGA	2	6	657779	657784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555810
14037	NC_020127	TGC	2	6	657833	657838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555810
14038	NC_020127	AGA	2	6	657848	657853	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555810
14039	NC_020127	AGTC	2	8	657872	657879	25 %	25 %	25 %	25 %	442555810
14040	NC_020127	TCA	2	6	657885	657890	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555810
14041	NC_020127	TGG	4	12	657926	657937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555810
14042	NC_020127	CAA	2	6	657958	657963	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555810
14043	NC_020127	A	6	6	658012	658017	100 %	0 %	0 %	0 %	442555810
14044	NC_020127	CAA	2	6	658027	658032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555810
14045	NC_020127	CTAT	2	8	658119	658126	25 %	50 %	0 %	25 %	442555811
14046	NC_020127	AAT	2	6	658183	658188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555811
14047	NC_020127	CAT	3	9	658221	658229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555811
14048	NC_020127	GCAA	2	8	658237	658244	50 %	0 %	25 %	25 %	442555811
14049	NC_020127	ACA	2	6	658255	658260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555811
14050	NC_020127	CAA	2	6	658271	658276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555811
14051	NC_020127	GTAA	2	8	658280	658287	50 %	25 %	25 %	0 %	442555811
14052	NC_020127	A	6	6	658291	658296	100 %	0 %	0 %	0 %	442555811
14053	NC_020127	AAT	3	9	658341	658349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555811
14054	NC_020127	ATT	2	6	658356	658361	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555811
14055	NC_020127	TAG	2	6	658427	658432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555811
14056	NC_020127	TCA	2	6	658435	658440	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555811
14057	NC_020127	CAT	2	6	658478	658483	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555811
14058	NC_020127	TGC	2	6	658506	658511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555811
14059	NC_020127	AT	3	6	658558	658563	50 %	50 %	0 %	0 %	442555811
14060	NC_020127	ATA	2	6	658573	658578	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555811
14061	NC_020127	AAT	2	6	658590	658595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555811
14062	NC_020127	CATT	2	8	658604	658611	25 %	50 %	0 %	25 %	442555811
14063	NC_020127	AGG	2	6	658620	658625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555811
14064	NC_020127	CTG	2	6	658629	658634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555811
14065	NC_020127	ACA	2	6	658666	658671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555811
14066	NC_020127	ATG	2	6	658685	658690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555811
14067	NC_020127	CAT	2	6	658695	658700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555811
14068	NC_020127	CCTAAA	2	12	658729	658740	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	442555811
14069	NC_020127	ATT	2	6	658744	658749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555811
14070	NC_020127	AT	3	6	658768	658773	50 %	50 %	0 %	0 %	442555811
14071	NC_020127	TCA	2	6	658798	658803	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555812
14072	NC_020127	GTT	2	6	658807	658812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555812
14073	NC_020127	AAAG	2	8	658888	658895	75 %	0 %	25 %	0 %	442555812
14074	NC_020127	TGAA	2	8	658905	658912	50 %	25 %	25 %	0 %	442555812
14075	NC_020127	ATGT	2	8	658931	658938	25 %	50 %	25 %	0 %	442555812
14076	NC_020127	ACTC	2	8	658958	658965	25 %	25 %	0 %	50 %	442555812
14077	NC_020127	GTA	2	6	658969	658974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555812
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14079	NC_020127	CGT	2	6	659085	659090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555812
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14083	NC_020127	CATTA	2	10	659295	659304	40 %	40 %	0 %	20 %	442555812
14084	NC_020127	AT	3	6	659325	659330	50 %	50 %	0 %	0 %	442555812
14085	NC_020127	A	6	6	659332	659337	100 %	0 %	0 %	0 %	442555812
14086	NC_020127	T	6	6	659338	659343	0 %	100 %	0 %	0 %	442555812
14087	NC_020127	TCT	2	6	659416	659421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555812
14088	NC_020127	CA	3	6	659451	659456	50 %	0 %	0 %	50 %	442555812
14089	NC_020127	CTA	2	6	659471	659476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555812
14090	NC_020127	A	6	6	659488	659493	100 %	0 %	0 %	0 %	442555812
14091	NC_020127	AT	3	6	659519	659524	50 %	50 %	0 %	0 %	442555812
14092	NC_020127	AAC	2	6	659577	659582	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555812
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14102	NC_020127	TTC	3	9	659940	659948	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555813
14103	NC_020127	CTT	2	6	659981	659986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555813
14104	NC_020127	GTT	2	6	659990	659995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555813
14105	NC_020127	T	6	6	660005	660010	0 %	100 %	0 %	0 %	442555813
14106	NC_020127	T	6	6	660058	660063	0 %	100 %	0 %	0 %	442555813
14107	NC_020127	CT	4	8	660086	660093	0 %	50 %	0 %	50 %	442555813
14108	NC_020127	TAA	2	6	660165	660170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555813
14109	NC_020127	TAA	2	6	660189	660194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555813
14110	NC_020127	TTC	2	6	660267	660272	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555813
14111	NC_020127	TCT	2	6	660286	660291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555813
14112	NC_020127	CAA	2	6	660320	660325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555813
14113	NC_020127	TGT	2	6	660352	660357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555813
14114	NC_020127	AGAA	2	8	660384	660391	75 %	0 %	25 %	0 %	442555813
14115	NC_020127	T	7	7	660450	660456	0 %	100 %	0 %	0 %	442555814
14116	NC_020127	T	6	6	660485	660490	0 %	100 %	0 %	0 %	442555814
14117	NC_020127	CTG	2	6	660501	660506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555814
14118	NC_020127	A	6	6	660508	660513	100 %	0 %	0 %	0 %	442555814
14119	NC_020127	TAT	2	6	660527	660532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555814
14120	NC_020127	CAT	2	6	660542	660547	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555814
14121	NC_020127	GCA	2	6	660550	660555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555814
14122	NC_020127	CAG	2	6	660707	660712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555814
14123	NC_020127	TGC	2	6	660723	660728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555814
14124	NC_020127	ATA	2	6	660748	660753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555814
14125	NC_020127	TAGAA	2	10	660762	660771	60 %	20 %	20 %	0 %	442555814
14126	NC_020127	ATC	2	6	660801	660806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555814
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14128	NC_020127	GCTC	2	8	660862	660869	0 %	25 %	25 %	50 %	442555814
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14144	NC_020127	GTAA	2	8	661537	661544	50 %	25 %	25 %	0 %	442555814
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14152	NC_020127	T	6	6	661947	661952	0 %	100 %	0 %	0 %	442555815
14153	NC_020127	TAAC	2	8	661987	661994	50 %	25 %	0 %	25 %	442555815
14154	NC_020127	T	6	6	662075	662080	0 %	100 %	0 %	0 %	442555815
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14226	NC_020127	TAA	2	6	664960	664965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555820
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14229	NC_020127	A	6	6	665012	665017	100 %	0 %	0 %	0 %	442555820
14230	NC_020127	ATCTAT	2	12	665048	665059	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	442555820
14231	NC_020127	TTG	2	6	665095	665100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555820
14232	NC_020127	GTTCAA	2	12	665110	665121	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	442555820
14233	NC_020127	CTC	2	6	665275	665280	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555821
14234	NC_020127	TCCTTT	2	12	665293	665304	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555821
14235	NC_020127	AT	3	6	665311	665316	50 %	50 %	0 %	0 %	442555821
14236	NC_020127	CTT	3	9	665317	665325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555821
14237	NC_020127	T	6	6	665324	665329	0 %	100 %	0 %	0 %	442555821
14238	NC_020127	T	6	6	665365	665370	0 %	100 %	0 %	0 %	442555821
14239	NC_020127	TCT	3	9	665376	665384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555821
14240	NC_020127	TAA	2	6	665392	665397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555821
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14242	NC_020127	GTT	2	6	665410	665415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555821
14243	NC_020127	TTC	2	6	665435	665440	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555821
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14487	NC_020127	TAC	2	6	681246	681251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555828
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