MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_020127	A	6	6	609552	609557	100 %	0 %	0 %	0 %	442555769
13002	NC_020127	AATA	2	8	609681	609688	75 %	25 %	0 %	0 %	442555770
13003	NC_020127	CT	3	6	609700	609705	0 %	50 %	0 %	50 %	442555770
13004	NC_020127	AT	4	8	609774	609781	50 %	50 %	0 %	0 %	442555770
13005	NC_020127	CTT	2	6	609787	609792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555770
13006	NC_020127	CTG	2	6	609800	609805	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555770
13007	NC_020127	GGA	2	6	609892	609897	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555770
13008	NC_020127	T	6	6	609910	609915	0 %	100 %	0 %	0 %	442555770
13009	NC_020127	GGT	2	6	609949	609954	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555770
13010	NC_020127	ATT	2	6	609991	609996	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555770
13011	NC_020127	ATGG	2	8	610085	610092	25 %	25 %	50 %	0 %	442555770
13012	NC_020127	GCA	2	6	610177	610182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555770
13013	NC_020127	T	6	6	610240	610245	0 %	100 %	0 %	0 %	442555770
13014	NC_020127	TGG	2	6	610254	610259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555770
13015	NC_020127	CTC	2	6	610264	610269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555770
13016	NC_020127	ACA	2	6	610282	610287	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555770
13017	NC_020127	T	6	6	610308	610313	0 %	100 %	0 %	0 %	442555770
13018	NC_020127	GTA	2	6	610339	610344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555770
13019	NC_020127	GGT	2	6	610348	610353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555770
13020	NC_020127	ATT	3	9	610387	610395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555770
13021	NC_020127	CTT	2	6	610402	610407	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555770
13022	NC_020127	T	6	6	610487	610492	0 %	100 %	0 %	0 %	442555770
13023	NC_020127	ATT	2	6	610510	610515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555770
13024	NC_020127	CGA	2	6	610522	610527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555770
13025	NC_020127	AAT	2	6	610533	610538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555770
13026	NC_020127	GAAA	2	8	610545	610552	75 %	0 %	25 %	0 %	442555770
13027	NC_020127	AT	3	6	610595	610600	50 %	50 %	0 %	0 %	442555770
13028	NC_020127	CAA	2	6	610614	610619	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555771
13029	NC_020127	A	7	7	610618	610624	100 %	0 %	0 %	0 %	442555771
13030	NC_020127	TGG	2	6	610667	610672	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555771
13031	NC_020127	AAC	2	6	610686	610691	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555771
13032	NC_020127	TGC	2	6	610721	610726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555771
13033	NC_020127	CAC	2	6	610789	610794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555771
13034	NC_020127	T	8	8	610807	610814	0 %	100 %	0 %	0 %	442555771
13035	NC_020127	TCC	2	6	610838	610843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555771
13036	NC_020127	AAC	2	6	610907	610912	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555771
13037	NC_020127	ACG	2	6	610943	610948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555771
13038	NC_020127	TGG	2	6	610959	610964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555771
13039	NC_020127	GAA	2	6	610998	611003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555771
13040	NC_020127	A	9	9	611002	611010	100 %	0 %	0 %	0 %	442555771
13041	NC_020127	TGA	2	6	611153	611158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555771
13042	NC_020127	CTG	3	9	611161	611169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555771
13043	NC_020127	GAAT	2	8	611170	611177	50 %	25 %	25 %	0 %	442555771
13044	NC_020127	TTA	2	6	611206	611211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555771
13045	NC_020127	TCC	2	6	611242	611247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555771
13046	NC_020127	AT	3	6	611288	611293	50 %	50 %	0 %	0 %	442555771
13047	NC_020127	ATT	2	6	611316	611321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555771
13048	NC_020127	A	6	6	611338	611343	100 %	0 %	0 %	0 %	442555771
13049	NC_020127	GAA	2	6	611385	611390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555771
13050	NC_020127	TAT	2	6	611425	611430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555772
13051	NC_020127	GGT	2	6	611431	611436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555772
13052	NC_020127	AGC	2	6	611518	611523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555772
13053	NC_020127	ATA	2	6	611524	611529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555772
13054	NC_020127	TAA	2	6	611546	611551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555772
13055	NC_020127	GTA	2	6	611564	611569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555772
13056	NC_020127	TA	3	6	611573	611578	50 %	50 %	0 %	0 %	442555772
13057	NC_020127	CAG	2	6	611602	611607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555772
13058	NC_020127	GAAG	2	8	611662	611669	50 %	0 %	50 %	0 %	442555772
13059	NC_020127	TCC	2	6	611675	611680	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555772
13060	NC_020127	TA	3	6	611719	611724	50 %	50 %	0 %	0 %	442555772
13061	NC_020127	AGG	2	6	611808	611813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555772
13062	NC_020127	TGG	2	6	611823	611828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555772
13063	NC_020127	AAC	2	6	611831	611836	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555772
13064	NC_020127	TGCT	2	8	611840	611847	0 %	50 %	25 %	25 %	442555772
13065	NC_020127	CCTT	2	8	611872	611879	0 %	50 %	0 %	50 %	442555772
13066	NC_020127	TGA	2	6	611889	611894	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555772
13067	NC_020127	TTC	2	6	611945	611950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555772
13068	NC_020127	TAG	2	6	611981	611986	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555772
13069	NC_020127	TGC	2	6	612000	612005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555772
13070	NC_020127	TTA	2	6	612076	612081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555772
13071	NC_020127	AAG	2	6	612098	612103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555772
13072	NC_020127	AGG	2	6	612111	612116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555772
13073	NC_020127	TAT	2	6	612437	612442	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555773
13074	NC_020127	ACC	2	6	612449	612454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555773
13075	NC_020127	CTG	2	6	612471	612476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555773
13076	NC_020127	GAA	2	6	612488	612493	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555773
13077	NC_020127	CAA	2	6	612497	612502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555773
13078	NC_020127	AAG	2	6	612519	612524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555773
13079	NC_020127	CTATTG	2	12	612558	612569	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	442555773
13080	NC_020127	ATA	2	6	612578	612583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555773
13081	NC_020127	TTC	2	6	612588	612593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555773
13082	NC_020127	T	7	7	612602	612608	0 %	100 %	0 %	0 %	442555773
13083	NC_020127	TAG	2	6	612615	612620	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555773
13084	NC_020127	TTTC	2	8	612644	612651	0 %	75 %	0 %	25 %	442555773
13085	NC_020127	GAAT	2	8	612672	612679	50 %	25 %	25 %	0 %	442555773
13086	NC_020127	ACA	2	6	612704	612709	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555773
13087	NC_020127	AGC	2	6	612712	612717	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555773
13088	NC_020127	CT	3	6	612810	612815	0 %	50 %	0 %	50 %	442555773
13089	NC_020127	CCT	2	6	612823	612828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555773
13090	NC_020127	TAG	2	6	612870	612875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555773
13091	NC_020127	GGA	2	6	612923	612928	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555773
13092	NC_020127	CTG	2	6	613011	613016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555773
13093	NC_020127	GCT	2	6	613064	613069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555773
13094	NC_020127	AGC	2	6	613117	613122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555773
13095	NC_020127	ATTT	2	8	613124	613131	25 %	75 %	0 %	0 %	442555773
13096	NC_020127	CAAT	2	8	613145	613152	50 %	25 %	0 %	25 %	442555773
13097	NC_020127	ATG	3	9	613154	613162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555773
13098	NC_020127	TGG	2	6	613177	613182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555773
13099	NC_020127	TAT	2	6	613189	613194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555773
13100	NC_020127	TAT	2	6	613201	613206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555773
13101	NC_020127	CAA	2	6	613338	613343	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555773
13102	NC_020127	TAT	2	6	613369	613374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555773
13103	NC_020127	TTA	2	6	613379	613384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555773
13104	NC_020127	ATT	2	6	613417	613422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555773
13105	NC_020127	GTA	2	6	613470	613475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555773
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13107	NC_020127	TGCT	2	8	613635	613642	0 %	50 %	25 %	25 %	442555773
13108	NC_020127	TGG	2	6	613696	613701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555773
13109	NC_020127	GTAC	2	8	613733	613740	25 %	25 %	25 %	25 %	442555773
13110	NC_020127	ACA	2	6	613772	613777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555773
13111	NC_020127	GAA	2	6	613850	613855	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555773
13112	NC_020127	AGG	2	6	613930	613935	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555773
13113	NC_020127	ACT	2	6	613936	613941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555773
13114	NC_020127	ATG	2	6	613967	613972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555773
13115	NC_020127	GTT	3	9	613997	614005	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555773
13116	NC_020127	CGT	2	6	614012	614017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555773
13117	NC_020127	CTG	2	6	614073	614078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555773
13118	NC_020127	AGC	2	6	614095	614100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555773
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