MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11501	NC_020127	TAT	2	6	535668	535673	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555712
11502	NC_020127	TGT	2	6	535716	535721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555712
11503	NC_020127	AT	3	6	535725	535730	50 %	50 %	0 %	0 %	442555712
11504	NC_020127	GA	3	6	535741	535746	50 %	0 %	50 %	0 %	442555712
11505	NC_020127	A	6	6	535766	535771	100 %	0 %	0 %	0 %	442555712
11506	NC_020127	GAT	2	6	535858	535863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555712
11507	NC_020127	CAA	2	6	535913	535918	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555712
11508	NC_020127	ATG	2	6	535949	535954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555712
11509	NC_020127	GT	3	6	535955	535960	0 %	50 %	50 %	0 %	442555712
11510	NC_020127	GCT	2	6	535994	535999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11511	NC_020127	TAC	2	6	536070	536075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555712
11512	NC_020127	GCT	2	6	536095	536100	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11513	NC_020127	TGCAGC	2	12	536115	536126	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11514	NC_020127	TGC	2	6	536133	536138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11515	NC_020127	GAA	3	9	536185	536193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555712
11516	NC_020127	TCA	2	6	536223	536228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555712
11517	NC_020127	ATA	2	6	536237	536242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555712
11518	NC_020127	TGT	2	6	536257	536262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555712
11519	NC_020127	CTG	2	6	536270	536275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11520	NC_020127	A	6	6	536279	536284	100 %	0 %	0 %	0 %	442555712
11521	NC_020127	TAC	2	6	536292	536297	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555712
11522	NC_020127	CTG	2	6	536301	536306	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11523	NC_020127	ACT	2	6	536347	536352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555712
11524	NC_020127	TAA	2	6	536359	536364	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555712
11525	NC_020127	TTG	3	9	536431	536439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555713
11526	NC_020127	TCA	2	6	536490	536495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555713
11527	NC_020127	AAT	2	6	536498	536503	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555713
11528	NC_020127	TCA	2	6	536517	536522	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555713
11529	NC_020127	ATT	2	6	536547	536552	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555713
11530	NC_020127	TA	3	6	536636	536641	50 %	50 %	0 %	0 %	442555713
11531	NC_020127	ATG	2	6	536700	536705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555713
11532	NC_020127	GATTG	2	10	536763	536772	20 %	40 %	40 %	0 %	442555713
11533	NC_020127	GCA	2	6	536784	536789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555713
11534	NC_020127	A	6	6	536802	536807	100 %	0 %	0 %	0 %	442555713
11535	NC_020127	TCT	2	6	536832	536837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555713
11536	NC_020127	TCT	2	6	536847	536852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555713
11537	NC_020127	A	6	6	536874	536879	100 %	0 %	0 %	0 %	442555713
11538	NC_020127	ATT	2	6	536892	536897	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555713
11539	NC_020127	CCA	2	6	536958	536963	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555713
11540	NC_020127	TGG	2	6	537044	537049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555713
11541	NC_020127	GGT	2	6	537078	537083	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555713
11542	NC_020127	GGT	2	6	537114	537119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555713
11543	NC_020127	TAT	2	6	537161	537166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555713
11544	NC_020127	ATCT	2	8	537268	537275	25 %	50 %	0 %	25 %	442555713
11545	NC_020127	TGG	2	6	537287	537292	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555713
11546	NC_020127	CAA	2	6	537298	537303	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555713
11547	NC_020127	TAT	2	6	537350	537355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555713
11548	NC_020127	AGA	2	6	537398	537403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555713
11549	NC_020127	GAA	2	6	537414	537419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555713
11550	NC_020127	TCAT	2	8	537425	537432	25 %	50 %	0 %	25 %	442555713
11551	NC_020127	ATG	2	6	537597	537602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555713
11552	NC_020127	AG	3	6	537646	537651	50 %	0 %	50 %	0 %	442555713
11553	NC_020127	TGA	2	6	537671	537676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555713
11554	NC_020127	CA	3	6	537704	537709	50 %	0 %	0 %	50 %	442555713
11555	NC_020127	TAT	2	6	537731	537736	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555713
11556	NC_020127	GCT	2	6	537762	537767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555713
11557	NC_020127	T	6	6	537783	537788	0 %	100 %	0 %	0 %	442555713
11558	NC_020127	TAC	2	6	537836	537841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555713
11559	NC_020127	AAG	2	6	537868	537873	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555713
11560	NC_020127	GTT	2	6	537924	537929	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555713
11561	NC_020127	CTA	2	6	537970	537975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555713
11562	NC_020127	TGC	2	6	537983	537988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555713
11563	NC_020127	AGC	2	6	538025	538030	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555713
11564	NC_020127	ATT	2	6	538125	538130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555713
11565	NC_020127	ATA	2	6	538184	538189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555713
11566	NC_020127	TAT	2	6	538290	538295	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555714
11567	NC_020127	GAA	2	6	538297	538302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555714
11568	NC_020127	CCA	3	9	538306	538314	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555714
11569	NC_020127	AT	3	6	538326	538331	50 %	50 %	0 %	0 %	442555714
11570	NC_020127	TCTT	2	8	538451	538458	0 %	75 %	0 %	25 %	442555714
11571	NC_020127	AT	3	6	538464	538469	50 %	50 %	0 %	0 %	442555714
11572	NC_020127	TTAT	2	8	538526	538533	25 %	75 %	0 %	0 %	442555714
11573	NC_020127	TAA	2	6	538545	538550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555714
11574	NC_020127	TGG	2	6	538594	538599	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555714
11575	NC_020127	TATT	2	8	538627	538634	25 %	75 %	0 %	0 %	442555714
11576	NC_020127	TTC	2	6	538714	538719	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555714
11577	NC_020127	GGAATG	2	12	538732	538743	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	442555714
11578	NC_020127	TGG	2	6	538815	538820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555714
11579	NC_020127	TAT	2	6	538866	538871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555714
11580	NC_020127	GAA	2	6	538909	538914	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555714
11581	NC_020127	ACA	2	6	538927	538932	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555714
11582	NC_020127	TAGT	2	8	538934	538941	25 %	50 %	25 %	0 %	442555714
11583	NC_020127	AAC	2	6	538979	538984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555714
11584	NC_020127	TAT	2	6	539009	539014	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555715
11585	NC_020127	ATA	2	6	539104	539109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555715
11586	NC_020127	ATT	2	6	539144	539149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555715
11587	NC_020127	AGAT	2	8	539168	539175	50 %	25 %	25 %	0 %	442555715
11588	NC_020127	CCA	2	6	539208	539213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555715
11589	NC_020127	ATT	2	6	539220	539225	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555715
11590	NC_020127	CTTAC	2	10	539251	539260	20 %	40 %	0 %	40 %	442555715
11591	NC_020127	ATT	2	6	539301	539306	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555715
11592	NC_020127	AGCC	2	8	539312	539319	25 %	0 %	25 %	50 %	442555715
11593	NC_020127	CCAA	2	8	539360	539367	50 %	0 %	0 %	50 %	442555715
11594	NC_020127	CAG	2	6	539476	539481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555715
11595	NC_020127	A	7	7	539486	539492	100 %	0 %	0 %	0 %	442555715
11596	NC_020127	AGC	2	6	539501	539506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555715
11597	NC_020127	AAG	2	6	540354	540359	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555716
11598	NC_020127	ATT	2	6	540438	540443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555716
11599	NC_020127	A	8	8	540462	540469	100 %	0 %	0 %	0 %	442555716
11600	NC_020127	AATA	2	8	540482	540489	75 %	25 %	0 %	0 %	442555716
11601	NC_020127	TTA	2	6	540592	540597	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555716
11602	NC_020127	A	6	6	540684	540689	100 %	0 %	0 %	0 %	442555716
11603	NC_020127	CTT	2	6	540722	540727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555717
11604	NC_020127	GTG	2	6	540740	540745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555717
11605	NC_020127	AT	3	6	540760	540765	50 %	50 %	0 %	0 %	442555717
11606	NC_020127	A	7	7	540843	540849	100 %	0 %	0 %	0 %	442555717
11607	NC_020127	CAAAA	2	10	540890	540899	80 %	0 %	0 %	20 %	442555717
11608	NC_020127	A	6	6	540896	540901	100 %	0 %	0 %	0 %	442555717
11609	NC_020127	ATT	2	6	540915	540920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555717
11610	NC_020127	ATA	2	6	540956	540961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555717
11611	NC_020127	TGG	2	6	540982	540987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555717
11612	NC_020127	A	7	7	541144	541150	100 %	0 %	0 %	0 %	442555717
11613	NC_020127	CAA	2	6	541193	541198	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555717
11614	NC_020127	TTG	2	6	541262	541267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555717
11615	NC_020127	ATT	2	6	541299	541304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555717
11616	NC_020127	AGA	2	6	541362	541367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555717
11617	NC_020127	ACT	2	6	541445	541450	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555717
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11619	NC_020127	ATT	2	6	541591	541596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555717
11620	NC_020127	CT	3	6	541645	541650	0 %	50 %	0 %	50 %	442555717
11621	NC_020127	GAA	2	6	541666	541671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555717
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11983	NC_020127	TAC	2	6	558030	558035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555735
11984	NC_020127	TCC	2	6	558057	558062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555735
11985	NC_020127	GAA	2	6	558086	558091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555735
11986	NC_020127	AT	3	6	558154	558159	50 %	50 %	0 %	0 %	442555735
11987	NC_020127	TAA	2	6	558186	558191	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555735
11988	NC_020127	ATCT	2	8	558200	558207	25 %	50 %	0 %	25 %	442555735
11989	NC_020127	T	8	8	558236	558243	0 %	100 %	0 %	0 %	442555735
11990	NC_020127	ATC	2	6	558246	558251	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555735
11991	NC_020127	TAA	2	6	558278	558283	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555735
11992	NC_020127	TACA	2	8	558333	558340	50 %	25 %	0 %	25 %	442555735
11993	NC_020127	CTT	2	6	558386	558391	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555735
11994	NC_020127	AGC	2	6	558486	558491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555735
11995	NC_020127	A	7	7	558519	558525	100 %	0 %	0 %	0 %	442555735
11996	NC_020127	ACCA	2	8	558569	558576	50 %	0 %	0 %	50 %	442555735
11997	NC_020127	TCT	2	6	558619	558624	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555735
11998	NC_020127	ATC	2	6	558771	558776	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555735
11999	NC_020127	AAT	2	6	558783	558788	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555735
12000	NC_020127	ATC	2	6	558810	558815	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555735

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