MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lawsonia intracellularis N343

Total Repeats: 31162

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_020127	CTAC	2	8	510244	510251	25 %	25 %	0 %	50 %	442555692
11002	NC_020127	GT	3	6	510277	510282	0 %	50 %	50 %	0 %	442555692
11003	NC_020127	TACAA	2	10	510300	510309	60 %	20 %	0 %	20 %	442555692
11004	NC_020127	CAA	2	6	510317	510322	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555692
11005	NC_020127	CCAT	2	8	510352	510359	25 %	25 %	0 %	50 %	442555692
11006	NC_020127	TCC	2	6	510495	510500	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555692
11007	NC_020127	ATA	2	6	510505	510510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555692
11008	NC_020127	CAT	2	6	510516	510521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555692
11009	NC_020127	CTG	2	6	510593	510598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555692
11010	NC_020127	ATA	2	6	510634	510639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555692
11011	NC_020127	AAT	2	6	510648	510653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555692
11012	NC_020127	CTT	2	6	510778	510783	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555693
11013	NC_020127	TGG	2	6	510818	510823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555693
11014	NC_020127	ATA	2	6	510827	510832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555693
11015	NC_020127	CAT	2	6	510855	510860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555693
11016	NC_020127	TAG	2	6	510882	510887	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555693
11017	NC_020127	TTG	2	6	510907	510912	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555693
11018	NC_020127	ATC	2	6	511019	511024	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555693
11019	NC_020127	CCA	2	6	511034	511039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555693
11020	NC_020127	TTGA	2	8	511057	511064	25 %	50 %	25 %	0 %	442555693
11021	NC_020127	TCC	2	6	511070	511075	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555693
11022	NC_020127	ACC	2	6	511078	511083	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555693
11023	NC_020127	ACA	2	6	511134	511139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555693
11024	NC_020127	TAT	2	6	511150	511155	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555693
11025	NC_020127	CAC	2	6	511236	511241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555693
11026	NC_020127	AAGTA	2	10	511291	511300	60 %	20 %	20 %	0 %	442555693
11027	NC_020127	TTA	2	6	511371	511376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555693
11028	NC_020127	T	6	6	511486	511491	0 %	100 %	0 %	0 %	442555694
11029	NC_020127	T	6	6	511548	511553	0 %	100 %	0 %	0 %	442555694
11030	NC_020127	TG	3	6	511686	511691	0 %	50 %	50 %	0 %	442555694
11031	NC_020127	AT	3	6	511744	511749	50 %	50 %	0 %	0 %	442555694
11032	NC_020127	CT	3	6	511792	511797	0 %	50 %	0 %	50 %	442555694
11033	NC_020127	CAA	2	6	511818	511823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555694
11034	NC_020127	GCT	2	6	511844	511849	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555694
11035	NC_020127	CAT	2	6	511855	511860	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555694
11036	NC_020127	ATA	2	6	511899	511904	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555694
11037	NC_020127	TAA	2	6	511927	511932	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555694
11038	NC_020127	ATC	2	6	511993	511998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555694
11039	NC_020127	AAGG	2	8	512061	512068	50 %	0 %	50 %	0 %	442555694
11040	NC_020127	TGA	2	6	512132	512137	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555694
11041	NC_020127	TTGT	2	8	512154	512161	0 %	75 %	25 %	0 %	442555694
11042	NC_020127	ATGT	2	8	512277	512284	25 %	50 %	25 %	0 %	442555694
11043	NC_020127	ACA	2	6	512306	512311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555694
11044	NC_020127	TTA	3	9	512330	512338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555694
11045	NC_020127	TAA	2	6	512343	512348	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555694
11046	NC_020127	AGA	2	6	512385	512390	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555694
11047	NC_020127	TTC	2	6	512396	512401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555694
11048	NC_020127	TTA	3	9	514082	514090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555695
11049	NC_020127	TTA	2	6	514118	514123	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555695
11050	NC_020127	T	7	7	514124	514130	0 %	100 %	0 %	0 %	442555695
11051	NC_020127	TACAT	2	10	514137	514146	40 %	40 %	0 %	20 %	442555695
11052	NC_020127	TTA	2	6	514184	514189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555695
11053	NC_020127	TCTAC	2	10	514222	514231	20 %	40 %	0 %	40 %	442555695
11054	NC_020127	A	8	8	514295	514302	100 %	0 %	0 %	0 %	442555695
11055	NC_020127	ACAA	2	8	514305	514312	75 %	0 %	0 %	25 %	442555695
11056	NC_020127	TTA	2	6	514340	514345	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555695
11057	NC_020127	CTG	2	6	514376	514381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555695
11058	NC_020127	AAAG	2	8	514437	514444	75 %	0 %	25 %	0 %	442555695
11059	NC_020127	AGA	2	6	514461	514466	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555695
11060	NC_020127	TTA	2	6	514493	514498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555695
11061	NC_020127	TTA	2	6	514556	514561	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555695
11062	NC_020127	A	6	6	514641	514646	100 %	0 %	0 %	0 %	442555695
11063	NC_020127	TA	3	6	514650	514655	50 %	50 %	0 %	0 %	442555695
11064	NC_020127	T	6	6	514657	514662	0 %	100 %	0 %	0 %	442555695
11065	NC_020127	TC	3	6	514691	514696	0 %	50 %	0 %	50 %	442555695
11066	NC_020127	CAT	2	6	514717	514722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555695
11067	NC_020127	A	6	6	514723	514728	100 %	0 %	0 %	0 %	442555695
11068	NC_020127	CAA	2	6	514735	514740	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555695
11069	NC_020127	ACATA	2	10	514752	514761	60 %	20 %	0 %	20 %	442555695
11070	NC_020127	AAC	2	6	514772	514777	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555695
11071	NC_020127	AG	3	6	514783	514788	50 %	0 %	50 %	0 %	442555695
11072	NC_020127	TCT	2	6	514792	514797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555695
11073	NC_020127	AAC	2	6	514818	514823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	442555695
11074	NC_020127	TGG	2	6	514902	514907	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555695
11075	NC_020127	CTT	2	6	514916	514921	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555695
11076	NC_020127	TCT	2	6	515008	515013	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555696
11077	NC_020127	ATC	2	6	515024	515029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555696
11078	NC_020127	AAG	2	6	515057	515062	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555696
11079	NC_020127	TCC	2	6	515066	515071	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555696
11080	NC_020127	TCA	2	6	515118	515123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555696
11081	NC_020127	CTG	2	6	515140	515145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555696
11082	NC_020127	TAT	2	6	515189	515194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555696
11083	NC_020127	TTC	2	6	515288	515293	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555696
11084	NC_020127	ATC	2	6	515327	515332	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555696
11085	NC_020127	TAT	2	6	515351	515356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555696
11086	NC_020127	ACC	2	6	515357	515362	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	442555696
11087	NC_020127	ATC	2	6	515414	515419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555696
11088	NC_020127	TGT	2	6	515429	515434	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555696
11089	NC_020127	T	6	6	515499	515504	0 %	100 %	0 %	0 %	442555696
11090	NC_020127	A	6	6	515529	515534	100 %	0 %	0 %	0 %	442555696
11091	NC_020127	T	7	7	515564	515570	0 %	100 %	0 %	0 %	442555696
11092	NC_020127	CTT	2	6	515572	515577	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555696
11093	NC_020127	ATC	2	6	515580	515585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555696
11094	NC_020127	GACA	2	8	515587	515594	50 %	0 %	25 %	25 %	442555696
11095	NC_020127	AGC	2	6	515627	515632	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555696
11096	NC_020127	TAC	2	6	515650	515655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555696
11097	NC_020127	T	7	7	515669	515675	0 %	100 %	0 %	0 %	442555696
11098	NC_020127	TTA	2	6	515814	515819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555696
11099	NC_020127	TA	3	6	515854	515859	50 %	50 %	0 %	0 %	442555696
11100	NC_020127	TTTGC	2	10	515887	515896	0 %	60 %	20 %	20 %	442555696
11101	NC_020127	ATA	2	6	515922	515927	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555696
11102	NC_020127	AT	4	8	515978	515985	50 %	50 %	0 %	0 %	442555697
11103	NC_020127	A	7	7	516002	516008	100 %	0 %	0 %	0 %	442555697
11104	NC_020127	TCAT	2	8	516025	516032	25 %	50 %	0 %	25 %	442555697
11105	NC_020127	A	6	6	516042	516047	100 %	0 %	0 %	0 %	442555697
11106	NC_020127	TTA	2	6	516103	516108	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555697
11107	NC_020127	TGC	2	6	516110	516115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555697
11108	NC_020127	GTA	2	6	516127	516132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555697
11109	NC_020127	CTT	2	6	516162	516167	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555697
11110	NC_020127	AAT	2	6	516174	516179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555697
11111	NC_020127	ACT	2	6	516201	516206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555697
11112	NC_020127	CAAA	2	8	516258	516265	75 %	0 %	0 %	25 %	442555697
11113	NC_020127	TAT	2	6	516274	516279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555697
11114	NC_020127	ATT	2	6	516284	516289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555697
11115	NC_020127	T	6	6	516324	516329	0 %	100 %	0 %	0 %	442555697
11116	NC_020127	T	7	7	516364	516370	0 %	100 %	0 %	0 %	442555697
11117	NC_020127	CTT	2	6	516384	516389	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	442555697
11118	NC_020127	TTA	2	6	516392	516397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	442555697
11119	NC_020127	AAT	2	6	516402	516407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	442555697
11120	NC_020127	ATC	2	6	516419	516424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555697
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11122	NC_020127	GAT	2	6	516444	516449	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	442555697
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11240	NC_020127	A	6	6	520820	520825	100 %	0 %	0 %	0 %	442555702
11241	NC_020127	TAC	2	6	520906	520911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555702
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11243	NC_020127	TA	4	8	520964	520971	50 %	50 %	0 %	0 %	442555702
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11246	NC_020127	GGA	2	6	522671	522676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	442555703
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11361	NC_020127	GCAA	2	8	527793	527800	50 %	0 %	25 %	25 %	442555708
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11365	NC_020127	AG	3	6	527893	527898	50 %	0 %	50 %	0 %	442555708
11366	NC_020127	TAAAA	2	10	527906	527915	80 %	20 %	0 %	0 %	442555708
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11489	NC_020127	GTC	2	6	535157	535162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11490	NC_020127	TTTA	2	8	535196	535203	25 %	75 %	0 %	0 %	442555712
11491	NC_020127	TGT	2	6	535266	535271	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555712
11492	NC_020127	GTT	2	6	535295	535300	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555712
11493	NC_020127	GCA	2	6	535393	535398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11494	NC_020127	GAA	2	6	535423	535428	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555712
11495	NC_020127	CTC	2	6	535478	535483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	442555712
11496	NC_020127	AAG	2	6	535511	535516	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	442555712
11497	NC_020127	GTG	2	6	535544	535549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	442555712
11498	NC_020127	TTG	2	6	535572	535577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	442555712
11499	NC_020127	GCT	2	6	535609	535614	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	442555712
11500	NC_020127	ATCCTA	2	12	535616	535627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	442555712

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