MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptolyngbya sp. PCC 7376 chromosome

Total Repeats: 81277

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
23001	NC_019683	ACTTTG	2	12	1464295	1464306	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427723209
23002	NC_019683	TCA	2	6	1464307	1464312	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723209
23003	NC_019683	CAA	2	6	1464618	1464623	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427723210
23004	NC_019683	CAC	2	6	1464639	1464644	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427723210
23005	NC_019683	ACT	2	6	1464724	1464729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723210
23006	NC_019683	TCT	3	9	1464788	1464796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723210
23007	NC_019683	AGT	2	6	1464814	1464819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723210
23008	NC_019683	TAG	2	6	1464828	1464833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723210
23009	NC_019683	TCA	2	6	1464944	1464949	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723210
23010	NC_019683	CCA	2	6	1465013	1465018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427723210
23011	NC_019683	GCA	2	6	1465079	1465084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723210
23012	NC_019683	ACCAAG	2	12	1465120	1465131	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	427723210
23013	NC_019683	GTA	2	6	1465168	1465173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723210
23014	NC_019683	GCTT	2	8	1465205	1465212	0 %	50 %	25 %	25 %	427723210
23015	NC_019683	ATA	2	6	1465283	1465288	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723210
23016	NC_019683	GAA	2	6	1465353	1465358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723210
23017	NC_019683	GTA	2	6	1465363	1465368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723210
23018	NC_019683	GGT	2	6	1465648	1465653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427723211
23019	NC_019683	ATG	2	6	1465681	1465686	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723211
23020	NC_019683	ATT	2	6	1465708	1465713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723211
23021	NC_019683	GTT	2	6	1465786	1465791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427723211
23022	NC_019683	TTA	2	6	1465820	1465825	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723211
23023	NC_019683	TCT	2	6	1466128	1466133	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723211
23024	NC_019683	TG	3	6	1466198	1466203	0 %	50 %	50 %	0 %	427723211
23025	NC_019683	AGA	2	6	1466211	1466216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723211
23026	NC_019683	AC	3	6	1466246	1466251	50 %	0 %	0 %	50 %	427723211
23027	NC_019683	TTGA	2	8	1466335	1466342	25 %	50 %	25 %	0 %	427723211
23028	NC_019683	GAA	2	6	1466527	1466532	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723211
23029	NC_019683	TC	3	6	1466567	1466572	0 %	50 %	0 %	50 %	427723211
23030	NC_019683	CAA	2	6	1466660	1466665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427723211
23031	NC_019683	ATCT	2	8	1466688	1466695	25 %	50 %	0 %	25 %	427723211
23032	NC_019683	GAC	2	6	1466725	1466730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723211
23033	NC_019683	CTAC	2	8	1466776	1466783	25 %	25 %	0 %	50 %	427723211
23034	NC_019683	ACAA	2	8	1466800	1466807	75 %	0 %	0 %	25 %	427723211
23035	NC_019683	TGAT	2	8	1467652	1467659	25 %	50 %	25 %	0 %	427723212
23036	NC_019683	A	6	6	1467772	1467777	100 %	0 %	0 %	0 %	427723212
23037	NC_019683	T	7	7	1467785	1467791	0 %	100 %	0 %	0 %	427723212
23038	NC_019683	A	6	6	1467827	1467832	100 %	0 %	0 %	0 %	427723212
23039	NC_019683	AGA	2	6	1467912	1467917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723212
23040	NC_019683	A	6	6	1468044	1468049	100 %	0 %	0 %	0 %	427723212
23041	NC_019683	CAT	2	6	1468064	1468069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723212
23042	NC_019683	ATCAG	3	15	1468083	1468097	40 %	20 %	20 %	20 %	427723212
23043	NC_019683	ATT	2	6	1468117	1468122	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723212
23044	NC_019683	TCT	2	6	1468187	1468192	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723213
23045	NC_019683	AAT	2	6	1468215	1468220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723213
23046	NC_019683	CTG	2	6	1468341	1468346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723213
23047	NC_019683	CTGG	2	8	1468428	1468435	0 %	25 %	50 %	25 %	427723213
23048	NC_019683	CTT	2	6	1468439	1468444	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723213
23049	NC_019683	AAC	2	6	1468467	1468472	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427723213
23050	NC_019683	CAG	2	6	1468511	1468516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723213
23051	NC_019683	AAG	2	6	1468558	1468563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723213
23052	NC_019683	GTT	2	6	1468565	1468570	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427723213
23053	NC_019683	GAC	2	6	1468601	1468606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723213
23054	NC_019683	TTC	3	9	1468608	1468616	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723213
23055	NC_019683	TGA	2	6	1468645	1468650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723213
23056	NC_019683	TCA	2	6	1468721	1468726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723213
23057	NC_019683	TTA	2	6	1468753	1468758	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723213
23058	NC_019683	TCATTT	2	12	1468807	1468818	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	427723213
23059	NC_019683	TCT	2	6	1468819	1468824	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723213
23060	NC_019683	TGT	2	6	1468841	1468846	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427723213
23061	NC_019683	TGT	2	6	1468897	1468902	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427723213
23062	NC_019683	T	6	6	1469014	1469019	0 %	100 %	0 %	0 %	427723213
23063	NC_019683	TCA	2	6	1469053	1469058	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723213
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23070	NC_019683	ACG	2	6	1469364	1469369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723213
23071	NC_019683	CAT	2	6	1469376	1469381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723213
23072	NC_019683	TCA	2	6	1469404	1469409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723213
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23074	NC_019683	GCC	2	6	1469512	1469517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427723213
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23076	NC_019683	TCCAAG	2	12	1469696	1469707	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	427723213
23077	NC_019683	TTG	2	6	1469725	1469730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427723213
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23083	NC_019683	ACC	2	6	1469952	1469957	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427723213
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23085	NC_019683	ATC	2	6	1470048	1470053	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723213
23086	NC_019683	T	7	7	1470077	1470083	0 %	100 %	0 %	0 %	427723213
23087	NC_019683	GAT	2	6	1470084	1470089	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723213
23088	NC_019683	TCA	2	6	1470106	1470111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723213
23089	NC_019683	CTT	2	6	1470255	1470260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723213
23090	NC_019683	TGG	2	6	1470298	1470303	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427723213
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23092	NC_019683	TGT	2	6	1470409	1470414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427723213
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23098	NC_019683	TCT	2	6	1470912	1470917	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723214
23099	NC_019683	TTC	2	6	1470959	1470964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	427723214
23100	NC_019683	CT	3	6	1471521	1471526	0 %	50 %	0 %	50 %	427723215
23101	NC_019683	TGA	2	6	1471543	1471548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723215
23102	NC_019683	AGC	2	6	1471614	1471619	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723215
23103	NC_019683	CAAC	2	8	1471621	1471628	50 %	0 %	0 %	50 %	427723215
23104	NC_019683	TGG	2	6	1471750	1471755	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427723215
23105	NC_019683	AACTAA	2	12	1471806	1471817	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	427723215
23106	NC_019683	GCA	2	6	1471863	1471868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723215
23107	NC_019683	TGAA	2	8	1471971	1471978	50 %	25 %	25 %	0 %	427723215
23108	NC_019683	CAA	2	6	1472046	1472051	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427723215
23109	NC_019683	ACAA	2	8	1472065	1472072	75 %	0 %	0 %	25 %	427723215
23110	NC_019683	ATA	2	6	1472100	1472105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723215
23111	NC_019683	AGCA	2	8	1472133	1472140	50 %	0 %	25 %	25 %	427723215
23112	NC_019683	GCT	2	6	1472159	1472164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723215
23113	NC_019683	CTA	2	6	1472178	1472183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723215
23114	NC_019683	CCTGTG	2	12	1472222	1472233	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723215
23115	NC_019683	TGATTC	2	12	1472257	1472268	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	427723215
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23231	NC_019683	GTC	2	6	1479753	1479758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723222
23232	NC_019683	GTC	2	6	1479771	1479776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723222
23233	NC_019683	ATG	2	6	1479870	1479875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723222
23234	NC_019683	ATA	2	6	1479876	1479881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723222
23235	NC_019683	TAG	2	6	1479898	1479903	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723222
23236	NC_019683	AAGA	2	8	1480037	1480044	75 %	0 %	25 %	0 %	427723222
23237	NC_019683	GAA	3	9	1480063	1480071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723222
23238	NC_019683	AAT	3	9	1480124	1480132	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723222
23239	NC_019683	TGA	2	6	1480147	1480152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723222
23240	NC_019683	TCG	2	6	1480171	1480176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723222
23241	NC_019683	TAA	2	6	1480246	1480251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723222
23242	NC_019683	AGA	2	6	1480282	1480287	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723222
23243	NC_019683	CCAACT	4	24	1480289	1480312	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	427723222
23244	NC_019683	ACC	2	6	1480363	1480368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427723222
23245	NC_019683	AGA	2	6	1480381	1480386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723222
23246	NC_019683	CCAACA	5	30	1480388	1480417	50 %	0 %	0 %	50 %	427723222
23247	NC_019683	CCTGCA	2	12	1480418	1480429	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	427723222
23248	NC_019683	CGGCTC	2	12	1480467	1480478	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	427723222
23249	NC_019683	GCACCC	2	12	1480505	1480516	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	427723222
23250	NC_019683	CAC	2	6	1480551	1480556	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427723222
23251	NC_019683	A	6	6	1480568	1480573	100 %	0 %	0 %	0 %	427723222
23252	NC_019683	CTG	2	6	1480578	1480583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723222
23253	NC_019683	TGG	2	6	1480588	1480593	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427723222
23254	NC_019683	ATA	2	6	1480671	1480676	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723223
23255	NC_019683	GCG	2	6	1480731	1480736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427723223
23256	NC_019683	TAC	2	6	1480766	1480771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723223
23257	NC_019683	GCG	2	6	1480775	1480780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	427723223
23258	NC_019683	GAG	2	6	1480821	1480826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427723223
23259	NC_019683	AGC	2	6	1480855	1480860	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723223
23260	NC_019683	TGG	2	6	1480956	1480961	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427723223
23261	NC_019683	CGC	2	6	1480978	1480983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427723223
23262	NC_019683	AAT	2	6	1480984	1480989	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723223
23263	NC_019683	TAA	2	6	1481004	1481009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723223
23264	NC_019683	ATC	2	6	1481040	1481045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723223
23265	NC_019683	ATC	2	6	1481073	1481078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723223
23266	NC_019683	TTTG	2	8	1481135	1481142	0 %	75 %	25 %	0 %	427723223
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23269	NC_019683	GTA	2	6	1481442	1481447	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723224
23270	NC_019683	CGA	2	6	1481484	1481489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723224
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23272	NC_019683	GAT	2	6	1481674	1481679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723224
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23284	NC_019683	TGC	3	9	1482236	1482244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723224
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23300	NC_019683	CA	3	6	1483597	1483602	50 %	0 %	0 %	50 %	427723226
23301	NC_019683	GTTT	2	8	1483645	1483652	0 %	75 %	25 %	0 %	427723226
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23331	NC_019683	TTA	2	6	1486704	1486709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723230
23332	NC_019683	GCTC	2	8	1486744	1486751	0 %	25 %	25 %	50 %	427723230
23333	NC_019683	ATT	2	6	1486755	1486760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723230
23334	NC_019683	TCG	2	6	1486766	1486771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723230
23335	NC_019683	A	6	6	1487053	1487058	100 %	0 %	0 %	0 %	427723230
23336	NC_019683	TATGG	2	10	1487073	1487082	20 %	40 %	40 %	0 %	427723230
23337	NC_019683	CGA	2	6	1487134	1487139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723230
23338	NC_019683	A	6	6	1487222	1487227	100 %	0 %	0 %	0 %	427723230
23339	NC_019683	GAA	2	6	1487307	1487312	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723230
23340	NC_019683	CTG	2	6	1487446	1487451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723230
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23342	NC_019683	ACA	2	6	1487881	1487886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	427723231
23343	NC_019683	A	6	6	1487965	1487970	100 %	0 %	0 %	0 %	427723231
23344	NC_019683	T	7	7	1488011	1488017	0 %	100 %	0 %	0 %	427723231
23345	NC_019683	TGC	2	6	1488037	1488042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723231
23346	NC_019683	TTG	2	6	1488099	1488104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427723231
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23463	NC_019683	CGC	2	6	1494834	1494839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	427723235
23464	NC_019683	CAC	2	6	1494881	1494886	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427723235
23465	NC_019683	AC	3	6	1494949	1494954	50 %	0 %	0 %	50 %	427723235
23466	NC_019683	TGAG	2	8	1495094	1495101	25 %	25 %	50 %	0 %	427723236
23467	NC_019683	TGC	2	6	1495122	1495127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723236
23468	NC_019683	TAC	2	6	1495141	1495146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723236
23469	NC_019683	CCAACT	2	12	1495149	1495160	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	427723236
23470	NC_019683	AACA	2	8	1495175	1495182	75 %	0 %	0 %	25 %	427723236
23471	NC_019683	TGG	2	6	1495239	1495244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427723236
23472	NC_019683	GATT	2	8	1495293	1495300	25 %	50 %	25 %	0 %	427723236
23473	NC_019683	GAT	2	6	1495311	1495316	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723236
23474	NC_019683	GA	3	6	1495380	1495385	50 %	0 %	50 %	0 %	427723236
23475	NC_019683	TGA	2	6	1495401	1495406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723236
23476	NC_019683	ATTTT	2	10	1495415	1495424	20 %	80 %	0 %	0 %	427723236
23477	NC_019683	GCT	2	6	1495508	1495513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	427723236
23478	NC_019683	T	7	7	1495519	1495525	0 %	100 %	0 %	0 %	427723236
23479	NC_019683	TAT	2	6	1495620	1495625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723236
23480	NC_019683	TATC	2	8	1495643	1495650	25 %	50 %	0 %	25 %	427723236
23481	NC_019683	AGA	2	6	1495737	1495742	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723236
23482	NC_019683	A	6	6	1495819	1495824	100 %	0 %	0 %	0 %	427723236
23483	NC_019683	TAT	2	6	1495855	1495860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723236
23484	NC_019683	ATC	2	6	1495911	1495916	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	427723237
23485	NC_019683	T	8	8	1495948	1495955	0 %	100 %	0 %	0 %	427723237
23486	NC_019683	AGT	2	6	1495957	1495962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723237
23487	NC_019683	GGT	2	6	1496056	1496061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427723237
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23489	NC_019683	TGA	2	6	1496133	1496138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723237
23490	NC_019683	AAG	2	6	1496161	1496166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723237
23491	NC_019683	CGA	2	6	1496205	1496210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	427723237
23492	NC_019683	CCA	2	6	1496281	1496286	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	427723237
23493	NC_019683	GAA	2	6	1496299	1496304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	427723237
23494	NC_019683	AAT	2	6	1496368	1496373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	427723237
23495	NC_019683	GCGAA	2	10	1496384	1496393	40 %	0 %	40 %	20 %	427723237
23496	NC_019683	TGT	2	6	1496400	1496405	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	427723237
23497	NC_019683	TGG	2	6	1496454	1496459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	427723237
23498	NC_019683	GAG	2	6	1496510	1496515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	427723237
23499	NC_019683	ATT	2	6	1496525	1496530	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	427723237
23500	NC_019683	GAT	2	6	1496554	1496559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	427723237

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