MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris UC509.9

Total Repeats: 38067

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
38001	NC_019435	GTT	2	6	2241104	2241109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075264
38002	NC_019435	TGA	2	6	2241168	2241173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075264
38003	NC_019435	CAAC	2	8	2241198	2241205	50 %	0 %	0 %	50 %	414075264
38004	NC_019435	A	7	7	2241213	2241219	100 %	0 %	0 %	0 %	414075264
38005	NC_019435	GAT	2	6	2241230	2241235	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075264
38006	NC_019435	GAAAA	2	10	2241261	2241270	80 %	0 %	20 %	0 %	414075264
38007	NC_019435	TTG	2	6	2241282	2241287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075264
38008	NC_019435	TGT	2	6	2241307	2241312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075264
38009	NC_019435	CAA	2	6	2241393	2241398	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075264
38010	NC_019435	CTA	2	6	2241429	2241434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075264
38011	NC_019435	CAG	2	6	2241471	2241476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075264
38012	NC_019435	A	7	7	2241497	2241503	100 %	0 %	0 %	0 %	414075264
38013	NC_019435	GTA	2	6	2241513	2241518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075264
38014	NC_019435	T	6	6	2241531	2241536	0 %	100 %	0 %	0 %	414075264
38015	NC_019435	AACAA	2	10	2241695	2241704	80 %	0 %	0 %	20 %	414075265
38016	NC_019435	T	6	6	2241730	2241735	0 %	100 %	0 %	0 %	414075265
38017	NC_019435	TTTTC	2	10	2241738	2241747	0 %	80 %	0 %	20 %	414075265
38018	NC_019435	TCC	2	6	2241763	2241768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	414075265
38019	NC_019435	ATG	2	6	2241779	2241784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075265
38020	NC_019435	TGAGAA	2	12	2241796	2241807	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	414075265
38021	NC_019435	AGC	2	6	2241832	2241837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075265
38022	NC_019435	CAA	2	6	2241876	2241881	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075265
38023	NC_019435	TTA	2	6	2242019	2242024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075265
38024	NC_019435	ACA	2	6	2242040	2242045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075265
38025	NC_019435	CTT	2	6	2242098	2242103	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075265
38026	NC_019435	CAA	2	6	2242104	2242109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075265
38027	NC_019435	ACCA	2	8	2242147	2242154	50 %	0 %	0 %	50 %	414075265
38028	NC_019435	TTTGT	2	10	2242194	2242203	0 %	80 %	20 %	0 %	414075265
38029	NC_019435	ACC	2	6	2242234	2242239	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075265
38030	NC_019435	GAA	2	6	2242259	2242264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075265
38031	NC_019435	ACC	2	6	2242339	2242344	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075265
38032	NC_019435	TGT	2	6	2242445	2242450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	414075265
38033	NC_019435	CCA	2	6	2242460	2242465	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075265
38034	NC_019435	GAA	2	6	2242521	2242526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075265
38035	NC_019435	T	6	6	2242670	2242675	0 %	100 %	0 %	0 %	414075266
38036	NC_019435	TGG	2	6	2242692	2242697	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	414075266
38037	NC_019435	AAG	2	6	2242724	2242729	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	414075266
38038	NC_019435	T	7	7	2242780	2242786	0 %	100 %	0 %	0 %	414075266
38039	NC_019435	TCCTC	2	10	2242789	2242798	0 %	40 %	0 %	60 %	414075266
38040	NC_019435	TAA	2	6	2242810	2242815	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075266
38041	NC_019435	ACC	2	6	2242833	2242838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075266
38042	NC_019435	CAAC	2	8	2242841	2242848	50 %	0 %	0 %	50 %	414075266
38043	NC_019435	AGC	2	6	2242941	2242946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	414075266
38044	NC_019435	TAAT	2	8	2242966	2242973	50 %	50 %	0 %	0 %	414075266
38045	NC_019435	TTC	2	6	2242977	2242982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075266
38046	NC_019435	ATT	2	6	2243089	2243094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	414075266
38047	NC_019435	A	7	7	2243191	2243197	100 %	0 %	0 %	0 %	414075266
38048	NC_019435	CAT	2	6	2243237	2243242	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075266
38049	NC_019435	ATG	2	6	2243251	2243256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	414075266
38050	NC_019435	TTTAA	2	10	2243435	2243444	40 %	60 %	0 %	0 %	414075267
38051	NC_019435	TAC	2	6	2243488	2243493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075267
38052	NC_019435	CGT	2	6	2243496	2243501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	414075267
38053	NC_019435	T	6	6	2243537	2243542	0 %	100 %	0 %	0 %	414075267
38054	NC_019435	AAT	2	6	2243561	2243566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	414075267
38055	NC_019435	ATGA	2	8	2243597	2243604	50 %	25 %	25 %	0 %	414075267
38056	NC_019435	CAT	2	6	2243789	2243794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	414075267
38057	NC_019435	TTAA	2	8	2243820	2243827	50 %	50 %	0 %	0 %	414075267
38058	NC_019435	AC	3	6	2243834	2243839	50 %	0 %	0 %	50 %	414075267
38059	NC_019435	TTC	2	6	2243921	2243926	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	414075267
38060	NC_019435	AATC	2	8	2243947	2243954	50 %	25 %	0 %	25 %	414075267
38061	NC_019435	ACA	2	6	2243994	2243999	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	414075267
38062	NC_019435	AT	3	6	2244132	2244137	50 %	50 %	0 %	0 %	414075267
38063	NC_019435	T	6	6	2244155	2244160	0 %	100 %	0 %	0 %	414075267
38064	NC_019435	ACC	2	6	2244257	2244262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	414075267
38065	NC_019435	T	6	6	2244325	2244330	0 %	100 %	0 %	0 %	414075267
38066	NC_019435	T	6	6	2244339	2244344	0 %	100 %	0 %	0 %	414075267
38067	NC_019435	ATTC	2	8	2244352	2244359	25 %	50 %	0 %	25 %	414075267

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.