MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leptospirillum ferriphilum ML-04 chromosome

Total Repeats: 43411

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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43002	NC_018649	CGT	2	6	2383119	2383124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480022
43003	NC_018649	CAAA	2	8	2383239	2383246	75 %	0 %	0 %	25 %	410480022
43004	NC_018649	AAT	2	6	2383260	2383265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480022
43005	NC_018649	CGG	2	6	2383338	2383343	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480022
43006	NC_018649	TTC	2	6	2383436	2383441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480022
43007	NC_018649	CA	3	6	2383468	2383473	50 %	0 %	0 %	50 %	410480022
43008	NC_018649	GA	3	6	2383526	2383531	50 %	0 %	50 %	0 %	410480022
43009	NC_018649	CTC	2	6	2383554	2383559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480022
43010	NC_018649	AGA	2	6	2383605	2383610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480022
43011	NC_018649	A	8	8	2383621	2383628	100 %	0 %	0 %	0 %	410480022
43012	NC_018649	TCT	2	6	2383645	2383650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480022
43013	NC_018649	AGGA	2	8	2383787	2383794	50 %	0 %	50 %	0 %	410480023
43014	NC_018649	CA	3	6	2383833	2383838	50 %	0 %	0 %	50 %	410480023
43015	NC_018649	CTC	2	6	2383839	2383844	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480023
43016	NC_018649	TC	3	6	2384049	2384054	0 %	50 %	0 %	50 %	410480023
43017	NC_018649	T	6	6	2384108	2384113	0 %	100 %	0 %	0 %	410480023
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43020	NC_018649	CTT	2	6	2384172	2384177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480023
43021	NC_018649	CA	3	6	2384206	2384211	50 %	0 %	0 %	50 %	410480023
43022	NC_018649	CTC	2	6	2384236	2384241	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480023
43023	NC_018649	GAC	2	6	2384250	2384255	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480023
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43029	NC_018649	T	6	6	2384537	2384542	0 %	100 %	0 %	0 %	410480024
43030	NC_018649	GAAA	2	8	2384643	2384650	75 %	0 %	25 %	0 %	410480024
43031	NC_018649	GGA	2	6	2384680	2384685	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480024
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43033	NC_018649	GATG	2	8	2384816	2384823	25 %	25 %	50 %	0 %	410480024
43034	NC_018649	GCG	2	6	2384855	2384860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	410480024
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43036	NC_018649	T	6	6	2384908	2384913	0 %	100 %	0 %	0 %	410480024
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43039	NC_018649	TC	3	6	2384958	2384963	0 %	50 %	0 %	50 %	410480024
43040	NC_018649	CTT	2	6	2385016	2385021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480024
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43052	NC_018649	CCGG	2	8	2385692	2385699	0 %	0 %	50 %	50 %	410480025
43053	NC_018649	AAG	2	6	2385706	2385711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	410480025
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43113	NC_018649	CTT	2	6	2389046	2389051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	410480029
43114	NC_018649	G	6	6	2389131	2389136	0 %	0 %	100 %	0 %	410480029
43115	NC_018649	TC	4	8	2389155	2389162	0 %	50 %	0 %	50 %	410480029
43116	NC_018649	GAC	2	6	2389262	2389267	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480029
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43119	NC_018649	GGA	2	6	2389438	2389443	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	410480029
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43223	NC_018649	CT	4	8	2395358	2395365	0 %	50 %	0 %	50 %	410480038
43224	NC_018649	TGT	2	6	2395398	2395403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	410480038
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43230	NC_018649	A	7	7	2395763	2395769	100 %	0 %	0 %	0 %	410480039
43231	NC_018649	TCA	2	6	2395788	2395793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480039
43232	NC_018649	A	6	6	2395892	2395897	100 %	0 %	0 %	0 %	410480039
43233	NC_018649	CAG	2	6	2395909	2395914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	410480039
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43235	NC_018649	TCA	2	6	2395950	2395955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480039
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43357	NC_018649	GAAC	2	8	2402836	2402843	50 %	0 %	25 %	25 %	410480046
43358	NC_018649	TCG	2	6	2403001	2403006	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480046
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43360	NC_018649	CGT	2	6	2403026	2403031	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	410480046
43361	NC_018649	GAAACG	2	12	2403049	2403060	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	410480046
43362	NC_018649	GCATGG	2	12	2403151	2403162	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	410480046
43363	NC_018649	ATA	2	6	2403181	2403186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	410480046
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43374	NC_018649	TGA	2	6	2403646	2403651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480047
43375	NC_018649	ATCA	2	8	2403653	2403660	50 %	25 %	0 %	25 %	410480047
43376	NC_018649	TGA	2	6	2403676	2403681	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480047
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43384	NC_018649	TCA	2	6	2404278	2404283	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480048
43385	NC_018649	ACC	2	6	2404381	2404386	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	410480048
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43394	NC_018649	ATGA	2	8	2404735	2404742	50 %	25 %	25 %	0 %	410480048
43395	NC_018649	ATC	2	6	2404786	2404791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	410480048
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43402	NC_018649	CTC	2	6	2404995	2405000	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480048
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43407	NC_018649	GAT	2	6	2405278	2405283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480048
43408	NC_018649	TGA	3	9	2405337	2405345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	410480048
43409	NC_018649	GA	3	6	2405506	2405511	50 %	0 %	50 %	0 %	410480048
43410	NC_018649	CCT	2	6	2405552	2405557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	410480048
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.