MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 37088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
37001	NC_018631	TCG	2	6	1889090	1889095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600782
37002	NC_018631	ATC	2	6	1889105	1889110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600782
37003	NC_018631	T	7	7	1889113	1889119	0 %	100 %	0 %	0 %	406600782
37004	NC_018631	AAT	2	6	1889122	1889127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600782
37005	NC_018631	CAC	2	6	1889154	1889159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600782
37006	NC_018631	GATC	2	8	1889385	1889392	25 %	25 %	25 %	25 %	406600782
37007	NC_018631	TGT	2	6	1889443	1889448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600782
37008	NC_018631	ATC	2	6	1889512	1889517	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600782
37009	NC_018631	T	6	6	1889552	1889557	0 %	100 %	0 %	0 %	406600782
37010	NC_018631	ATC	2	6	1889564	1889569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600782
37011	NC_018631	TTG	2	6	1889594	1889599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600783
37012	NC_018631	ATAA	2	8	1889651	1889658	75 %	25 %	0 %	0 %	406600783
37013	NC_018631	AAT	2	6	1889712	1889717	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600783
37014	NC_018631	CAA	2	6	1889728	1889733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600783
37015	NC_018631	TAAG	2	8	1889741	1889748	50 %	25 %	25 %	0 %	406600783
37016	NC_018631	TGT	2	6	1889760	1889765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600783
37017	NC_018631	ACG	2	6	1889801	1889806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600783
37018	NC_018631	AAAT	2	8	1889817	1889824	75 %	25 %	0 %	0 %	406600783
37019	NC_018631	ATA	2	6	1889859	1889864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600783
37020	NC_018631	CAA	2	6	1889866	1889871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600783
37021	NC_018631	TTTG	2	8	1889898	1889905	0 %	75 %	25 %	0 %	406600783
37022	NC_018631	GAT	2	6	1889971	1889976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600783
37023	NC_018631	T	6	6	1889978	1889983	0 %	100 %	0 %	0 %	406600783
37024	NC_018631	TCA	2	6	1890060	1890065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600783
37025	NC_018631	GAT	2	6	1890089	1890094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600783
37026	NC_018631	AGA	2	6	1890119	1890124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600783
37027	NC_018631	TTAGTG	2	12	1890165	1890176	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	406600783
37028	NC_018631	GAT	2	6	1890178	1890183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600783
37029	NC_018631	TTG	2	6	1890197	1890202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600783
37030	NC_018631	CAA	2	6	1890308	1890313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600783
37031	NC_018631	T	6	6	1890380	1890385	0 %	100 %	0 %	0 %	406600783
37032	NC_018631	TCA	2	6	1890417	1890422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600783
37033	NC_018631	T	6	6	1890453	1890458	0 %	100 %	0 %	0 %	406600783
37034	NC_018631	AT	3	6	1890494	1890499	50 %	50 %	0 %	0 %	406600783
37035	NC_018631	ATT	2	6	1890509	1890514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600783
37036	NC_018631	CAAT	2	8	1890517	1890524	50 %	25 %	0 %	25 %	406600783
37037	NC_018631	ATT	2	6	1890527	1890532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600783
37038	NC_018631	GCTT	2	8	1890578	1890585	0 %	50 %	25 %	25 %	406600783
37039	NC_018631	ATA	2	6	1890608	1890613	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600783
37040	NC_018631	TTG	2	6	1890635	1890640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600783
37041	NC_018631	ATAG	2	8	1890695	1890702	50 %	25 %	25 %	0 %	406600783
37042	NC_018631	AGT	2	6	1890717	1890722	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600783
37043	NC_018631	AATT	2	8	1890781	1890788	50 %	50 %	0 %	0 %	406600783
37044	NC_018631	TAA	2	6	1890875	1890880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600783
37045	NC_018631	CA	3	6	1890996	1891001	50 %	0 %	0 %	50 %	406600783
37046	NC_018631	T	7	7	1891042	1891048	0 %	100 %	0 %	0 %	406600783
37047	NC_018631	GCA	2	6	1891053	1891058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600783
37048	NC_018631	AAT	2	6	1891103	1891108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600783
37049	NC_018631	TAG	2	6	1891112	1891117	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600783
37050	NC_018631	TAT	2	6	1891183	1891188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600783
37051	NC_018631	TTG	2	6	1891197	1891202	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600783
37052	NC_018631	CTG	2	6	1891222	1891227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600783
37053	NC_018631	T	6	6	1891233	1891238	0 %	100 %	0 %	0 %	406600783
37054	NC_018631	T	8	8	1891270	1891277	0 %	100 %	0 %	0 %	406600783
37055	NC_018631	T	6	6	1891333	1891338	0 %	100 %	0 %	0 %	406600783
37056	NC_018631	ATTA	2	8	1891346	1891353	50 %	50 %	0 %	0 %	406600783
37057	NC_018631	GTTTT	2	10	1891362	1891371	0 %	80 %	20 %	0 %	406600783
37058	NC_018631	CAC	2	6	1891379	1891384	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600783
37059	NC_018631	T	6	6	1891423	1891428	0 %	100 %	0 %	0 %	406600783
37060	NC_018631	AAT	2	6	1891544	1891549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600783
37061	NC_018631	AATA	2	8	1891553	1891560	75 %	25 %	0 %	0 %	406600783
37062	NC_018631	TATT	2	8	1891677	1891684	25 %	75 %	0 %	0 %	406600784
37063	NC_018631	ATG	2	6	1891698	1891703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600784
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37065	NC_018631	GCA	2	6	1891844	1891849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600784
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37068	NC_018631	CAT	2	6	1891967	1891972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600784
37069	NC_018631	TCA	2	6	1891999	1892004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600784
37070	NC_018631	ACC	2	6	1892040	1892045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600784
37071	NC_018631	TTA	2	6	1892050	1892055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600784
37072	NC_018631	TAAT	2	8	1892114	1892121	50 %	50 %	0 %	0 %	406600784
37073	NC_018631	TCA	2	6	1892167	1892172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600784
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37075	NC_018631	AATTTG	2	12	1892258	1892269	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	406600784
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37077	NC_018631	C	6	6	1892287	1892292	0 %	0 %	0 %	100 %	406600784
37078	NC_018631	GCA	2	6	1892299	1892304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600784
37079	NC_018631	TACT	2	8	1892323	1892330	25 %	50 %	0 %	25 %	406600784
37080	NC_018631	GCA	2	6	1892344	1892349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600784
37081	NC_018631	GTCT	2	8	1892352	1892359	0 %	50 %	25 %	25 %	406600784
37082	NC_018631	TTTAT	2	10	1892474	1892483	20 %	80 %	0 %	0 %	406600785
37083	NC_018631	ATAC	2	8	1892490	1892497	50 %	25 %	0 %	25 %	406600785
37084	NC_018631	TG	3	6	1892531	1892536	0 %	50 %	50 %	0 %	406600785
37085	NC_018631	CTG	2	6	1892567	1892572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600785
37086	NC_018631	ACG	2	6	1892580	1892585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600785
37087	NC_018631	AAC	2	6	1892793	1892798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600785
37088	NC_018631	CAG	2	6	1892900	1892905	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600785

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.