MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 37088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
28501	NC_018631	GCT	3	9	1432175	1432183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600349
28502	NC_018631	CA	3	6	1432202	1432207	50 %	0 %	0 %	50 %	406600349
28503	NC_018631	ATT	2	6	1432208	1432213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600349
28504	NC_018631	CAA	2	6	1432223	1432228	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600349
28505	NC_018631	AGA	2	6	1432231	1432236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600349
28506	NC_018631	CAT	2	6	1432238	1432243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600349
28507	NC_018631	GAA	2	6	1432244	1432249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600349
28508	NC_018631	TCG	2	6	1432267	1432272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600349
28509	NC_018631	GCG	2	6	1432280	1432285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406600349
28510	NC_018631	CTA	2	6	1432297	1432302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600349
28511	NC_018631	TAAC	2	8	1432634	1432641	50 %	25 %	0 %	25 %	406600350
28512	NC_018631	TTA	2	6	1432643	1432648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600350
28513	NC_018631	AGA	2	6	1432713	1432718	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600350
28514	NC_018631	TTTG	2	8	1432768	1432775	0 %	75 %	25 %	0 %	406600350
28515	NC_018631	AGA	2	6	1432851	1432856	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600350
28516	NC_018631	CTG	2	6	1432934	1432939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600350
28517	NC_018631	CTT	2	6	1432953	1432958	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600350
28518	NC_018631	TGA	2	6	1432968	1432973	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600350
28519	NC_018631	AAT	2	6	1433044	1433049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600350
28520	NC_018631	GAA	2	6	1433071	1433076	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600350
28521	NC_018631	TGG	3	9	1433249	1433257	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600351
28522	NC_018631	TGG	2	6	1433333	1433338	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600351
28523	NC_018631	GTC	2	6	1433343	1433348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
28524	NC_018631	ACA	2	6	1433349	1433354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600351
28525	NC_018631	CAA	2	6	1433418	1433423	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600351
28526	NC_018631	A	7	7	1433510	1433516	100 %	0 %	0 %	0 %	406600351
28527	NC_018631	TAT	2	6	1433537	1433542	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600351
28528	NC_018631	GTG	2	6	1433605	1433610	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600351
28529	NC_018631	ATT	2	6	1433639	1433644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600351
28530	NC_018631	GGT	3	9	1433670	1433678	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600351
28531	NC_018631	TGC	2	6	1433681	1433686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
28532	NC_018631	GAA	2	6	1433691	1433696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600351
28533	NC_018631	GTT	2	6	1433733	1433738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600351
28534	NC_018631	TCT	2	6	1433745	1433750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600351
28535	NC_018631	AGT	2	6	1433825	1433830	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600351
28536	NC_018631	ATT	2	6	1433848	1433853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600351
28537	NC_018631	TCA	2	6	1433869	1433874	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600351
28538	NC_018631	AC	3	6	1433883	1433888	50 %	0 %	0 %	50 %	406600351
28539	NC_018631	AAC	2	6	1433891	1433896	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600351
28540	NC_018631	ATC	2	6	1433902	1433907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600351
28541	NC_018631	GAT	2	6	1433916	1433921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600351
28542	NC_018631	CAAA	2	8	1433961	1433968	75 %	0 %	0 %	25 %	406600351
28543	NC_018631	GTT	2	6	1433969	1433974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600351
28544	NC_018631	A	6	6	1433976	1433981	100 %	0 %	0 %	0 %	406600351
28545	NC_018631	TGA	2	6	1433993	1433998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600351
28546	NC_018631	AT	3	6	1434005	1434010	50 %	50 %	0 %	0 %	406600351
28547	NC_018631	TCAA	2	8	1434029	1434036	50 %	25 %	0 %	25 %	406600351
28548	NC_018631	CTG	2	6	1434097	1434102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
28549	NC_018631	GCT	2	6	1434120	1434125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
28550	NC_018631	A	7	7	1434155	1434161	100 %	0 %	0 %	0 %	406600351
28551	NC_018631	A	6	6	1434198	1434203	100 %	0 %	0 %	0 %	406600351
28552	NC_018631	GCAC	2	8	1434204	1434211	25 %	0 %	25 %	50 %	406600351
28553	NC_018631	AGA	2	6	1434236	1434241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600351
28554	NC_018631	CTG	2	6	1434250	1434255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
28555	NC_018631	ACA	2	6	1434299	1434304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600351
28556	NC_018631	TAA	2	6	1434320	1434325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600351
28557	NC_018631	A	6	6	1434370	1434375	100 %	0 %	0 %	0 %	406600351
28558	NC_018631	GAATT	2	10	1434411	1434420	40 %	40 %	20 %	0 %	406600351
28559	NC_018631	CTG	2	6	1434580	1434585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
28560	NC_018631	TTG	2	6	1434613	1434618	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600351
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28562	NC_018631	GCTATT	2	12	1434645	1434656	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406600351
28563	NC_018631	TGT	2	6	1434689	1434694	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600351
28564	NC_018631	TGC	2	6	1434695	1434700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
28565	NC_018631	CTG	2	6	1434736	1434741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600351
28566	NC_018631	TGAT	2	8	1434745	1434752	25 %	50 %	25 %	0 %	406600351
28567	NC_018631	CAT	2	6	1434783	1434788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600351
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28569	NC_018631	ATC	2	6	1435070	1435075	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600352
28570	NC_018631	CTG	2	6	1435165	1435170	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600352
28571	NC_018631	TGGT	2	8	1435292	1435299	0 %	50 %	50 %	0 %	406600352
28572	NC_018631	ATC	2	6	1435427	1435432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600352
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28574	NC_018631	ATT	2	6	1435478	1435483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600352
28575	NC_018631	ATAA	2	8	1435498	1435505	75 %	25 %	0 %	0 %	406600352
28576	NC_018631	T	6	6	1435551	1435556	0 %	100 %	0 %	0 %	406600352
28577	NC_018631	TAA	2	6	1435660	1435665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600352
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28582	NC_018631	AAATC	2	10	1436026	1436035	60 %	20 %	0 %	20 %	406600353
28583	NC_018631	CAA	2	6	1436050	1436055	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600353
28584	NC_018631	GGCA	2	8	1436246	1436253	25 %	0 %	50 %	25 %	406600353
28585	NC_018631	TCT	2	6	1436283	1436288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600353
28586	NC_018631	TAT	2	6	1436443	1436448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600353
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28588	NC_018631	ATAA	2	8	1436494	1436501	75 %	25 %	0 %	0 %	406600353
28589	NC_018631	CAG	2	6	1436527	1436532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600353
28590	NC_018631	CAT	2	6	1436551	1436556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600353
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28596	NC_018631	T	6	6	1436766	1436771	0 %	100 %	0 %	0 %	406600353
28597	NC_018631	AAT	2	6	1436807	1436812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600353
28598	NC_018631	ACC	2	6	1436816	1436821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600353
28599	NC_018631	GCTA	2	8	1436831	1436838	25 %	25 %	25 %	25 %	406600353
28600	NC_018631	ATT	2	6	1436873	1436878	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600353
28601	NC_018631	AAT	2	6	1436886	1436891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600353
28602	NC_018631	TCT	2	6	1436901	1436906	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600353
28603	NC_018631	ATG	2	6	1436966	1436971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600353
28604	NC_018631	T	6	6	1436972	1436977	0 %	100 %	0 %	0 %	406600353
28605	NC_018631	AAC	2	6	1437011	1437016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600353
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28616	NC_018631	GAT	2	6	1437393	1437398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600354
28617	NC_018631	CTT	2	6	1437498	1437503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600354
28618	NC_018631	TAA	2	6	1437510	1437515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600354
28619	NC_018631	AATCGT	2	12	1437556	1437567	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	406600354
28620	NC_018631	TACA	2	8	1437682	1437689	50 %	25 %	0 %	25 %	406600354
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28623	NC_018631	T	7	7	1437787	1437793	0 %	100 %	0 %	0 %	406600354
28624	NC_018631	CAT	2	6	1437846	1437851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600354
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28733	NC_018631	ATA	2	6	1443241	1443246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600360
28734	NC_018631	TAA	2	6	1443258	1443263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600360
28735	NC_018631	CTA	2	6	1443275	1443280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600360
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28739	NC_018631	AAG	2	6	1443491	1443496	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600360
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28744	NC_018631	TTG	2	6	1449234	1449239	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600361
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28748	NC_018631	A	6	6	1449396	1449401	100 %	0 %	0 %	0 %	406600361
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28966	NC_018631	ATA	2	6	1461005	1461010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600376
28967	NC_018631	ACC	2	6	1461154	1461159	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600376
28968	NC_018631	CAT	2	6	1461171	1461176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600376
28969	NC_018631	CAT	2	6	1461193	1461198	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600376
28970	NC_018631	TGC	2	6	1461212	1461217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600376
28971	NC_018631	GTT	2	6	1461227	1461232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600376
28972	NC_018631	TTG	2	6	1461316	1461321	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600376
28973	NC_018631	AAAG	2	8	1461328	1461335	75 %	0 %	25 %	0 %	406600376
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28992	NC_018631	AC	3	6	1462051	1462056	50 %	0 %	0 %	50 %	406600378
28993	NC_018631	GTC	2	6	1462119	1462124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600378
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28999	NC_018631	ATTA	2	8	1462388	1462395	50 %	50 %	0 %	0 %	406600378
29000	NC_018631	GAT	2	6	1462425	1462430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600378

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