MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Leuconostoc gelidum JB7 chromosome

Total Repeats: 37088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
26001	NC_018631	CTGAG	2	10	1312913	1312922	20 %	20 %	40 %	20 %	406600240
26002	NC_018631	ATC	2	6	1312931	1312936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600240
26003	NC_018631	TGT	2	6	1312950	1312955	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600240
26004	NC_018631	TGAT	2	8	1313001	1313008	25 %	50 %	25 %	0 %	406600240
26005	NC_018631	ATC	2	6	1313040	1313045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600240
26006	NC_018631	TAA	2	6	1313087	1313092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600240
26007	NC_018631	GTTTT	2	10	1313155	1313164	0 %	80 %	20 %	0 %	406600240
26008	NC_018631	TCTT	2	8	1313203	1313210	0 %	75 %	0 %	25 %	406600241
26009	NC_018631	GCC	2	6	1313284	1313289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406600241
26010	NC_018631	CAA	2	6	1313313	1313318	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600241
26011	NC_018631	GCA	2	6	1313380	1313385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600241
26012	NC_018631	CAT	2	6	1313387	1313392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600241
26013	NC_018631	TGA	2	6	1313419	1313424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600241
26014	NC_018631	AT	3	6	1313554	1313559	50 %	50 %	0 %	0 %	406600241
26015	NC_018631	TTAAA	2	10	1313666	1313675	60 %	40 %	0 %	0 %	406600241
26016	NC_018631	CTG	2	6	1313696	1313701	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600241
26017	NC_018631	GCC	2	6	1313727	1313732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406600241
26018	NC_018631	TGC	2	6	1313809	1313814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600241
26019	NC_018631	CAA	2	6	1313828	1313833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600241
26020	NC_018631	CTG	2	6	1313846	1313851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600241
26021	NC_018631	TTG	2	6	1313856	1313861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600241
26022	NC_018631	CAC	2	6	1313897	1313902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600241
26023	NC_018631	ATTT	2	8	1313912	1313919	25 %	75 %	0 %	0 %	406600241
26024	NC_018631	ATGA	2	8	1313946	1313953	50 %	25 %	25 %	0 %	406600241
26025	NC_018631	GCA	2	6	1313977	1313982	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600241
26026	NC_018631	ACC	2	6	1313986	1313991	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600241
26027	NC_018631	ACC	2	6	1314006	1314011	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600241
26028	NC_018631	CAA	3	9	1314017	1314025	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600241
26029	NC_018631	TAA	2	6	1314044	1314049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600241
26030	NC_018631	T	7	7	1314050	1314056	0 %	100 %	0 %	0 %	406600241
26031	NC_018631	AAAT	2	8	1314078	1314085	75 %	25 %	0 %	0 %	406600241
26032	NC_018631	CAC	2	6	1314185	1314190	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600241
26033	NC_018631	TAA	2	6	1314236	1314241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600241
26034	NC_018631	CCT	2	6	1314274	1314279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406600241
26035	NC_018631	CCA	2	6	1314283	1314288	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600241
26036	NC_018631	CTTT	2	8	1314324	1314331	0 %	75 %	0 %	25 %	406600242
26037	NC_018631	CGC	2	6	1314351	1314356	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406600242
26038	NC_018631	AGC	2	6	1314388	1314393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600242
26039	NC_018631	TAA	2	6	1314474	1314479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600242
26040	NC_018631	AGC	2	6	1314490	1314495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600242
26041	NC_018631	T	6	6	1314513	1314518	0 %	100 %	0 %	0 %	406600242
26042	NC_018631	TAA	2	6	1314556	1314561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600242
26043	NC_018631	TAA	2	6	1314568	1314573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600242
26044	NC_018631	ATC	2	6	1314583	1314588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600242
26045	NC_018631	CCA	2	6	1314602	1314607	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600242
26046	NC_018631	TGT	2	6	1314716	1314721	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600242
26047	NC_018631	ACC	2	6	1314736	1314741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600242
26048	NC_018631	CTA	2	6	1314837	1314842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600242
26049	NC_018631	AAT	2	6	1314880	1314885	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600242
26050	NC_018631	GTAC	2	8	1314902	1314909	25 %	25 %	25 %	25 %	406600242
26051	NC_018631	T	6	6	1314920	1314925	0 %	100 %	0 %	0 %	406600242
26052	NC_018631	CAA	2	6	1314939	1314944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600242
26053	NC_018631	T	7	7	1314957	1314963	0 %	100 %	0 %	0 %	406600242
26054	NC_018631	ATC	2	6	1314970	1314975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600242
26055	NC_018631	GTT	2	6	1315016	1315021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600242
26056	NC_018631	T	6	6	1315025	1315030	0 %	100 %	0 %	0 %	406600242
26057	NC_018631	TAAT	2	8	1315104	1315111	50 %	50 %	0 %	0 %	406600242
26058	NC_018631	TAA	2	6	1315165	1315170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600242
26059	NC_018631	ATC	2	6	1315177	1315182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600242
26060	NC_018631	CAG	2	6	1315230	1315235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600242
26061	NC_018631	GTT	4	12	1315283	1315294	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600242
26062	NC_018631	TAAT	2	8	1315412	1315419	50 %	50 %	0 %	0 %	406600242
26063	NC_018631	AAT	2	6	1315437	1315442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600242
26064	NC_018631	AGT	2	6	1315447	1315452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600242
26065	NC_018631	CAT	3	9	1315467	1315475	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600242
26066	NC_018631	TAA	2	6	1315479	1315484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600242
26067	NC_018631	CTG	2	6	1315494	1315499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600242
26068	NC_018631	CAA	2	6	1315501	1315506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600242
26069	NC_018631	CCA	2	6	1315538	1315543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600242
26070	NC_018631	AAC	2	6	1315546	1315551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600242
26071	NC_018631	GCT	2	6	1315589	1315594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600242
26072	NC_018631	CCAA	2	8	1315609	1315616	50 %	0 %	0 %	50 %	406600242
26073	NC_018631	T	6	6	1315627	1315632	0 %	100 %	0 %	0 %	406600242
26074	NC_018631	TCA	2	6	1315653	1315658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600242
26075	NC_018631	GAAT	2	8	1315795	1315802	50 %	25 %	25 %	0 %	406600243
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26077	NC_018631	AACA	2	8	1315885	1315892	75 %	0 %	0 %	25 %	406600243
26078	NC_018631	CCAAA	4	20	1315893	1315912	60 %	0 %	0 %	40 %	406600243
26079	NC_018631	A	6	6	1316018	1316023	100 %	0 %	0 %	0 %	406600243
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26083	NC_018631	ATA	2	6	1316285	1316290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600243
26084	NC_018631	CTG	2	6	1316292	1316297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600243
26085	NC_018631	TTAA	2	8	1316354	1316361	50 %	50 %	0 %	0 %	406600243
26086	NC_018631	ATC	2	6	1316371	1316376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600243
26087	NC_018631	ACA	2	6	1316492	1316497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600243
26088	NC_018631	CAC	2	6	1316505	1316510	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600243
26089	NC_018631	TGGTC	2	10	1316540	1316549	0 %	40 %	40 %	20 %	406600243
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26091	NC_018631	AACT	2	8	1316719	1316726	50 %	25 %	0 %	25 %	406600244
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26093	NC_018631	TGCA	2	8	1316860	1316867	25 %	25 %	25 %	25 %	406600244
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26097	NC_018631	CTGT	2	8	1317018	1317025	0 %	50 %	25 %	25 %	406600244
26098	NC_018631	CACTAT	2	12	1317048	1317059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600244
26099	NC_018631	TTG	2	6	1317114	1317119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600244
26100	NC_018631	GTT	2	6	1317138	1317143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600244
26101	NC_018631	T	7	7	1317173	1317179	0 %	100 %	0 %	0 %	406600244
26102	NC_018631	GAAT	2	8	1317200	1317207	50 %	25 %	25 %	0 %	406600244
26103	NC_018631	AAC	2	6	1317331	1317336	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600244
26104	NC_018631	ATCA	2	8	1317337	1317344	50 %	25 %	0 %	25 %	406600244
26105	NC_018631	TGT	2	6	1317359	1317364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600244
26106	NC_018631	TTG	2	6	1317409	1317414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600244
26107	NC_018631	CAT	2	6	1317477	1317482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600244
26108	NC_018631	GTG	2	6	1317516	1317521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600244
26109	NC_018631	AAT	2	6	1317579	1317584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600244
26110	NC_018631	TTC	2	6	1317592	1317597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600244
26111	NC_018631	GCT	2	6	1317672	1317677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600244
26112	NC_018631	GGA	2	6	1317703	1317708	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406600244
26113	NC_018631	CAA	2	6	1317762	1317767	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600244
26114	NC_018631	T	6	6	1317769	1317774	0 %	100 %	0 %	0 %	406600244
26115	NC_018631	GTAG	2	8	1317802	1317809	25 %	25 %	50 %	0 %	406600244
26116	NC_018631	GCA	2	6	1317842	1317847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600244
26117	NC_018631	TAG	2	6	1317864	1317869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600244
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26119	NC_018631	GCA	2	6	1317962	1317967	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600244
26120	NC_018631	TCG	2	6	1318020	1318025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600244
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26233	NC_018631	TCT	2	6	1323451	1323456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600251
26234	NC_018631	TGA	2	6	1323457	1323462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406600251
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26335	NC_018631	AATG	2	8	1328437	1328444	50 %	25 %	25 %	0 %	406600257
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26344	NC_018631	TCG	2	6	1328932	1328937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406600258
26345	NC_018631	GCTT	2	8	1329025	1329032	0 %	50 %	25 %	25 %	406600258
26346	NC_018631	TAT	2	6	1329101	1329106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406600258
26347	NC_018631	CAA	2	6	1329111	1329116	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600258
26348	NC_018631	TCA	2	6	1329157	1329162	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600258
26349	NC_018631	ATC	2	6	1329204	1329209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600258
26350	NC_018631	TTG	2	6	1329296	1329301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600258
26351	NC_018631	T	6	6	1329302	1329307	0 %	100 %	0 %	0 %	406600258
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26357	NC_018631	T	6	6	1330028	1330033	0 %	100 %	0 %	0 %	406600259
26358	NC_018631	AATT	2	8	1330065	1330072	50 %	50 %	0 %	0 %	406600259
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26451	NC_018631	AT	3	6	1334955	1334960	50 %	50 %	0 %	0 %	406600262
26452	NC_018631	TTC	2	6	1334981	1334986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600262
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26458	NC_018631	GTT	2	6	1335282	1335287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600263
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26462	NC_018631	CATA	2	8	1335351	1335358	50 %	25 %	0 %	25 %	406600263
26463	NC_018631	AAT	2	6	1335379	1335384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600263
26464	NC_018631	CAT	2	6	1335471	1335476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600263
26465	NC_018631	TCT	2	6	1335626	1335631	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600263
26466	NC_018631	TAA	2	6	1335729	1335734	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600263
26467	NC_018631	CCA	2	6	1335758	1335763	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600263
26468	NC_018631	AATA	2	8	1335766	1335773	75 %	25 %	0 %	0 %	406600263
26469	NC_018631	ACC	2	6	1335823	1335828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406600263
26470	NC_018631	TGG	2	6	1335832	1335837	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406600263
26471	NC_018631	TTG	2	6	1335877	1335882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600263
26472	NC_018631	T	7	7	1335928	1335934	0 %	100 %	0 %	0 %	406600263
26473	NC_018631	TCA	2	6	1335950	1335955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600263
26474	NC_018631	ATAA	2	8	1335958	1335965	75 %	25 %	0 %	0 %	406600263
26475	NC_018631	TGT	2	6	1335971	1335976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600263
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26477	NC_018631	TCT	2	6	1336034	1336039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600263
26478	NC_018631	TGT	2	6	1336063	1336068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600263
26479	NC_018631	GTT	2	6	1336187	1336192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600263
26480	NC_018631	TA	3	6	1336227	1336232	50 %	50 %	0 %	0 %	406600263
26481	NC_018631	CTGCAA	2	12	1336233	1336244	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	406600263
26482	NC_018631	CAT	2	6	1336257	1336262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600263
26483	NC_018631	CTCA	2	8	1336363	1336370	25 %	25 %	0 %	50 %	406600263
26484	NC_018631	T	6	6	1336376	1336381	0 %	100 %	0 %	0 %	406600263
26485	NC_018631	CA	3	6	1336390	1336395	50 %	0 %	0 %	50 %	406600263
26486	NC_018631	CAA	2	6	1336428	1336433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406600263
26487	NC_018631	TCT	2	6	1336481	1336486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600263
26488	NC_018631	AGTC	2	8	1336717	1336724	25 %	25 %	25 %	25 %	406600264
26489	NC_018631	CT	3	6	1336726	1336731	0 %	50 %	0 %	50 %	406600264
26490	NC_018631	AAT	2	6	1336764	1336769	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406600264
26491	NC_018631	GCAC	2	8	1336785	1336792	25 %	0 %	25 %	50 %	406600264
26492	NC_018631	AGC	2	6	1336796	1336801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406600264
26493	NC_018631	AGTT	2	8	1336825	1336832	25 %	50 %	25 %	0 %	406600264
26494	NC_018631	CTT	2	6	1336834	1336839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600264
26495	NC_018631	CTT	2	6	1336927	1336932	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406600264
26496	NC_018631	ATC	2	6	1336949	1336954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600264
26497	NC_018631	GAA	2	6	1336976	1336981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406600264
26498	NC_018631	TTG	3	9	1337000	1337008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406600264
26499	NC_018631	TCA	2	6	1337049	1337054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406600264
26500	NC_018631	T	6	6	1337105	1337110	0 %	100 %	0 %	0 %	406600264

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