MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 41420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_018610	TCT	2	6	1848191	1848196	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027620
31003	NC_018610	TTCAA	2	10	1848206	1848215	40 %	40 %	0 %	20 %	406027620
31004	NC_018610	GGT	2	6	1848247	1848252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027620
31005	NC_018610	ATTG	2	8	1848339	1848346	25 %	50 %	25 %	0 %	406027620
31006	NC_018610	AATC	2	8	1848369	1848376	50 %	25 %	0 %	25 %	406027620
31007	NC_018610	GGT	2	6	1848412	1848417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027620
31008	NC_018610	TTG	2	6	1848424	1848429	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027620
31009	NC_018610	CTG	2	6	1848433	1848438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31010	NC_018610	T	6	6	1848444	1848449	0 %	100 %	0 %	0 %	406027620
31011	NC_018610	GTC	2	6	1848529	1848534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31012	NC_018610	GCG	2	6	1848548	1848553	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027620
31013	NC_018610	CGT	2	6	1848742	1848747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31014	NC_018610	GTG	2	6	1848764	1848769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027620
31015	NC_018610	GCT	2	6	1848812	1848817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31016	NC_018610	GCCTTC	2	12	1848893	1848904	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	406027620
31017	NC_018610	GCC	2	6	1848911	1848916	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406027620
31018	NC_018610	TTG	2	6	1849003	1849008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027620
31019	NC_018610	TGGT	2	8	1849037	1849044	0 %	50 %	50 %	0 %	406027620
31020	NC_018610	CTG	2	6	1849248	1849253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31021	NC_018610	GGT	2	6	1849264	1849269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027620
31022	NC_018610	TTG	2	6	1849271	1849276	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027620
31023	NC_018610	GCTG	2	8	1849295	1849302	0 %	25 %	50 %	25 %	406027620
31024	NC_018610	GCT	2	6	1849319	1849324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31025	NC_018610	GGCTG	2	10	1849331	1849340	0 %	20 %	60 %	20 %	406027620
31026	NC_018610	GTT	2	6	1849445	1849450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027620
31027	NC_018610	GCT	2	6	1849502	1849507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31028	NC_018610	GCT	2	6	1849601	1849606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31029	NC_018610	GTT	2	6	1849631	1849636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027620
31030	NC_018610	GGT	2	6	1849714	1849719	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027620
31031	NC_018610	ACTG	2	8	1849758	1849765	25 %	25 %	25 %	25 %	406027620
31032	NC_018610	GCA	2	6	1849778	1849783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027620
31033	NC_018610	ATC	2	6	1849799	1849804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027620
31034	NC_018610	TCC	2	6	1849850	1849855	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406027620
31035	NC_018610	TAA	2	6	1849860	1849865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027620
31036	NC_018610	TGA	2	6	1849876	1849881	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027620
31037	NC_018610	TTAA	2	8	1850116	1850123	50 %	50 %	0 %	0 %	406027621
31038	NC_018610	T	6	6	1850131	1850136	0 %	100 %	0 %	0 %	406027621
31039	NC_018610	CAG	2	6	1850137	1850142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027621
31040	NC_018610	CAG	2	6	1850191	1850196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027621
31041	NC_018610	ATG	2	6	1850217	1850222	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027621
31042	NC_018610	AAT	2	6	1850261	1850266	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027621
31043	NC_018610	CCA	2	6	1850282	1850287	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027621
31044	NC_018610	GAA	2	6	1850338	1850343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027621
31045	NC_018610	AATC	2	8	1850383	1850390	50 %	25 %	0 %	25 %	406027621
31046	NC_018610	GCA	2	6	1850530	1850535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027621
31047	NC_018610	GCT	2	6	1850583	1850588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027621
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31049	NC_018610	TTG	2	6	1850702	1850707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027621
31050	NC_018610	T	6	6	1850784	1850789	0 %	100 %	0 %	0 %	406027621
31051	NC_018610	AGC	2	6	1850876	1850881	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027621
31052	NC_018610	GCA	3	9	1850907	1850915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027621
31053	NC_018610	ATA	2	6	1850916	1850921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027621
31054	NC_018610	TCA	2	6	1850985	1850990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027621
31055	NC_018610	TGAC	2	8	1851066	1851073	25 %	25 %	25 %	25 %	406027621
31056	NC_018610	GAT	2	6	1851260	1851265	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027621
31057	NC_018610	GGC	2	6	1851278	1851283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027621
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31060	NC_018610	TCA	2	6	1851361	1851366	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027621
31061	NC_018610	TTG	2	6	1851426	1851431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027621
31062	NC_018610	CAC	2	6	1851436	1851441	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027621
31063	NC_018610	TTGA	2	8	1851511	1851518	25 %	50 %	25 %	0 %	406027621
31064	NC_018610	CAG	2	6	1851538	1851543	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027621
31065	NC_018610	GCC	2	6	1851657	1851662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406027621
31066	NC_018610	CCAA	2	8	1851706	1851713	50 %	0 %	0 %	50 %	406027621
31067	NC_018610	AATG	2	8	1851800	1851807	50 %	25 %	25 %	0 %	406027621
31068	NC_018610	TCA	2	6	1851856	1851861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027621
31069	NC_018610	GCC	2	6	1851914	1851919	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406027621
31070	NC_018610	ATG	2	6	1852008	1852013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027621
31071	NC_018610	CAT	2	6	1852085	1852090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027621
31072	NC_018610	CAT	3	9	1852103	1852111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027621
31073	NC_018610	CGC	2	6	1852114	1852119	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406027621
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31076	NC_018610	TAT	2	6	1852342	1852347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027621
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31081	NC_018610	CGA	2	6	1852577	1852582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027622
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31083	NC_018610	GTT	2	6	1852663	1852668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027622
31084	NC_018610	TTCA	2	8	1852689	1852696	25 %	50 %	0 %	25 %	406027622
31085	NC_018610	CCAT	2	8	1853003	1853010	25 %	25 %	0 %	50 %	406027623
31086	NC_018610	CTG	2	6	1853155	1853160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027623
31087	NC_018610	CAG	2	6	1853208	1853213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027623
31088	NC_018610	TCT	2	6	1853214	1853219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027623
31089	NC_018610	ACCC	2	8	1853255	1853262	25 %	0 %	0 %	75 %	406027623
31090	NC_018610	CGG	2	6	1853364	1853369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027623
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31093	NC_018610	CTGA	2	8	1853447	1853454	25 %	25 %	25 %	25 %	406027623
31094	NC_018610	CGG	2	6	1853761	1853766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027624
31095	NC_018610	ACTAC	2	10	1853790	1853799	40 %	20 %	0 %	40 %	406027624
31096	NC_018610	GAC	2	6	1853846	1853851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027624
31097	NC_018610	CGT	2	6	1853924	1853929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027624
31098	NC_018610	CTG	2	6	1853990	1853995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027624
31099	NC_018610	CAA	2	6	1854019	1854024	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406027624
31100	NC_018610	AGC	2	6	1854068	1854073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027624
31101	NC_018610	ACT	2	6	1854158	1854163	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027624
31102	NC_018610	AGTGCA	2	12	1854171	1854182	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	406027624
31103	NC_018610	GTA	2	6	1854197	1854202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027624
31104	NC_018610	ACTT	2	8	1854298	1854305	25 %	50 %	0 %	25 %	406027624
31105	NC_018610	TTAG	2	8	1854315	1854322	25 %	50 %	25 %	0 %	406027624
31106	NC_018610	AGA	2	6	1854368	1854373	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027624
31107	NC_018610	TGG	2	6	1854397	1854402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027624
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31109	NC_018610	ATT	2	6	1854455	1854460	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027624
31110	NC_018610	TAA	2	6	1854515	1854520	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027624
31111	NC_018610	ATT	2	6	1854574	1854579	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027625
31112	NC_018610	CGG	2	6	1854616	1854621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027625
31113	NC_018610	AAC	2	6	1854695	1854700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406027625
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31115	NC_018610	GTTG	2	8	1854786	1854793	0 %	50 %	50 %	0 %	406027625
31116	NC_018610	CCG	2	6	1854816	1854821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406027625
31117	NC_018610	CCA	2	6	1854824	1854829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027625
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31119	NC_018610	GAA	2	6	1854942	1854947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027625
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31123	NC_018610	TTG	2	6	1855146	1855151	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027625
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31128	NC_018610	GAT	2	6	1855463	1855468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027625
31129	NC_018610	GT	3	6	1855988	1855993	0 %	50 %	50 %	0 %	406027626
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31135	NC_018610	CTTG	2	8	1856240	1856247	0 %	50 %	25 %	25 %	406027626
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31143	NC_018610	TCGA	2	8	1856532	1856539	25 %	25 %	25 %	25 %	406027626
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31146	NC_018610	TTG	2	6	1856596	1856601	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027626
31147	NC_018610	GCA	2	6	1856657	1856662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027626
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31202	NC_018610	CCAC	2	8	1859603	1859610	25 %	0 %	0 %	75 %	406027628
31203	NC_018610	CAA	2	6	1859659	1859664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406027628
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31212	NC_018610	ACCA	2	8	1860247	1860254	50 %	0 %	0 %	50 %	406027629
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31214	NC_018610	TCG	2	6	1860287	1860292	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027629
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31223	NC_018610	T	7	7	1860895	1860901	0 %	100 %	0 %	0 %	406027630
31224	NC_018610	ATA	2	6	1860960	1860965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406027630
31225	NC_018610	CTG	2	6	1860996	1861001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027630
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31227	NC_018610	CGG	2	6	1861334	1861339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027631
31228	NC_018610	CCAA	2	8	1861348	1861355	50 %	0 %	0 %	50 %	406027631
31229	NC_018610	GAC	2	6	1861376	1861381	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027631
31230	NC_018610	CAT	2	6	1861382	1861387	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027631
31231	NC_018610	TCT	2	6	1861399	1861404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027631
31232	NC_018610	ATT	2	6	1861635	1861640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406027631
31233	NC_018610	GTT	2	6	1861655	1861660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027631
31234	NC_018610	GGC	2	6	1861683	1861688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027631
31235	NC_018610	CAC	2	6	1861724	1861729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027631
31236	NC_018610	ATG	2	6	1861812	1861817	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027631
31237	NC_018610	ACCG	2	8	1861854	1861861	25 %	0 %	25 %	50 %	406027631
31238	NC_018610	CAT	2	6	1861895	1861900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027631
31239	NC_018610	TCA	2	6	1861996	1862001	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027631
31240	NC_018610	TTC	2	6	1862026	1862031	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027631
31241	NC_018610	TTG	3	9	1862086	1862094	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027631
31242	NC_018610	TAAT	2	8	1862118	1862125	50 %	50 %	0 %	0 %	406027631
31243	NC_018610	AAG	2	6	1862250	1862255	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027632
31244	NC_018610	CGA	2	6	1862272	1862277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027632
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31246	NC_018610	TCC	2	6	1862342	1862347	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406027632
31247	NC_018610	AAC	2	6	1862412	1862417	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406027632
31248	NC_018610	CAT	2	6	1862471	1862476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027632
31249	NC_018610	TGA	2	6	1862546	1862551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027632
31250	NC_018610	CAC	2	6	1862552	1862557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027632
31251	NC_018610	ATC	2	6	1862562	1862567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027632
31252	NC_018610	ATC	2	6	1862640	1862645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027632
31253	NC_018610	CAG	2	6	1862660	1862665	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027632
31254	NC_018610	AT	3	6	1862676	1862681	50 %	50 %	0 %	0 %	406027632
31255	NC_018610	GAT	2	6	1862710	1862715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027632
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31259	NC_018610	GCTG	2	8	1863104	1863111	0 %	25 %	50 %	25 %	406027632
31260	NC_018610	CAG	2	6	1863113	1863118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027632
31261	NC_018610	GCT	2	6	1863220	1863225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027632
31262	NC_018610	CAG	2	6	1863299	1863304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027632
31263	NC_018610	GATT	2	8	1863360	1863367	25 %	50 %	25 %	0 %	406027632
31264	NC_018610	CGGC	2	8	1863462	1863469	0 %	0 %	50 %	50 %	406027632
31265	NC_018610	GCG	2	6	1863516	1863521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027632
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31267	NC_018610	CGA	2	6	1863608	1863613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027632
31268	NC_018610	TTCAG	2	10	1863663	1863672	20 %	40 %	20 %	20 %	406027632
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31270	NC_018610	GGC	2	6	1863893	1863898	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027632
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31280	NC_018610	CAGT	2	8	1864639	1864646	25 %	25 %	25 %	25 %	406027633
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31285	NC_018610	CCA	2	6	1864900	1864905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027633
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31294	NC_018610	GCCG	2	8	1865251	1865258	0 %	0 %	50 %	50 %	406027634
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31301	NC_018610	TCG	2	6	1865434	1865439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406027634
31302	NC_018610	CAAA	2	8	1865447	1865454	75 %	0 %	0 %	25 %	406027634
31303	NC_018610	CCA	2	6	1865578	1865583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027634
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31308	NC_018610	TTC	2	6	1865786	1865791	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406027634
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31311	NC_018610	GCA	2	6	1865867	1865872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027634
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31315	NC_018610	TCAG	2	8	1866026	1866033	25 %	25 %	25 %	25 %	406027634
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31320	NC_018610	CAG	2	6	1866264	1866269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027634
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31323	NC_018610	CGAC	2	8	1866355	1866362	25 %	0 %	25 %	50 %	406027634
31324	NC_018610	GTCA	2	8	1866411	1866418	25 %	25 %	25 %	25 %	406027634
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31327	NC_018610	ACCAA	2	10	1866619	1866628	60 %	0 %	0 %	40 %	406027634
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31329	NC_018610	AGC	2	6	1866727	1866732	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406027634
31330	NC_018610	TGGG	2	8	1866792	1866799	0 %	25 %	75 %	0 %	406027634
31331	NC_018610	CTC	2	6	1866807	1866812	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406027634
31332	NC_018610	AGA	2	6	1866845	1866850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406027634
31333	NC_018610	ACC	2	6	1866930	1866935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406027634
31334	NC_018610	TCA	2	6	1866937	1866942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027634
31335	NC_018610	TCA	2	6	1866958	1866963	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027634
31336	NC_018610	TTG	2	6	1866984	1866989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406027634
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31339	NC_018610	GGT	2	6	1867119	1867124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406027634
31340	NC_018610	GT	3	6	1867123	1867128	0 %	50 %	50 %	0 %	406027634
31341	NC_018610	TTCC	2	8	1867144	1867151	0 %	50 %	0 %	50 %	406027634
31342	NC_018610	AG	3	6	1867206	1867211	50 %	0 %	50 %	0 %	406027634
31343	NC_018610	TTCT	2	8	1867278	1867285	0 %	75 %	0 %	25 %	406027634
31344	NC_018610	GCG	2	6	1867301	1867306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406027634
31345	NC_018610	GAT	2	6	1867519	1867524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406027635
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31464	NC_018610	ACCA	2	8	1875670	1875677	50 %	0 %	0 %	50 %	406027642
31465	NC_018610	ACT	2	6	1875871	1875876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027642
31466	NC_018610	AACC	2	8	1875878	1875885	50 %	0 %	0 %	50 %	406027642
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31495	NC_018610	TCA	2	6	1877832	1877837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406027645
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