MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus buchneri CD034 chromosome

Total Repeats: 41420

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18001	NC_018610	TCA	2	6	1098494	1098499	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026905
18002	NC_018610	GCC	2	6	1098524	1098529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026905
18003	NC_018610	CAT	2	6	1098609	1098614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026905
18004	NC_018610	A	6	6	1098628	1098633	100 %	0 %	0 %	0 %	406026905
18005	NC_018610	TCA	2	6	1098654	1098659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026905
18006	NC_018610	A	6	6	1098780	1098785	100 %	0 %	0 %	0 %	406026905
18007	NC_018610	TTG	2	6	1098800	1098805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026905
18008	NC_018610	A	7	7	1098871	1098877	100 %	0 %	0 %	0 %	406026905
18009	NC_018610	GAA	2	6	1098882	1098887	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026905
18010	NC_018610	ATG	2	6	1098897	1098902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026905
18011	NC_018610	TGA	2	6	1099018	1099023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18012	NC_018610	ATT	2	6	1099040	1099045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406026906
18013	NC_018610	A	6	6	1099265	1099270	100 %	0 %	0 %	0 %	406026906
18014	NC_018610	AAC	2	6	1099285	1099290	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026906
18015	NC_018610	TCG	2	6	1099510	1099515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026906
18016	NC_018610	TTC	2	6	1099523	1099528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026906
18017	NC_018610	AAG	2	6	1099551	1099556	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18018	NC_018610	TGC	2	6	1099565	1099570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026906
18019	NC_018610	AAG	2	6	1099587	1099592	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18020	NC_018610	GAT	2	6	1099680	1099685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18021	NC_018610	GAA	2	6	1099704	1099709	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18022	NC_018610	AGA	2	6	1099715	1099720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18023	NC_018610	GCC	2	6	1099783	1099788	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026906
18024	NC_018610	CAT	2	6	1099819	1099824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026906
18025	NC_018610	GAA	2	6	1099857	1099862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18026	NC_018610	ACT	2	6	1099927	1099932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026906
18027	NC_018610	AACT	2	8	1099939	1099946	50 %	25 %	0 %	25 %	406026906
18028	NC_018610	GAT	3	9	1100001	1100009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18029	NC_018610	CTGCAC	2	12	1100025	1100036	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	406026906
18030	NC_018610	TAA	2	6	1100063	1100068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026906
18031	NC_018610	A	7	7	1100173	1100179	100 %	0 %	0 %	0 %	406026906
18032	NC_018610	TGG	2	6	1100215	1100220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026906
18033	NC_018610	TTAC	2	8	1100236	1100243	25 %	50 %	0 %	25 %	406026906
18034	NC_018610	GTT	2	6	1100280	1100285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026906
18035	NC_018610	AAC	2	6	1100297	1100302	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026906
18036	NC_018610	TGAT	2	8	1100368	1100375	25 %	50 %	25 %	0 %	406026906
18037	NC_018610	GAA	2	6	1100382	1100387	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18038	NC_018610	GAAC	2	8	1100415	1100422	50 %	0 %	25 %	25 %	406026906
18039	NC_018610	GAA	2	6	1100475	1100480	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18040	NC_018610	GCGAT	2	10	1100509	1100518	20 %	20 %	40 %	20 %	406026906
18041	NC_018610	GTC	2	6	1100520	1100525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026906
18042	NC_018610	GCAT	2	8	1100581	1100588	25 %	25 %	25 %	25 %	406026906
18043	NC_018610	ATC	2	6	1100604	1100609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026906
18044	NC_018610	ACTTTG	2	12	1100613	1100624	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	406026906
18045	NC_018610	CAT	2	6	1100703	1100708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026906
18046	NC_018610	ATG	2	6	1100719	1100724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18047	NC_018610	CTAT	2	8	1100747	1100754	25 %	50 %	0 %	25 %	406026906
18048	NC_018610	GGCC	2	8	1100879	1100886	0 %	0 %	50 %	50 %	406026906
18049	NC_018610	CTGC	2	8	1100998	1101005	0 %	25 %	25 %	50 %	406026906
18050	NC_018610	ATG	2	6	1101030	1101035	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18051	NC_018610	CAC	2	6	1101112	1101117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026906
18052	NC_018610	GAT	2	6	1101141	1101146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18053	NC_018610	TGA	2	6	1101338	1101343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18054	NC_018610	GAA	2	6	1101384	1101389	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18055	NC_018610	TTG	2	6	1101391	1101396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026906
18056	NC_018610	ACA	2	6	1101400	1101405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026906
18057	NC_018610	TGA	2	6	1101419	1101424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18058	NC_018610	TCCA	2	8	1101436	1101443	25 %	25 %	0 %	50 %	406026906
18059	NC_018610	ATC	2	6	1101585	1101590	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026906
18060	NC_018610	GGTT	2	8	1101680	1101687	0 %	50 %	50 %	0 %	406026906
18061	NC_018610	GCC	2	6	1101734	1101739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406026906
18062	NC_018610	AC	3	6	1101764	1101769	50 %	0 %	0 %	50 %	406026906
18063	NC_018610	CA	3	6	1101814	1101819	50 %	0 %	0 %	50 %	406026906
18064	NC_018610	ATG	2	6	1101843	1101848	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18065	NC_018610	CTT	2	6	1101881	1101886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026906
18066	NC_018610	TTTG	2	8	1101971	1101978	0 %	75 %	25 %	0 %	406026906
18067	NC_018610	ATC	2	6	1102155	1102160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026906
18068	NC_018610	CGA	2	6	1102214	1102219	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026906
18069	NC_018610	AAC	2	6	1102238	1102243	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026906
18070	NC_018610	ATA	2	6	1102270	1102275	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026906
18071	NC_018610	ATG	2	6	1102300	1102305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18072	NC_018610	GAT	2	6	1102313	1102318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18073	NC_018610	GAT	2	6	1102368	1102373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
18074	NC_018610	TCT	2	6	1102390	1102395	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026906
18075	NC_018610	TCAA	2	8	1102433	1102440	50 %	25 %	0 %	25 %	406026906
18076	NC_018610	CAT	2	6	1102640	1102645	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026906
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18081	NC_018610	GAT	2	6	1102914	1102919	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
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18083	NC_018610	GAT	2	6	1102973	1102978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026906
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18085	NC_018610	CTG	2	6	1103019	1103024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026906
18086	NC_018610	TGG	2	6	1103077	1103082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026906
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18088	NC_018610	AG	3	6	1103196	1103201	50 %	0 %	50 %	0 %	406026906
18089	NC_018610	AGA	2	6	1103222	1103227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026906
18090	NC_018610	TTGA	2	8	1103259	1103266	25 %	50 %	25 %	0 %	406026906
18091	NC_018610	TTTGA	2	10	1103325	1103334	20 %	60 %	20 %	0 %	406026906
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18100	NC_018610	CAATT	2	10	1103952	1103961	40 %	40 %	0 %	20 %	406026907
18101	NC_018610	AAT	2	6	1103979	1103984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406026908
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18103	NC_018610	A	6	6	1104037	1104042	100 %	0 %	0 %	0 %	406026908
18104	NC_018610	CGA	2	6	1104129	1104134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026908
18105	NC_018610	A	6	6	1104136	1104141	100 %	0 %	0 %	0 %	406026908
18106	NC_018610	GGT	2	6	1104171	1104176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406026908
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18111	NC_018610	TGC	2	6	1104297	1104302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026908
18112	NC_018610	TGA	2	6	1104363	1104368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026908
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18116	NC_018610	AAC	2	6	1104700	1104705	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406026908
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18232	NC_018610	GAA	2	6	1110086	1110091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026914
18233	NC_018610	TCA	2	6	1110093	1110098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026914
18234	NC_018610	A	6	6	1110164	1110169	100 %	0 %	0 %	0 %	406026914
18235	NC_018610	TCA	2	6	1110219	1110224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406026914
18236	NC_018610	TTG	2	6	1110317	1110322	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406026914
18237	NC_018610	GAG	2	6	1110362	1110367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406026914
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18239	NC_018610	AGC	2	6	1110693	1110698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026914
18240	NC_018610	TTC	2	6	1110875	1110880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026915
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18243	NC_018610	TTC	2	6	1111029	1111034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026915
18244	NC_018610	ATCG	2	8	1111047	1111054	25 %	25 %	25 %	25 %	406026915
18245	NC_018610	CTT	2	6	1111130	1111135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026915
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18250	NC_018610	CTT	2	6	1111491	1111496	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406026915
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18264	NC_018610	AAAC	2	8	1112061	1112068	75 %	0 %	0 %	25 %	406026916
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18355	NC_018610	T	7	7	1115634	1115640	0 %	100 %	0 %	0 %	406026918
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18364	NC_018610	GATT	2	8	1116243	1116250	25 %	50 %	25 %	0 %	406026919
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18457	NC_018610	TGA	2	6	1122956	1122961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026925
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18460	NC_018610	A	6	6	1123044	1123049	100 %	0 %	0 %	0 %	406026925
18461	NC_018610	CCA	2	6	1123088	1123093	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406026925
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18463	NC_018610	A	6	6	1123131	1123136	100 %	0 %	0 %	0 %	406026925
18464	NC_018610	CTG	2	6	1123199	1123204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026925
18465	NC_018610	GAA	2	6	1123299	1123304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406026925
18466	NC_018610	ATG	2	6	1123363	1123368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026925
18467	NC_018610	CTG	2	6	1123404	1123409	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026925
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18471	NC_018610	TTTA	2	8	1123570	1123577	25 %	75 %	0 %	0 %	406026925
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18475	NC_018610	ATG	2	6	1124014	1124019	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406026926
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18482	NC_018610	CACC	2	8	1124343	1124350	25 %	0 %	0 %	75 %	406026927
18483	NC_018610	AC	3	6	1124443	1124448	50 %	0 %	0 %	50 %	406026927
18484	NC_018610	CTG	2	6	1124488	1124493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026927
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18486	NC_018610	A	7	7	1124592	1124598	100 %	0 %	0 %	0 %	406026927
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18492	NC_018610	TCAA	2	8	1124879	1124886	50 %	25 %	0 %	25 %	406026928
18493	NC_018610	C	6	6	1124937	1124942	0 %	0 %	0 %	100 %	406026928
18494	NC_018610	CTG	2	6	1124968	1124973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406026928
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18498	NC_018610	GGC	2	6	1125118	1125123	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	406026928
18499	NC_018610	GAC	2	6	1125157	1125162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406026928
18500	NC_018610	ATCCG	2	10	1125259	1125268	20 %	20 %	20 %	40 %	406026928

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