MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes SLCC2376

Total Repeats: 56600

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56501	NC_018590	ACTTTT	2	12	2836001	2836012	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	404409232
56502	NC_018590	CAT	2	6	2836026	2836031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409232
56503	NC_018590	CAA	2	6	2836086	2836091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409232
56504	NC_018590	A	8	8	2836122	2836129	100 %	0 %	0 %	0 %	404409232
56505	NC_018590	TCT	2	6	2836148	2836153	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409232
56506	NC_018590	AT	3	6	2836187	2836192	50 %	50 %	0 %	0 %	404409232
56507	NC_018590	CAA	2	6	2836224	2836229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409232
56508	NC_018590	T	6	6	2836256	2836261	0 %	100 %	0 %	0 %	404409232
56509	NC_018590	AGA	3	9	2836262	2836270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	404409232
56510	NC_018590	TCA	2	6	2836275	2836280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409232
56511	NC_018590	TGA	2	6	2836349	2836354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409232
56512	NC_018590	CAC	2	6	2836376	2836381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404409232
56513	NC_018590	TTA	2	6	2836399	2836404	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409232
56514	NC_018590	A	8	8	2836494	2836501	100 %	0 %	0 %	0 %	404409232
56515	NC_018590	A	6	6	2836537	2836542	100 %	0 %	0 %	0 %	404409232
56516	NC_018590	GCA	2	6	2836548	2836553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409232
56517	NC_018590	ATT	2	6	2836593	2836598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409232
56518	NC_018590	ACTT	2	8	2836623	2836630	25 %	50 %	0 %	25 %	404409232
56519	NC_018590	A	7	7	2836644	2836650	100 %	0 %	0 %	0 %	404409232
56520	NC_018590	A	6	6	2836683	2836688	100 %	0 %	0 %	0 %	404409232
56521	NC_018590	AAC	2	6	2836750	2836755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409233
56522	NC_018590	TCT	2	6	2836784	2836789	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409233
56523	NC_018590	CA	3	6	2836810	2836815	50 %	0 %	0 %	50 %	404409233
56524	NC_018590	TTA	2	6	2836932	2836937	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409233
56525	NC_018590	CTT	3	9	2836956	2836964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409233
56526	NC_018590	ACA	2	6	2836979	2836984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	404409233
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56528	NC_018590	CCAT	2	8	2837060	2837067	25 %	25 %	0 %	50 %	404409233
56529	NC_018590	CCA	2	6	2837075	2837080	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	404409233
56530	NC_018590	ACTT	2	8	2837127	2837134	25 %	50 %	0 %	25 %	404409233
56531	NC_018590	ATC	2	6	2837138	2837143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409233
56532	NC_018590	ATTT	2	8	2837255	2837262	25 %	75 %	0 %	0 %	404409234
56533	NC_018590	AAT	2	6	2837350	2837355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409234
56534	NC_018590	TTTC	2	8	2837357	2837364	0 %	75 %	0 %	25 %	404409234
56535	NC_018590	GC	3	6	2837393	2837398	0 %	0 %	50 %	50 %	404409234
56536	NC_018590	AAT	2	6	2837485	2837490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	404409234
56537	NC_018590	GTT	2	6	2837507	2837512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409234
56538	NC_018590	TTA	2	6	2837513	2837518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409234
56539	NC_018590	AATT	2	8	2837521	2837528	50 %	50 %	0 %	0 %	404409234
56540	NC_018590	CTT	2	6	2837625	2837630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409234
56541	NC_018590	ATCG	2	8	2837635	2837642	25 %	25 %	25 %	25 %	404409234
56542	NC_018590	AATC	2	8	2837682	2837689	50 %	25 %	0 %	25 %	404409234
56543	NC_018590	TCT	2	6	2837705	2837710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	404409234
56544	NC_018590	T	6	6	2837761	2837766	0 %	100 %	0 %	0 %	404409234
56545	NC_018590	GTT	2	6	2837804	2837809	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	404409234
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56547	NC_018590	CTTT	2	8	2837877	2837884	0 %	75 %	0 %	25 %	404409234
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56549	NC_018590	T	6	6	2837895	2837900	0 %	100 %	0 %	0 %	404409235
56550	NC_018590	GCT	2	6	2837917	2837922	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	404409235
56551	NC_018590	T	6	6	2837922	2837927	0 %	100 %	0 %	0 %	404409235
56552	NC_018590	AGC	2	6	2837952	2837957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	404409235
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56554	NC_018590	GTTT	2	8	2837978	2837985	0 %	75 %	25 %	0 %	404409235
56555	NC_018590	ATT	2	6	2837994	2837999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	404409235
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56557	NC_018590	ATC	2	6	2838112	2838117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409235
56558	NC_018590	ATTT	2	8	2838125	2838132	25 %	75 %	0 %	0 %	404409235
56559	NC_018590	CAT	2	6	2838147	2838152	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	404409235
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56562	NC_018590	GAAT	2	8	2838240	2838247	50 %	25 %	25 %	0 %	404409235
56563	NC_018590	TAG	2	6	2838291	2838296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	404409235
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56567	NC_018590	TGTTT	2	10	2838388	2838397	0 %	80 %	20 %	0 %	404409235
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56575	NC_018590	GACA	2	8	2838969	2838976	50 %	0 %	25 %	25 %	404409236
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56587	NC_018590	TC	3	6	2839554	2839559	0 %	50 %	0 %	50 %	404409238
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56594	NC_018590	T	8	8	2839809	2839816	0 %	100 %	0 %	0 %	404409238
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56600	NC_018590	TC	3	6	2839968	2839973	0 %	50 %	0 %	50 %	404409238

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.