MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_018528	TTCC	2	8	236358	236365	0 %	50 %	0 %	50 %	403514263
4002	NC_018528	TGC	2	6	236438	236443	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514263
4003	NC_018528	TTG	2	6	236485	236490	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514263
4004	NC_018528	TA	3	6	236512	236517	50 %	50 %	0 %	0 %	403514263
4005	NC_018528	TAA	2	6	236574	236579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514263
4006	NC_018528	AAATC	2	10	236597	236606	60 %	20 %	0 %	20 %	403514263
4007	NC_018528	ATC	2	6	236681	236686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514263
4008	NC_018528	ACT	2	6	236690	236695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514263
4009	NC_018528	GCTA	2	8	236725	236732	25 %	25 %	25 %	25 %	403514263
4010	NC_018528	TTG	2	6	236771	236776	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514263
4011	NC_018528	T	6	6	236802	236807	0 %	100 %	0 %	0 %	403514263
4012	NC_018528	TAA	2	6	236902	236907	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514263
4013	NC_018528	GTC	2	6	236914	236919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514263
4014	NC_018528	T	6	6	236956	236961	0 %	100 %	0 %	0 %	403514263
4015	NC_018528	TTC	2	6	236979	236984	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514263
4016	NC_018528	AC	3	6	236997	237002	50 %	0 %	0 %	50 %	403514263
4017	NC_018528	GCT	2	6	237063	237068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514263
4018	NC_018528	AAC	2	6	237115	237120	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514263
4019	NC_018528	CTT	2	6	237168	237173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514263
4020	NC_018528	T	6	6	237181	237186	0 %	100 %	0 %	0 %	403514263
4021	NC_018528	GCA	2	6	237321	237326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514264
4022	NC_018528	GAT	2	6	237360	237365	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514264
4023	NC_018528	GAAACT	2	12	237366	237377	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	403514264
4024	NC_018528	AGA	2	6	237404	237409	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514264
4025	NC_018528	AAT	2	6	237411	237416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514264
4026	NC_018528	GT	3	6	237427	237432	0 %	50 %	50 %	0 %	403514264
4027	NC_018528	AGA	2	6	237440	237445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514264
4028	NC_018528	TAG	2	6	237509	237514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514264
4029	NC_018528	TGT	2	6	237566	237571	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514264
4030	NC_018528	AGCA	2	8	237625	237632	50 %	0 %	25 %	25 %	403514264
4031	NC_018528	TAA	2	6	237682	237687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514264
4032	NC_018528	GAA	2	6	237910	237915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514265
4033	NC_018528	GAA	2	6	238030	238035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514265
4034	NC_018528	ACC	2	6	238040	238045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514265
4035	NC_018528	AGA	2	6	238047	238052	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514265
4036	NC_018528	GAA	2	6	238054	238059	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514265
4037	NC_018528	AAG	2	6	238081	238086	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514265
4038	NC_018528	TGA	3	9	238116	238124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514265
4039	NC_018528	ATT	2	6	238126	238131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514265
4040	NC_018528	ATG	2	6	238142	238147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514265
4041	NC_018528	AGA	2	6	238152	238157	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514265
4042	NC_018528	GAT	2	6	238159	238164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514265
4043	NC_018528	CTG	2	6	238175	238180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514265
4044	NC_018528	TGA	3	9	238203	238211	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514265
4045	NC_018528	TGA	2	6	238242	238247	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514265
4046	NC_018528	GAT	2	6	238291	238296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514265
4047	NC_018528	GAC	2	6	238297	238302	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514265
4048	NC_018528	TAAT	2	8	238308	238315	50 %	50 %	0 %	0 %	403514265
4049	NC_018528	AAAT	2	8	238426	238433	75 %	25 %	0 %	0 %	403514266
4050	NC_018528	CTT	2	6	238510	238515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514266
4051	NC_018528	AT	3	6	238557	238562	50 %	50 %	0 %	0 %	403514266
4052	NC_018528	GAT	2	6	238618	238623	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514266
4053	NC_018528	AGTA	2	8	238681	238688	50 %	25 %	25 %	0 %	403514266
4054	NC_018528	ACT	2	6	238699	238704	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514266
4055	NC_018528	AAG	2	6	238718	238723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514266
4056	NC_018528	CGT	2	6	238738	238743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514266
4057	NC_018528	AAG	3	9	238798	238806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514266
4058	NC_018528	GCA	2	6	238816	238821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514266
4059	NC_018528	CAC	2	6	238824	238829	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514266
4060	NC_018528	ATT	2	6	238843	238848	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514266
4061	NC_018528	TGG	2	6	238857	238862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514266
4062	NC_018528	CGT	2	6	238915	238920	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514266
4063	NC_018528	GAA	2	6	238930	238935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514266
4064	NC_018528	AATGT	2	10	238936	238945	40 %	40 %	20 %	0 %	403514266
4065	NC_018528	CTT	2	6	238969	238974	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514266
4066	NC_018528	ATGAA	2	10	238985	238994	60 %	20 %	20 %	0 %	403514266
4067	NC_018528	TTC	2	6	239060	239065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514266
4068	NC_018528	AAC	2	6	239072	239077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514266
4069	NC_018528	ATT	2	6	239163	239168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514266
4070	NC_018528	CTT	2	6	239220	239225	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514266
4071	NC_018528	GAA	2	6	239268	239273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514266
4072	NC_018528	TGA	2	6	239277	239282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514266
4073	NC_018528	CAC	2	6	239302	239307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403514266
4074	NC_018528	TGGT	2	8	239321	239328	0 %	50 %	50 %	0 %	403514266
4075	NC_018528	ACA	2	6	239396	239401	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514266
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4077	NC_018528	ACA	2	6	239447	239452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514266
4078	NC_018528	TGG	2	6	239493	239498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514266
4079	NC_018528	TTTG	2	8	239576	239583	0 %	75 %	25 %	0 %	403514266
4080	NC_018528	TAC	2	6	239643	239648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514266
4081	NC_018528	ATT	2	6	239677	239682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514266
4082	NC_018528	TGA	2	6	239703	239708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514266
4083	NC_018528	TGG	2	6	239718	239723	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514266
4084	NC_018528	GCT	2	6	239749	239754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514266
4085	NC_018528	AAG	2	6	239758	239763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514266
4086	NC_018528	CGTCAC	2	12	239812	239823	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	403514266
4087	NC_018528	AAC	2	6	239836	239841	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514266
4088	NC_018528	TGGTA	2	10	239868	239877	20 %	40 %	40 %	0 %	403514266
4089	NC_018528	ATT	2	6	239914	239919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514266
4090	NC_018528	AGA	2	6	239930	239935	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514266
4091	NC_018528	GTC	2	6	239975	239980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514266
4092	NC_018528	GAT	2	6	240189	240194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514267
4093	NC_018528	TGG	2	6	240201	240206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514267
4094	NC_018528	TGG	2	6	240234	240239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514267
4095	NC_018528	TTG	2	6	240320	240325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403514267
4096	NC_018528	TTA	2	6	240346	240351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514267
4097	NC_018528	GATG	2	8	240357	240364	25 %	25 %	50 %	0 %	403514267
4098	NC_018528	CTT	2	6	240481	240486	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514267
4099	NC_018528	AGT	2	6	240504	240509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514267
4100	NC_018528	TGG	2	6	240519	240524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514267
4101	NC_018528	AGA	2	6	240627	240632	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514267
4102	NC_018528	ATT	2	6	240691	240696	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514267
4103	NC_018528	TAT	2	6	240726	240731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514267
4104	NC_018528	ATT	2	6	240757	240762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514267
4105	NC_018528	GTG	2	6	240803	240808	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403514267
4106	NC_018528	ATT	2	6	240871	240876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514267
4107	NC_018528	GTATTC	2	12	240932	240943	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403514267
4108	NC_018528	ATA	2	6	240944	240949	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514267
4109	NC_018528	GAA	2	6	240955	240960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514267
4110	NC_018528	CTTA	2	8	240971	240978	25 %	50 %	0 %	25 %	403514267
4111	NC_018528	AGA	2	6	240987	240992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403514267
4112	NC_018528	GTA	2	6	241000	241005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514267
4113	NC_018528	CAG	2	6	241040	241045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403514267
4114	NC_018528	CAA	2	6	241105	241110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403514267
4115	NC_018528	CTT	2	6	241123	241128	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403514267
4116	NC_018528	GTA	2	6	241153	241158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514267
4117	NC_018528	ATA	2	6	241163	241168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514267
4118	NC_018528	ATA	2	6	241235	241240	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403514267
4119	NC_018528	CTG	2	6	241286	241291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514267
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4121	NC_018528	GAT	2	6	241317	241322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514267
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4366	NC_018528	TAT	2	6	258316	258321	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403514283
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4374	NC_018528	TAATT	2	10	258760	258769	40 %	60 %	0 %	0 %	403514283
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4486	NC_018528	ATC	2	6	264606	264611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403514289
4487	NC_018528	GTA	2	6	264620	264625	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403514289
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4490	NC_018528	CGT	2	6	264815	264820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403514289
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