MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31001	NC_018528	CGA	2	6	1812361	1812366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515737
31002	NC_018528	ACGC	2	8	1812371	1812378	25 %	0 %	25 %	50 %	403515737
31003	NC_018528	TGC	2	6	1812391	1812396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515737
31004	NC_018528	CTT	2	6	1812520	1812525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515737
31005	NC_018528	TAA	2	6	1812532	1812537	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515737
31006	NC_018528	ACA	3	9	1812582	1812590	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515737
31007	NC_018528	GGGCAA	2	12	1812595	1812606	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	403515737
31008	NC_018528	CAA	2	6	1812685	1812690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515737
31009	NC_018528	GAT	2	6	1812725	1812730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515737
31010	NC_018528	CGC	2	6	1812773	1812778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403515737
31011	NC_018528	A	7	7	1812803	1812809	100 %	0 %	0 %	0 %	403515737
31012	NC_018528	GAA	2	6	1812832	1812837	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515737
31013	NC_018528	GAC	2	6	1812874	1812879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515737
31014	NC_018528	ACG	2	6	1812947	1812952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515737
31015	NC_018528	CAC	2	6	1812985	1812990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515737
31016	NC_018528	TAT	2	6	1813019	1813024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515737
31017	NC_018528	CAGA	2	8	1813045	1813052	50 %	0 %	25 %	25 %	403515737
31018	NC_018528	ATT	2	6	1813276	1813281	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515738
31019	NC_018528	ATA	2	6	1813282	1813287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515738
31020	NC_018528	TCG	2	6	1813300	1813305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515738
31021	NC_018528	ATTG	2	8	1813369	1813376	25 %	50 %	25 %	0 %	403515738
31022	NC_018528	AAC	2	6	1813425	1813430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515738
31023	NC_018528	GTAG	2	8	1813520	1813527	25 %	25 %	50 %	0 %	403515738
31024	NC_018528	TTG	2	6	1813634	1813639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515738
31025	NC_018528	CTT	2	6	1813694	1813699	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515738
31026	NC_018528	CTT	2	6	1813709	1813714	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515738
31027	NC_018528	CAA	2	6	1813738	1813743	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515738
31028	NC_018528	CTT	2	6	1813754	1813759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515738
31029	NC_018528	GCT	2	6	1813767	1813772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515738
31030	NC_018528	CTT	2	6	1813805	1813810	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515738
31031	NC_018528	CTT	2	6	1813862	1813867	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515738
31032	NC_018528	ATCC	2	8	1813895	1813902	25 %	25 %	0 %	50 %	403515738
31033	NC_018528	TACC	2	8	1813942	1813949	25 %	25 %	0 %	50 %	403515738
31034	NC_018528	CAG	2	6	1813978	1813983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515738
31035	NC_018528	TTA	2	6	1814040	1814045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515738
31036	NC_018528	TAAT	2	8	1814082	1814089	50 %	50 %	0 %	0 %	403515738
31037	NC_018528	AGTG	2	8	1814165	1814172	25 %	25 %	50 %	0 %	403515738
31038	NC_018528	GCT	2	6	1814178	1814183	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515738
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31040	NC_018528	TTC	2	6	1814212	1814217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515738
31041	NC_018528	CAG	2	6	1814563	1814568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515739
31042	NC_018528	CTG	3	9	1814570	1814578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515739
31043	NC_018528	GA	3	6	1814646	1814651	50 %	0 %	50 %	0 %	403515739
31044	NC_018528	T	6	6	1814781	1814786	0 %	100 %	0 %	0 %	403515739
31045	NC_018528	TCT	2	6	1814802	1814807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515739
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31047	NC_018528	GCT	2	6	1814923	1814928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515740
31048	NC_018528	TCA	2	6	1814930	1814935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515740
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31050	NC_018528	TAA	2	6	1815005	1815010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515740
31051	NC_018528	ATC	2	6	1815317	1815322	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515741
31052	NC_018528	TTCT	2	8	1815345	1815352	0 %	75 %	0 %	25 %	403515741
31053	NC_018528	AAAT	2	8	1815368	1815375	75 %	25 %	0 %	0 %	403515741
31054	NC_018528	AC	4	8	1815860	1815867	50 %	0 %	0 %	50 %	403515742
31055	NC_018528	T	7	7	1815884	1815890	0 %	100 %	0 %	0 %	403515742
31056	NC_018528	CCT	2	6	1815943	1815948	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403515742
31057	NC_018528	CTA	2	6	1816009	1816014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515742
31058	NC_018528	GGC	2	6	1816019	1816024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403515742
31059	NC_018528	GC	3	6	1816034	1816039	0 %	0 %	50 %	50 %	403515742
31060	NC_018528	CTC	2	6	1816091	1816096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403515742
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31062	NC_018528	TGTT	2	8	1816212	1816219	0 %	75 %	25 %	0 %	403515742
31063	NC_018528	T	7	7	1816218	1816224	0 %	100 %	0 %	0 %	403515742
31064	NC_018528	A	6	6	1816365	1816370	100 %	0 %	0 %	0 %	403515742
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31066	NC_018528	TCT	2	6	1816460	1816465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515742
31067	NC_018528	GCC	2	6	1816508	1816513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403515742
31068	NC_018528	CTG	2	6	1816556	1816561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515742
31069	NC_018528	TCA	2	6	1816563	1816568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515742
31070	NC_018528	CAC	2	6	1816648	1816653	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515742
31071	NC_018528	TCG	2	6	1816683	1816688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515742
31072	NC_018528	TAC	2	6	1816707	1816712	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515742
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31078	NC_018528	AATT	2	8	1817225	1817232	50 %	50 %	0 %	0 %	403515743
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31082	NC_018528	CTT	2	6	1817490	1817495	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515743
31083	NC_018528	TTCAAT	2	12	1817570	1817581	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	403515743
31084	NC_018528	GAC	2	6	1817586	1817591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515743
31085	NC_018528	CGG	2	6	1817592	1817597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403515743
31086	NC_018528	TCC	2	6	1817681	1817686	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403515743
31087	NC_018528	CGC	2	6	1817789	1817794	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403515743
31088	NC_018528	TTCGT	2	10	1817807	1817816	0 %	60 %	20 %	20 %	403515743
31089	NC_018528	CCA	2	6	1817817	1817822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515743
31090	NC_018528	GAG	2	6	1817917	1817922	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	403515743
31091	NC_018528	GGC	2	6	1817934	1817939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403515743
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31094	NC_018528	CCAA	2	8	1818109	1818116	50 %	0 %	0 %	50 %	403515743
31095	NC_018528	CAA	2	6	1818169	1818174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515743
31096	NC_018528	GCCA	2	8	1818196	1818203	25 %	0 %	25 %	50 %	403515743
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31098	NC_018528	T	7	7	1818289	1818295	0 %	100 %	0 %	0 %	403515743
31099	NC_018528	CAC	2	6	1818312	1818317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515743
31100	NC_018528	TTA	2	6	1818446	1818451	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515744
31101	NC_018528	TAT	2	6	1818516	1818521	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515744
31102	NC_018528	TCG	2	6	1818684	1818689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515744
31103	NC_018528	TTTG	2	8	1818904	1818911	0 %	75 %	25 %	0 %	403515744
31104	NC_018528	TTTC	2	8	1818994	1819001	0 %	75 %	0 %	25 %	403515744
31105	NC_018528	GCA	2	6	1819019	1819024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515744
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31108	NC_018528	TGGAA	2	10	1820616	1820625	40 %	20 %	40 %	0 %	403515745
31109	NC_018528	CCA	2	6	1820663	1820668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515745
31110	NC_018528	TGG	2	6	1820799	1820804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515745
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31114	NC_018528	AACCGG	2	12	1821259	1821270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515746
31115	NC_018528	T	6	6	1821416	1821421	0 %	100 %	0 %	0 %	403515746
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31117	NC_018528	TTGA	2	8	1821634	1821641	25 %	50 %	25 %	0 %	403515746
31118	NC_018528	TTG	2	6	1821660	1821665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515746
31119	NC_018528	T	6	6	1821670	1821675	0 %	100 %	0 %	0 %	403515746
31120	NC_018528	TGCTT	2	10	1821701	1821710	0 %	60 %	20 %	20 %	403515746
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31217	NC_018528	CGA	2	6	1827276	1827281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515751
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31220	NC_018528	GAAT	2	8	1828047	1828054	50 %	25 %	25 %	0 %	403515753
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31222	NC_018528	GAAC	2	8	1828081	1828088	50 %	0 %	25 %	25 %	403515753
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31230	NC_018528	AACA	2	8	1828306	1828313	75 %	0 %	0 %	25 %	403515753
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31232	NC_018528	ATC	2	6	1828368	1828373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515753
31233	NC_018528	CTT	2	6	1828445	1828450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515753
31234	NC_018528	CAT	2	6	1828456	1828461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515753
31235	NC_018528	CAA	2	6	1828463	1828468	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515753
31236	NC_018528	AGC	2	6	1828475	1828480	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515753
31237	NC_018528	CGT	2	6	1828481	1828486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515753
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31239	NC_018528	TTGGCG	2	12	1828552	1828563	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	403515753
31240	NC_018528	AGC	2	6	1828607	1828612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515753
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31252	NC_018528	GTC	2	6	1829229	1829234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515753
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31254	NC_018528	ATC	2	6	1829340	1829345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515753
31255	NC_018528	TTTG	2	8	1829362	1829369	0 %	75 %	25 %	0 %	403515753
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31301	NC_018528	TGCCA	2	10	1832034	1832043	20 %	20 %	20 %	40 %	403515757
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31332	NC_018528	CTAA	2	8	1834117	1834124	50 %	25 %	0 %	25 %	403515759
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31338	NC_018528	ACT	2	6	1834276	1834281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515759
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31340	NC_018528	AGA	2	6	1834317	1834322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515759
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31342	NC_018528	TCT	2	6	1834416	1834421	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515759
31343	NC_018528	CAG	2	6	1834430	1834435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515759
31344	NC_018528	TAA	2	6	1834448	1834453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515759
31345	NC_018528	TTTC	2	8	1834459	1834466	0 %	75 %	0 %	25 %	403515759
31346	NC_018528	GATA	2	8	1834518	1834525	50 %	25 %	25 %	0 %	403515759
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31466	NC_018528	CTT	3	9	1842484	1842492	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515768
31467	NC_018528	TCCT	2	8	1842578	1842585	0 %	50 %	0 %	50 %	403515768
31468	NC_018528	A	6	6	1842587	1842592	100 %	0 %	0 %	0 %	403515768
31469	NC_018528	TCT	2	6	1842601	1842606	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515768
31470	NC_018528	GCA	3	9	1842714	1842722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515768
31471	NC_018528	CCT	2	6	1842724	1842729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403515768
31472	NC_018528	TCT	2	6	1842736	1842741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515768
31473	NC_018528	TCT	2	6	1842843	1842848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515768
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31475	NC_018528	TGA	3	9	1844595	1844603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515769
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31479	NC_018528	ATT	2	6	1844974	1844979	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515769
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31481	NC_018528	ACA	2	6	1845083	1845088	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515769
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31485	NC_018528	AGT	2	6	1845243	1845248	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515769
31486	NC_018528	ATG	2	6	1845580	1845585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515770
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31491	NC_018528	TGAA	2	8	1846169	1846176	50 %	25 %	25 %	0 %	403515771
31492	NC_018528	TTC	2	6	1846218	1846223	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515771
31493	NC_018528	GAA	2	6	1846263	1846268	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515771
31494	NC_018528	A	6	6	1846281	1846286	100 %	0 %	0 %	0 %	403515771
31495	NC_018528	T	6	6	1846295	1846300	0 %	100 %	0 %	0 %	403515771
31496	NC_018528	A	6	6	1846338	1846343	100 %	0 %	0 %	0 %	403515771
31497	NC_018528	TAT	2	6	1846354	1846359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515771
31498	NC_018528	TCAT	2	8	1846371	1846378	25 %	50 %	0 %	25 %	403515771
31499	NC_018528	CAAA	2	8	1846398	1846405	75 %	0 %	0 %	25 %	403515771
31500	NC_018528	TGT	2	6	1846440	1846445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515771

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