MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
25501	NC_018528	GTA	2	6	1491674	1491679	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515431
25502	NC_018528	TCT	2	6	1491681	1491686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515431
25503	NC_018528	TAT	2	6	1491723	1491728	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515431
25504	NC_018528	CTT	2	6	1491745	1491750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515431
25505	NC_018528	CCA	2	6	1491752	1491757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515431
25506	NC_018528	ACA	2	6	1491797	1491802	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515431
25507	NC_018528	AAC	2	6	1491925	1491930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515431
25508	NC_018528	TTC	2	6	1491941	1491946	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515431
25509	NC_018528	TCT	2	6	1491981	1491986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515431
25510	NC_018528	TCT	3	9	1492020	1492028	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515431
25511	NC_018528	AGA	2	6	1492030	1492035	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515431
25512	NC_018528	GAT	2	6	1492040	1492045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515431
25513	NC_018528	TGA	2	6	1492054	1492059	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515431
25514	NC_018528	TAT	2	6	1492074	1492079	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515431
25515	NC_018528	ACC	2	6	1492096	1492101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515431
25516	NC_018528	TGA	2	6	1492102	1492107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515431
25517	NC_018528	AAT	2	6	1492144	1492149	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515431
25518	NC_018528	TTC	2	6	1492196	1492201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515431
25519	NC_018528	CTT	2	6	1492224	1492229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515431
25520	NC_018528	TCA	2	6	1492262	1492267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515431
25521	NC_018528	AGT	2	6	1492304	1492309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515431
25522	NC_018528	ACT	2	6	1492328	1492333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515431
25523	NC_018528	CT	3	6	1492471	1492476	0 %	50 %	0 %	50 %	403515431
25524	NC_018528	TC	3	6	1492491	1492496	0 %	50 %	0 %	50 %	403515431
25525	NC_018528	AGCC	2	8	1492584	1492591	25 %	0 %	25 %	50 %	403515432
25526	NC_018528	TTGT	2	8	1492606	1492613	0 %	75 %	25 %	0 %	403515432
25527	NC_018528	TGC	2	6	1492627	1492632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515432
25528	NC_018528	TCT	2	6	1492701	1492706	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515432
25529	NC_018528	TCT	2	6	1492725	1492730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515432
25530	NC_018528	ATT	2	6	1492790	1492795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515432
25531	NC_018528	TA	3	6	1492855	1492860	50 %	50 %	0 %	0 %	403515432
25532	NC_018528	TAGT	2	8	1492954	1492961	25 %	50 %	25 %	0 %	403515432
25533	NC_018528	TTA	2	6	1492987	1492992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515432
25534	NC_018528	CAA	2	6	1493075	1493080	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515432
25535	NC_018528	CAT	2	6	1493107	1493112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515432
25536	NC_018528	AATTT	2	10	1493122	1493131	40 %	60 %	0 %	0 %	403515432
25537	NC_018528	AAT	2	6	1493166	1493171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515432
25538	NC_018528	TTC	2	6	1493183	1493188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515432
25539	NC_018528	GC	3	6	1493295	1493300	0 %	0 %	50 %	50 %	403515432
25540	NC_018528	ATTT	2	8	1493304	1493311	25 %	75 %	0 %	0 %	403515432
25541	NC_018528	TTC	2	6	1493312	1493317	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515433
25542	NC_018528	TTC	2	6	1493387	1493392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515433
25543	NC_018528	TTC	2	6	1493450	1493455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515433
25544	NC_018528	ATT	2	6	1493483	1493488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515433
25545	NC_018528	GCCA	2	8	1493508	1493515	25 %	0 %	25 %	50 %	403515433
25546	NC_018528	TTCT	2	8	1493516	1493523	0 %	75 %	0 %	25 %	403515433
25547	NC_018528	TAA	2	6	1493545	1493550	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515433
25548	NC_018528	ATT	2	6	1493610	1493615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515433
25549	NC_018528	CTT	2	6	1493707	1493712	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515433
25550	NC_018528	TCA	2	6	1493737	1493742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515433
25551	NC_018528	ATT	2	6	1493763	1493768	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515433
25552	NC_018528	ATA	2	6	1493800	1493805	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515433
25553	NC_018528	TCC	2	6	1493855	1493860	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403515433
25554	NC_018528	CAA	2	6	1494007	1494012	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515433
25555	NC_018528	TAG	2	6	1494022	1494027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515433
25556	NC_018528	CTA	2	6	1494097	1494102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515433
25557	NC_018528	ATC	2	6	1494170	1494175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515433
25558	NC_018528	CTA	2	6	1494250	1494255	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515433
25559	NC_018528	AAC	3	9	1494261	1494269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515433
25560	NC_018528	ATC	2	6	1494273	1494278	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515433
25561	NC_018528	T	6	6	1494386	1494391	0 %	100 %	0 %	0 %	403515433
25562	NC_018528	AAT	2	6	1494396	1494401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515433
25563	NC_018528	A	6	6	1494411	1494416	100 %	0 %	0 %	0 %	403515433
25564	NC_018528	CTG	2	6	1494447	1494452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515433
25565	NC_018528	AAT	3	9	1494461	1494469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515433
25566	NC_018528	A	6	6	1494474	1494479	100 %	0 %	0 %	0 %	403515433
25567	NC_018528	TAA	2	6	1494541	1494546	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515433
25568	NC_018528	CGT	2	6	1494619	1494624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515434
25569	NC_018528	T	6	6	1494628	1494633	0 %	100 %	0 %	0 %	403515434
25570	NC_018528	TC	3	6	1494642	1494647	0 %	50 %	0 %	50 %	403515434
25571	NC_018528	AAT	2	6	1494660	1494665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515434
25572	NC_018528	ATCCA	2	10	1494715	1494724	40 %	20 %	0 %	40 %	403515434
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25574	NC_018528	TTC	2	6	1494769	1494774	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515434
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25583	NC_018528	TCAA	2	8	1495079	1495086	50 %	25 %	0 %	25 %	403515434
25584	NC_018528	TAA	2	6	1495131	1495136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515434
25585	NC_018528	TAAAA	2	10	1495149	1495158	80 %	20 %	0 %	0 %	403515434
25586	NC_018528	TCA	2	6	1495173	1495178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515434
25587	NC_018528	CTACAG	2	12	1495203	1495214	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403515434
25588	NC_018528	TCA	2	6	1495274	1495279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515434
25589	NC_018528	A	6	6	1495333	1495338	100 %	0 %	0 %	0 %	403515434
25590	NC_018528	CGAT	2	8	1495340	1495347	25 %	25 %	25 %	25 %	403515434
25591	NC_018528	GCT	2	6	1495362	1495367	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515434
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25599	NC_018528	ACA	2	6	1495659	1495664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515434
25600	NC_018528	A	6	6	1495706	1495711	100 %	0 %	0 %	0 %	403515434
25601	NC_018528	T	6	6	1495735	1495740	0 %	100 %	0 %	0 %	403515434
25602	NC_018528	T	6	6	1495742	1495747	0 %	100 %	0 %	0 %	403515434
25603	NC_018528	ATT	2	6	1495772	1495777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515434
25604	NC_018528	TGG	2	6	1495799	1495804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515435
25605	NC_018528	TCA	2	6	1495866	1495871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515435
25606	NC_018528	GCA	2	6	1495881	1495886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515435
25607	NC_018528	GCA	2	6	1495915	1495920	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515435
25608	NC_018528	TGC	2	6	1495938	1495943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515435
25609	NC_018528	CGA	2	6	1495944	1495949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515435
25610	NC_018528	TCT	2	6	1495980	1495985	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515435
25611	NC_018528	TCA	2	6	1495989	1495994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515435
25612	NC_018528	TCA	2	6	1496046	1496051	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515435
25613	NC_018528	TGC	2	6	1496064	1496069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515435
25614	NC_018528	TCA	2	6	1496100	1496105	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515435
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25734	NC_018528	CAT	2	6	1501963	1501968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515440
25735	NC_018528	GTG	2	6	1501981	1501986	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515440
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25852	NC_018528	T	6	6	1509447	1509452	0 %	100 %	0 %	0 %	403515445
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25962	NC_018528	TGA	2	6	1514416	1514421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515451
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