MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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25002	NC_018528	AAAGAT	2	12	1462679	1462690	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	403515409
25003	NC_018528	CCAT	2	8	1462731	1462738	25 %	25 %	0 %	50 %	403515409
25004	NC_018528	CTT	2	6	1462795	1462800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515409
25005	NC_018528	GTA	3	9	1462803	1462811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515409
25006	NC_018528	CAT	2	6	1462912	1462917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515409
25007	NC_018528	TGA	2	6	1462951	1462956	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515409
25008	NC_018528	AGC	2	6	1462982	1462987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515409
25009	NC_018528	CT	3	6	1463008	1463013	0 %	50 %	0 %	50 %	403515409
25010	NC_018528	GAT	2	6	1463017	1463022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515409
25011	NC_018528	TTC	2	6	1463031	1463036	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515409
25012	NC_018528	TAA	2	6	1463053	1463058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515409
25013	NC_018528	CAA	2	6	1463063	1463068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515409
25014	NC_018528	TCT	2	6	1463152	1463157	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515409
25015	NC_018528	TAA	2	6	1463158	1463163	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515409
25016	NC_018528	AGC	2	6	1463247	1463252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515409
25017	NC_018528	CAAG	2	8	1463416	1463423	50 %	0 %	25 %	25 %	403515409
25018	NC_018528	AAT	2	6	1463465	1463470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515409
25019	NC_018528	TTA	2	6	1463499	1463504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515409
25020	NC_018528	TAA	2	6	1463521	1463526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515409
25021	NC_018528	TCGA	2	8	1463567	1463574	25 %	25 %	25 %	25 %	403515409
25022	NC_018528	TAA	2	6	1463581	1463586	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515409
25023	NC_018528	AAT	2	6	1463604	1463609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515409
25024	NC_018528	TCA	2	6	1463614	1463619	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515409
25025	NC_018528	TGGT	2	8	1463661	1463668	0 %	50 %	50 %	0 %	403515409
25026	NC_018528	CAAT	2	8	1463709	1463716	50 %	25 %	0 %	25 %	403515409
25027	NC_018528	CTA	2	6	1463728	1463733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515409
25028	NC_018528	GTA	2	6	1463840	1463845	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515409
25029	NC_018528	AAG	2	6	1463877	1463882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515409
25030	NC_018528	TAA	2	6	1463900	1463905	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515409
25031	NC_018528	ATC	2	6	1463969	1463974	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515409
25032	NC_018528	TAG	2	6	1463977	1463982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515409
25033	NC_018528	TAAT	2	8	1463985	1463992	50 %	50 %	0 %	0 %	403515409
25034	NC_018528	TTC	2	6	1463993	1463998	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515409
25035	NC_018528	ACC	2	6	1464098	1464103	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515409
25036	NC_018528	AGAC	2	8	1464169	1464176	50 %	0 %	25 %	25 %	403515409
25037	NC_018528	TTG	2	6	1464177	1464182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515409
25038	NC_018528	TACCGT	2	12	1464289	1464300	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403515409
25039	NC_018528	GCT	3	9	1464339	1464347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515409
25040	NC_018528	CCA	2	6	1464360	1464365	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515409
25041	NC_018528	ATCC	2	8	1464446	1464453	25 %	25 %	0 %	50 %	403515409
25042	NC_018528	AGT	2	6	1464511	1464516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515409
25043	NC_018528	T	6	6	1464524	1464529	0 %	100 %	0 %	0 %	403515409
25044	NC_018528	CTT	2	6	1464541	1464546	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515409
25045	NC_018528	TA	3	6	1464607	1464612	50 %	50 %	0 %	0 %	403515409
25046	NC_018528	TTC	2	6	1464686	1464691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515409
25047	NC_018528	CCGT	2	8	1464791	1464798	0 %	25 %	25 %	50 %	403515410
25048	NC_018528	AGC	2	6	1464831	1464836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515410
25049	NC_018528	ACC	2	6	1464945	1464950	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515410
25050	NC_018528	TGG	2	6	1464955	1464960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515410
25051	NC_018528	ACT	2	6	1464961	1464966	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515410
25052	NC_018528	AAT	2	6	1465216	1465221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515410
25053	NC_018528	CAAT	2	8	1465259	1465266	50 %	25 %	0 %	25 %	403515410
25054	NC_018528	CTT	2	6	1465326	1465331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515410
25055	NC_018528	TG	3	6	1465427	1465432	0 %	50 %	50 %	0 %	403515410
25056	NC_018528	GAA	2	6	1465608	1465613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515410
25057	NC_018528	TG	3	6	1465740	1465745	0 %	50 %	50 %	0 %	403515410
25058	NC_018528	CAT	3	9	1465791	1465799	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515410
25059	NC_018528	TGCT	2	8	1465806	1465813	0 %	50 %	25 %	25 %	403515410
25060	NC_018528	TCGC	2	8	1465827	1465834	0 %	25 %	25 %	50 %	403515410
25061	NC_018528	CAT	2	6	1465835	1465840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515410
25062	NC_018528	TAA	2	6	1465843	1465848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515410
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25064	NC_018528	GCCA	2	8	1465946	1465953	25 %	0 %	25 %	50 %	403515410
25065	NC_018528	CAT	2	6	1466039	1466044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515410
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25067	NC_018528	CAT	3	9	1466183	1466191	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515411
25068	NC_018528	CGT	2	6	1466359	1466364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515411
25069	NC_018528	CTTCA	2	10	1466379	1466388	20 %	40 %	0 %	40 %	403515411
25070	NC_018528	TTC	2	6	1466422	1466427	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515411
25071	NC_018528	AAT	3	9	1466444	1466452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515411
25072	NC_018528	AAG	2	6	1466504	1466509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515411
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25074	NC_018528	GCT	2	6	1466681	1466686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515411
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25076	NC_018528	CTG	2	6	1466763	1466768	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515411
25077	NC_018528	ATT	2	6	1466781	1466786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515411
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25083	NC_018528	GAT	2	6	1466973	1466978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515411
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25085	NC_018528	T	6	6	1467020	1467025	0 %	100 %	0 %	0 %	403515411
25086	NC_018528	AT	3	6	1467037	1467042	50 %	50 %	0 %	0 %	403515411
25087	NC_018528	TTGA	2	8	1467117	1467124	25 %	50 %	25 %	0 %	403515411
25088	NC_018528	AGCG	2	8	1467217	1467224	25 %	0 %	50 %	25 %	403515411
25089	NC_018528	GTTG	2	8	1467260	1467267	0 %	50 %	50 %	0 %	403515411
25090	NC_018528	TAT	2	6	1467287	1467292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515411
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25097	NC_018528	CTTC	2	8	1467957	1467964	0 %	50 %	0 %	50 %	403515412
25098	NC_018528	AAG	2	6	1467993	1467998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515412
25099	NC_018528	TAA	2	6	1468069	1468074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515412
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25101	NC_018528	TAA	2	6	1468263	1468268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515412
25102	NC_018528	ACC	2	6	1468333	1468338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515412
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25106	NC_018528	CTC	2	6	1468448	1468453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	403515413
25107	NC_018528	CTT	2	6	1468569	1468574	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515413
25108	NC_018528	CGT	2	6	1468578	1468583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515413
25109	NC_018528	GCT	2	6	1468594	1468599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515413
25110	NC_018528	ACC	2	6	1468611	1468616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515413
25111	NC_018528	CTT	2	6	1468683	1468688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515413
25112	NC_018528	TTC	2	6	1468733	1468738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515413
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25114	NC_018528	TTA	2	6	1468885	1468890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515413
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25116	NC_018528	TA	3	6	1469009	1469014	50 %	50 %	0 %	0 %	403515413
25117	NC_018528	TTG	2	6	1469034	1469039	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515413
25118	NC_018528	TCA	2	6	1469092	1469097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515413
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25121	NC_018528	CAT	2	6	1469207	1469212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515413
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25334	NC_018528	GTA	2	6	1483231	1483236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515424
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25345	NC_018528	TTTTGC	2	12	1483972	1483983	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	403515424
25346	NC_018528	TAA	2	6	1483991	1483996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515424
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25348	NC_018528	GAC	2	6	1484276	1484281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515424
25349	NC_018528	ATA	2	6	1484285	1484290	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515424
25350	NC_018528	T	8	8	1484346	1484353	0 %	100 %	0 %	0 %	403515425
25351	NC_018528	AGA	2	6	1484360	1484365	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515425
25352	NC_018528	T	6	6	1484369	1484374	0 %	100 %	0 %	0 %	403515425
25353	NC_018528	TAA	2	6	1484404	1484409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515425
25354	NC_018528	ACT	2	6	1484448	1484453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515425
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25356	NC_018528	ATG	2	6	1484542	1484547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515425
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25358	NC_018528	GTT	2	6	1484646	1484651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515425
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25377	NC_018528	ATA	2	6	1485453	1485458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515426
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25379	NC_018528	A	6	6	1485588	1485593	100 %	0 %	0 %	0 %	403515426
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25422	NC_018528	TTC	2	6	1488680	1488685	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515428
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25451	NC_018528	TTG	3	9	1489659	1489667	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515429
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25453	NC_018528	CCGAT	2	10	1489729	1489738	20 %	20 %	20 %	40 %	403515429
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25463	NC_018528	CAC	2	6	1490216	1490221	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515429
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