MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus helveticus R0052 chromosome

Total Repeats: 35998

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
21001	NC_018528	TTGAG	2	10	1240770	1240779	20 %	40 %	40 %	0 %	403515202
21002	NC_018528	AGC	2	6	1240807	1240812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515202
21003	NC_018528	GTA	3	9	1240844	1240852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515202
21004	NC_018528	AAAGT	2	10	1240906	1240915	60 %	20 %	20 %	0 %	403515202
21005	NC_018528	CAGTTT	2	12	1240926	1240937	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	403515202
21006	NC_018528	ATC	2	6	1240990	1240995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515202
21007	NC_018528	CTT	2	6	1241050	1241055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515202
21008	NC_018528	TC	3	6	1241101	1241106	0 %	50 %	0 %	50 %	403515202
21009	NC_018528	ACC	2	6	1241113	1241118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515202
21010	NC_018528	AAG	2	6	1241128	1241133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515202
21011	NC_018528	ACGCA	2	10	1241203	1241212	40 %	0 %	20 %	40 %	403515202
21012	NC_018528	TAG	2	6	1241283	1241288	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515202
21013	NC_018528	CTCA	2	8	1241365	1241372	25 %	25 %	0 %	50 %	403515202
21014	NC_018528	AAAG	2	8	1241423	1241430	75 %	0 %	25 %	0 %	403515202
21015	NC_018528	TAT	2	6	1241499	1241504	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515202
21016	NC_018528	TCT	2	6	1241505	1241510	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515202
21017	NC_018528	CTTT	2	8	1241568	1241575	0 %	75 %	0 %	25 %	403515202
21018	NC_018528	TCT	2	6	1241576	1241581	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515202
21019	NC_018528	AGC	2	6	1241590	1241595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515202
21020	NC_018528	TTTA	2	8	1241611	1241618	25 %	75 %	0 %	0 %	403515202
21021	NC_018528	ATTT	2	8	1241643	1241650	25 %	75 %	0 %	0 %	403515202
21022	NC_018528	ATT	2	6	1241659	1241664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515202
21023	NC_018528	TTC	2	6	1241686	1241691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515202
21024	NC_018528	TTC	2	6	1241743	1241748	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515202
21025	NC_018528	GTA	2	6	1241786	1241791	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515202
21026	NC_018528	CAT	2	6	1241826	1241831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515202
21027	NC_018528	ATT	2	6	1241848	1241853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515202
21028	NC_018528	AGA	2	6	1241895	1241900	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515202
21029	NC_018528	AGC	2	6	1241917	1241922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515202
21030	NC_018528	CTT	2	6	1242506	1242511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515203
21031	NC_018528	ATC	2	6	1242532	1242537	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515203
21032	NC_018528	CAT	2	6	1242717	1242722	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515203
21033	NC_018528	CTT	2	6	1242771	1242776	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515203
21034	NC_018528	TCG	2	6	1242808	1242813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515203
21035	NC_018528	CTT	2	6	1242936	1242941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515203
21036	NC_018528	AGTACC	2	12	1242978	1242989	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	403515203
21037	NC_018528	TAC	2	6	1243062	1243067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515203
21038	NC_018528	CAA	2	6	1243091	1243096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515203
21039	NC_018528	CAAGT	2	10	1243140	1243149	40 %	20 %	20 %	20 %	403515203
21040	NC_018528	ACC	2	6	1243173	1243178	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515203
21041	NC_018528	CAA	2	6	1243286	1243291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515203
21042	NC_018528	TCA	2	6	1243324	1243329	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515203
21043	NC_018528	CAA	2	6	1243385	1243390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515203
21044	NC_018528	ATT	2	6	1243575	1243580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515204
21045	NC_018528	ACG	2	6	1243581	1243586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515204
21046	NC_018528	CTT	2	6	1243587	1243592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515204
21047	NC_018528	CTA	2	6	1243598	1243603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515204
21048	NC_018528	CTA	2	6	1243646	1243651	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515204
21049	NC_018528	AGT	2	6	1243685	1243690	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515204
21050	NC_018528	AGC	2	6	1244072	1244077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515205
21051	NC_018528	TGT	2	6	1244111	1244116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515205
21052	NC_018528	GTT	2	6	1244124	1244129	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515205
21053	NC_018528	AGT	2	6	1244144	1244149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515205
21054	NC_018528	CCA	2	6	1244172	1244177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515205
21055	NC_018528	AGT	2	6	1244189	1244194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515205
21056	NC_018528	GCC	2	6	1244195	1244200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	403515205
21057	NC_018528	ACC	3	9	1244249	1244257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515205
21058	NC_018528	GTT	2	6	1244272	1244277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515205
21059	NC_018528	TTG	2	6	1244324	1244329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515205
21060	NC_018528	TGC	2	6	1244513	1244518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515205
21061	NC_018528	CTT	2	6	1244639	1244644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515205
21062	NC_018528	ATGA	2	8	1244685	1244692	50 %	25 %	25 %	0 %	403515205
21063	NC_018528	T	6	6	1244711	1244716	0 %	100 %	0 %	0 %	403515205
21064	NC_018528	GAA	2	6	1244807	1244812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515205
21065	NC_018528	TGC	2	6	1244873	1244878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515205
21066	NC_018528	CAT	2	6	1244893	1244898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515205
21067	NC_018528	TTG	2	6	1244949	1244954	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515205
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21069	NC_018528	ACC	2	6	1245068	1245073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515205
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21071	NC_018528	TCGA	2	8	1245182	1245189	25 %	25 %	25 %	25 %	403515205
21072	NC_018528	ATCG	2	8	1245227	1245234	25 %	25 %	25 %	25 %	403515205
21073	NC_018528	GCT	2	6	1245296	1245301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515205
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21083	NC_018528	AGA	2	6	1246210	1246215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515206
21084	NC_018528	CCAA	2	8	1246371	1246378	50 %	0 %	0 %	50 %	403515206
21085	NC_018528	CCA	2	6	1246433	1246438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515206
21086	NC_018528	GTA	2	6	1246507	1246512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515206
21087	NC_018528	ATG	2	6	1246529	1246534	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515206
21088	NC_018528	CATC	2	8	1246568	1246575	25 %	25 %	0 %	50 %	403515207
21089	NC_018528	TCT	2	6	1246585	1246590	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515207
21090	NC_018528	CGA	2	6	1246594	1246599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515207
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21097	NC_018528	GTATCA	2	12	1247055	1247066	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	403515208
21098	NC_018528	GTGAAT	2	12	1247102	1247113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515208
21099	NC_018528	AGT	2	6	1247153	1247158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515208
21100	NC_018528	GCA	2	6	1247313	1247318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515208
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21102	NC_018528	CTT	2	6	1247636	1247641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515208
21103	NC_018528	ATG	2	6	1247643	1247648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515208
21104	NC_018528	ACC	2	6	1247666	1247671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515208
21105	NC_018528	AGCCTT	2	12	1247687	1247698	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	403515208
21106	NC_018528	GCTT	2	8	1247767	1247774	0 %	50 %	25 %	25 %	403515208
21107	NC_018528	T	6	6	1247808	1247813	0 %	100 %	0 %	0 %	403515208
21108	NC_018528	CT	3	6	1247878	1247883	0 %	50 %	0 %	50 %	403515208
21109	NC_018528	CCA	2	6	1247895	1247900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515208
21110	NC_018528	TCA	2	6	1247935	1247940	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515208
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21112	NC_018528	GTT	2	6	1248041	1248046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515208
21113	NC_018528	GAT	2	6	1248050	1248055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515208
21114	NC_018528	CTT	2	6	1248058	1248063	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515208
21115	NC_018528	ACC	2	6	1248119	1248124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515208
21116	NC_018528	T	6	6	1248127	1248132	0 %	100 %	0 %	0 %	403515208
21117	NC_018528	GCG	2	6	1248183	1248188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	403515208
21118	NC_018528	ACC	2	6	1248200	1248205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515208
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21120	NC_018528	CAT	2	6	1248223	1248228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515208
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21219	NC_018528	AGT	2	6	1253478	1253483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515214
21220	NC_018528	CAT	2	6	1253489	1253494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515214
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21222	NC_018528	TACT	2	8	1253534	1253541	25 %	50 %	0 %	25 %	403515214
21223	NC_018528	CCA	2	6	1253560	1253565	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	403515214
21224	NC_018528	GCAA	2	8	1253632	1253639	50 %	0 %	25 %	25 %	403515214
21225	NC_018528	ATG	2	6	1253642	1253647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515214
21226	NC_018528	ATTACC	2	12	1253707	1253718	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515214
21227	NC_018528	ATT	2	6	1253787	1253792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515214
21228	NC_018528	AAC	2	6	1253793	1253798	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515214
21229	NC_018528	CTT	2	6	1254050	1254055	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515214
21230	NC_018528	AT	3	6	1254088	1254093	50 %	50 %	0 %	0 %	403515214
21231	NC_018528	TTG	2	6	1254117	1254122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515214
21232	NC_018528	CTT	2	6	1254212	1254217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515214
21233	NC_018528	TTAG	2	8	1254265	1254272	25 %	50 %	25 %	0 %	403515214
21234	NC_018528	ATC	2	6	1254279	1254284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515214
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21262	NC_018528	A	7	7	1256207	1256213	100 %	0 %	0 %	0 %	403515215
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21348	NC_018528	ATT	2	6	1261930	1261935	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515219
21349	NC_018528	CTA	2	6	1261982	1261987	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515219
21350	NC_018528	CAA	2	6	1262017	1262022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515219
21351	NC_018528	TCTTT	2	10	1262192	1262201	0 %	80 %	0 %	20 %	403515220
21352	NC_018528	TTTTCA	2	12	1262218	1262229	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	403515220
21353	NC_018528	AAT	2	6	1262238	1262243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515220
21354	NC_018528	TCT	2	6	1262266	1262271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515220
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21406	NC_018528	CTTT	2	8	1264949	1264956	0 %	75 %	0 %	25 %	403515222
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21411	NC_018528	CTT	2	6	1265037	1265042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	403515222
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21421	NC_018528	GCA	2	6	1265473	1265478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515223
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21424	NC_018528	TTA	2	6	1265578	1265583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515223
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21428	NC_018528	TCA	2	6	1265683	1265688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515223
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21431	NC_018528	AG	3	6	1266279	1266284	50 %	0 %	50 %	0 %	403515224
21432	NC_018528	TCAT	2	8	1266357	1266364	25 %	50 %	0 %	25 %	403515224
21433	NC_018528	TGA	2	6	1266382	1266387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515224
21434	NC_018528	TGA	2	6	1266517	1266522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515224
21435	NC_018528	GCT	2	6	1266605	1266610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515224
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21440	NC_018528	ATT	2	6	1268412	1268417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515225
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21447	NC_018528	ATC	2	6	1268783	1268788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515225
21448	NC_018528	CTTG	2	8	1269069	1269076	0 %	50 %	25 %	25 %	403515226
21449	NC_018528	ATC	2	6	1269077	1269082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515226
21450	NC_018528	CAA	2	6	1269091	1269096	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515226
21451	NC_018528	TAA	2	6	1269133	1269138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515226
21452	NC_018528	TCA	2	6	1269168	1269173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515226
21453	NC_018528	CTGC	2	8	1269205	1269212	0 %	25 %	25 %	50 %	403515226
21454	NC_018528	ATA	2	6	1269215	1269220	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515226
21455	NC_018528	T	6	6	1269300	1269305	0 %	100 %	0 %	0 %	403515226
21456	NC_018528	TTA	2	6	1269571	1269576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	403515227
21457	NC_018528	AGC	2	6	1269583	1269588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515227
21458	NC_018528	AATG	2	8	1269631	1269638	50 %	25 %	25 %	0 %	403515227
21459	NC_018528	CAA	2	6	1269657	1269662	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515227
21460	NC_018528	CA	3	6	1269666	1269671	50 %	0 %	0 %	50 %	403515227
21461	NC_018528	GTT	2	6	1269744	1269749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515227
21462	NC_018528	GAT	2	6	1269754	1269759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515227
21463	NC_018528	AGT	2	6	1269775	1269780	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515227
21464	NC_018528	CAA	2	6	1269795	1269800	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	403515227
21465	NC_018528	GTG	2	6	1269813	1269818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	403515227
21466	NC_018528	AAAT	2	8	1269822	1269829	75 %	25 %	0 %	0 %	403515227
21467	NC_018528	AGA	2	6	1269872	1269877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515227
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21472	NC_018528	TAG	2	6	1270104	1270109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515227
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21476	NC_018528	ATG	2	6	1270154	1270159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	403515227
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21490	NC_018528	ATA	2	6	1270838	1270843	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515227
21491	NC_018528	TCTTT	2	10	1270890	1270899	0 %	80 %	0 %	20 %	403515227
21492	NC_018528	AAG	2	6	1270902	1270907	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	403515227
21493	NC_018528	TTG	2	6	1271136	1271141	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	403515228
21494	NC_018528	T	6	6	1271145	1271150	0 %	100 %	0 %	0 %	403515228
21495	NC_018528	TAA	2	6	1271170	1271175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	403515228
21496	NC_018528	GCT	2	6	1271221	1271226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	403515228
21497	NC_018528	ATC	2	6	1271296	1271301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	403515228
21498	NC_018528	AAACA	2	10	1271316	1271325	80 %	0 %	0 %	20 %	403515228
21499	NC_018528	AT	3	6	1271364	1271369	50 %	50 %	0 %	0 %	403515228
21500	NC_018528	CAG	2	6	1271432	1271437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	403515228

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