MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Legionella pneumophila subsp. pneumophila

Total Repeats: 64073

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
64001	NC_018139	TAA	2	6	3463259	3463264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397665622
64002	NC_018139	GTC	2	6	3463297	3463302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397665622
64003	NC_018139	GTTG	2	8	3463326	3463333	0 %	50 %	50 %	0 %	397665622
64004	NC_018139	T	7	7	3463358	3463364	0 %	100 %	0 %	0 %	397665622
64005	NC_018139	ATAA	2	8	3463396	3463403	75 %	25 %	0 %	0 %	397665622
64006	NC_018139	TCA	2	6	3463413	3463418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397665622
64007	NC_018139	TAG	2	6	3463435	3463440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665622
64008	NC_018139	TTG	2	6	3463517	3463522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397665622
64009	NC_018139	CTA	2	6	3463540	3463545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397665622
64010	NC_018139	AAG	2	6	3463547	3463552	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397665622
64011	NC_018139	CA	3	6	3463553	3463558	50 %	0 %	0 %	50 %	397665622
64012	NC_018139	CCA	2	6	3463606	3463611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397665622
64013	NC_018139	ATC	2	6	3463613	3463618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397665622
64014	NC_018139	ATC	2	6	3463661	3463666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397665622
64015	NC_018139	ATA	2	6	3463686	3463691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397665622
64016	NC_018139	GTA	2	6	3463698	3463703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665622
64017	NC_018139	GTT	2	6	3463745	3463750	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397665622
64018	NC_018139	CAA	2	6	3463811	3463816	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397665622
64019	NC_018139	TCT	2	6	3463845	3463850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397665622
64020	NC_018139	AAT	2	6	3463859	3463864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397665622
64021	NC_018139	GTA	2	6	3463870	3463875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	397665622
64022	NC_018139	CAT	2	6	3463891	3463896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397665622
64023	NC_018139	ACAT	2	8	3463941	3463948	50 %	25 %	0 %	25 %	397665622
64024	NC_018139	GTAA	2	8	3463951	3463958	50 %	25 %	25 %	0 %	397665622
64025	NC_018139	TTCA	2	8	3463967	3463974	25 %	50 %	0 %	25 %	397665622
64026	NC_018139	ATTT	2	8	3463979	3463986	25 %	75 %	0 %	0 %	397665622
64027	NC_018139	T	7	7	3463984	3463990	0 %	100 %	0 %	0 %	397665622
64028	NC_018139	CTG	2	6	3464146	3464151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397665622
64029	NC_018139	TTAA	2	8	3464163	3464170	50 %	50 %	0 %	0 %	397665622
64030	NC_018139	ATT	2	6	3464279	3464284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397665622
64031	NC_018139	TA	3	6	3464290	3464295	50 %	50 %	0 %	0 %	397665622
64032	NC_018139	CAA	2	6	3464425	3464430	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397665622
64033	NC_018139	ATTT	2	8	3464445	3464452	25 %	75 %	0 %	0 %	397665622
64034	NC_018139	CAA	2	6	3464461	3464466	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397665623
64035	NC_018139	TAT	2	6	3464533	3464538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397665623
64036	NC_018139	ATA	2	6	3464593	3464598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397665623
64037	NC_018139	CAT	2	6	3464609	3464614	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397665623
64038	NC_018139	CAG	2	6	3464635	3464640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397665623
64039	NC_018139	GAA	2	6	3464692	3464697	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	397665623
64040	NC_018139	GCC	2	6	3464828	3464833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	397665623
64041	NC_018139	ATC	2	6	3464894	3464899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	397665623
64042	NC_018139	CAA	2	6	3465040	3465045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	397665623
64043	NC_018139	ATA	2	6	3465073	3465078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	397665623
64044	NC_018139	TCT	2	6	3465195	3465200	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397665623
64045	NC_018139	GGCT	2	8	3465219	3465226	0 %	25 %	50 %	25 %	397665623
64046	NC_018139	A	6	6	3465309	3465314	100 %	0 %	0 %	0 %	397665623
64047	NC_018139	GTT	2	6	3465319	3465324	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397665623
64048	NC_018139	ACC	2	6	3465338	3465343	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	397665623
64049	NC_018139	CATCCA	2	12	3465349	3465360	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	397665623
64050	NC_018139	AACT	2	8	3465385	3465392	50 %	25 %	0 %	25 %	397665623
64051	NC_018139	T	6	6	3465405	3465410	0 %	100 %	0 %	0 %	397665623
64052	NC_018139	TCT	2	6	3465468	3465473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397665623
64053	NC_018139	T	6	6	3465590	3465595	0 %	100 %	0 %	0 %	397665623
64054	NC_018139	AAAATC	2	12	3465686	3465697	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397665623
64055	NC_018139	CAAAA	2	10	3465722	3465731	80 %	0 %	0 %	20 %	397665623
64056	NC_018139	CTGG	2	8	3465755	3465762	0 %	25 %	50 %	25 %	397665623
64057	NC_018139	AG	3	6	3465775	3465780	50 %	0 %	50 %	0 %	397665623
64058	NC_018139	T	6	6	3465849	3465854	0 %	100 %	0 %	0 %	397665623
64059	NC_018139	CTG	2	6	3465906	3465911	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397665623
64060	NC_018139	TAT	2	6	3465962	3465967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	397665623
64061	NC_018139	TCT	2	6	3466009	3466014	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	397665623
64062	NC_018139	GTT	2	6	3466024	3466029	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	397665623
64063	NC_018139	AAGCGC	2	12	3466076	3466087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397665623
64064	NC_018139	AT	3	6	3466089	3466094	50 %	50 %	0 %	0 %	397665623
64065	NC_018139	CGT	2	6	3466104	3466109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	397665623
64066	NC_018139	ATTTA	2	10	3466378	3466387	40 %	60 %	0 %	0 %	397665624
64067	NC_018139	CAG	2	6	3466449	3466454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397665624
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64069	NC_018139	T	7	7	3466608	3466614	0 %	100 %	0 %	0 %	397665624
64070	NC_018139	AAATCA	2	12	3466631	3466642	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	397665624
64071	NC_018139	T	9	9	3466643	3466651	0 %	100 %	0 %	0 %	397665624
64072	NC_018139	T	6	6	3466666	3466671	0 %	100 %	0 %	0 %	397665624
64073	NC_018139	ACG	2	6	3466714	3466719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	397665625

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.