MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes FSL R2-561 chromosome

Total Repeats: 59374

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017546	ATTAT	2	10	24890	24899	40 %	60 %	0 %	0 %	386048950
502	NC_017546	GCA	2	6	24901	24906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048950
503	NC_017546	AAC	2	6	24960	24965	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048950
504	NC_017546	GAA	2	6	24991	24996	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048950
505	NC_017546	TTG	2	6	25073	25078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048950
506	NC_017546	AGG	2	6	25193	25198	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048950
507	NC_017546	ATA	2	6	25217	25222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048950
508	NC_017546	TGA	2	6	25263	25268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048950
509	NC_017546	GGA	2	6	25272	25277	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048950
510	NC_017546	CAA	2	6	25348	25353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048951
511	NC_017546	TTG	2	6	25390	25395	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048951
512	NC_017546	ATG	2	6	25396	25401	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048951
513	NC_017546	A	6	6	25409	25414	100 %	0 %	0 %	0 %	386048951
514	NC_017546	CTG	2	6	25450	25455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048951
515	NC_017546	GCA	2	6	25488	25493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048951
516	NC_017546	AAT	2	6	25494	25499	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048951
517	NC_017546	AAT	2	6	25503	25508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048951
518	NC_017546	GCA	2	6	25523	25528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048951
519	NC_017546	A	7	7	25643	25649	100 %	0 %	0 %	0 %	386048951
520	NC_017546	ATT	2	6	25687	25692	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048951
521	NC_017546	A	7	7	25766	25772	100 %	0 %	0 %	0 %	386048951
522	NC_017546	GTTA	2	8	25827	25834	25 %	50 %	25 %	0 %	386048952
523	NC_017546	TAA	2	6	25895	25900	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048952
524	NC_017546	CGG	2	6	25995	26000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048952
525	NC_017546	TCG	2	6	26033	26038	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048952
526	NC_017546	TCAGG	2	10	26059	26068	20 %	20 %	40 %	20 %	386048952
527	NC_017546	CAG	2	6	26198	26203	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048952
528	NC_017546	CG	4	8	26246	26253	0 %	0 %	50 %	50 %	386048952
529	NC_017546	TGG	2	6	26349	26354	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048952
530	NC_017546	TTC	2	6	26357	26362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048952
531	NC_017546	AGT	2	6	26364	26369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048952
532	NC_017546	CAA	2	6	26399	26404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048952
533	NC_017546	TCG	2	6	26411	26416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048952
534	NC_017546	AGC	3	9	26439	26447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048952
535	NC_017546	ATC	2	6	26500	26505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048952
536	NC_017546	CAAA	2	8	26511	26518	75 %	0 %	0 %	25 %	386048952
537	NC_017546	GAG	2	6	26569	26574	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048952
538	NC_017546	AGC	2	6	26641	26646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048953
539	NC_017546	GTTG	2	8	26655	26662	0 %	50 %	50 %	0 %	386048953
540	NC_017546	GCCA	2	8	26666	26673	25 %	0 %	25 %	50 %	386048953
541	NC_017546	ATG	2	6	26696	26701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048953
542	NC_017546	TGA	3	9	26755	26763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048953
543	NC_017546	ATG	2	6	26774	26779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048953
544	NC_017546	GGT	2	6	26819	26824	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048953
545	NC_017546	AAAG	2	8	26863	26870	75 %	0 %	25 %	0 %	386048953
546	NC_017546	AAG	2	6	26877	26882	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048953
547	NC_017546	CGA	2	6	26958	26963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048953
548	NC_017546	AT	3	6	26983	26988	50 %	50 %	0 %	0 %	386048953
549	NC_017546	TTTAC	2	10	27059	27068	20 %	60 %	0 %	20 %	386048953
550	NC_017546	GTC	2	6	27164	27169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048953
551	NC_017546	A	7	7	27323	27329	100 %	0 %	0 %	0 %	386048953
552	NC_017546	TTA	2	6	27350	27355	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048953
553	NC_017546	ATT	2	6	27371	27376	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048953
554	NC_017546	T	6	6	27443	27448	0 %	100 %	0 %	0 %	386048954
555	NC_017546	GGA	2	6	27469	27474	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048954
556	NC_017546	A	6	6	27480	27485	100 %	0 %	0 %	0 %	386048954
557	NC_017546	TCA	2	6	27502	27507	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048954
558	NC_017546	AGC	2	6	27508	27513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048954
559	NC_017546	TGG	2	6	27519	27524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048954
560	NC_017546	ACG	2	6	27540	27545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048954
561	NC_017546	ATT	2	6	27548	27553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048954
562	NC_017546	AGG	2	6	27610	27615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048954
563	NC_017546	TTA	2	6	27633	27638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048954
564	NC_017546	CTG	2	6	27645	27650	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386048954
565	NC_017546	TTA	2	6	27655	27660	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048954
566	NC_017546	AT	3	6	27720	27725	50 %	50 %	0 %	0 %	386048954
567	NC_017546	TTG	2	6	27807	27812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048954
568	NC_017546	CAG	2	6	27837	27842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048954
569	NC_017546	TTG	2	6	27866	27871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386048954
570	NC_017546	CAA	2	6	27992	27997	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048954
571	NC_017546	ACC	2	6	28042	28047	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386048954
572	NC_017546	TGG	2	6	28072	28077	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048954
573	NC_017546	TAA	2	6	28133	28138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386048954
574	NC_017546	ATG	2	6	28187	28192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048955
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576	NC_017546	TAC	2	6	28219	28224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386048955
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579	NC_017546	GTCC	2	8	28370	28377	0 %	25 %	25 %	50 %	386048955
580	NC_017546	AGA	2	6	28405	28410	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386048955
581	NC_017546	TGAT	2	8	28422	28429	25 %	50 %	25 %	0 %	386048955
582	NC_017546	ATT	2	6	28522	28527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048955
583	NC_017546	GCA	2	6	28535	28540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048955
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585	NC_017546	TAG	2	6	28578	28583	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048955
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588	NC_017546	AT	3	6	28699	28704	50 %	50 %	0 %	0 %	386048955
589	NC_017546	ATT	2	6	28727	28732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048955
590	NC_017546	GGA	2	6	28742	28747	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386048955
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592	NC_017546	CGG	2	6	29077	29082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048956
593	NC_017546	GAAA	2	8	29161	29168	75 %	0 %	25 %	0 %	386048956
594	NC_017546	GTG	2	6	29205	29210	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048956
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596	NC_017546	GAAG	2	8	29297	29304	50 %	0 %	50 %	0 %	386048956
597	NC_017546	TTGG	2	8	29433	29440	0 %	50 %	50 %	0 %	386048956
598	NC_017546	GTAC	2	8	29457	29464	25 %	25 %	25 %	25 %	386048956
599	NC_017546	CTT	2	6	29500	29505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048956
600	NC_017546	A	6	6	29534	29539	100 %	0 %	0 %	0 %	386048956
601	NC_017546	CGG	2	6	29542	29547	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	386048956
602	NC_017546	GGT	2	6	29573	29578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048956
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606	NC_017546	ATT	2	6	29884	29889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386048956
607	NC_017546	GGT	2	6	29948	29953	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048956
608	NC_017546	CAA	2	6	30010	30015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048956
609	NC_017546	A	7	7	30116	30122	100 %	0 %	0 %	0 %	386048956
610	NC_017546	ATTT	2	8	30145	30152	25 %	75 %	0 %	0 %	386048956
611	NC_017546	A	6	6	30206	30211	100 %	0 %	0 %	0 %	386048956
612	NC_017546	TGG	2	6	30235	30240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048956
613	NC_017546	TGG	2	6	30244	30249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048956
614	NC_017546	AT	3	6	30280	30285	50 %	50 %	0 %	0 %	386048956
615	NC_017546	CTT	2	6	30319	30324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048956
616	NC_017546	TGG	2	6	30356	30361	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	386048956
617	NC_017546	GTA	2	6	30413	30418	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048956
618	NC_017546	GTA	3	9	30440	30448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048956
619	NC_017546	AGT	2	6	30508	30513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048956
620	NC_017546	CAG	2	6	30618	30623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386048956
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622	NC_017546	ACA	2	6	30671	30676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386048956
623	NC_017546	TTC	2	6	30737	30742	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386048956
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625	NC_017546	AGT	3	9	30844	30852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386048956
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