MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria monocytogenes 10403S chromosome

Total Repeats: 57954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
53001	NC_017544	ACCCC	2	10	2653958	2653967	20 %	0 %	0 %	80 %	386044912
53002	NC_017544	TCG	2	6	2654030	2654035	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044912
53003	NC_017544	TTC	2	6	2654047	2654052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044912
53004	NC_017544	GTC	2	6	2654068	2654073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044912
53005	NC_017544	CAT	2	6	2654133	2654138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044912
53006	NC_017544	ATC	2	6	2654152	2654157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044912
53007	NC_017544	CATA	2	8	2654163	2654170	50 %	25 %	0 %	25 %	386044912
53008	NC_017544	T	6	6	2654209	2654214	0 %	100 %	0 %	0 %	386044912
53009	NC_017544	TTTC	2	8	2654235	2654242	0 %	75 %	0 %	25 %	386044912
53010	NC_017544	TAAA	2	8	2654262	2654269	75 %	25 %	0 %	0 %	386044912
53011	NC_017544	TC	3	6	2654274	2654279	0 %	50 %	0 %	50 %	386044912
53012	NC_017544	TTG	2	6	2654284	2654289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044912
53013	NC_017544	GTA	2	6	2654352	2654357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044912
53014	NC_017544	TAT	2	6	2654615	2654620	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044913
53015	NC_017544	AAT	2	6	2654632	2654637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044913
53016	NC_017544	T	6	6	2654671	2654676	0 %	100 %	0 %	0 %	386044913
53017	NC_017544	ACC	2	6	2654692	2654697	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044913
53018	NC_017544	CAT	2	6	2654724	2654729	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044913
53019	NC_017544	TTC	2	6	2654765	2654770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044913
53020	NC_017544	TAC	2	6	2654806	2654811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044913
53021	NC_017544	AGC	2	6	2654836	2654841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044913
53022	NC_017544	GAC	2	6	2654847	2654852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044913
53023	NC_017544	T	6	6	2654869	2654874	0 %	100 %	0 %	0 %	386044913
53024	NC_017544	CAA	2	6	2654895	2654900	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044913
53025	NC_017544	TGT	2	6	2654929	2654934	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044913
53026	NC_017544	GTA	2	6	2654976	2654981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044913
53027	NC_017544	TCA	2	6	2655130	2655135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044914
53028	NC_017544	CTGTA	2	10	2655164	2655173	20 %	40 %	20 %	20 %	386044914
53029	NC_017544	GAAC	2	8	2655204	2655211	50 %	0 %	25 %	25 %	386044914
53030	NC_017544	TTC	2	6	2655224	2655229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044914
53031	NC_017544	TCT	2	6	2655264	2655269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044914
53032	NC_017544	GTTAA	2	10	2655306	2655315	40 %	40 %	20 %	0 %	386044914
53033	NC_017544	AGAA	2	8	2655335	2655342	75 %	0 %	25 %	0 %	386044914
53034	NC_017544	CTT	2	6	2655364	2655369	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044914
53035	NC_017544	A	6	6	2655478	2655483	100 %	0 %	0 %	0 %	386044914
53036	NC_017544	CAG	2	6	2655535	2655540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044914
53037	NC_017544	GT	3	6	2655541	2655546	0 %	50 %	50 %	0 %	386044914
53038	NC_017544	ACCACG	2	12	2655548	2655559	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	386044914
53039	NC_017544	TAAT	2	8	2655648	2655655	50 %	50 %	0 %	0 %	386044914
53040	NC_017544	TAC	2	6	2655668	2655673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044914
53041	NC_017544	T	6	6	2655703	2655708	0 %	100 %	0 %	0 %	386044914
53042	NC_017544	TCA	2	6	2655711	2655716	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044914
53043	NC_017544	T	6	6	2655737	2655742	0 %	100 %	0 %	0 %	386044914
53044	NC_017544	GTT	2	6	2655759	2655764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044914
53045	NC_017544	TCT	2	6	2655768	2655773	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044914
53046	NC_017544	CTG	2	6	2655832	2655837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044914
53047	NC_017544	GAAGA	2	10	2655844	2655853	60 %	0 %	40 %	0 %	386044914
53048	NC_017544	ACG	2	6	2655863	2655868	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044914
53049	NC_017544	ACA	2	6	2655915	2655920	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044914
53050	NC_017544	CAT	2	6	2655937	2655942	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044914
53051	NC_017544	CGA	2	6	2656105	2656110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044915
53052	NC_017544	GGA	2	6	2656117	2656122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	386044915
53053	NC_017544	GCT	2	6	2656180	2656185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044915
53054	NC_017544	TGC	2	6	2656275	2656280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044915
53055	NC_017544	TG	3	6	2656375	2656380	0 %	50 %	50 %	0 %	386044915
53056	NC_017544	TAT	2	6	2656400	2656405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044915
53057	NC_017544	TG	3	6	2656421	2656426	0 %	50 %	50 %	0 %	386044915
53058	NC_017544	TAT	2	6	2656508	2656513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044916
53059	NC_017544	ATT	2	6	2656561	2656566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044916
53060	NC_017544	T	6	6	2656565	2656570	0 %	100 %	0 %	0 %	386044916
53061	NC_017544	ACG	2	6	2656597	2656602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044916
53062	NC_017544	ACG	2	6	2656663	2656668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	386044916
53063	NC_017544	CTT	2	6	2656722	2656727	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044916
53064	NC_017544	ACGAGT	2	12	2656738	2656749	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	386044916
53065	NC_017544	CTT	2	6	2656779	2656784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044916
53066	NC_017544	TGTT	2	8	2656789	2656796	0 %	75 %	25 %	0 %	386044916
53067	NC_017544	TTGTTT	2	12	2656900	2656911	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	386044917
53068	NC_017544	CTTTAC	2	12	2656941	2656952	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	386044917
53069	NC_017544	ATT	2	6	2657110	2657115	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044918
53070	NC_017544	TTC	2	6	2657131	2657136	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	386044918
53071	NC_017544	TAC	2	6	2657291	2657296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044918
53072	NC_017544	CTC	2	6	2657711	2657716	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	386044919
53073	NC_017544	AAG	2	6	2657720	2657725	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044919
53074	NC_017544	T	6	6	2657732	2657737	0 %	100 %	0 %	0 %	386044919
53075	NC_017544	TTATG	2	10	2657777	2657786	20 %	60 %	20 %	0 %	386044919
53076	NC_017544	TTTC	2	8	2657864	2657871	0 %	75 %	0 %	25 %	386044919
53077	NC_017544	GTC	2	6	2657874	2657879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044919
53078	NC_017544	CCA	2	6	2657899	2657904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044919
53079	NC_017544	TCA	2	6	2657999	2658004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044919
53080	NC_017544	CAAG	2	8	2658113	2658120	50 %	0 %	25 %	25 %	386044919
53081	NC_017544	CAT	2	6	2658134	2658139	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044919
53082	NC_017544	ACGA	2	8	2658156	2658163	50 %	0 %	25 %	25 %	386044919
53083	NC_017544	TAT	2	6	2658236	2658241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	386044919
53084	NC_017544	GCT	2	6	2658250	2658255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044919
53085	NC_017544	TGT	2	6	2658287	2658292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044919
53086	NC_017544	CAA	2	6	2658299	2658304	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044919
53087	NC_017544	TG	3	6	2658316	2658321	0 %	50 %	50 %	0 %	386044919
53088	NC_017544	GTT	2	6	2658469	2658474	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044920
53089	NC_017544	GTA	2	6	2658477	2658482	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044920
53090	NC_017544	TAG	2	6	2658506	2658511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044920
53091	NC_017544	ACC	2	6	2658518	2658523	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044920
53092	NC_017544	TAAAC	2	10	2658542	2658551	60 %	20 %	0 %	20 %	386044920
53093	NC_017544	AGT	2	6	2658554	2658559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044920
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53095	NC_017544	TGAA	2	8	2658726	2658733	50 %	25 %	25 %	0 %	386044920
53096	NC_017544	CAA	2	6	2658754	2658759	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044920
53097	NC_017544	ACA	2	6	2658825	2658830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044920
53098	NC_017544	AAAG	2	8	2658845	2658852	75 %	0 %	25 %	0 %	386044920
53099	NC_017544	TAA	3	9	2658871	2658879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044920
53100	NC_017544	TTGC	2	8	2658940	2658947	0 %	50 %	25 %	25 %	386044920
53101	NC_017544	GC	3	6	2658946	2658951	0 %	0 %	50 %	50 %	386044920
53102	NC_017544	TTG	2	6	2659010	2659015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044920
53103	NC_017544	GAA	2	6	2659016	2659021	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	386044920
53104	NC_017544	ACA	2	6	2659032	2659037	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044920
53105	NC_017544	ATG	2	6	2659173	2659178	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044920
53106	NC_017544	AGT	2	6	2659244	2659249	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386044920
53107	NC_017544	CAATA	2	10	2659250	2659259	60 %	20 %	0 %	20 %	386044920
53108	NC_017544	TTGA	2	8	2659385	2659392	25 %	50 %	25 %	0 %	386044920
53109	NC_017544	T	6	6	2659394	2659399	0 %	100 %	0 %	0 %	386044920
53110	NC_017544	AAC	2	6	2659442	2659447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044920
53111	NC_017544	AAT	2	6	2659469	2659474	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	386044920
53112	NC_017544	ATGTA	2	10	2659480	2659489	40 %	40 %	20 %	0 %	386044920
53113	NC_017544	T	6	6	2659521	2659526	0 %	100 %	0 %	0 %	386044920
53114	NC_017544	CCA	2	6	2659533	2659538	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	386044920
53115	NC_017544	CCAT	2	8	2659569	2659576	25 %	25 %	0 %	50 %	386044920
53116	NC_017544	GCT	2	6	2659590	2659595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044920
53117	NC_017544	T	7	7	2659666	2659672	0 %	100 %	0 %	0 %	386044920
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53217	NC_017544	TCCGC	2	10	2664995	2665004	0 %	20 %	20 %	60 %	386044934
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53222	NC_017544	CTTCA	2	10	2665486	2665495	20 %	40 %	0 %	40 %	386044935
53223	NC_017544	TTGCAC	2	12	2665533	2665544	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	386044935
53224	NC_017544	CAA	2	6	2665590	2665595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	386044935
53225	NC_017544	CTA	2	6	2665605	2665610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	386044935
53226	NC_017544	GTT	2	6	2665615	2665620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	386044935
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53228	NC_017544	CTTG	2	8	2665734	2665741	0 %	50 %	25 %	25 %	386044935
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53230	NC_017544	T	7	7	2665865	2665871	0 %	100 %	0 %	0 %	386044936
53231	NC_017544	TCG	2	6	2665873	2665878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	386044936
53232	NC_017544	GTAC	2	8	2665893	2665900	25 %	25 %	25 %	25 %	386044936
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