MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris A76 plasmid pQA554

Total Repeats: 895

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017496	AAG	2	6	99	104	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836853
2	NC_017496	A	6	6	137	142	100 %	0 %	0 %	0 %	385836853
3	NC_017496	ATCT	2	8	156	163	25 %	50 %	0 %	25 %	385836853
4	NC_017496	GCTG	2	8	218	225	0 %	25 %	50 %	25 %	385836854
5	NC_017496	TAA	2	6	239	244	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836854
6	NC_017496	AAT	2	6	260	265	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836854
7	NC_017496	A	6	6	289	294	100 %	0 %	0 %	0 %	385836854
8	NC_017496	A	6	6	296	301	100 %	0 %	0 %	0 %	385836854
9	NC_017496	AGAAC	2	10	375	384	60 %	0 %	20 %	20 %	385836854
10	NC_017496	CAA	2	6	435	440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836854
11	NC_017496	A	6	6	459	464	100 %	0 %	0 %	0 %	385836854
12	NC_017496	GAA	2	6	471	476	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836854
13	NC_017496	AGA	2	6	560	565	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836854
14	NC_017496	AGG	2	6	601	606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836854
15	NC_017496	AAAC	2	8	611	618	75 %	0 %	0 %	25 %	385836854
16	NC_017496	A	6	6	675	680	100 %	0 %	0 %	0 %	385836854
17	NC_017496	ATC	3	9	944	952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836855
18	NC_017496	T	7	7	978	984	0 %	100 %	0 %	0 %	385836855
19	NC_017496	ATA	2	6	1016	1021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836855
20	NC_017496	TA	3	6	1042	1047	50 %	50 %	0 %	0 %	385836855
21	NC_017496	ATC	2	6	1061	1066	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836855
22	NC_017496	TGT	2	6	1130	1135	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836855
23	NC_017496	TGT	2	6	1179	1184	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836855
24	NC_017496	GTTTGA	2	12	1285	1296	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	385836855
25	NC_017496	CTTTGT	2	12	1332	1343	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	385836855
26	NC_017496	T	7	7	1393	1399	0 %	100 %	0 %	0 %	385836855
27	NC_017496	TAA	2	6	1429	1434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836855
28	NC_017496	AATTTC	2	12	1574	1585	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385836855
29	NC_017496	CTTT	2	8	1611	1618	0 %	75 %	0 %	25 %	385836855
30	NC_017496	T	7	7	1665	1671	0 %	100 %	0 %	0 %	385836855
31	NC_017496	T	7	7	1732	1738	0 %	100 %	0 %	0 %	385836855
32	NC_017496	T	6	6	1775	1780	0 %	100 %	0 %	0 %	385836855
33	NC_017496	TCA	2	6	1849	1854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836855
34	NC_017496	GTTT	2	8	1864	1871	0 %	75 %	25 %	0 %	385836855
35	NC_017496	AAT	2	6	1912	1917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836855
36	NC_017496	GGAC	2	8	1947	1954	25 %	0 %	50 %	25 %	385836855
37	NC_017496	AAT	2	6	1955	1960	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836855
38	NC_017496	TTTC	2	8	1996	2003	0 %	75 %	0 %	25 %	385836855
39	NC_017496	TTTTG	2	10	2020	2029	0 %	80 %	20 %	0 %	385836855
40	NC_017496	ATTT	2	8	2035	2042	25 %	75 %	0 %	0 %	385836855
41	NC_017496	ACA	2	6	2240	2245	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836856
42	NC_017496	GTT	2	6	2256	2261	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836856
43	NC_017496	TCA	2	6	2345	2350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836856
44	NC_017496	ATACA	2	10	2416	2425	60 %	20 %	0 %	20 %	385836856
45	NC_017496	CTTAT	2	10	2435	2444	20 %	60 %	0 %	20 %	385836856
46	NC_017496	GCT	2	6	2496	2501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836856
47	NC_017496	ATAAG	2	10	2621	2630	60 %	20 %	20 %	0 %	385836856
48	NC_017496	AAT	2	6	2634	2639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836856
49	NC_017496	GTA	2	6	2668	2673	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836856
50	NC_017496	TGA	2	6	2709	2714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836856
51	NC_017496	TCTT	2	8	2771	2778	0 %	75 %	0 %	25 %	385836856
52	NC_017496	AAAT	2	8	2802	2809	75 %	25 %	0 %	0 %	385836856
53	NC_017496	TG	3	6	2951	2956	0 %	50 %	50 %	0 %	385836856
54	NC_017496	T	6	6	2964	2969	0 %	100 %	0 %	0 %	385836856
55	NC_017496	GTC	2	6	3070	3075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385836856
56	NC_017496	TTC	2	6	3178	3183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836856
57	NC_017496	CTT	2	6	3193	3198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836856
58	NC_017496	TTCT	2	8	3255	3262	0 %	75 %	0 %	25 %	385836856
59	NC_017496	AAAC	2	8	3297	3304	75 %	0 %	0 %	25 %	385836856
60	NC_017496	AGAT	2	8	3320	3327	50 %	25 %	25 %	0 %	385836856
61	NC_017496	TGA	2	6	3465	3470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836856
62	NC_017496	TAT	2	6	3495	3500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836856
63	NC_017496	AGC	2	6	3504	3509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836856
64	NC_017496	GCC	2	6	3541	3546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385836856
65	NC_017496	CT	3	6	3550	3555	0 %	50 %	0 %	50 %	385836856
66	NC_017496	ATAG	2	8	3631	3638	50 %	25 %	25 %	0 %	385836856
67	NC_017496	ATT	2	6	3647	3652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836856
68	NC_017496	CTT	2	6	3660	3665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836856
69	NC_017496	T	6	6	3722	3727	0 %	100 %	0 %	0 %	385836856
70	NC_017496	TTC	2	6	3738	3743	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836856
71	NC_017496	AAT	2	6	3784	3789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836856
72	NC_017496	T	6	6	3791	3796	0 %	100 %	0 %	0 %	385836856
73	NC_017496	T	6	6	3798	3803	0 %	100 %	0 %	0 %	385836856
74	NC_017496	ATC	2	6	3826	3831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836856
75	NC_017496	TAA	2	6	3887	3892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836856
76	NC_017496	TTCT	2	8	3966	3973	0 %	75 %	0 %	25 %	385836856
77	NC_017496	TTG	2	6	3984	3989	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385836856
78	NC_017496	ACT	2	6	4538	4543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836857
79	NC_017496	TG	3	6	4595	4600	0 %	50 %	50 %	0 %	385836857
80	NC_017496	TCA	2	6	4685	4690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836857
81	NC_017496	T	7	7	4730	4736	0 %	100 %	0 %	0 %	385836857
82	NC_017496	T	6	6	4745	4750	0 %	100 %	0 %	0 %	385836857
83	NC_017496	TCA	2	6	4784	4789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836857
84	NC_017496	TGAA	2	8	4795	4802	50 %	25 %	25 %	0 %	385836857
85	NC_017496	T	6	6	4845	4850	0 %	100 %	0 %	0 %	385836857
86	NC_017496	TCA	2	6	4857	4862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836857
87	NC_017496	CCGTT	2	10	4902	4911	0 %	40 %	20 %	40 %	385836857
88	NC_017496	T	6	6	4941	4946	0 %	100 %	0 %	0 %	385836857
89	NC_017496	T	6	6	4982	4987	0 %	100 %	0 %	0 %	385836858
90	NC_017496	ATT	2	6	5040	5045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836858
91	NC_017496	TGAT	2	8	5074	5081	25 %	50 %	25 %	0 %	385836858
92	NC_017496	ATT	2	6	5082	5087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836858
93	NC_017496	GAA	2	6	5116	5121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836858
94	NC_017496	ATA	2	6	5131	5136	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836858
95	NC_017496	A	6	6	5162	5167	100 %	0 %	0 %	0 %	385836858
96	NC_017496	CAA	2	6	5179	5184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836858
97	NC_017496	TC	3	6	5224	5229	0 %	50 %	0 %	50 %	385836858
98	NC_017496	ATC	2	6	5230	5235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836858
99	NC_017496	CTT	2	6	5252	5257	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836858
100	NC_017496	T	6	6	5274	5279	0 %	100 %	0 %	0 %	385836858
101	NC_017496	TC	3	6	5289	5294	0 %	50 %	0 %	50 %	385836858
102	NC_017496	ATT	2	6	5305	5310	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836858
103	NC_017496	TCAC	2	8	5426	5433	25 %	25 %	0 %	50 %	385836859
104	NC_017496	ATTTT	2	10	5451	5460	20 %	80 %	0 %	0 %	385836859
105	NC_017496	TGG	2	6	5490	5495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385836859
106	NC_017496	A	7	7	5518	5524	100 %	0 %	0 %	0 %	385836859
107	NC_017496	T	7	7	5624	5630	0 %	100 %	0 %	0 %	385836860
108	NC_017496	ATT	2	6	5642	5647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836860
109	NC_017496	TTC	2	6	5651	5656	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836860
110	NC_017496	TCT	2	6	5691	5696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385836860
111	NC_017496	T	8	8	5713	5720	0 %	100 %	0 %	0 %	385836860
112	NC_017496	ATTT	2	8	5731	5738	25 %	75 %	0 %	0 %	385836860
113	NC_017496	ATC	2	6	5811	5816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836860
114	NC_017496	T	6	6	5858	5863	0 %	100 %	0 %	0 %	385836861
115	NC_017496	T	8	8	5881	5888	0 %	100 %	0 %	0 %	385836861
116	NC_017496	TTCT	2	8	5916	5923	0 %	75 %	0 %	25 %	385836861
117	NC_017496	TCATTG	2	12	5925	5936	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	385836861
118	NC_017496	T	6	6	5938	5943	0 %	100 %	0 %	0 %	385836861
119	NC_017496	T	6	6	5982	5987	0 %	100 %	0 %	0 %	385836861
120	NC_017496	AATT	2	8	5989	5996	50 %	50 %	0 %	0 %	385836861
121	NC_017496	TCA	2	6	6021	6026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836861
122	NC_017496	TCA	2	6	6041	6046	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836861
123	NC_017496	AAT	2	6	6087	6092	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385836861
124	NC_017496	AATT	2	8	6367	6374	50 %	50 %	0 %	0 %	385836862
125	NC_017496	T	6	6	6399	6404	0 %	100 %	0 %	0 %	385836862
126	NC_017496	CAT	2	6	6408	6413	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836862
127	NC_017496	TGA	2	6	6481	6486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836862
128	NC_017496	ACG	2	6	6646	6651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836862
129	NC_017496	GAG	2	6	6661	6666	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385836862
130	NC_017496	AAG	2	6	6689	6694	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836862
131	NC_017496	AAG	2	6	6706	6711	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385836862
132	NC_017496	ATT	2	6	6749	6754	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385836862
133	NC_017496	AGC	2	6	6816	6821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836862
134	NC_017496	AGC	2	6	6858	6863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836862
135	NC_017496	TCA	2	6	6926	6931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836862
136	NC_017496	TGA	2	6	7071	7076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385836863
137	NC_017496	GAC	2	6	7088	7093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385836863
138	NC_017496	ATC	2	6	7167	7172	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385836863
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163	NC_017496	TAATT	2	10	8455	8464	40 %	60 %	0 %	0 %	385836863
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171	NC_017496	AT	3	6	8923	8928	50 %	50 %	0 %	0 %	385836863
172	NC_017496	CAA	2	6	8972	8977	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385836863
173	NC_017496	TTGA	2	8	8978	8985	25 %	50 %	25 %	0 %	385836863
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