MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus rhamnosus GG

Total Repeats: 47040

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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32117	NC_017482	CGAT	2	8	2051505	2051512	25 %	25 %	25 %	25 %	385828652
32118	NC_017482	T	6	6	2051526	2051531	0 %	100 %	0 %	0 %	385828652
32119	NC_017482	CTAC	2	8	2051890	2051897	25 %	25 %	0 %	50 %	385828653
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32121	NC_017482	CGG	2	6	2051930	2051935	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828653
32122	NC_017482	TTC	2	6	2051936	2051941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828653
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32215	NC_017482	TCG	2	6	2058437	2058442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828659
32216	NC_017482	TCT	2	6	2058477	2058482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828659
32217	NC_017482	TCG	2	6	2058486	2058491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828659
32218	NC_017482	TTC	2	6	2058691	2058696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828659
32219	NC_017482	GCG	2	6	2059209	2059214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828660
32220	NC_017482	GGT	2	6	2059223	2059228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828660
32221	NC_017482	CATC	2	8	2059275	2059282	25 %	25 %	0 %	50 %	385828660
32222	NC_017482	CAG	2	6	2059360	2059365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828660
32223	NC_017482	GAA	2	6	2059496	2059501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828661
32224	NC_017482	GCC	2	6	2059548	2059553	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828661
32225	NC_017482	CAGCCA	2	12	2059557	2059568	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	385828661
32226	NC_017482	GCA	2	6	2059615	2059620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828661
32227	NC_017482	GCT	2	6	2059656	2059661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828661
32228	NC_017482	TCA	2	6	2059688	2059693	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828661
32229	NC_017482	GCACTT	2	12	2059754	2059765	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	385828661
32230	NC_017482	CAC	2	6	2059806	2059811	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828661
32231	NC_017482	ATA	2	6	2059928	2059933	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828661
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32335	NC_017482	ATGA	2	8	2067248	2067255	50 %	25 %	25 %	0 %	385828666
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32344	NC_017482	TCT	2	6	2068015	2068020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828667
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32347	NC_017482	CTT	2	6	2068235	2068240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828667
32348	NC_017482	AAC	2	6	2068269	2068274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828667
32349	NC_017482	GGC	2	6	2068329	2068334	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828667
32350	NC_017482	CCG	2	6	2068355	2068360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828667
32351	NC_017482	GCT	2	6	2068455	2068460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828667
32352	NC_017482	GCCA	2	8	2068527	2068534	25 %	0 %	25 %	50 %	385828667
32353	NC_017482	ACC	2	6	2068554	2068559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828667
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32356	NC_017482	CTG	2	6	2068733	2068738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828667
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32358	NC_017482	TGC	2	6	2068782	2068787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828667
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32362	NC_017482	CAA	2	6	2068906	2068911	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828668
32363	NC_017482	AGC	2	6	2069041	2069046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828668
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32374	NC_017482	T	6	6	2070007	2070012	0 %	100 %	0 %	0 %	385828669
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32378	NC_017482	ACC	2	6	2070392	2070397	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828669
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32386	NC_017482	TCC	2	6	2070965	2070970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385828669
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32389	NC_017482	GCC	2	6	2071054	2071059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828669
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32398	NC_017482	ATTG	2	8	2072410	2072417	25 %	50 %	25 %	0 %	385828670
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32416	NC_017482	GCA	2	6	2073801	2073806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828671
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32428	NC_017482	GCCC	2	8	2074438	2074445	0 %	0 %	25 %	75 %	385828671
32429	NC_017482	TAC	2	6	2074861	2074866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828672
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32432	NC_017482	GCG	2	6	2075032	2075037	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828672
32433	NC_017482	TCG	2	6	2075040	2075045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828672
32434	NC_017482	ATG	2	6	2075082	2075087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828672
32435	NC_017482	T	6	6	2075096	2075101	0 %	100 %	0 %	0 %	385828672
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32437	NC_017482	GCG	2	6	2075275	2075280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828672
32438	NC_017482	CGT	2	6	2075285	2075290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828672
32439	NC_017482	AAT	2	6	2075357	2075362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828672
32440	NC_017482	GCA	2	6	2075419	2075424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828672
32441	NC_017482	TGC	2	6	2075455	2075460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828672
32442	NC_017482	CAG	2	6	2075492	2075497	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828672
32443	NC_017482	TGG	2	6	2075509	2075514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385828672
32444	NC_017482	CCA	2	6	2075571	2075576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828672
32445	NC_017482	AAGCGC	2	12	2075624	2075635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828672
32446	NC_017482	T	6	6	2075677	2075682	0 %	100 %	0 %	0 %	385828672
32447	NC_017482	GCG	2	6	2075880	2075885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828673
32448	NC_017482	CAA	2	6	2075900	2075905	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828673
32449	NC_017482	AAT	2	6	2075919	2075924	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828673
32450	NC_017482	CAA	2	6	2076003	2076008	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828673
32451	NC_017482	CCG	2	6	2076055	2076060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828673
32452	NC_017482	T	6	6	2076105	2076110	0 %	100 %	0 %	0 %	385828673
32453	NC_017482	T	7	7	2076173	2076179	0 %	100 %	0 %	0 %	385828673
32454	NC_017482	ATA	2	6	2076207	2076212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828673
32455	NC_017482	GCG	2	6	2076293	2076298	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828673
32456	NC_017482	AGGCG	2	10	2076368	2076377	20 %	0 %	60 %	20 %	385828673
32457	NC_017482	AAC	2	6	2076400	2076405	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385828673
32458	NC_017482	TCA	2	6	2076460	2076465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828673
32459	NC_017482	GCAC	2	8	2076470	2076477	25 %	0 %	25 %	50 %	385828673
32460	NC_017482	ATAC	2	8	2076510	2076517	50 %	25 %	0 %	25 %	385828673
32461	NC_017482	A	6	6	2076532	2076537	100 %	0 %	0 %	0 %	385828673
32462	NC_017482	CGACT	2	10	2076573	2076582	20 %	20 %	20 %	40 %	385828673
32463	NC_017482	CCT	2	6	2076596	2076601	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385828673
32464	NC_017482	GAT	2	6	2076731	2076736	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828673
32465	NC_017482	CGC	2	6	2076754	2076759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828673
32466	NC_017482	TGA	2	6	2076805	2076810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828673
32467	NC_017482	ATA	2	6	2076894	2076899	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828673
32468	NC_017482	GTT	2	6	2076963	2076968	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385828673
32469	NC_017482	CCG	2	6	2077024	2077029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828673
32470	NC_017482	ACC	2	6	2077102	2077107	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828673
32471	NC_017482	AAT	2	6	2077236	2077241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828673
32472	NC_017482	AAT	2	6	2077247	2077252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385828673
32473	NC_017482	CAG	2	6	2077287	2077292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828673
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32475	NC_017482	CTG	2	6	2077410	2077415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828673
32476	NC_017482	ATC	2	6	2077419	2077424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385828673
32477	NC_017482	TGA	2	6	2077438	2077443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828673
32478	NC_017482	A	6	6	2077477	2077482	100 %	0 %	0 %	0 %	385828673
32479	NC_017482	GTC	2	6	2077498	2077503	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828673
32480	NC_017482	TCATC	2	10	2077508	2077517	20 %	40 %	0 %	40 %	385828673
32481	NC_017482	TGA	2	6	2077655	2077660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828673
32482	NC_017482	ATG	2	6	2077720	2077725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385828673
32483	NC_017482	TTGAT	2	10	2077880	2077889	20 %	60 %	20 %	0 %	385828674
32484	NC_017482	A	6	6	2077932	2077937	100 %	0 %	0 %	0 %	385828674
32485	NC_017482	AGG	3	9	2077943	2077951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385828674
32486	NC_017482	ACC	2	6	2077988	2077993	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385828674
32487	NC_017482	AAG	2	6	2078045	2078050	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385828674
32488	NC_017482	CGA	2	6	2078075	2078080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828674
32489	NC_017482	CTT	2	6	2078170	2078175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828674
32490	NC_017482	AG	3	6	2078205	2078210	50 %	0 %	50 %	0 %	385828674
32491	NC_017482	ATCA	2	8	2078320	2078327	50 %	25 %	0 %	25 %	385828674
32492	NC_017482	GCT	3	9	2078472	2078480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828674
32493	NC_017482	GCG	2	6	2078608	2078613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385828674
32494	NC_017482	CGC	2	6	2078627	2078632	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385828674
32495	NC_017482	AGC	2	6	2078756	2078761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385828674
32496	NC_017482	CG	3	6	2078856	2078861	0 %	0 %	50 %	50 %	385828674
32497	NC_017482	TG	3	6	2078932	2078937	0 %	50 %	50 %	0 %	385828674
32498	NC_017482	CTT	2	6	2078947	2078952	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385828674
32499	NC_017482	TCG	2	6	2079008	2079013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385828674
32500	NC_017482	CGGT	2	8	2079023	2079030	0 %	25 %	50 %	25 %	385828674

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