MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_017474	CTT	2	6	2844520	2844525	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824612
46003	NC_017474	GCC	2	6	2844536	2844541	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824612
46004	NC_017474	GAA	2	6	2844548	2844553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824612
46005	NC_017474	TCA	2	6	2844891	2844896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824612
46006	NC_017474	CAC	2	6	2844923	2844928	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824612
46007	NC_017474	TGGA	2	8	2844969	2844976	25 %	25 %	50 %	0 %	385824612
46008	NC_017474	ATG	2	6	2845124	2845129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824613
46009	NC_017474	TGC	2	6	2845183	2845188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824613
46010	NC_017474	TGG	2	6	2845215	2845220	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824613
46011	NC_017474	CCG	2	6	2845233	2845238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824613
46012	NC_017474	CG	3	6	2845237	2845242	0 %	0 %	50 %	50 %	385824613
46013	NC_017474	CTT	2	6	2845272	2845277	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824613
46014	NC_017474	GTG	2	6	2845385	2845390	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824613
46015	NC_017474	AGA	2	6	2845680	2845685	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824613
46016	NC_017474	CGC	2	6	2845687	2845692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824613
46017	NC_017474	ATC	3	9	2845706	2845714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824613
46018	NC_017474	ACC	2	6	2845757	2845762	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824613
46019	NC_017474	CCG	2	6	2845766	2845771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824613
46020	NC_017474	CTT	2	6	2845788	2845793	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824613
46021	NC_017474	TACT	2	8	2845880	2845887	25 %	50 %	0 %	25 %	385824613
46022	NC_017474	GAT	2	6	2845897	2845902	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824613
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46024	NC_017474	GTA	2	6	2846134	2846139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824613
46025	NC_017474	GCC	2	6	2846178	2846183	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824614
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46027	NC_017474	GCA	2	6	2846393	2846398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824614
46028	NC_017474	GGT	2	6	2846450	2846455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824614
46029	NC_017474	CGT	2	6	2846573	2846578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824614
46030	NC_017474	TCA	2	6	2846605	2846610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824614
46031	NC_017474	CGG	2	6	2846691	2846696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824614
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46034	NC_017474	ATCA	2	8	2846781	2846788	50 %	25 %	0 %	25 %	385824614
46035	NC_017474	CG	3	6	2846804	2846809	0 %	0 %	50 %	50 %	385824614
46036	NC_017474	TGT	2	6	2846966	2846971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824614
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46042	NC_017474	GTT	2	6	2847221	2847226	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824614
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46051	NC_017474	CGA	2	6	2848136	2848141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824615
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46053	NC_017474	CAT	2	6	2848217	2848222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824615
46054	NC_017474	GTTT	2	8	2848231	2848238	0 %	75 %	25 %	0 %	385824615
46055	NC_017474	TGA	2	6	2848279	2848284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824616
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46057	NC_017474	CAA	2	6	2848326	2848331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824616
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46075	NC_017474	GGCACC	2	12	2848812	2848823	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	385824616
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46099	NC_017474	AATA	2	8	2850571	2850578	75 %	25 %	0 %	0 %	385824619
46100	NC_017474	CTG	2	6	2850599	2850604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
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46104	NC_017474	T	6	6	2850686	2850691	0 %	100 %	0 %	0 %	385824619
46105	NC_017474	CTC	2	6	2850700	2850705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824619
46106	NC_017474	AC	3	6	2850781	2850786	50 %	0 %	0 %	50 %	385824619
46107	NC_017474	TGA	2	6	2850787	2850792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824619
46108	NC_017474	CAT	2	6	2850829	2850834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824619
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46110	NC_017474	AAAC	2	8	2851000	2851007	75 %	0 %	0 %	25 %	385824619
46111	NC_017474	T	6	6	2851054	2851059	0 %	100 %	0 %	0 %	385824619
46112	NC_017474	GACT	2	8	2851146	2851153	25 %	25 %	25 %	25 %	385824619
46113	NC_017474	CAAC	2	8	2851207	2851214	50 %	0 %	0 %	50 %	385824619
46114	NC_017474	GAT	2	6	2851229	2851234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824619
46115	NC_017474	ATA	2	6	2851301	2851306	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824619
46116	NC_017474	CTG	2	6	2851376	2851381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
46117	NC_017474	GAT	2	6	2851405	2851410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824619
46118	NC_017474	TCGGT	2	10	2851594	2851603	0 %	40 %	40 %	20 %	385824619
46119	NC_017474	CTG	2	6	2851655	2851660	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824619
46120	NC_017474	TGA	2	6	2851663	2851668	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824619
46121	NC_017474	CGG	2	6	2851683	2851688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824619
46122	NC_017474	ATA	2	6	2851721	2851726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824619
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46134	NC_017474	GAAT	2	8	2852893	2852900	50 %	25 %	25 %	0 %	385824620
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46231	NC_017474	CGA	2	6	2858442	2858447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824627
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46334	NC_017474	TTAAA	2	10	2865156	2865165	60 %	40 %	0 %	0 %	385824634
46335	NC_017474	TCGG	2	8	2865189	2865196	0 %	25 %	50 %	25 %	385824634
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46338	NC_017474	AT	3	6	2865299	2865304	50 %	50 %	0 %	0 %	385824634
46339	NC_017474	AGT	2	6	2865363	2865368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824634
46340	NC_017474	TGC	2	6	2865398	2865403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824634
46341	NC_017474	ATC	2	6	2865455	2865460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824635
46342	NC_017474	GTC	2	6	2865596	2865601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824635
46343	NC_017474	CACGAT	2	12	2865701	2865712	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385824635
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46462	NC_017474	ATGTA	2	10	2874207	2874216	40 %	40 %	20 %	0 %	385824644
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46492	NC_017474	CTT	2	6	2875542	2875547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824645
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46496	NC_017474	CAT	2	6	2875716	2875721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824645
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