MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45232	NC_017474	TGA	2	6	2799050	2799055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824565
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45247	NC_017474	TGC	2	6	2801138	2801143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824568
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45314	NC_017474	GTCAG	2	10	2804320	2804329	20 %	20 %	40 %	20 %	385824571
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45318	NC_017474	GATT	2	8	2804414	2804421	25 %	50 %	25 %	0 %	385824571
45319	NC_017474	ATCA	2	8	2804499	2804506	50 %	25 %	0 %	25 %	385824571
45320	NC_017474	GCA	2	6	2804527	2804532	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824571
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45325	NC_017474	GCA	2	6	2804809	2804814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824571
45326	NC_017474	TTG	2	6	2804817	2804822	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824571
45327	NC_017474	T	6	6	2804835	2804840	0 %	100 %	0 %	0 %	385824571
45328	NC_017474	GCT	2	6	2804842	2804847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824571
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45330	NC_017474	GCTG	2	8	2804920	2804927	0 %	25 %	50 %	25 %	385824571
45331	NC_017474	GCG	2	6	2804938	2804943	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824571
45332	NC_017474	CAT	2	6	2805027	2805032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824571
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45334	NC_017474	AGC	2	6	2805096	2805101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824571
45335	NC_017474	GCG	2	6	2805143	2805148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824571
45336	NC_017474	ACG	2	6	2805238	2805243	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824571
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45338	NC_017474	CCA	2	6	2805404	2805409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824571
45339	NC_017474	TAA	2	6	2805435	2805440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824571
45340	NC_017474	A	6	6	2805503	2805508	100 %	0 %	0 %	0 %	385824571
45341	NC_017474	TGGG	2	8	2805667	2805674	0 %	25 %	75 %	0 %	385824571
45342	NC_017474	A	6	6	2805700	2805705	100 %	0 %	0 %	0 %	385824571
45343	NC_017474	TAT	2	6	2805707	2805712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824571
45344	NC_017474	TGT	2	6	2805754	2805759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824571
45345	NC_017474	TGC	2	6	2805760	2805765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824571
45346	NC_017474	GCT	2	6	2805794	2805799	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824571
45347	NC_017474	CCT	2	6	2805816	2805821	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824572
45348	NC_017474	CAC	2	6	2805823	2805828	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824572
45349	NC_017474	TCT	2	6	2805890	2805895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824572
45350	NC_017474	ATCA	2	8	2805928	2805935	50 %	25 %	0 %	25 %	385824572
45351	NC_017474	GAC	2	6	2806054	2806059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824572
45352	NC_017474	AAT	2	6	2806072	2806077	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824572
45353	NC_017474	TCA	2	6	2806089	2806094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824572
45354	NC_017474	GTT	2	6	2806184	2806189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824573
45355	NC_017474	TGC	2	6	2806207	2806212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824573
45356	NC_017474	GTG	2	6	2806283	2806288	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824573
45357	NC_017474	GCG	2	6	2806352	2806357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385824573
45358	NC_017474	CAC	2	6	2806358	2806363	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385824573
45359	NC_017474	GTT	2	6	2806441	2806446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824573
45360	NC_017474	AGACA	2	10	2806506	2806515	60 %	0 %	20 %	20 %	385824573
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45362	NC_017474	CTT	3	9	2806757	2806765	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824574
45363	NC_017474	TGCCA	2	10	2806884	2806893	20 %	20 %	20 %	40 %	385824574
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45365	NC_017474	TGCAA	2	10	2807103	2807112	40 %	20 %	20 %	20 %	385824574
45366	NC_017474	CG	3	6	2807207	2807212	0 %	0 %	50 %	50 %	385824574
45367	NC_017474	CGT	2	6	2807215	2807220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824574
45368	NC_017474	ATA	2	6	2807253	2807258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824574
45369	NC_017474	GTT	2	6	2807313	2807318	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824574
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45371	NC_017474	ATG	2	6	2807370	2807375	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824574
45372	NC_017474	T	6	6	2807462	2807467	0 %	100 %	0 %	0 %	385824574
45373	NC_017474	GCC	2	6	2807550	2807555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824575
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45375	NC_017474	TTG	2	6	2807590	2807595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824575
45376	NC_017474	CA	3	6	2807652	2807657	50 %	0 %	0 %	50 %	385824575
45377	NC_017474	AT	3	6	2807683	2807688	50 %	50 %	0 %	0 %	385824575
45378	NC_017474	CTT	2	6	2807691	2807696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824575
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45380	NC_017474	ACCC	2	8	2807741	2807748	25 %	0 %	0 %	75 %	385824575
45381	NC_017474	TAA	2	6	2807862	2807867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385824575
45382	NC_017474	TGT	2	6	2807868	2807873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824575
45383	NC_017474	GTT	2	6	2807937	2807942	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824575
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45438	NC_017474	CGAT	2	8	2811857	2811864	25 %	25 %	25 %	25 %	385824579
45439	NC_017474	GAA	2	6	2811880	2811885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824579
45440	NC_017474	TGC	2	6	2811900	2811905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824579
45441	NC_017474	A	7	7	2811911	2811917	100 %	0 %	0 %	0 %	385824579
45442	NC_017474	AC	3	6	2812007	2812012	50 %	0 %	0 %	50 %	385824579
45443	NC_017474	ACCTAT	2	12	2812423	2812434	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824580
45444	NC_017474	TTC	2	6	2812516	2812521	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385824580
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45446	NC_017474	TGG	2	6	2812554	2812559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824580
45447	NC_017474	TAT	2	6	2812569	2812574	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824580
45448	NC_017474	AGC	2	6	2812590	2812595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824580
45449	NC_017474	TTA	2	6	2812614	2812619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824580
45450	NC_017474	TGT	2	6	2812686	2812691	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824580
45451	NC_017474	GCCAA	2	10	2812750	2812759	40 %	0 %	20 %	40 %	385824580
45452	NC_017474	CAA	2	6	2812768	2812773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824580
45453	NC_017474	AT	3	6	2812800	2812805	50 %	50 %	0 %	0 %	385824580
45454	NC_017474	ACG	2	6	2812902	2812907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824580
45455	NC_017474	ATT	2	6	2812998	2813003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824580
45456	NC_017474	CGT	2	6	2813016	2813021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824580
45457	NC_017474	TG	3	6	2813084	2813089	0 %	50 %	50 %	0 %	385824580
45458	NC_017474	ATG	2	6	2813105	2813110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824580
45459	NC_017474	ATGA	2	8	2813128	2813135	50 %	25 %	25 %	0 %	385824580
45460	NC_017474	TCA	2	6	2813191	2813196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824581
45461	NC_017474	GAA	3	9	2813201	2813209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385824581
45462	NC_017474	ACA	2	6	2813382	2813387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824581
45463	NC_017474	GTT	2	6	2813468	2813473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824581
45464	NC_017474	GAT	2	6	2813527	2813532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824581
45465	NC_017474	CGC	2	6	2813534	2813539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385824581
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45468	NC_017474	AGC	2	6	2813597	2813602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385824581
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45470	NC_017474	ATC	2	6	2813660	2813665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385824581
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45474	NC_017474	CG	3	6	2813840	2813845	0 %	0 %	50 %	50 %	385824581
45475	NC_017474	TAT	2	6	2813968	2813973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385824581
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45485	NC_017474	ACTG	2	8	2814622	2814629	25 %	25 %	25 %	25 %	385824582
45486	NC_017474	TGG	2	6	2814650	2814655	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824582
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45489	NC_017474	ATG	2	6	2814800	2814805	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385824583
45490	NC_017474	CCAA	2	8	2814818	2814825	50 %	0 %	0 %	50 %	385824583
45491	NC_017474	CAA	2	6	2814827	2814832	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385824583
45492	NC_017474	TCC	2	6	2814837	2814842	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385824583
45493	NC_017474	TGG	2	6	2814868	2814873	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385824583
45494	NC_017474	TGC	2	6	2814889	2814894	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385824583
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45497	NC_017474	TGT	2	6	2815075	2815080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385824583
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45499	NC_017474	TATTTT	2	12	2815160	2815171	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	385824583
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