MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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26002	NC_017474	GGTCA	2	10	1626055	1626064	20 %	20 %	40 %	20 %	385823370
26003	NC_017474	CAA	2	6	1626072	1626077	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823370
26004	NC_017474	TGCG	3	12	1626123	1626134	0 %	25 %	50 %	25 %	385823370
26005	NC_017474	TCA	2	6	1626180	1626185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823370
26006	NC_017474	ATC	2	6	1626205	1626210	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823370
26007	NC_017474	TCA	2	6	1626216	1626221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823370
26008	NC_017474	CTG	2	6	1626271	1626276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823370
26009	NC_017474	CCA	2	6	1626324	1626329	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385823370
26010	NC_017474	AACATG	2	12	1626352	1626363	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	385823370
26011	NC_017474	GAA	2	6	1626402	1626407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385823370
26012	NC_017474	CAC	2	6	1626450	1626455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385823370
26013	NC_017474	ATT	2	6	1626478	1626483	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385823370
26014	NC_017474	GCC	2	6	1626656	1626661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385823370
26015	NC_017474	ATC	2	6	1627023	1627028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823371
26016	NC_017474	GTG	2	6	1627064	1627069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385823371
26017	NC_017474	TAG	2	6	1627086	1627091	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823371
26018	NC_017474	T	6	6	1627094	1627099	0 %	100 %	0 %	0 %	385823371
26019	NC_017474	TGA	2	6	1627142	1627147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823371
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26021	NC_017474	AGCCA	2	10	1627200	1627209	40 %	0 %	20 %	40 %	385823371
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26028	NC_017474	GTA	2	6	1627860	1627865	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823371
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26032	NC_017474	T	6	6	1628135	1628140	0 %	100 %	0 %	0 %	385823371
26033	NC_017474	AAG	2	6	1628143	1628148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385823371
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26035	NC_017474	CAT	2	6	1628340	1628345	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823371
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26038	NC_017474	T	7	7	1628678	1628684	0 %	100 %	0 %	0 %	385823371
26039	NC_017474	CAT	2	6	1628712	1628717	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823371
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26041	NC_017474	TCA	2	6	1628770	1628775	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823371
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26463	NC_017474	GGT	2	6	1654303	1654308	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385823391
26464	NC_017474	GCT	2	6	1654366	1654371	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823391
26465	NC_017474	TAT	2	6	1654417	1654422	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385823392
26466	NC_017474	GAC	2	6	1654423	1654428	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26467	NC_017474	CG	3	6	1654436	1654441	0 %	0 %	50 %	50 %	385823392
26468	NC_017474	CA	3	6	1654442	1654447	50 %	0 %	0 %	50 %	385823392
26469	NC_017474	TGC	2	6	1654494	1654499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26470	NC_017474	AGC	2	6	1654508	1654513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26471	NC_017474	CTTTAA	2	12	1654518	1654529	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	385823392
26472	NC_017474	CAG	2	6	1654548	1654553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26473	NC_017474	AAT	2	6	1654574	1654579	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385823392
26474	NC_017474	GAA	2	6	1654601	1654606	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385823392
26475	NC_017474	CTG	2	6	1654704	1654709	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26476	NC_017474	TGC	2	6	1654738	1654743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26477	NC_017474	CTG	2	6	1654752	1654757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26478	NC_017474	CG	3	6	1654763	1654768	0 %	0 %	50 %	50 %	385823392
26479	NC_017474	GC	3	6	1654808	1654813	0 %	0 %	50 %	50 %	385823392
26480	NC_017474	TGG	2	6	1654846	1654851	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385823392
26481	NC_017474	GAC	2	6	1654877	1654882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26482	NC_017474	CTG	2	6	1654953	1654958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26483	NC_017474	A	7	7	1654959	1654965	100 %	0 %	0 %	0 %	385823392
26484	NC_017474	CTA	2	6	1655014	1655019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823392
26485	NC_017474	GAC	2	6	1655081	1655086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385823392
26486	NC_017474	GCAT	2	8	1655127	1655134	25 %	25 %	25 %	25 %	385823392
26487	NC_017474	GCG	2	6	1655135	1655140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385823392
26488	NC_017474	AAC	2	6	1655211	1655216	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823392
26489	NC_017474	GATG	2	8	1655245	1655252	25 %	25 %	50 %	0 %	385823392
26490	NC_017474	ACT	2	6	1655276	1655281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823392
26491	NC_017474	TTA	2	6	1655300	1655305	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385823392
26492	NC_017474	CAT	2	6	1655368	1655373	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823392
26493	NC_017474	TGA	2	6	1655389	1655394	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385823392
26494	NC_017474	ATCGC	2	10	1655408	1655417	20 %	20 %	20 %	40 %	385823392
26495	NC_017474	AAC	2	6	1655513	1655518	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385823393
26496	NC_017474	CGG	2	6	1655591	1655596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385823393
26497	NC_017474	TCA	2	6	1655774	1655779	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385823393
26498	NC_017474	CTG	3	9	1655785	1655793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823393
26499	NC_017474	GGC	2	6	1655795	1655800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385823393
26500	NC_017474	TGC	2	6	1655843	1655848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385823393

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