MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei BD-II chromosome

Total Repeats: 49466

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_017474	ATG	2	6	1221335	1221340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822945
19503	NC_017474	T	6	6	1221390	1221395	0 %	100 %	0 %	0 %	385822945
19504	NC_017474	GGC	2	6	1221417	1221422	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822945
19505	NC_017474	GTTT	2	8	1221423	1221430	0 %	75 %	25 %	0 %	385822945
19506	NC_017474	G	6	6	1221482	1221487	0 %	0 %	100 %	0 %	385822945
19507	NC_017474	ATC	2	6	1221523	1221528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822945
19508	NC_017474	TGT	2	6	1221617	1221622	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822945
19509	NC_017474	GGC	2	6	1221652	1221657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822945
19510	NC_017474	GTTG	2	8	1221666	1221673	0 %	50 %	50 %	0 %	385822945
19511	NC_017474	GCG	2	6	1221678	1221683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822945
19512	NC_017474	CTG	2	6	1221733	1221738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822945
19513	NC_017474	GAT	2	6	1221762	1221767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822945
19514	NC_017474	CGA	2	6	1221809	1221814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822945
19515	NC_017474	GTAT	2	8	1221869	1221876	25 %	50 %	25 %	0 %	385822945
19516	NC_017474	GTT	2	6	1222056	1222061	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822945
19517	NC_017474	GAC	2	6	1222113	1222118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822945
19518	NC_017474	TCA	2	6	1222168	1222173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822945
19519	NC_017474	CGA	2	6	1222241	1222246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822945
19520	NC_017474	TTA	2	6	1222293	1222298	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822945
19521	NC_017474	GGC	2	6	1222312	1222317	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822945
19522	NC_017474	GAGT	2	8	1222320	1222327	25 %	25 %	50 %	0 %	385822945
19523	NC_017474	AGA	2	6	1222335	1222340	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822945
19524	NC_017474	T	7	7	1222356	1222362	0 %	100 %	0 %	0 %	385822945
19525	NC_017474	TCA	2	6	1222392	1222397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822945
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19527	NC_017474	ACT	2	6	1222535	1222540	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822945
19528	NC_017474	CAG	2	6	1222580	1222585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385822945
19529	NC_017474	GGCT	2	8	1222639	1222646	0 %	25 %	50 %	25 %	385822945
19530	NC_017474	GGC	2	6	1222672	1222677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822945
19531	NC_017474	TGG	2	6	1222678	1222683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822945
19532	NC_017474	TTG	2	6	1222684	1222689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385822945
19533	NC_017474	AAT	2	6	1222742	1222747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385822945
19534	NC_017474	CGT	2	6	1223129	1223134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822946
19535	NC_017474	AAC	2	6	1223186	1223191	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385822946
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19537	NC_017474	ATC	2	6	1223204	1223209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822946
19538	NC_017474	GCCA	2	8	1223232	1223239	25 %	0 %	25 %	50 %	385822946
19539	NC_017474	A	6	6	1223290	1223295	100 %	0 %	0 %	0 %	385822946
19540	NC_017474	GAT	2	6	1223359	1223364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822946
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19542	NC_017474	TCA	2	6	1223538	1223543	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822946
19543	NC_017474	TTA	2	6	1223588	1223593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822946
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19545	NC_017474	GTA	2	6	1223752	1223757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822946
19546	NC_017474	GA	3	6	1223774	1223779	50 %	0 %	50 %	0 %	385822946
19547	NC_017474	GCC	2	6	1223792	1223797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385822946
19548	NC_017474	CGAG	2	8	1223809	1223816	25 %	0 %	50 %	25 %	385822946
19549	NC_017474	TCG	2	6	1223879	1223884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385822946
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19553	NC_017474	GGT	2	6	1224279	1224284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385822947
19554	NC_017474	GAA	2	6	1224288	1224293	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385822947
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19558	NC_017474	CCAA	2	8	1224448	1224455	50 %	0 %	0 %	50 %	385822947
19559	NC_017474	GGC	2	6	1224465	1224470	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822947
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19562	NC_017474	T	7	7	1224531	1224537	0 %	100 %	0 %	0 %	385822947
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19572	NC_017474	CAAT	2	8	1225542	1225549	50 %	25 %	0 %	25 %	385822948
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19588	NC_017474	ATTG	2	8	1227303	1227310	25 %	50 %	25 %	0 %	385822952
19589	NC_017474	GCG	2	6	1227333	1227338	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385822952
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19603	NC_017474	A	7	7	1227908	1227914	100 %	0 %	0 %	0 %	385822953
19604	NC_017474	TTA	2	6	1227922	1227927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385822953
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19607	NC_017474	TTGA	2	8	1228332	1228339	25 %	50 %	25 %	0 %	385822953
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19611	NC_017474	ATC	2	6	1228826	1228831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385822954
19612	NC_017474	TC	3	6	1228886	1228891	0 %	50 %	0 %	50 %	385822954
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19614	NC_017474	TGA	2	6	1229055	1229060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385822954
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19616	NC_017474	GGTCA	2	10	1229110	1229119	20 %	20 %	40 %	20 %	385822954
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