MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus casei LC2W chromosome

Total Repeats: 49082

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017473	CAT	2	6	324959	324964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818846
5002	NC_017473	A	6	6	324993	324998	100 %	0 %	0 %	0 %	385818846
5003	NC_017473	ATGAA	2	10	325000	325009	60 %	20 %	20 %	0 %	385818846
5004	NC_017473	CTT	2	6	325022	325027	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818846
5005	NC_017473	AGA	2	6	325440	325445	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818847
5006	NC_017473	GTCA	2	8	325480	325487	25 %	25 %	25 %	25 %	385818847
5007	NC_017473	TGCT	2	8	325551	325558	0 %	50 %	25 %	25 %	385818847
5008	NC_017473	AAG	2	6	325562	325567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818847
5009	NC_017473	TGGT	2	8	325605	325612	0 %	50 %	50 %	0 %	385818847
5010	NC_017473	CTT	2	6	325660	325665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385818847
5011	NC_017473	ATT	2	6	325758	325763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818847
5012	NC_017473	GGC	2	6	325807	325812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818847
5013	NC_017473	TGA	2	6	325921	325926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818847
5014	NC_017473	CCG	2	6	325975	325980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818847
5015	NC_017473	GGCG	2	8	326114	326121	0 %	0 %	75 %	25 %	385818847
5016	NC_017473	TAT	2	6	326161	326166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818847
5017	NC_017473	ATG	3	9	326175	326183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818847
5018	NC_017473	CAT	2	6	326216	326221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818847
5019	NC_017473	GAT	2	6	326258	326263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818847
5020	NC_017473	CG	3	6	326333	326338	0 %	0 %	50 %	50 %	385818847
5021	NC_017473	TTGA	2	8	326408	326415	25 %	50 %	25 %	0 %	385818847
5022	NC_017473	A	6	6	326504	326509	100 %	0 %	0 %	0 %	385818848
5023	NC_017473	TTA	2	6	326517	326522	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818848
5024	NC_017473	AGA	2	6	326602	326607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818848
5025	NC_017473	A	6	6	326635	326640	100 %	0 %	0 %	0 %	385818848
5026	NC_017473	GAA	2	6	326665	326670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818848
5027	NC_017473	AGA	2	6	326710	326715	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818848
5028	NC_017473	AAC	2	6	326736	326741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818848
5029	NC_017473	GCG	2	6	326877	326882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818848
5030	NC_017473	T	6	6	326886	326891	0 %	100 %	0 %	0 %	385818848
5031	NC_017473	AGCA	2	8	327032	327039	50 %	0 %	25 %	25 %	385818849
5032	NC_017473	GAA	2	6	327079	327084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818849
5033	NC_017473	TGA	2	6	327195	327200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818849
5034	NC_017473	TGG	2	6	327243	327248	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818849
5035	NC_017473	TCA	2	6	327310	327315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818849
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5037	NC_017473	ACA	2	6	327351	327356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818849
5038	NC_017473	GGC	2	6	327421	327426	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818849
5039	NC_017473	AAC	2	6	327465	327470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818849
5040	NC_017473	ATC	2	6	327545	327550	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818849
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5042	NC_017473	CGG	2	6	327611	327616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818849
5043	NC_017473	GAA	2	6	327662	327667	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818849
5044	NC_017473	CCA	2	6	327729	327734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385818849
5045	NC_017473	AAC	2	6	327750	327755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385818849
5046	NC_017473	TGGT	2	8	327768	327775	0 %	50 %	50 %	0 %	385818849
5047	NC_017473	TTA	2	6	327989	327994	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385818849
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5049	NC_017473	T	6	6	328051	328056	0 %	100 %	0 %	0 %	385818849
5050	NC_017473	AGA	2	6	328090	328095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818849
5051	NC_017473	GAT	2	6	328157	328162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818849
5052	NC_017473	GCAG	2	8	328235	328242	25 %	0 %	50 %	25 %	385818849
5053	NC_017473	GCG	2	6	328248	328253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818849
5054	NC_017473	GTG	2	6	328329	328334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818849
5055	NC_017473	TGA	2	6	328368	328373	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385818849
5056	NC_017473	ATC	2	6	328400	328405	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385818849
5057	NC_017473	TGT	2	6	328456	328461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385818849
5058	NC_017473	GAA	2	6	328595	328600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385818850
5059	NC_017473	TGG	2	6	328633	328638	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385818850
5060	NC_017473	CGG	2	6	328763	328768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818850
5061	NC_017473	TGTC	2	8	328777	328784	0 %	50 %	25 %	25 %	385818850
5062	NC_017473	GACCAT	2	12	328952	328963	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	385818850
5063	NC_017473	ACGT	2	8	328977	328984	25 %	25 %	25 %	25 %	385818850
5064	NC_017473	CAG	2	6	329024	329029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385818850
5065	NC_017473	CATTC	2	10	329069	329078	20 %	40 %	0 %	40 %	385818850
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5069	NC_017473	CGC	2	6	329330	329335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385818850
5070	NC_017473	GTC	2	6	329337	329342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385818850
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5104	NC_017473	CAGA	2	8	331480	331487	50 %	0 %	25 %	25 %	385818852
5105	NC_017473	CGG	2	6	331505	331510	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385818852
5106	NC_017473	GCGG	2	8	331590	331597	0 %	0 %	75 %	25 %	385818852
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5488	NC_017473	ACTG	2	8	356278	356285	25 %	25 %	25 %	25 %	385818882
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