MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 24576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
24501	NC_017465	TCACG	2	10	2092694	2092703	20 %	20 %	20 %	40 %	385812832
24502	NC_017465	GTC	2	6	2092705	2092710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812832
24503	NC_017465	ATG	2	6	2092792	2092797	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812832
24504	NC_017465	CCTT	2	8	2092828	2092835	0 %	50 %	0 %	50 %	385812832
24505	NC_017465	CGT	2	6	2092919	2092924	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812832
24506	NC_017465	CCG	2	6	2093916	2093921	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812833
24507	NC_017465	GCG	2	6	2094064	2094069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812833
24508	NC_017465	GGCG	2	8	2094098	2094105	0 %	0 %	75 %	25 %	385812833
24509	NC_017465	CCG	2	6	2094113	2094118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812833
24510	NC_017465	GCT	2	6	2094161	2094166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812833
24511	NC_017465	TTC	2	6	2094180	2094185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812833
24512	NC_017465	CGG	2	6	2094206	2094211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812833
24513	NC_017465	TCT	2	6	2094214	2094219	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812833
24514	NC_017465	ACC	2	6	2094289	2094294	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812833
24515	NC_017465	CCGG	2	8	2094308	2094315	0 %	0 %	50 %	50 %	385812833
24516	NC_017465	CCG	2	6	2094336	2094341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812833
24517	NC_017465	ACC	2	6	2094352	2094357	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812833
24518	NC_017465	TTG	2	6	2094393	2094398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812833
24519	NC_017465	ACTC	2	8	2094437	2094444	25 %	25 %	0 %	50 %	385812833
24520	NC_017465	A	7	7	2094461	2094467	100 %	0 %	0 %	0 %	385812833
24521	NC_017465	GCC	2	6	2094582	2094587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812833
24522	NC_017465	TGCTT	2	10	2094588	2094597	0 %	60 %	20 %	20 %	385812833
24523	NC_017465	CCG	2	6	2094605	2094610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812833
24524	NC_017465	ACC	2	6	2094666	2094671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812833
24525	NC_017465	GCC	2	6	2094687	2094692	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812833
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24527	NC_017465	TCG	2	6	2094742	2094747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812833
24528	NC_017465	AAG	2	6	2094790	2094795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812833
24529	NC_017465	CCG	2	6	2094811	2094816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812833
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24531	NC_017465	AAG	2	6	2094867	2094872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812833
24532	NC_017465	GCA	2	6	2094949	2094954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812833
24533	NC_017465	TTG	2	6	2094995	2095000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812833
24534	NC_017465	GCT	2	6	2095012	2095017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812833
24535	NC_017465	T	7	7	2095047	2095053	0 %	100 %	0 %	0 %	385812833
24536	NC_017465	GCG	2	6	2095069	2095074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812833
24537	NC_017465	TCA	2	6	2095090	2095095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812833
24538	NC_017465	CAT	2	6	2095115	2095120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812833
24539	NC_017465	GAT	3	9	2095127	2095135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812833
24540	NC_017465	GAT	3	9	2095139	2095147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812833
24541	NC_017465	GAT	3	9	2095154	2095162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812833
24542	NC_017465	ATA	2	6	2095200	2095205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812833
24543	NC_017465	GCC	2	6	2095281	2095286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812833
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24545	NC_017465	T	6	6	2095340	2095345	0 %	100 %	0 %	0 %	385812833
24546	NC_017465	CT	3	6	2095358	2095363	0 %	50 %	0 %	50 %	385812833
24547	NC_017465	TTC	2	6	2095410	2095415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812833
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24549	NC_017465	AAG	2	6	2095464	2095469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812833
24550	NC_017465	CGT	2	6	2095521	2095526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812833
24551	NC_017465	ACCG	2	8	2095565	2095572	25 %	0 %	25 %	50 %	385812833
24552	NC_017465	GGTT	2	8	2095593	2095600	0 %	50 %	50 %	0 %	385812833
24553	NC_017465	T	6	6	2095683	2095688	0 %	100 %	0 %	0 %	385812833
24554	NC_017465	T	6	6	2095700	2095705	0 %	100 %	0 %	0 %	385812833
24555	NC_017465	AGTC	2	8	2095711	2095718	25 %	25 %	25 %	25 %	385812833
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.