MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 24576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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15002	NC_017465	CTTC	2	8	1285156	1285163	0 %	50 %	0 %	50 %	385812436
15003	NC_017465	AGC	2	6	1285181	1285186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812436
15004	NC_017465	CCG	3	9	1285195	1285203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812436
15005	NC_017465	CGG	2	6	1285213	1285218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812436
15006	NC_017465	TTTAC	2	10	1285234	1285243	20 %	60 %	0 %	20 %	385812436
15007	NC_017465	TCG	2	6	1285258	1285263	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812436
15008	NC_017465	TTCC	2	8	1285274	1285281	0 %	50 %	0 %	50 %	385812436
15009	NC_017465	T	6	6	1285379	1285384	0 %	100 %	0 %	0 %	385812436
15010	NC_017465	GGA	2	6	1285393	1285398	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812436
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15012	NC_017465	GAC	2	6	1285466	1285471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812436
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15015	NC_017465	CAG	2	6	1285714	1285719	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812436
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15017	NC_017465	TTG	2	6	1286160	1286165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812437
15018	NC_017465	ACC	2	6	1286262	1286267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812437
15019	NC_017465	TTGGG	2	10	1286329	1286338	0 %	40 %	60 %	0 %	385812437
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15024	NC_017465	ACTC	2	8	1286558	1286565	25 %	25 %	0 %	50 %	385812437
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15032	NC_017465	CCGG	2	8	1286986	1286993	0 %	0 %	50 %	50 %	385812437
15033	NC_017465	TGG	2	6	1286999	1287004	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812437
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15051	NC_017465	GGT	3	9	1288224	1288232	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812438
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15230	NC_017465	ACC	2	6	1299859	1299864	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812443
15231	NC_017465	TCCT	2	8	1299887	1299894	0 %	50 %	0 %	50 %	385812443
15232	NC_017465	TAC	2	6	1299901	1299906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812443
15233	NC_017465	GAC	2	6	1300001	1300006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812443
15234	NC_017465	CTTC	2	8	1300085	1300092	0 %	50 %	0 %	50 %	385812443
15235	NC_017465	T	6	6	1300161	1300166	0 %	100 %	0 %	0 %	385812443
15236	NC_017465	TCC	2	6	1300177	1300182	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812443
15237	NC_017465	ATT	2	6	1300241	1300246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812443
15238	NC_017465	TTG	2	6	1300284	1300289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812443
15239	NC_017465	CGACC	2	10	1300373	1300382	20 %	0 %	20 %	60 %	385812443
15240	NC_017465	TCT	2	6	1300447	1300452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812443
15241	NC_017465	TAAT	2	8	1300477	1300484	50 %	50 %	0 %	0 %	385812443
15242	NC_017465	GTG	2	6	1300629	1300634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812443
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15244	NC_017465	ACC	2	6	1300828	1300833	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812444
15245	NC_017465	GGCT	2	8	1300847	1300854	0 %	25 %	50 %	25 %	385812444
15246	NC_017465	GGC	2	6	1300868	1300873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812444
15247	NC_017465	TCG	2	6	1300895	1300900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812444
15248	NC_017465	GTC	2	6	1300935	1300940	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812444
15249	NC_017465	AGT	2	6	1301039	1301044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812444
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15251	NC_017465	CCTT	2	8	1301148	1301155	0 %	50 %	0 %	50 %	385812444
15252	NC_017465	ACA	2	6	1301229	1301234	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812444
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15254	NC_017465	TCC	2	6	1301271	1301276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812444
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15257	NC_017465	ATC	2	6	1301461	1301466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812444
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15261	NC_017465	ACG	2	6	1301537	1301542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812444
15262	NC_017465	TGA	2	6	1301591	1301596	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812444
15263	NC_017465	ACC	2	6	1301645	1301650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812444
15264	NC_017465	TCT	2	6	1301654	1301659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812444
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15268	NC_017465	GTCC	2	8	1301873	1301880	0 %	25 %	25 %	50 %	385812444
15269	NC_017465	T	6	6	1301901	1301906	0 %	100 %	0 %	0 %	385812444
15270	NC_017465	ACCCTC	2	12	1302481	1302492	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	385812445
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15320	NC_017465	GAA	2	6	1305225	1305230	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812447
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15329	NC_017465	TTC	2	6	1305685	1305690	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812447
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15331	NC_017465	AG	3	6	1305754	1305759	50 %	0 %	50 %	0 %	385812447
15332	NC_017465	GGA	2	6	1305770	1305775	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812447
15333	NC_017465	ACAG	2	8	1305788	1305795	50 %	0 %	25 %	25 %	385812447
15334	NC_017465	CAG	2	6	1305850	1305855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812447
15335	NC_017465	GCG	3	9	1305931	1305939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812447
15336	NC_017465	GCGGT	2	10	1305980	1305989	0 %	20 %	60 %	20 %	385812447
15337	NC_017465	CTCA	2	8	1306082	1306089	25 %	25 %	0 %	50 %	385812447
15338	NC_017465	GAT	2	6	1306095	1306100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812447
15339	NC_017465	CTAC	2	8	1306101	1306108	25 %	25 %	0 %	50 %	385812447
15340	NC_017465	GGT	2	6	1306135	1306140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812447
15341	NC_017465	CCAC	2	8	1306180	1306187	25 %	0 %	0 %	75 %	385812447
15342	NC_017465	GCC	2	6	1306212	1306217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812447
15343	NC_017465	G	6	6	1306221	1306226	0 %	0 %	100 %	0 %	385812447
15344	NC_017465	GGC	2	6	1306230	1306235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812447
15345	NC_017465	CGC	2	6	1306244	1306249	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812447
15346	NC_017465	TGA	4	12	1306462	1306473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812448
15347	NC_017465	TGA	2	6	1306504	1306509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812448
15348	NC_017465	ATCG	2	8	1306520	1306527	25 %	25 %	25 %	25 %	385812448
15349	NC_017465	ACA	2	6	1306535	1306540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812448
15350	NC_017465	TTC	2	6	1306559	1306564	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812448
15351	NC_017465	GAT	2	6	1306571	1306576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812448
15352	NC_017465	CCA	2	6	1306579	1306584	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812448
15353	NC_017465	TGG	2	6	1306606	1306611	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812448
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15355	NC_017465	TGG	2	6	1306699	1306704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812448
15356	NC_017465	CTT	2	6	1306748	1306753	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812448
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15359	NC_017465	TGG	2	6	1306859	1306864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812448
15360	NC_017465	CGT	2	6	1306943	1306948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812448
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15364	NC_017465	GGT	2	6	1307302	1307307	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812448
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15366	NC_017465	ACC	2	6	1307322	1307327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812448
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15379	NC_017465	TAGTT	2	10	1308031	1308040	20 %	60 %	20 %	0 %	385812449
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15383	NC_017465	AAGGTG	2	12	1308107	1308118	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	385812449
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15447	NC_017465	ATG	2	6	1313006	1313011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812452
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15450	NC_017465	GCTT	2	8	1313153	1313160	0 %	50 %	25 %	25 %	385812452
15451	NC_017465	CTT	2	6	1313166	1313171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812452
15452	NC_017465	GAACCA	2	12	1313172	1313183	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	385812452
15453	NC_017465	TCT	2	6	1313193	1313198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812452
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15455	NC_017465	CCTT	2	8	1313270	1313277	0 %	50 %	0 %	50 %	385812452
15456	NC_017465	GCG	2	6	1313291	1313296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812452
15457	NC_017465	ATG	2	6	1313330	1313335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812452
15458	NC_017465	CTT	2	6	1313403	1313408	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812452
15459	NC_017465	GGAA	2	8	1313412	1313419	50 %	0 %	50 %	0 %	385812452
15460	NC_017465	GAA	2	6	1313443	1313448	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812452
15461	NC_017465	GGA	2	6	1313470	1313475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812452
15462	NC_017465	CGT	2	6	1313493	1313498	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812452
15463	NC_017465	ACC	3	9	1313587	1313595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812452
15464	NC_017465	ATG	2	6	1313690	1313695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812452
15465	NC_017465	GAT	2	6	1313761	1313766	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812452
15466	NC_017465	GTT	2	6	1313851	1313856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812452
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15474	NC_017465	CGT	2	6	1314128	1314133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812453
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15490	NC_017465	ATG	2	6	1314631	1314636	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812453
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15492	NC_017465	TTC	2	6	1314660	1314665	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812453
15493	NC_017465	GTC	2	6	1314774	1314779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812453
15494	NC_017465	TGGC	2	8	1314808	1314815	0 %	25 %	50 %	25 %	385812453
15495	NC_017465	TTC	2	6	1314816	1314821	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812453
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15497	NC_017465	ATC	2	6	1314930	1314935	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812453
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