MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 24576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14502	NC_017465	TTGG	2	8	1252393	1252400	0 %	50 %	50 %	0 %	385812413
14503	NC_017465	AACC	2	8	1252765	1252772	50 %	0 %	0 %	50 %	385812414
14504	NC_017465	TGAT	2	8	1252899	1252906	25 %	50 %	25 %	0 %	385812414
14505	NC_017465	ACC	2	6	1252913	1252918	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812414
14506	NC_017465	CCA	2	6	1253815	1253820	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812415
14507	NC_017465	CAT	2	6	1253847	1253852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812415
14508	NC_017465	CAG	2	6	1253858	1253863	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812415
14509	NC_017465	ACC	2	6	1253866	1253871	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812415
14510	NC_017465	ACG	2	6	1253933	1253938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812415
14511	NC_017465	ACT	2	6	1253951	1253956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812415
14512	NC_017465	GAA	2	6	1254007	1254012	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812415
14513	NC_017465	GAT	2	6	1254072	1254077	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812415
14514	NC_017465	AAG	2	6	1254088	1254093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812415
14515	NC_017465	TTGT	2	8	1254122	1254129	0 %	75 %	25 %	0 %	385812415
14516	NC_017465	GTG	2	6	1254232	1254237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812415
14517	NC_017465	GTT	2	6	1254298	1254303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812415
14518	NC_017465	GAA	3	9	1254388	1254396	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812415
14519	NC_017465	ATC	2	6	1254424	1254429	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812415
14520	NC_017465	GAC	2	6	1254432	1254437	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812415
14521	NC_017465	GCG	2	6	1254486	1254491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812415
14522	NC_017465	ACG	2	6	1254533	1254538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812415
14523	NC_017465	CAT	2	6	1254546	1254551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812415
14524	NC_017465	CGC	2	6	1254561	1254566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812415
14525	NC_017465	CCA	2	6	1254574	1254579	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812415
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14529	NC_017465	TTTA	2	8	1254938	1254945	25 %	75 %	0 %	0 %	385812416
14530	NC_017465	CTAA	2	8	1254958	1254965	50 %	25 %	0 %	25 %	385812416
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14533	NC_017465	AT	3	6	1255075	1255080	50 %	50 %	0 %	0 %	385812416
14534	NC_017465	TAAC	2	8	1255111	1255118	50 %	25 %	0 %	25 %	385812416
14535	NC_017465	GGA	2	6	1255123	1255128	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812416
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14545	NC_017465	CCGCC	2	10	1256160	1256169	0 %	0 %	20 %	80 %	385812417
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14549	NC_017465	GAT	2	6	1256305	1256310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812417
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14551	NC_017465	CAT	2	6	1256326	1256331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812417
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14617	NC_017465	TTC	2	6	1260486	1260491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812420
14618	NC_017465	GTA	2	6	1260513	1260518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812420
14619	NC_017465	GCT	2	6	1260521	1260526	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812420
14620	NC_017465	GTC	2	6	1260618	1260623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812420
14621	NC_017465	AGTC	2	8	1260698	1260705	25 %	25 %	25 %	25 %	385812420
14622	NC_017465	ATC	2	6	1260769	1260774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812420
14623	NC_017465	TGG	2	6	1260790	1260795	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812420
14624	NC_017465	ACA	2	6	1260821	1260826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	385812420
14625	NC_017465	ACGG	2	8	1260859	1260866	25 %	0 %	50 %	25 %	385812420
14626	NC_017465	CGC	3	9	1260930	1260938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812420
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14629	NC_017465	CGG	2	6	1261031	1261036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812420
14630	NC_017465	AGT	2	6	1261055	1261060	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812420
14631	NC_017465	TCG	2	6	1261102	1261107	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812420
14632	NC_017465	GAT	2	6	1261110	1261115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812420
14633	NC_017465	TGT	2	6	1261370	1261375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812421
14634	NC_017465	TCT	2	6	1261460	1261465	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812421
14635	NC_017465	GTC	2	6	1261470	1261475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812421
14636	NC_017465	CTT	2	6	1261500	1261505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812421
14637	NC_017465	GTA	2	6	1261521	1261526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812421
14638	NC_017465	GCATCG	2	12	1261574	1261585	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	385812421
14639	NC_017465	T	7	7	1261639	1261645	0 %	100 %	0 %	0 %	385812421
14640	NC_017465	GC	3	6	1261657	1261662	0 %	0 %	50 %	50 %	385812421
14641	NC_017465	CCT	2	6	1261667	1261672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812421
14642	NC_017465	GTC	2	6	1261710	1261715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812421
14643	NC_017465	GTC	2	6	1261740	1261745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812421
14644	NC_017465	TCA	2	6	1261769	1261774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812421
14645	NC_017465	TCC	2	6	1261778	1261783	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812421
14646	NC_017465	TCA	2	6	1261784	1261789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812421
14647	NC_017465	CCA	2	6	1261819	1261824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812421
14648	NC_017465	GCGG	2	8	1261846	1261853	0 %	0 %	75 %	25 %	385812421
14649	NC_017465	ATG	2	6	1261862	1261867	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812421
14650	NC_017465	TCA	2	6	1261998	1262003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812421
14651	NC_017465	ACCT	2	8	1262074	1262081	25 %	25 %	0 %	50 %	385812421
14652	NC_017465	CAC	2	6	1262103	1262108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812421
14653	NC_017465	TTG	2	6	1262159	1262164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812421
14654	NC_017465	ATT	2	6	1262206	1262211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812421
14655	NC_017465	GAA	2	6	1262234	1262239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812421
14656	NC_017465	TCA	2	6	1262341	1262346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812421
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14658	NC_017465	CCCG	2	8	1262367	1262374	0 %	0 %	25 %	75 %	385812421
14659	NC_017465	ATCG	2	8	1262585	1262592	25 %	25 %	25 %	25 %	385812422
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14665	NC_017465	CGA	2	6	1262953	1262958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812422
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14667	NC_017465	GCC	2	6	1262982	1262987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812422
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14672	NC_017465	CTT	2	6	1263206	1263211	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812422
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14674	NC_017465	CGG	2	6	1263256	1263261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812422
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14678	NC_017465	GCG	2	6	1263631	1263636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812422
14679	NC_017465	TCAA	2	8	1263661	1263668	50 %	25 %	0 %	25 %	385812422
14680	NC_017465	CAT	2	6	1263705	1263710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812422
14681	NC_017465	GTC	2	6	1263829	1263834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812422
14682	NC_017465	GTT	2	6	1263858	1263863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812422
14683	NC_017465	GGT	2	6	1263885	1263890	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812422
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14685	NC_017465	CAAT	2	8	1263929	1263936	50 %	25 %	0 %	25 %	385812422
14686	NC_017465	CGT	2	6	1263965	1263970	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812422
14687	NC_017465	TTG	2	6	1264431	1264436	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812423
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14690	NC_017465	TGGT	2	8	1264560	1264567	0 %	50 %	50 %	0 %	385812423
14691	NC_017465	TGG	2	6	1264684	1264689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812423
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14693	NC_017465	TCC	2	6	1264742	1264747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812423
14694	NC_017465	TCA	2	6	1264758	1264763	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812423
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14697	NC_017465	TGA	2	6	1264924	1264929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812423
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14700	NC_017465	TCG	2	6	1265016	1265021	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812423
14701	NC_017465	ATC	2	6	1265043	1265048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812423
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14703	NC_017465	CTT	2	6	1265072	1265077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812423
14704	NC_017465	C	7	7	1265080	1265086	0 %	0 %	0 %	100 %	385812423
14705	NC_017465	T	6	6	1265159	1265164	0 %	100 %	0 %	0 %	385812423
14706	NC_017465	GTC	2	6	1265189	1265194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812423
14707	NC_017465	GGCGG	2	10	1265195	1265204	0 %	0 %	80 %	20 %	385812423
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14709	NC_017465	GC	3	6	1265291	1265296	0 %	0 %	50 %	50 %	385812423
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14712	NC_017465	TCC	2	6	1265552	1265557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812423
14713	NC_017465	TAT	2	6	1265568	1265573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812423
14714	NC_017465	TA	3	6	1265582	1265587	50 %	50 %	0 %	0 %	385812423
14715	NC_017465	TTA	2	6	1265610	1265615	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812423
14716	NC_017465	TAAAA	2	10	1265648	1265657	80 %	20 %	0 %	0 %	385812423
14717	NC_017465	TAA	2	6	1265696	1265701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812424
14718	NC_017465	ACTA	2	8	1265706	1265713	50 %	25 %	0 %	25 %	385812424
14719	NC_017465	TAT	2	6	1265738	1265743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812424
14720	NC_017465	AT	3	6	1265742	1265747	50 %	50 %	0 %	0 %	385812424
14721	NC_017465	AAT	2	6	1265754	1265759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812424
14722	NC_017465	AGG	2	6	1265766	1265771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812424
14723	NC_017465	AAGGA	2	10	1265862	1265871	60 %	0 %	40 %	0 %	385812424
14724	NC_017465	TCA	2	6	1265910	1265915	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812424
14725	NC_017465	GGGA	2	8	1265971	1265978	25 %	0 %	75 %	0 %	385812424
14726	NC_017465	ACC	2	6	1265989	1265994	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812424
14727	NC_017465	A	7	7	1266095	1266101	100 %	0 %	0 %	0 %	385812424
14728	NC_017465	CTT	2	6	1266194	1266199	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812424
14729	NC_017465	ACC	2	6	1266212	1266217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812424
14730	NC_017465	TTG	2	6	1266268	1266273	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812424
14731	NC_017465	CGA	2	6	1266327	1266332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812424
14732	NC_017465	GAA	2	6	1266373	1266378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812424
14733	NC_017465	GGCTG	2	10	1266380	1266389	0 %	20 %	60 %	20 %	385812424
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