MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus fermentum CECT 5716 chromosome

Total Repeats: 24576

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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14002	NC_017465	TC	3	6	1207800	1207805	0 %	50 %	0 %	50 %	385812393
14003	NC_017465	TTC	2	6	1209604	1209609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812394
14004	NC_017465	TGC	2	6	1209613	1209618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812394
14005	NC_017465	CAT	2	6	1209731	1209736	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812394
14006	NC_017465	CAT	2	6	1209767	1209772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812394
14007	NC_017465	TTA	2	6	1209781	1209786	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812394
14008	NC_017465	ATC	2	6	1209816	1209821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812394
14009	NC_017465	TCA	2	6	1209835	1209840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812394
14010	NC_017465	TGT	2	6	1209856	1209861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812394
14011	NC_017465	TCA	2	6	1209889	1209894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812394
14012	NC_017465	TTC	2	6	1209900	1209905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812394
14013	NC_017465	ATC	2	6	1209927	1209932	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812394
14014	NC_017465	TCA	2	6	1209970	1209975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812394
14015	NC_017465	AAG	2	6	1209985	1209990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812394
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14017	NC_017465	TTC	2	6	1210842	1210847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812395
14018	NC_017465	CAC	2	6	1210931	1210936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812395
14019	NC_017465	AGT	2	6	1210977	1210982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812395
14020	NC_017465	AATT	2	8	1211013	1211020	50 %	50 %	0 %	0 %	385812395
14021	NC_017465	T	6	6	1211052	1211057	0 %	100 %	0 %	0 %	385812395
14022	NC_017465	TCA	2	6	1211080	1211085	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812395
14023	NC_017465	TAC	2	6	1211091	1211096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812395
14024	NC_017465	GCA	2	6	1211107	1211112	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812395
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14027	NC_017465	GCA	2	6	1211186	1211191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812395
14028	NC_017465	TAAC	2	8	1211201	1211208	50 %	25 %	0 %	25 %	385812395
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14032	NC_017465	CCTT	2	8	1211398	1211405	0 %	50 %	0 %	50 %	385812395
14033	NC_017465	AAT	2	6	1211440	1211445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812395
14034	NC_017465	TGA	2	6	1211455	1211460	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812395
14035	NC_017465	CAT	2	6	1211469	1211474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812395
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14038	NC_017465	CCATA	2	10	1211606	1211615	40 %	20 %	0 %	40 %	385812395
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14049	NC_017465	ATCC	2	8	1212228	1212235	25 %	25 %	0 %	50 %	385812395
14050	NC_017465	ATA	2	6	1212317	1212322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812395
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14054	NC_017465	GCC	2	6	1212484	1212489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812395
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14059	NC_017465	GA	3	6	1212677	1212682	50 %	0 %	50 %	0 %	385812395
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14065	NC_017465	ATC	2	6	1213162	1213167	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812395
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14087	NC_017465	TCCT	2	8	1214576	1214583	0 %	50 %	0 %	50 %	385812396
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14100	NC_017465	CTAT	2	8	1215117	1215124	25 %	50 %	0 %	25 %	385812396
14101	NC_017465	CCCTT	2	10	1215145	1215154	0 %	40 %	0 %	60 %	385812396
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14103	NC_017465	A	6	6	1215296	1215301	100 %	0 %	0 %	0 %	385812396
14104	NC_017465	GGTT	2	8	1215327	1215334	0 %	50 %	50 %	0 %	385812396
14105	NC_017465	TCA	2	6	1215355	1215360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812396
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14107	NC_017465	T	6	6	1215398	1215403	0 %	100 %	0 %	0 %	385812396
14108	NC_017465	TGA	2	6	1215435	1215440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812396
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14113	NC_017465	CCG	2	6	1218338	1218343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812397
14114	NC_017465	GGC	2	6	1218409	1218414	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812397
14115	NC_017465	CGATGG	2	12	1218490	1218501	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	385812397
14116	NC_017465	GAC	2	6	1218519	1218524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812397
14117	NC_017465	TGG	2	6	1218544	1218549	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812397
14118	NC_017465	ACC	2	6	1218565	1218570	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812397
14119	NC_017465	AGG	2	6	1218687	1218692	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812397
14120	NC_017465	ATT	2	6	1218707	1218712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812397
14121	NC_017465	GTT	2	6	1218786	1218791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812397
14122	NC_017465	CTC	2	6	1218813	1218818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812397
14123	NC_017465	CAT	2	6	1218887	1218892	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812397
14124	NC_017465	GGT	3	9	1218936	1218944	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812397
14125	NC_017465	CGA	2	6	1218955	1218960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812397
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14127	NC_017465	ATC	2	6	1219020	1219025	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812397
14128	NC_017465	ATC	2	6	1219071	1219076	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812397
14129	NC_017465	TCA	2	6	1219078	1219083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812397
14130	NC_017465	TTA	2	6	1220146	1220151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812398
14131	NC_017465	CGA	2	6	1220178	1220183	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812398
14132	NC_017465	CCA	3	9	1220222	1220230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812398
14133	NC_017465	A	6	6	1220261	1220266	100 %	0 %	0 %	0 %	385812398
14134	NC_017465	GAA	2	6	1220272	1220277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812398
14135	NC_017465	TGG	2	6	1220366	1220371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812398
14136	NC_017465	TTGG	2	8	1220377	1220384	0 %	50 %	50 %	0 %	385812398
14137	NC_017465	GCT	2	6	1220409	1220414	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812398
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14141	NC_017465	GCCCA	2	10	1220545	1220554	20 %	0 %	20 %	60 %	385812398
14142	NC_017465	CCAT	2	8	1220558	1220565	25 %	25 %	0 %	50 %	385812398
14143	NC_017465	TTA	2	6	1220684	1220689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812398
14144	NC_017465	CAT	2	6	1220726	1220731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812398
14145	NC_017465	ACT	2	6	1220818	1220823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812398
14146	NC_017465	GC	3	6	1220861	1220866	0 %	0 %	50 %	50 %	385812399
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14148	NC_017465	TGA	2	6	1221005	1221010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812399
14149	NC_017465	CGA	2	6	1221035	1221040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812399
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14215	NC_017465	T	6	6	1226394	1226399	0 %	100 %	0 %	0 %	385812401
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14223	NC_017465	GTCG	2	8	1226764	1226771	0 %	25 %	50 %	25 %	385812401
14224	NC_017465	C	6	6	1226931	1226936	0 %	0 %	0 %	100 %	385812401
14225	NC_017465	TAA	2	6	1227165	1227170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812401
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14228	NC_017465	CCA	2	6	1227268	1227273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812401
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14230	NC_017465	AAG	2	6	1227342	1227347	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	385812401
14231	NC_017465	CCG	2	6	1227427	1227432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812401
14232	NC_017465	TCC	2	6	1227444	1227449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812401
14233	NC_017465	GAT	2	6	1227509	1227514	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812401
14234	NC_017465	CGG	2	6	1227592	1227597	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812401
14235	NC_017465	CCAG	2	8	1227667	1227674	25 %	0 %	25 %	50 %	385812401
14236	NC_017465	TGG	2	6	1228971	1228976	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812402
14237	NC_017465	GTC	2	6	1229010	1229015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812402
14238	NC_017465	C	7	7	1229066	1229072	0 %	0 %	0 %	100 %	385812402
14239	NC_017465	TAGG	2	8	1229084	1229091	25 %	25 %	50 %	0 %	385812402
14240	NC_017465	TAA	2	6	1229118	1229123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812402
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14243	NC_017465	CG	3	6	1229263	1229268	0 %	0 %	50 %	50 %	385812402
14244	NC_017465	T	7	7	1229322	1229328	0 %	100 %	0 %	0 %	385812402
14245	NC_017465	CTC	2	6	1229384	1229389	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812402
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14257	NC_017465	TGGT	2	8	1231040	1231047	0 %	50 %	50 %	0 %	385812403
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14302	NC_017465	GGC	2	6	1234763	1234768	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812405
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14304	NC_017465	CCCG	2	8	1234779	1234786	0 %	0 %	25 %	75 %	385812405
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14329	NC_017465	TAA	2	6	1236327	1236332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812405
14330	NC_017465	AGG	2	6	1236333	1236338	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812405
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14332	NC_017465	A	6	6	1236402	1236407	100 %	0 %	0 %	0 %	385812405
14333	NC_017465	AGCCA	2	10	1236410	1236419	40 %	0 %	20 %	40 %	385812405
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14335	NC_017465	TGA	2	6	1236553	1236558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812405
14336	NC_017465	GAC	2	6	1236560	1236565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812405
14337	NC_017465	ACC	2	6	1236603	1236608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812405
14338	NC_017465	CGC	2	6	1236639	1236644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812405
14339	NC_017465	GAC	2	6	1236839	1236844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	385812405
14340	NC_017465	CAC	2	6	1236899	1236904	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812405
14341	NC_017465	TGG	2	6	1236919	1236924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812405
14342	NC_017465	ACT	2	6	1237024	1237029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812405
14343	NC_017465	ACCT	2	8	1237131	1237138	25 %	25 %	0 %	50 %	385812405
14344	NC_017465	ACCA	2	8	1237344	1237351	50 %	0 %	0 %	50 %	385812405
14345	NC_017465	TAG	2	6	1237379	1237384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812405
14346	NC_017465	CCA	2	6	1237399	1237404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812405
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14348	NC_017465	GCG	2	6	1237447	1237452	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812405
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14453	NC_017465	CTT	2	6	1248974	1248979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812411
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14464	NC_017465	TCA	2	6	1249718	1249723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812411
14465	NC_017465	TCC	2	6	1249819	1249824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812411
14466	NC_017465	TCC	2	6	1250234	1250239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	385812412
14467	NC_017465	CGG	2	6	1250254	1250259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	385812412
14468	NC_017465	TGA	2	6	1250307	1250312	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812412
14469	NC_017465	ATT	2	6	1250483	1250488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812412
14470	NC_017465	CAC	2	6	1250569	1250574	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812412
14471	NC_017465	CTT	2	6	1250621	1250626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812412
14472	NC_017465	CAC	2	6	1250661	1250666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	385812412
14473	NC_017465	TGT	2	6	1250677	1250682	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	385812412
14474	NC_017465	GGT	2	6	1250726	1250731	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812412
14475	NC_017465	TCCGT	2	10	1250747	1250756	0 %	40 %	20 %	40 %	385812412
14476	NC_017465	TC	3	6	1250762	1250767	0 %	50 %	0 %	50 %	385812412
14477	NC_017465	ATA	2	6	1250877	1250882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812412
14478	NC_017465	ACCTT	2	10	1250894	1250903	20 %	40 %	0 %	40 %	385812412
14479	NC_017465	TAT	2	6	1250913	1250918	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	385812412
14480	NC_017465	TAA	2	6	1250956	1250961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	385812412
14481	NC_017465	GCC	2	6	1251483	1251488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812413
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14483	NC_017465	CAAC	2	8	1251527	1251534	50 %	0 %	0 %	50 %	385812413
14484	NC_017465	AC	3	6	1251582	1251587	50 %	0 %	0 %	50 %	385812413
14485	NC_017465	CTT	2	6	1251620	1251625	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812413
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14488	NC_017465	GCC	2	6	1251933	1251938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812413
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14490	NC_017465	TGG	2	6	1251992	1251997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	385812413
14491	NC_017465	AGG	2	6	1252046	1252051	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	385812413
14492	NC_017465	GCC	2	6	1252101	1252106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	385812413
14493	NC_017465	CTG	2	6	1252203	1252208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	385812413
14494	NC_017465	ATG	2	6	1252221	1252226	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	385812413
14495	NC_017465	ATC	2	6	1252239	1252244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812413
14496	NC_017465	TTC	2	6	1252251	1252256	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	385812413
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14500	NC_017465	ATC	2	6	1252338	1252343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	385812413

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