MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Listeria ivanovii subsp. ivanovii PAM 55

Total Repeats: 55821

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
54001	NC_016011	CTT	2	6	2835110	2835115	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347550082
54002	NC_016011	ATT	2	6	2835120	2835125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550082
54003	NC_016011	ATT	2	6	2835480	2835485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550083
54004	NC_016011	AAT	2	6	2835531	2835536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347550083
54005	NC_016011	AAG	2	6	2835571	2835576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347550083
54006	NC_016011	TGAT	2	8	2835631	2835638	25 %	50 %	25 %	0 %	347550083
54007	NC_016011	TCT	2	6	2835642	2835647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347550083
54008	NC_016011	CA	3	6	2835710	2835715	50 %	0 %	0 %	50 %	347550083
54009	NC_016011	CTT	2	6	2835736	2835741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347550083
54010	NC_016011	GCT	2	6	2835751	2835756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347550083
54011	NC_016011	AT	3	6	2835804	2835809	50 %	50 %	0 %	0 %	347550083
54012	NC_016011	T	6	6	2836087	2836092	0 %	100 %	0 %	0 %	347550084
54013	NC_016011	GAA	2	6	2836202	2836207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347550084
54014	NC_016011	T	7	7	2836288	2836294	0 %	100 %	0 %	0 %	347550084
54015	NC_016011	GTT	2	6	2836304	2836309	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347550084
54016	NC_016011	TGAC	2	8	2836464	2836471	25 %	25 %	25 %	25 %	347550084
54017	NC_016011	TCCA	2	8	2836527	2836534	25 %	25 %	0 %	50 %	347550084
54018	NC_016011	TTCT	2	8	2836542	2836549	0 %	75 %	0 %	25 %	347550084
54019	NC_016011	ACT	2	6	2836564	2836569	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347550084
54020	NC_016011	GATTT	2	10	2836616	2836625	20 %	60 %	20 %	0 %	347550085
54021	NC_016011	TTG	2	6	2836667	2836672	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347550085
54022	NC_016011	TGAG	2	8	2836682	2836689	25 %	25 %	50 %	0 %	347550085
54023	NC_016011	GCA	2	6	2836708	2836713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347550085
54024	NC_016011	GAA	2	6	2836714	2836719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347550085
54025	NC_016011	TTA	2	6	2836751	2836756	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550085
54026	NC_016011	GGC	2	6	2836764	2836769	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347550085
54027	NC_016011	A	6	6	2836780	2836785	100 %	0 %	0 %	0 %	347550085
54028	NC_016011	ATT	2	6	2836910	2836915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550085
54029	NC_016011	GCA	2	6	2836936	2836941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347550085
54030	NC_016011	GCT	2	6	2836957	2836962	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347550085
54031	NC_016011	CAACT	2	10	2836975	2836984	40 %	20 %	0 %	40 %	347550085
54032	NC_016011	ACA	2	6	2837049	2837054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347550085
54033	NC_016011	CTT	2	6	2837080	2837085	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347550085
54034	NC_016011	ATT	2	6	2837124	2837129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550085
54035	NC_016011	T	6	6	2837128	2837133	0 %	100 %	0 %	0 %	347550085
54036	NC_016011	A	6	6	2837241	2837246	100 %	0 %	0 %	0 %	347550085
54037	NC_016011	AGA	2	6	2837496	2837501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347550085
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54039	NC_016011	GGC	2	6	2837623	2837628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347550085
54040	NC_016011	GCT	2	6	2837701	2837706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347550085
54041	NC_016011	A	6	6	2837780	2837785	100 %	0 %	0 %	0 %	347550085
54042	NC_016011	CAT	2	6	2837791	2837796	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347550085
54043	NC_016011	GAAA	2	8	2837817	2837824	75 %	0 %	25 %	0 %	347550085
54044	NC_016011	AAC	2	6	2837828	2837833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347550085
54045	NC_016011	CAAC	2	8	2837857	2837864	50 %	0 %	0 %	50 %	347550085
54046	NC_016011	CTT	2	6	2837957	2837962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347550085
54047	NC_016011	ACG	2	6	2838010	2838015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347550085
54048	NC_016011	TAA	2	6	2838030	2838035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347550085
54049	NC_016011	A	6	6	2838039	2838044	100 %	0 %	0 %	0 %	347550085
54050	NC_016011	TCA	2	6	2838098	2838103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347550085
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54052	NC_016011	TCT	2	6	2838154	2838159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347550085
54053	NC_016011	TTA	2	6	2838190	2838195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550085
54054	NC_016011	GAAA	2	8	2838199	2838206	75 %	0 %	25 %	0 %	347550085
54055	NC_016011	AACA	2	8	2838215	2838222	75 %	0 %	0 %	25 %	347550085
54056	NC_016011	TG	3	6	2838255	2838260	0 %	50 %	50 %	0 %	347550085
54057	NC_016011	TTAA	2	8	2838262	2838269	50 %	50 %	0 %	0 %	347550085
54058	NC_016011	TCA	2	6	2838484	2838489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347550086
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54060	NC_016011	CGC	2	6	2838652	2838657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347550086
54061	NC_016011	TTCT	2	8	2838690	2838697	0 %	75 %	0 %	25 %	347550086
54062	NC_016011	TTCA	2	8	2838763	2838770	25 %	50 %	0 %	25 %	347550086
54063	NC_016011	TTG	2	6	2838801	2838806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347550086
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54065	NC_016011	TGG	2	6	2838932	2838937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347550086
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54068	NC_016011	GTT	2	6	2838962	2838967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347550086
54069	NC_016011	TTGA	2	8	2839025	2839032	25 %	50 %	25 %	0 %	347550086
54070	NC_016011	GTT	2	6	2839076	2839081	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347550086
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54086	NC_016011	A	7	7	2839667	2839673	100 %	0 %	0 %	0 %	347550086
54087	NC_016011	TTTC	2	8	2839689	2839696	0 %	75 %	0 %	25 %	347550086
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54098	NC_016011	A	6	6	2840040	2840045	100 %	0 %	0 %	0 %	347550086
54099	NC_016011	TTCTTG	2	12	2840073	2840084	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	347550086
54100	NC_016011	GTTGGT	2	12	2840099	2840110	0 %	50 %	50 %	0 %	347550086
54101	NC_016011	TTA	2	6	2840124	2840129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550086
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54103	NC_016011	AT	3	6	2840313	2840318	50 %	50 %	0 %	0 %	347550087
54104	NC_016011	CGT	2	6	2840349	2840354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347550087
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54111	NC_016011	TTCT	2	8	2840639	2840646	0 %	75 %	0 %	25 %	347550087
54112	NC_016011	TGGT	2	8	2840660	2840667	0 %	50 %	50 %	0 %	347550087
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54117	NC_016011	CAA	2	6	2840788	2840793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347550087
54118	NC_016011	A	6	6	2840828	2840833	100 %	0 %	0 %	0 %	347550087
54119	NC_016011	A	6	6	2840843	2840848	100 %	0 %	0 %	0 %	347550087
54120	NC_016011	TTA	2	6	2840849	2840854	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550087
54121	NC_016011	GAA	3	9	2840869	2840877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347550087
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54127	NC_016011	CTG	2	6	2841047	2841052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347550087
54128	NC_016011	GTTC	2	8	2841072	2841079	0 %	50 %	25 %	25 %	347550087
54129	NC_016011	CTA	2	6	2841133	2841138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347550087
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54133	NC_016011	GTAA	2	8	2841310	2841317	50 %	25 %	25 %	0 %	347550087
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54231	NC_016011	GTTT	2	8	2847317	2847324	0 %	75 %	25 %	0 %	347550090
54232	NC_016011	T	6	6	2847342	2847347	0 %	100 %	0 %	0 %	347550090
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54234	NC_016011	CCT	2	6	2847458	2847463	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347550090
54235	NC_016011	TTAT	2	8	2847601	2847608	25 %	75 %	0 %	0 %	347550091
54236	NC_016011	TTG	2	6	2847623	2847628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347550091
54237	NC_016011	AT	3	6	2847759	2847764	50 %	50 %	0 %	0 %	347550091
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54242	NC_016011	GGTT	2	8	2847947	2847954	0 %	50 %	50 %	0 %	347550091
54243	NC_016011	AATC	2	8	2847979	2847986	50 %	25 %	0 %	25 %	347550091
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54339	NC_016011	A	6	6	2855201	2855206	100 %	0 %	0 %	0 %	347550094
54340	NC_016011	ACTGGG	2	12	2855210	2855221	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	347550094
54341	NC_016011	AGA	2	6	2855328	2855333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347550094
54342	NC_016011	AAG	2	6	2855393	2855398	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347550094
54343	NC_016011	ATG	2	6	2855516	2855521	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347550094
54344	NC_016011	A	6	6	2855542	2855547	100 %	0 %	0 %	0 %	347550094
54345	NC_016011	TAG	2	6	2855597	2855602	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347550094
54346	NC_016011	A	7	7	2855672	2855678	100 %	0 %	0 %	0 %	347550095
54347	NC_016011	TTGT	2	8	2855685	2855692	0 %	75 %	25 %	0 %	347550095
54348	NC_016011	GAA	2	6	2855756	2855761	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347550095
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54458	NC_016011	AAT	2	6	2861544	2861549	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347550101
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54460	NC_016011	A	7	7	2861633	2861639	100 %	0 %	0 %	0 %	347550101
54461	NC_016011	A	6	6	2861682	2861687	100 %	0 %	0 %	0 %	347550101
54462	NC_016011	TAA	2	6	2861708	2861713	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347550101
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54464	NC_016011	A	6	6	2861766	2861771	100 %	0 %	0 %	0 %	347550101
54465	NC_016011	T	7	7	2861801	2861807	0 %	100 %	0 %	0 %	347550101
54466	NC_016011	GT	3	6	2861910	2861915	0 %	50 %	50 %	0 %	347550101
54467	NC_016011	ATG	2	6	2861985	2861990	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347550101
54468	NC_016011	TTTTTC	2	12	2862148	2862159	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	347550102
54469	NC_016011	AAT	3	9	2862180	2862188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347550102
54470	NC_016011	TGG	2	6	2862237	2862242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347550102
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54475	NC_016011	AAT	2	6	2862411	2862416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347550102
54476	NC_016011	CAT	2	6	2862468	2862473	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347550102
54477	NC_016011	CAAGTA	2	12	2862479	2862490	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	347550102
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54479	NC_016011	CCA	2	6	2862510	2862515	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347550102
54480	NC_016011	ACA	2	6	2862562	2862567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347550102
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54488	NC_016011	CTCA	2	8	2862802	2862809	25 %	25 %	0 %	50 %	347550102
54489	NC_016011	T	7	7	2862854	2862860	0 %	100 %	0 %	0 %	347550103
54490	NC_016011	ACA	2	6	2862909	2862914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347550103
54491	NC_016011	TAT	2	6	2862943	2862948	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347550103
54492	NC_016011	CAA	2	6	2862950	2862955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347550103
54493	NC_016011	TCGCTA	2	12	2863002	2863013	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347550103
54494	NC_016011	TGT	2	6	2863094	2863099	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347550103
54495	NC_016011	T	6	6	2863099	2863104	0 %	100 %	0 %	0 %	347550103
54496	NC_016011	AAT	2	6	2863117	2863122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347550103
54497	NC_016011	GCA	2	6	2863224	2863229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347550103
54498	NC_016011	AT	3	6	2863275	2863280	50 %	50 %	0 %	0 %	347550103
54499	NC_016011	GATT	2	8	2863293	2863300	25 %	50 %	25 %	0 %	347550103
54500	NC_016011	TAA	2	6	2863309	2863314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347550103

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