MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 34064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_015975	AAG	2	6	808265	808270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525229
13002	NC_015975	GTTG	2	8	808310	808317	0 %	50 %	50 %	0 %	347525229
13003	NC_015975	A	6	6	808338	808343	100 %	0 %	0 %	0 %	347525229
13004	NC_015975	GA	3	6	808498	808503	50 %	0 %	50 %	0 %	347525230
13005	NC_015975	GAA	2	6	808510	808515	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525230
13006	NC_015975	CAAGAA	2	12	808544	808555	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	347525230
13007	NC_015975	CGA	2	6	808556	808561	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525230
13008	NC_015975	CGT	2	6	808587	808592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525230
13009	NC_015975	ATT	2	6	808666	808671	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525230
13010	NC_015975	GAT	2	6	808707	808712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525230
13011	NC_015975	AGG	2	6	808756	808761	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347525230
13012	NC_015975	TGA	3	9	808782	808790	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525230
13013	NC_015975	TGA	2	6	808872	808877	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525230
13014	NC_015975	ACG	2	6	808964	808969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525230
13015	NC_015975	ATG	2	6	809003	809008	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525230
13016	NC_015975	ATCT	2	8	809017	809024	25 %	50 %	0 %	25 %	347525230
13017	NC_015975	ATG	2	6	809045	809050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525230
13018	NC_015975	GAA	2	6	809133	809138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525230
13019	NC_015975	GCTT	2	8	809151	809158	0 %	50 %	25 %	25 %	347525230
13020	NC_015975	TGC	2	6	809184	809189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525230
13021	NC_015975	TTTCA	2	10	809212	809221	20 %	60 %	0 %	20 %	347525230
13022	NC_015975	TGA	2	6	809447	809452	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525230
13023	NC_015975	A	6	6	809482	809487	100 %	0 %	0 %	0 %	347525230
13024	NC_015975	GCAATG	2	12	809510	809521	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	347525230
13025	NC_015975	T	6	6	809591	809596	0 %	100 %	0 %	0 %	347525230
13026	NC_015975	ACA	2	6	809609	809614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347525230
13027	NC_015975	GTC	2	6	809626	809631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525230
13028	NC_015975	GCA	2	6	809653	809658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525230
13029	NC_015975	TCT	2	6	809766	809771	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525230
13030	NC_015975	CTG	2	6	809837	809842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525230
13031	NC_015975	ACA	2	6	809939	809944	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347525230
13032	NC_015975	AGA	2	6	810000	810005	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525230
13033	NC_015975	TCG	2	6	810027	810032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525230
13034	NC_015975	GAA	2	6	810052	810057	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525230
13035	NC_015975	GAA	2	6	810082	810087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525230
13036	NC_015975	T	6	6	810365	810370	0 %	100 %	0 %	0 %	347525231
13037	NC_015975	TCT	2	6	810392	810397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525231
13038	NC_015975	AAGA	2	8	810414	810421	75 %	0 %	25 %	0 %	347525231
13039	NC_015975	TAT	2	6	810450	810455	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525231
13040	NC_015975	GCTTT	2	10	810498	810507	0 %	60 %	20 %	20 %	347525231
13041	NC_015975	GGC	2	6	810520	810525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525231
13042	NC_015975	GCG	2	6	810557	810562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525231
13043	NC_015975	ATG	2	6	810628	810633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525231
13044	NC_015975	TTGT	2	8	810655	810662	0 %	75 %	25 %	0 %	347525231
13045	NC_015975	TTG	2	6	810671	810676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525231
13046	NC_015975	T	6	6	810693	810698	0 %	100 %	0 %	0 %	347525231
13047	NC_015975	TAT	2	6	810708	810713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525231
13048	NC_015975	CTG	2	6	810714	810719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525231
13049	NC_015975	TTAT	2	8	810728	810735	25 %	75 %	0 %	0 %	347525231
13050	NC_015975	GTT	2	6	810814	810819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525231
13051	NC_015975	TTC	2	6	810911	810916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525231
13052	NC_015975	CGGCT	2	10	810960	810969	0 %	20 %	40 %	40 %	347525231
13053	NC_015975	ACT	2	6	811009	811014	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525231
13054	NC_015975	ATG	2	6	811033	811038	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525231
13055	NC_015975	TAT	2	6	811173	811178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525231
13056	NC_015975	TGCACG	2	12	811180	811191	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	347525231
13057	NC_015975	CATT	2	8	811199	811206	25 %	50 %	0 %	25 %	347525231
13058	NC_015975	TGA	2	6	811233	811238	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525231
13059	NC_015975	CGG	3	9	811353	811361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525231
13060	NC_015975	CGT	2	6	811395	811400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525231
13061	NC_015975	ATT	2	6	811405	811410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525231
13062	NC_015975	ATTT	2	8	811428	811435	25 %	75 %	0 %	0 %	347525231
13063	NC_015975	GAA	4	12	811477	811488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525231
13064	NC_015975	TTG	2	6	811490	811495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525231
13065	NC_015975	TTC	2	6	811530	811535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525231
13066	NC_015975	GCAG	2	8	811537	811544	25 %	0 %	50 %	25 %	347525231
13067	NC_015975	TCC	2	6	811822	811827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347525232
13068	NC_015975	AATT	2	8	811828	811835	50 %	50 %	0 %	0 %	347525232
13069	NC_015975	GACG	2	8	811882	811889	25 %	0 %	50 %	25 %	347525232
13070	NC_015975	CCTG	2	8	811952	811959	0 %	25 %	25 %	50 %	347525232
13071	NC_015975	TTCAAC	2	12	811972	811983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525232
13072	NC_015975	GCG	2	6	812006	812011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525232
13073	NC_015975	CCG	2	6	812024	812029	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525232
13074	NC_015975	T	7	7	812066	812072	0 %	100 %	0 %	0 %	347525232
13075	NC_015975	CGA	2	6	812091	812096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525232
13076	NC_015975	AAC	2	6	812176	812181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347525232
13077	NC_015975	TGC	2	6	812241	812246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525232
13078	NC_015975	AAC	2	6	812254	812259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347525232
13079	NC_015975	A	6	6	812700	812705	100 %	0 %	0 %	0 %	347525233
13080	NC_015975	TGA	2	6	812706	812711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525233
13081	NC_015975	A	8	8	812711	812718	100 %	0 %	0 %	0 %	347525233
13082	NC_015975	TCA	2	6	812741	812746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525233
13083	NC_015975	AT	3	6	812790	812795	50 %	50 %	0 %	0 %	347525233
13084	NC_015975	TTA	2	6	812846	812851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525233
13085	NC_015975	ATG	2	6	812894	812899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525233
13086	NC_015975	GAAA	2	8	812916	812923	75 %	0 %	25 %	0 %	347525233
13087	NC_015975	TCA	2	6	812951	812956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525233
13088	NC_015975	GAA	3	9	812974	812982	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525233
13089	NC_015975	AAAC	2	8	812989	812996	75 %	0 %	0 %	25 %	347525233
13090	NC_015975	AAG	2	6	813028	813033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525233
13091	NC_015975	CATT	2	8	813177	813184	25 %	50 %	0 %	25 %	347525233
13092	NC_015975	TGAT	2	8	813233	813240	25 %	50 %	25 %	0 %	347525233
13093	NC_015975	ATT	2	6	813334	813339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525233
13094	NC_015975	A	6	6	813499	813504	100 %	0 %	0 %	0 %	347525233
13095	NC_015975	CGATG	2	10	813513	813522	20 %	20 %	40 %	20 %	347525233
13096	NC_015975	A	6	6	813712	813717	100 %	0 %	0 %	0 %	347525233
13097	NC_015975	AGC	2	6	813758	813763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525233
13098	NC_015975	ACTG	2	8	813828	813835	25 %	25 %	25 %	25 %	347525233
13099	NC_015975	TTC	2	6	813869	813874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525233
13100	NC_015975	T	6	6	813986	813991	0 %	100 %	0 %	0 %	347525233
13101	NC_015975	GTT	2	6	814143	814148	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525233
13102	NC_015975	TCT	2	6	814208	814213	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525233
13103	NC_015975	TAC	2	6	814420	814425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525233
13104	NC_015975	CGAT	2	8	814625	814632	25 %	25 %	25 %	25 %	347525233
13105	NC_015975	TTA	2	6	814893	814898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525234
13106	NC_015975	A	8	8	814931	814938	100 %	0 %	0 %	0 %	347525234
13107	NC_015975	ACG	2	6	814945	814950	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525234
13108	NC_015975	TGTT	2	8	815093	815100	0 %	75 %	25 %	0 %	347525234
13109	NC_015975	GCT	2	6	815221	815226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525234
13110	NC_015975	TGTT	2	8	815254	815261	0 %	75 %	25 %	0 %	347525234
13111	NC_015975	CTG	2	6	815342	815347	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525234
13112	NC_015975	AGA	2	6	815356	815361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525234
13113	NC_015975	TTG	2	6	815394	815399	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525234
13114	NC_015975	AGA	2	6	815413	815418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525234
13115	NC_015975	A	6	6	815477	815482	100 %	0 %	0 %	0 %	347525234
13116	NC_015975	GCAA	2	8	815832	815839	50 %	0 %	25 %	25 %	347525235
13117	NC_015975	CAC	2	6	815877	815882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	347525235
13118	NC_015975	TTC	2	6	815942	815947	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525235
13119	NC_015975	GTC	2	6	815993	815998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525235
13120	NC_015975	GTCA	2	8	816035	816042	25 %	25 %	25 %	25 %	347525235
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13242	NC_015975	TTG	2	6	822822	822827	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525242
13243	NC_015975	AC	3	6	822832	822837	50 %	0 %	0 %	50 %	347525242
13244	NC_015975	TGA	2	6	822868	822873	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525242
13245	NC_015975	TGA	2	6	822880	822885	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525242
13246	NC_015975	TGAA	2	8	822993	823000	50 %	25 %	25 %	0 %	347525242
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13252	NC_015975	CGATTC	2	12	823294	823305	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	347525242
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13355	NC_015975	TTGC	2	8	830014	830021	0 %	50 %	25 %	25 %	347525248
13356	NC_015975	AT	3	6	830082	830087	50 %	50 %	0 %	0 %	347525248
13357	NC_015975	TCA	2	6	830115	830120	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525248
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13482	NC_015975	AGC	2	6	836559	836564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525254
13483	NC_015975	AAG	2	6	836579	836584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525254
13484	NC_015975	ATGA	2	8	836608	836615	50 %	25 %	25 %	0 %	347525254
13485	NC_015975	TCG	2	6	836642	836647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525254
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