MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus ruminis ATCC 27782 chromosome

Total Repeats: 34064

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_015975	TCG	2	6	617710	617715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525054
10002	NC_015975	AGC	2	6	617724	617729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525054
10003	NC_015975	TCC	2	6	617783	617788	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	347525054
10004	NC_015975	GTTC	2	8	617794	617801	0 %	50 %	25 %	25 %	347525054
10005	NC_015975	AAG	2	6	617813	617818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525054
10006	NC_015975	AGA	2	6	617898	617903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525054
10007	NC_015975	CTT	2	6	617911	617916	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
10008	NC_015975	T	6	6	617965	617970	0 %	100 %	0 %	0 %	347525054
10009	NC_015975	CAG	2	6	617993	617998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525054
10010	NC_015975	CTGAT	2	10	618046	618055	20 %	40 %	20 %	20 %	347525054
10011	NC_015975	TCAA	2	8	618075	618082	50 %	25 %	0 %	25 %	347525054
10012	NC_015975	GTC	2	6	618150	618155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525054
10013	NC_015975	TCT	2	6	618172	618177	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
10014	NC_015975	TCT	2	6	618245	618250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
10015	NC_015975	AAG	2	6	618272	618277	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525054
10016	NC_015975	CCG	2	6	618309	618314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525054
10017	NC_015975	TCT	2	6	618346	618351	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
10018	NC_015975	CTT	2	6	618369	618374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525054
10019	NC_015975	GCT	2	6	618376	618381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525054
10020	NC_015975	ATC	2	6	618486	618491	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525054
10021	NC_015975	TGA	3	9	618535	618543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525054
10022	NC_015975	ATC	2	6	618567	618572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525054
10023	NC_015975	CAG	3	9	618623	618631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525054
10024	NC_015975	CCGG	2	8	618705	618712	0 %	0 %	50 %	50 %	347525054
10025	NC_015975	ACTG	2	8	618715	618722	25 %	25 %	25 %	25 %	347525054
10026	NC_015975	A	6	6	618871	618876	100 %	0 %	0 %	0 %	347525054
10027	NC_015975	TGT	2	6	619033	619038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525055
10028	NC_015975	ACA	2	6	619063	619068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	347525055
10029	NC_015975	TTG	2	6	619075	619080	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525055
10030	NC_015975	GGA	2	6	619130	619135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347525055
10031	NC_015975	ATG	2	6	619255	619260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525055
10032	NC_015975	GTC	2	6	619317	619322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525055
10033	NC_015975	CAG	2	6	619329	619334	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525055
10034	NC_015975	ATG	2	6	619547	619552	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525056
10035	NC_015975	AGA	2	6	619622	619627	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	347525056
10036	NC_015975	GCG	2	6	619634	619639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525056
10037	NC_015975	GCT	2	6	619668	619673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525056
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10039	NC_015975	CTG	2	6	619851	619856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525056
10040	NC_015975	CG	3	6	619869	619874	0 %	0 %	50 %	50 %	347525056
10041	NC_015975	TTC	2	6	619884	619889	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525056
10042	NC_015975	CAT	2	6	619953	619958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525056
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10044	NC_015975	TGCT	2	8	620021	620028	0 %	50 %	25 %	25 %	347525056
10045	NC_015975	GA	3	6	620110	620115	50 %	0 %	50 %	0 %	347525056
10046	NC_015975	TTC	2	6	620142	620147	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525056
10047	NC_015975	CTG	2	6	620337	620342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525056
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10049	NC_015975	GTT	2	6	620393	620398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525056
10050	NC_015975	GAC	2	6	620406	620411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525056
10051	NC_015975	TTCGTC	2	12	620421	620432	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	347525056
10052	NC_015975	AGGC	2	8	620455	620462	25 %	0 %	50 %	25 %	347525056
10053	NC_015975	TGC	2	6	620520	620525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525056
10054	NC_015975	TTCA	2	8	620565	620572	25 %	50 %	0 %	25 %	347525056
10055	NC_015975	CAT	2	6	620633	620638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525056
10056	NC_015975	ATC	2	6	620664	620669	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525056
10057	NC_015975	CCG	2	6	620698	620703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525056
10058	NC_015975	T	7	7	620731	620737	0 %	100 %	0 %	0 %	347525056
10059	NC_015975	CG	4	8	620759	620766	0 %	0 %	50 %	50 %	347525056
10060	NC_015975	AAGCA	2	10	620817	620826	60 %	0 %	20 %	20 %	347525056
10061	NC_015975	GCT	2	6	620879	620884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525056
10062	NC_015975	TCGA	2	8	620911	620918	25 %	25 %	25 %	25 %	347525056
10063	NC_015975	CGT	2	6	620948	620953	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525056
10064	NC_015975	TTC	2	6	620967	620972	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525056
10065	NC_015975	ATG	2	6	620995	621000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525056
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10069	NC_015975	GCCT	2	8	621366	621373	0 %	25 %	25 %	50 %	347525056
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10072	NC_015975	A	6	6	621634	621639	100 %	0 %	0 %	0 %	347525057
10073	NC_015975	CCGA	2	8	621735	621742	25 %	0 %	25 %	50 %	347525057
10074	NC_015975	CCG	2	6	621805	621810	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525057
10075	NC_015975	ACGTC	2	10	621831	621840	20 %	20 %	20 %	40 %	347525057
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10087	NC_015975	ATTT	2	8	622809	622816	25 %	75 %	0 %	0 %	347525058
10088	NC_015975	AGC	2	6	622822	622827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525058
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10091	NC_015975	GCG	2	6	623160	623165	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	347525059
10092	NC_015975	TTGC	2	8	623178	623185	0 %	50 %	25 %	25 %	347525059
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10102	NC_015975	GCC	2	6	623753	623758	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	347525060
10103	NC_015975	TGT	2	6	623760	623765	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525060
10104	NC_015975	A	6	6	623766	623771	100 %	0 %	0 %	0 %	347525060
10105	NC_015975	ATT	2	6	624473	624478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525061
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10107	NC_015975	TAG	2	6	624595	624600	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525061
10108	NC_015975	TAT	2	6	624647	624652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525061
10109	NC_015975	TGC	2	6	624682	624687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	347525061
10110	NC_015975	GGA	2	6	624723	624728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	347525061
10111	NC_015975	GGT	2	6	624743	624748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	347525061
10112	NC_015975	TCA	2	6	624766	624771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525061
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10114	NC_015975	CAT	2	6	624823	624828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525061
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10117	NC_015975	TAA	2	6	625091	625096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	347525062
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10119	NC_015975	CGA	2	6	625182	625187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525062
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10121	NC_015975	TCA	2	6	625286	625291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525062
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10124	NC_015975	TGA	2	6	625451	625456	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525062
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10234	NC_015975	TAT	2	6	631295	631300	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525069
10235	NC_015975	CGA	2	6	631321	631326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525069
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10237	NC_015975	CGA	2	6	631417	631422	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	347525069
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10481	NC_015975	TTC	2	6	644097	644102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	347525083
10482	NC_015975	ATT	2	6	644189	644194	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	347525083
10483	NC_015975	A	6	6	644270	644275	100 %	0 %	0 %	0 %	347525083
10484	NC_015975	TGA	2	6	644892	644897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525084
10485	NC_015975	GTT	2	6	644986	644991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	347525084
10486	NC_015975	CAT	2	6	645010	645015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	347525084
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10488	NC_015975	ATG	2	6	645071	645076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	347525084
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