MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactobacillus reuteri SD2112 chromosome

Total Repeats: 42283

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_015697	ATT	2	6	212624	212629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202579
4002	NC_015697	CAT	2	6	212892	212897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202580
4003	NC_015697	AGC	2	6	212997	213002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202580
4004	NC_015697	TTA	2	6	213003	213008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202580
4005	NC_015697	CAA	2	6	213024	213029	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202580
4006	NC_015697	T	6	6	213038	213043	0 %	100 %	0 %	0 %	338202580
4007	NC_015697	CCA	2	6	213068	213073	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202580
4008	NC_015697	CAG	2	6	213077	213082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202580
4009	NC_015697	TGG	2	6	213110	213115	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	338202580
4010	NC_015697	A	6	6	213265	213270	100 %	0 %	0 %	0 %	338202580
4011	NC_015697	ACA	2	6	213278	213283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202580
4012	NC_015697	AATG	2	8	213320	213327	50 %	25 %	25 %	0 %	338202580
4013	NC_015697	GAT	2	6	213332	213337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202580
4014	NC_015697	CCAA	2	8	213340	213347	50 %	0 %	0 %	50 %	338202580
4015	NC_015697	ATT	2	6	213390	213395	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202580
4016	NC_015697	CTC	2	6	213402	213407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	338202580
4017	NC_015697	TTAT	2	8	213412	213419	25 %	75 %	0 %	0 %	338202580
4018	NC_015697	TGAT	2	8	213463	213470	25 %	50 %	25 %	0 %	338202580
4019	NC_015697	ATT	2	6	213472	213477	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202580
4020	NC_015697	GAT	2	6	213488	213493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202580
4021	NC_015697	GCT	2	6	213590	213595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202580
4022	NC_015697	CAG	2	6	213610	213615	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202580
4023	NC_015697	TTTAAT	2	12	213738	213749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202580
4024	NC_015697	CTT	2	6	213815	213820	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202580
4025	NC_015697	AAT	2	6	213822	213827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202580
4026	NC_015697	TCG	3	9	213839	213847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202580
4027	NC_015697	ATCT	2	8	213981	213988	25 %	50 %	0 %	25 %	338202580
4028	NC_015697	A	6	6	214022	214027	100 %	0 %	0 %	0 %	338202580
4029	NC_015697	TTA	2	6	214054	214059	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202580
4030	NC_015697	ACG	2	6	214192	214197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202580
4031	NC_015697	CTT	2	6	214200	214205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202580
4032	NC_015697	CTGT	2	8	214216	214223	0 %	50 %	25 %	25 %	338202580
4033	NC_015697	TAA	2	6	214253	214258	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202580
4034	NC_015697	A	7	7	214319	214325	100 %	0 %	0 %	0 %	338202580
4035	NC_015697	AAG	2	6	214329	214334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202580
4036	NC_015697	GAT	2	6	214383	214388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202580
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4038	NC_015697	AGTG	2	8	214517	214524	25 %	25 %	50 %	0 %	338202580
4039	NC_015697	CTT	2	6	214530	214535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202580
4040	NC_015697	TAG	2	6	214627	214632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202580
4041	NC_015697	GCC	2	6	214698	214703	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	338202580
4042	NC_015697	CCTTCA	2	12	214706	214717	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338202580
4043	NC_015697	ACA	2	6	214722	214727	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202580
4044	NC_015697	GTC	2	6	214774	214779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202580
4045	NC_015697	TTCA	2	8	214786	214793	25 %	50 %	0 %	25 %	338202580
4046	NC_015697	AAT	2	6	214830	214835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202580
4047	NC_015697	CCAA	2	8	214923	214930	50 %	0 %	0 %	50 %	338202580
4048	NC_015697	TAC	2	6	214938	214943	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202580
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4050	NC_015697	GTA	2	6	215031	215036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202580
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4052	NC_015697	TATC	2	8	215123	215130	25 %	50 %	0 %	25 %	338202580
4053	NC_015697	GTA	2	6	215203	215208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202580
4054	NC_015697	ACT	2	6	215259	215264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202580
4055	NC_015697	CTG	2	6	215269	215274	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202580
4056	NC_015697	CTA	2	6	215308	215313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202580
4057	NC_015697	TAT	2	6	215382	215387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202580
4058	NC_015697	TGGT	2	8	215444	215451	0 %	50 %	50 %	0 %	338202580
4059	NC_015697	AAGA	2	8	215457	215464	75 %	0 %	25 %	0 %	338202580
4060	NC_015697	TTA	2	6	215596	215601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202581
4061	NC_015697	TCA	2	6	215611	215616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202581
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4063	NC_015697	AGT	2	6	215709	215714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202581
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4071	NC_015697	AGT	2	6	216130	216135	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202583
4072	NC_015697	TCA	2	6	216139	216144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202583
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4077	NC_015697	ATTG	2	8	216365	216372	25 %	50 %	25 %	0 %	338202583
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4093	NC_015697	T	6	6	217694	217699	0 %	100 %	0 %	0 %	338202584
4094	NC_015697	TGA	2	6	217738	217743	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202584
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4099	NC_015697	TCT	2	6	218188	218193	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202584
4100	NC_015697	TCA	2	6	218257	218262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202584
4101	NC_015697	AAGA	2	8	218267	218274	75 %	0 %	25 %	0 %	338202584
4102	NC_015697	A	6	6	218278	218283	100 %	0 %	0 %	0 %	338202584
4103	NC_015697	TTA	2	6	218433	218438	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202584
4104	NC_015697	AAAC	2	8	218534	218541	75 %	0 %	0 %	25 %	338202584
4105	NC_015697	GCT	2	6	218567	218572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202584
4106	NC_015697	TAAT	2	8	218658	218665	50 %	50 %	0 %	0 %	338202585
4107	NC_015697	AACTTC	2	12	218703	218714	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202585
4108	NC_015697	ACT	2	6	218716	218721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202585
4109	NC_015697	TTC	2	6	218820	218825	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202585
4110	NC_015697	TTC	2	6	218829	218834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202585
4111	NC_015697	TAA	2	6	219038	219043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202585
4112	NC_015697	TTC	2	6	219069	219074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202585
4113	NC_015697	TTC	2	6	219094	219099	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202585
4114	NC_015697	T	6	6	219122	219127	0 %	100 %	0 %	0 %	338202585
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4116	NC_015697	AGCGT	2	10	219306	219315	20 %	20 %	40 %	20 %	338202586
4117	NC_015697	CAA	2	6	219326	219331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202586
4118	NC_015697	TAA	2	6	219371	219376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202586
4119	NC_015697	AAT	2	6	219426	219431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202586
4120	NC_015697	TCA	2	6	219439	219444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202586
4121	NC_015697	TCA	3	9	219490	219498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202586
4122	NC_015697	TTCC	2	8	219509	219516	0 %	50 %	0 %	50 %	338202586
4123	NC_015697	ATA	2	6	219520	219525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202586
4124	NC_015697	GGTT	2	8	219531	219538	0 %	50 %	50 %	0 %	338202586
4125	NC_015697	TTA	2	6	219604	219609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	338202586
4126	NC_015697	TTAA	2	8	219631	219638	50 %	50 %	0 %	0 %	338202586
4127	NC_015697	A	6	6	219637	219642	100 %	0 %	0 %	0 %	338202586
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4130	NC_015697	AGTA	2	8	219719	219726	50 %	25 %	25 %	0 %	338202586
4131	NC_015697	TAA	2	6	219734	219739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202586
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4142	NC_015697	ACC	2	6	220251	220256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202587
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4165	NC_015697	GTT	2	6	221634	221639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	338202588
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4228	NC_015697	T	6	6	225093	225098	0 %	100 %	0 %	0 %	338202591
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4234	NC_015697	CAA	2	6	225371	225376	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202591
4235	NC_015697	CATT	2	8	225403	225410	25 %	50 %	0 %	25 %	338202591
4236	NC_015697	T	6	6	225409	225414	0 %	100 %	0 %	0 %	338202591
4237	NC_015697	TTAAT	2	10	225482	225491	40 %	60 %	0 %	0 %	338202592
4238	NC_015697	CAC	2	6	225558	225563	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	338202592
4239	NC_015697	AGA	2	6	225599	225604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	338202592
4240	NC_015697	ATTG	2	8	225718	225725	25 %	50 %	25 %	0 %	338202592
4241	NC_015697	ATC	2	6	225733	225738	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202592
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4243	NC_015697	CTG	2	6	225825	225830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	338202592
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4365	NC_015697	CAT	2	6	231132	231137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202597
4366	NC_015697	ACA	2	6	231141	231146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202597
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4368	NC_015697	AT	3	6	231237	231242	50 %	50 %	0 %	0 %	338202597
4369	NC_015697	AAT	2	6	231249	231254	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202597
4370	NC_015697	T	6	6	231285	231290	0 %	100 %	0 %	0 %	338202597
4371	NC_015697	ATTT	2	8	231495	231502	25 %	75 %	0 %	0 %	338202598
4372	NC_015697	T	7	7	231500	231506	0 %	100 %	0 %	0 %	338202598
4373	NC_015697	AAT	2	6	231521	231526	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202598
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4377	NC_015697	ATC	2	6	231788	231793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202598
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4478	NC_015697	TCT	2	6	237075	237080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202604
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4482	NC_015697	CAT	3	9	237259	237267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202604
4483	NC_015697	TGA	2	6	237297	237302	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	338202604
4484	NC_015697	TCCTCA	2	12	237303	237314	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	338202604
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4486	NC_015697	CAG	2	6	237583	237588	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202604
4487	NC_015697	AGC	2	6	237620	237625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202604
4488	NC_015697	TTC	2	6	237856	237861	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202605
4489	NC_015697	TTC	2	6	237949	237954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	338202605
4490	NC_015697	CAA	2	6	237966	237971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	338202605
4491	NC_015697	C	6	6	238007	238012	0 %	0 %	0 %	100 %	338202605
4492	NC_015697	ATA	2	6	238016	238021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202605
4493	NC_015697	AAT	2	6	238026	238031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	338202605
4494	NC_015697	TCA	2	6	238049	238054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	338202605
4495	NC_015697	CGA	2	6	238065	238070	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	338202605
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4499	NC_015697	ATCT	2	8	238137	238144	25 %	50 %	0 %	25 %	338202606
4500	NC_015697	TCAA	2	8	238213	238220	50 %	25 %	0 %	25 %	338202606

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